MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_021814	GTAT	2	8	690167	690174	25 %	50 %	25 %	0 %	525837317
12503	NC_021814	GAA	2	6	690188	690193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837317
12504	NC_021814	A	6	6	690192	690197	100 %	0 %	0 %	0 %	525837317
12505	NC_021814	AGG	2	6	690201	690206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525837317
12506	NC_021814	CCG	2	6	690340	690345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837317
12507	NC_021814	ACA	2	6	690450	690455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837317
12508	NC_021814	CTGT	2	8	690473	690480	0 %	50 %	25 %	25 %	525837317
12509	NC_021814	ATT	2	6	690512	690517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837317
12510	NC_021814	TGC	2	6	690530	690535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837317
12511	NC_021814	C	6	6	690639	690644	0 %	0 %	0 %	100 %	525837317
12512	NC_021814	AACG	2	8	690669	690676	50 %	0 %	25 %	25 %	525837317
12513	NC_021814	ATA	2	6	690739	690744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837317
12514	NC_021814	TGAT	2	8	690786	690793	25 %	50 %	25 %	0 %	525837317
12515	NC_021814	TCT	2	6	690799	690804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837317
12516	NC_021814	GTT	2	6	690821	690826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837317
12517	NC_021814	T	6	6	690825	690830	0 %	100 %	0 %	0 %	525837317
12518	NC_021814	TCGA	2	8	691043	691050	25 %	25 %	25 %	25 %	525837317
12519	NC_021814	T	6	6	691058	691063	0 %	100 %	0 %	0 %	525837317
12520	NC_021814	TTC	2	6	691099	691104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837317
12521	NC_021814	CAG	2	6	691744	691749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837318
12522	NC_021814	CAG	2	6	691751	691756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837318
12523	NC_021814	CGT	2	6	691842	691847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837318
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12525	NC_021814	TCA	2	6	691946	691951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837318
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12529	NC_021814	ATT	2	6	692212	692217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840587
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12534	NC_021814	TCT	2	6	692358	692363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840587
12535	NC_021814	CCTGCG	2	12	692409	692420	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	525840588
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12539	NC_021814	CTG	2	6	692496	692501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840588
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12542	NC_021814	T	6	6	692661	692666	0 %	100 %	0 %	0 %	525840588
12543	NC_021814	ATGTCG	2	12	692668	692679	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525840588
12544	NC_021814	GGGC	2	8	692813	692820	0 %	0 %	75 %	25 %	525840588
12545	NC_021814	T	6	6	692830	692835	0 %	100 %	0 %	0 %	525840588
12546	NC_021814	CGC	2	6	692935	692940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840588
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12550	NC_021814	AGCG	2	8	693052	693059	25 %	0 %	50 %	25 %	525840588
12551	NC_021814	TCT	2	6	693104	693109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840588
12552	NC_021814	CATT	2	8	693145	693152	25 %	50 %	0 %	25 %	525840588
12553	NC_021814	TTC	2	6	693165	693170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840588
12554	NC_021814	GTC	2	6	693218	693223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840588
12555	NC_021814	GAT	2	6	693311	693316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840588
12556	NC_021814	TCC	2	6	693338	693343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525840588
12557	NC_021814	ACGC	2	8	693950	693957	25 %	0 %	25 %	50 %	525840589
12558	NC_021814	ATG	2	6	693983	693988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840589
12559	NC_021814	GTGCT	2	10	694085	694094	0 %	40 %	40 %	20 %	525840589
12560	NC_021814	GAC	2	6	694119	694124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840589
12561	NC_021814	TCCA	2	8	694159	694166	25 %	25 %	0 %	50 %	525840589
12562	NC_021814	GAT	2	6	694264	694269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840589
12563	NC_021814	TCG	2	6	694448	694453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840589
12564	NC_021814	CTT	2	6	694489	694494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840589
12565	NC_021814	CGC	2	6	694546	694551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840589
12566	NC_021814	CCAGT	2	10	694603	694612	20 %	20 %	20 %	40 %	525840589
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12569	NC_021814	GCG	2	6	694691	694696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840589
12570	NC_021814	TGG	2	6	694725	694730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840589
12571	NC_021814	GTCA	2	8	694750	694757	25 %	25 %	25 %	25 %	525840589
12572	NC_021814	GT	3	6	694778	694783	0 %	50 %	50 %	0 %	525840589
12573	NC_021814	GAG	2	6	694872	694877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525840590
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12581	NC_021814	GTC	2	6	695339	695344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840591
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12584	NC_021814	ACG	2	6	695508	695513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840591
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12591	NC_021814	CAG	2	6	695875	695880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840592
12592	NC_021814	CGGG	2	8	695925	695932	0 %	0 %	75 %	25 %	525840592
12593	NC_021814	CCG	2	6	696049	696054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840593
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12602	NC_021814	T	6	6	696446	696451	0 %	100 %	0 %	0 %	525840593
12603	NC_021814	GCC	2	6	696462	696467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840593
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12605	NC_021814	CGT	2	6	696542	696547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840593
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