MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_021814	GCA	2	6	633046	633051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837282
11502	NC_021814	CGA	2	6	633055	633060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837282
11503	NC_021814	AGC	2	6	633073	633078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837282
11504	NC_021814	AT	3	6	633137	633142	50 %	50 %	0 %	0 %	525837282
11505	NC_021814	AGC	2	6	633202	633207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837283
11506	NC_021814	CAG	2	6	633225	633230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837283
11507	NC_021814	CGC	2	6	633258	633263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837283
11508	NC_021814	GAT	3	9	633363	633371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837283
11509	NC_021814	GGC	2	6	633398	633403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837283
11510	NC_021814	CAGCGC	2	12	633438	633449	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525837283
11511	NC_021814	TCA	2	6	633593	633598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837283
11512	NC_021814	ATT	2	6	633610	633615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837284
11513	NC_021814	T	6	6	633662	633667	0 %	100 %	0 %	0 %	525837284
11514	NC_021814	GCT	2	6	633682	633687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837284
11515	NC_021814	GCT	2	6	633727	633732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837284
11516	NC_021814	TCG	2	6	633741	633746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837284
11517	NC_021814	CTT	2	6	633758	633763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837284
11518	NC_021814	CCAC	2	8	633772	633779	25 %	0 %	0 %	75 %	525837284
11519	NC_021814	AAT	2	6	633827	633832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837284
11520	NC_021814	CGC	2	6	633934	633939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837284
11521	NC_021814	CGC	3	9	634015	634023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837284
11522	NC_021814	GCGCCA	2	12	634116	634127	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525837284
11523	NC_021814	TCA	2	6	634162	634167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837284
11524	NC_021814	CGCA	2	8	634196	634203	25 %	0 %	25 %	50 %	525837284
11525	NC_021814	GCCA	2	8	634236	634243	25 %	0 %	25 %	50 %	525837284
11526	NC_021814	CAT	2	6	634249	634254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837284
11527	NC_021814	AGC	2	6	634293	634298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837284
11528	NC_021814	CCG	2	6	634302	634307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837284
11529	NC_021814	CGC	2	6	634378	634383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837284
11530	NC_021814	CCG	2	6	634470	634475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837284
11531	NC_021814	TGGC	2	8	634483	634490	0 %	25 %	50 %	25 %	525837284
11532	NC_021814	CCT	2	6	634516	634521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525837284
11533	NC_021814	TAA	2	6	634544	634549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837284
11534	NC_021814	T	6	6	634580	634585	0 %	100 %	0 %	0 %	525837284
11535	NC_021814	T	6	6	634588	634593	0 %	100 %	0 %	0 %	525837284
11536	NC_021814	AGA	2	6	634760	634765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837285
11537	NC_021814	CTGG	2	8	634784	634791	0 %	25 %	50 %	25 %	525837285
11538	NC_021814	GGC	2	6	634844	634849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837285
11539	NC_021814	TCT	2	6	634856	634861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837285
11540	NC_021814	ATGG	2	8	634911	634918	25 %	25 %	50 %	0 %	525837285
11541	NC_021814	GGT	2	6	634925	634930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837285
11542	NC_021814	TGC	2	6	634969	634974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837285
11543	NC_021814	ATG	2	6	635146	635151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837285
11544	NC_021814	CGC	2	6	635191	635196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837285
11545	NC_021814	CGA	2	6	635229	635234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837285
11546	NC_021814	CAG	2	6	635253	635258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837285
11547	NC_021814	A	6	6	635334	635339	100 %	0 %	0 %	0 %	525837285
11548	NC_021814	ACG	2	6	635364	635369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837285
11549	NC_021814	GCG	2	6	635398	635403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837285
11550	NC_021814	GCC	2	6	635518	635523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837286
11551	NC_021814	CTC	2	6	635550	635555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525837286
11552	NC_021814	TGG	2	6	635579	635584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837286
11553	NC_021814	GTG	2	6	635620	635625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837286
11554	NC_021814	ATGA	2	8	635647	635654	50 %	25 %	25 %	0 %	525837286
11555	NC_021814	GTC	2	6	635671	635676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837286
11556	NC_021814	GCC	2	6	635724	635729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837286
11557	NC_021814	GGCGA	2	10	635791	635800	20 %	0 %	60 %	20 %	525837286
11558	NC_021814	GGC	2	6	635836	635841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837286
11559	NC_021814	CGT	2	6	635887	635892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837286
11560	NC_021814	CTG	2	6	635908	635913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837286
11561	NC_021814	CTG	2	6	635938	635943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837286
11562	NC_021814	TTA	2	6	635974	635979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837286
11563	NC_021814	CGC	2	6	636025	636030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837286
11564	NC_021814	CGC	2	6	636047	636052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837286
11565	NC_021814	CTG	2	6	636061	636066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837286
11566	NC_021814	CGC	2	6	636182	636187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837286
11567	NC_021814	GGC	2	6	636207	636212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837286
11568	NC_021814	AGCC	2	8	636222	636229	25 %	0 %	25 %	50 %	525837286
11569	NC_021814	TCA	2	6	636237	636242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837286
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11571	NC_021814	GCG	2	6	636348	636353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837286
11572	NC_021814	GC	3	6	636415	636420	0 %	0 %	50 %	50 %	525837286
11573	NC_021814	CG	3	6	636558	636563	0 %	0 %	50 %	50 %	525837286
11574	NC_021814	GAT	2	6	636622	636627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837286
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11578	NC_021814	ACG	2	6	636969	636974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837287
11579	NC_021814	TCTT	2	8	636992	636999	0 %	75 %	0 %	25 %	525837287
11580	NC_021814	CCTGG	2	10	637014	637023	0 %	20 %	40 %	40 %	525837287
11581	NC_021814	TCA	2	6	637044	637049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837287
11582	NC_021814	GCA	2	6	637158	637163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837287
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11584	NC_021814	TTG	2	6	637241	637246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837287
11585	NC_021814	T	7	7	637323	637329	0 %	100 %	0 %	0 %	525837287
11586	NC_021814	CTG	2	6	637330	637335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837287
11587	NC_021814	GGC	2	6	637376	637381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837287
11588	NC_021814	TGA	2	6	637445	637450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837287
11589	NC_021814	CGTTT	2	10	637469	637478	0 %	60 %	20 %	20 %	525837287
11590	NC_021814	GGTTG	2	10	637548	637557	0 %	40 %	60 %	0 %	525837287
11591	NC_021814	CAG	2	6	637574	637579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837287
11592	NC_021814	TC	3	6	637594	637599	0 %	50 %	0 %	50 %	525837287
11593	NC_021814	ATG	2	6	637606	637611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837287
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11595	NC_021814	TAT	2	6	637720	637725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837287
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11597	NC_021814	TTGA	2	8	637792	637799	25 %	50 %	25 %	0 %	525837287
11598	NC_021814	GCT	2	6	637905	637910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837287
11599	NC_021814	TGAT	2	8	637963	637970	25 %	50 %	25 %	0 %	525837287
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11601	NC_021814	ATA	2	6	638170	638175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840568
11602	NC_021814	A	6	6	638767	638772	100 %	0 %	0 %	0 %	525837288
11603	NC_021814	T	8	8	638777	638784	0 %	100 %	0 %	0 %	525837288
11604	NC_021814	TGC	2	6	638836	638841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837288
11605	NC_021814	A	6	6	638996	639001	100 %	0 %	0 %	0 %	525837288
11606	NC_021814	TCA	2	6	639084	639089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837288
11607	NC_021814	GAA	2	6	639090	639095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837288
11608	NC_021814	T	6	6	639125	639130	0 %	100 %	0 %	0 %	525837288
11609	NC_021814	T	6	6	639160	639165	0 %	100 %	0 %	0 %	525837288
11610	NC_021814	AGA	2	6	639173	639178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837288
11611	NC_021814	TTTC	2	8	639206	639213	0 %	75 %	0 %	25 %	525837288
11612	NC_021814	AAG	2	6	639285	639290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837288
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11614	NC_021814	GAA	2	6	639425	639430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837288
11615	NC_021814	AAT	2	6	639460	639465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837288
11616	NC_021814	TAC	2	6	639490	639495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837288
11617	NC_021814	CTT	2	6	639568	639573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837288
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11619	NC_021814	T	6	6	639948	639953	0 %	100 %	0 %	0 %	525837289
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11744	NC_021814	AGAGG	2	10	647643	647652	40 %	0 %	60 %	0 %	525837293
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