MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_021814	CTGG	2	8	606327	606334	0 %	25 %	50 %	25 %	525837259
11002	NC_021814	TGT	2	6	606403	606408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837259
11003	NC_021814	GGCG	2	8	606416	606423	0 %	0 %	75 %	25 %	525837259
11004	NC_021814	GCA	2	6	606491	606496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837259
11005	NC_021814	CGA	2	6	606530	606535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837259
11006	NC_021814	CGT	2	6	606554	606559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837259
11007	NC_021814	CCAC	2	8	606638	606645	25 %	0 %	0 %	75 %	525837259
11008	NC_021814	CAC	2	6	606660	606665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837259
11009	NC_021814	GCG	2	6	606674	606679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837259
11010	NC_021814	TGG	2	6	606680	606685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837259
11011	NC_021814	GC	3	6	606695	606700	0 %	0 %	50 %	50 %	525837259
11012	NC_021814	CGGCG	2	10	606710	606719	0 %	0 %	60 %	40 %	525837259
11013	NC_021814	GCCA	2	8	606766	606773	25 %	0 %	25 %	50 %	525837259
11014	NC_021814	CGC	2	6	606792	606797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837259
11015	NC_021814	TTG	2	6	606798	606803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837259
11016	NC_021814	GC	3	6	606890	606895	0 %	0 %	50 %	50 %	525837259
11017	NC_021814	ACG	2	6	606963	606968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837259
11018	NC_021814	TTGCGC	2	12	606981	606992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837259
11019	NC_021814	T	6	6	607001	607006	0 %	100 %	0 %	0 %	525837259
11020	NC_021814	TGCT	2	8	607030	607037	0 %	50 %	25 %	25 %	525837259
11021	NC_021814	ATC	2	6	607042	607047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837259
11022	NC_021814	CAT	2	6	607238	607243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837259
11023	NC_021814	AAT	2	6	607299	607304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837259
11024	NC_021814	AAG	2	6	607320	607325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837259
11025	NC_021814	AGC	2	6	607327	607332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837259
11026	NC_021814	TCT	2	6	607352	607357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837259
11027	NC_021814	TGC	2	6	607366	607371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837259
11028	NC_021814	TGT	2	6	607400	607405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837259
11029	NC_021814	AGCGC	2	10	607529	607538	20 %	0 %	40 %	40 %	525837260
11030	NC_021814	TGA	2	6	607632	607637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837260
11031	NC_021814	ATG	2	6	607656	607661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837260
11032	NC_021814	CTT	2	6	607676	607681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837260
11033	NC_021814	CGG	2	6	607726	607731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837260
11034	NC_021814	ACG	2	6	607746	607751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837260
11035	NC_021814	GC	3	6	607817	607822	0 %	0 %	50 %	50 %	525837260
11036	NC_021814	AAC	2	6	607885	607890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837260
11037	NC_021814	CTTGC	2	10	607941	607950	0 %	40 %	20 %	40 %	525837260
11038	NC_021814	CCA	2	6	608587	608592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837261
11039	NC_021814	TAAG	2	8	608604	608611	50 %	25 %	25 %	0 %	525837261
11040	NC_021814	AGGCGG	2	12	608661	608672	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	525837261
11041	NC_021814	CGG	2	6	608721	608726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837261
11042	NC_021814	AAT	2	6	608821	608826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837261
11043	NC_021814	AGCC	2	8	608860	608867	25 %	0 %	25 %	50 %	525837261
11044	NC_021814	CAG	3	9	608878	608886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837261
11045	NC_021814	GTG	3	9	608897	608905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837261
11046	NC_021814	CG	3	6	608945	608950	0 %	0 %	50 %	50 %	525837261
11047	NC_021814	CGG	2	6	608961	608966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837261
11048	NC_021814	ATC	2	6	608990	608995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837261
11049	NC_021814	CGG	2	6	609013	609018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837261
11050	NC_021814	CAG	2	6	609082	609087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837261
11051	NC_021814	GCA	2	6	609099	609104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837261
11052	NC_021814	CCG	2	6	609254	609259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837261
11053	NC_021814	CAG	2	6	609268	609273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837261
11054	NC_021814	CAG	2	6	609292	609297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837261
11055	NC_021814	GGCG	2	8	609349	609356	0 %	0 %	75 %	25 %	525837261
11056	NC_021814	GGC	2	6	609367	609372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837261
11057	NC_021814	CCA	2	6	609393	609398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837261
11058	NC_021814	ATC	2	6	609431	609436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837261
11059	NC_021814	GACT	2	8	609446	609453	25 %	25 %	25 %	25 %	525837261
11060	NC_021814	GCC	2	6	609479	609484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837261
11061	NC_021814	ACA	2	6	609546	609551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837261
11062	NC_021814	GCG	2	6	609575	609580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837261
11063	NC_021814	AGC	2	6	609638	609643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837261
11064	NC_021814	TAG	2	6	609653	609658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837261
11065	NC_021814	CTT	2	6	609923	609928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837262
11066	NC_021814	CTG	3	9	609945	609953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837262
11067	NC_021814	GCAT	2	8	610012	610019	25 %	25 %	25 %	25 %	525837262
11068	NC_021814	ATG	2	6	610060	610065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837262
11069	NC_021814	CGC	3	9	610077	610085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837262
11070	NC_021814	GAG	2	6	610201	610206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525837262
11071	NC_021814	GAC	2	6	610224	610229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837262
11072	NC_021814	CTT	2	6	610298	610303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837262
11073	NC_021814	CAT	2	6	610326	610331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837262
11074	NC_021814	CGC	2	6	610332	610337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837262
11075	NC_021814	T	6	6	610364	610369	0 %	100 %	0 %	0 %	525837262
11076	NC_021814	TGAT	2	8	610393	610400	25 %	50 %	25 %	0 %	525837262
11077	NC_021814	CAGCCC	2	12	610411	610422	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	525837262
11078	NC_021814	AGC	2	6	610427	610432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837262
11079	NC_021814	CAT	2	6	610434	610439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837262
11080	NC_021814	TGT	2	6	610514	610519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837262
11081	NC_021814	CGG	2	6	610526	610531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837262
11082	NC_021814	T	7	7	610532	610538	0 %	100 %	0 %	0 %	525837262
11083	NC_021814	TTG	2	6	610594	610599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837262
11084	NC_021814	CTG	2	6	610607	610612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837262
11085	NC_021814	CATA	2	8	610616	610623	50 %	25 %	0 %	25 %	525837262
11086	NC_021814	TCA	2	6	610624	610629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837262
11087	NC_021814	CGG	2	6	610649	610654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837262
11088	NC_021814	CAGG	2	8	610823	610830	25 %	0 %	50 %	25 %	525837262
11089	NC_021814	GGT	2	6	611007	611012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837263
11090	NC_021814	ATG	2	6	611077	611082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837263
11091	NC_021814	CGC	2	6	611102	611107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837263
11092	NC_021814	GAC	2	6	611132	611137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837263
11093	NC_021814	GTA	2	6	611147	611152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837263
11094	NC_021814	CCG	2	6	611167	611172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837263
11095	NC_021814	ATC	2	6	611179	611184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837263
11096	NC_021814	GAC	2	6	611193	611198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837263
11097	NC_021814	GA	3	6	611203	611208	50 %	0 %	50 %	0 %	525837263
11098	NC_021814	TGG	2	6	611243	611248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837263
11099	NC_021814	AAC	2	6	611275	611280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837263
11100	NC_021814	GGCA	2	8	611328	611335	25 %	0 %	50 %	25 %	525837263
11101	NC_021814	CGG	2	6	611370	611375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837263
11102	NC_021814	AAT	2	6	611385	611390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837263
11103	NC_021814	CAC	3	9	611394	611402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837263
11104	NC_021814	GCATC	2	10	611471	611480	20 %	20 %	20 %	40 %	525837263
11105	NC_021814	CAG	2	6	611481	611486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837263
11106	NC_021814	GC	3	6	611506	611511	0 %	0 %	50 %	50 %	525837263
11107	NC_021814	GC	3	6	611517	611522	0 %	0 %	50 %	50 %	525837263
11108	NC_021814	ACG	2	6	611551	611556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837263
11109	NC_021814	AAC	2	6	611560	611565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837263
11110	NC_021814	ATC	2	6	611593	611598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837263
11111	NC_021814	AAT	2	6	611700	611705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837263
11112	NC_021814	GGGC	2	8	611714	611721	0 %	0 %	75 %	25 %	525837263
11113	NC_021814	CAG	3	9	611727	611735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837263
11114	NC_021814	GAC	2	6	611805	611810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837263
11115	NC_021814	AGA	2	6	611872	611877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837263
11116	NC_021814	GGCGCG	2	12	611896	611907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837263
11117	NC_021814	GCC	2	6	611928	611933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837263
11118	NC_021814	CGT	2	6	611979	611984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837263
11119	NC_021814	C	6	6	612038	612043	0 %	0 %	0 %	100 %	525837264
11120	NC_021814	AAT	2	6	612079	612084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837264
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11122	NC_021814	GA	3	6	612144	612149	50 %	0 %	50 %	0 %	525837264
11123	NC_021814	GTC	2	6	612190	612195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837264
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11225	NC_021814	GCG	2	6	618863	618868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837269
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11230	NC_021814	CAG	2	6	619061	619066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837269
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11232	NC_021814	GCA	2	6	619102	619107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837269
11233	NC_021814	GCTG	2	8	619111	619118	0 %	25 %	50 %	25 %	525837269
11234	NC_021814	GGC	2	6	619143	619148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837269
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11237	NC_021814	CGT	2	6	619526	619531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840565
11238	NC_021814	AGC	2	6	619547	619552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840565
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11240	NC_021814	GGC	2	6	619645	619650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840565
11241	NC_021814	CAT	2	6	619797	619802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840565
11242	NC_021814	CAT	2	6	619821	619826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840565
11243	NC_021814	CGT	2	6	619830	619835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840565
11244	NC_021814	TTCGG	2	10	619836	619845	0 %	40 %	40 %	20 %	525840565
11245	NC_021814	TTATGT	2	12	620120	620131	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525837270
11246	NC_021814	TCA	2	6	620196	620201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837270
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11351	NC_021814	GAC	2	6	625992	625997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837277
11352	NC_021814	CAG	2	6	626022	626027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837277
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11354	NC_021814	CGAT	2	8	626096	626103	25 %	25 %	25 %	25 %	525837277
11355	NC_021814	GCCC	2	8	626129	626136	0 %	0 %	25 %	75 %	525837277
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11357	NC_021814	AGTG	2	8	626370	626377	25 %	25 %	50 %	0 %	525837278
11358	NC_021814	TGT	2	6	626396	626401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837278
11359	NC_021814	CGCGGG	2	12	626438	626449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837278
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11482	NC_021814	A	6	6	632363	632368	100 %	0 %	0 %	0 %	525837282
11483	NC_021814	GAA	2	6	632379	632384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837282
11484	NC_021814	GTG	2	6	632391	632396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837282
11485	NC_021814	GC	3	6	632407	632412	0 %	0 %	50 %	50 %	525837282
11486	NC_021814	CTT	2	6	632413	632418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837282
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11490	NC_021814	CAT	2	6	632663	632668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837282
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