MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_021814	ATG	2	6	577258	577263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837235
10503	NC_021814	ACC	2	6	577264	577269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837235
10504	NC_021814	TTG	2	6	577331	577336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837235
10505	NC_021814	TCG	2	6	577352	577357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837235
10506	NC_021814	TAT	2	6	577363	577368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837235
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10508	NC_021814	AAG	2	6	577521	577526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837236
10509	NC_021814	CGC	2	6	577571	577576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837236
10510	NC_021814	A	6	6	577746	577751	100 %	0 %	0 %	0 %	525837236
10511	NC_021814	GC	3	6	577927	577932	0 %	0 %	50 %	50 %	525837236
10512	NC_021814	CAT	2	6	577937	577942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837236
10513	NC_021814	GCC	2	6	577963	577968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837236
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10516	NC_021814	GGAA	2	8	578223	578230	50 %	0 %	50 %	0 %	525837236
10517	NC_021814	TGA	2	6	578508	578513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837237
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10519	NC_021814	CGT	2	6	578575	578580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837237
10520	NC_021814	TCA	2	6	578646	578651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837237
10521	NC_021814	GTG	2	6	578825	578830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837237
10522	NC_021814	GGT	2	6	578839	578844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837237
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10524	NC_021814	CGTG	2	8	578869	578876	0 %	25 %	50 %	25 %	525837237
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10550	NC_021814	TGC	2	6	579913	579918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837238
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10552	NC_021814	GCT	2	6	579998	580003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837238
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10554	NC_021814	TGAG	2	8	580057	580064	25 %	25 %	50 %	0 %	525837238
10555	NC_021814	GGTG	2	8	580088	580095	0 %	25 %	75 %	0 %	525837238
10556	NC_021814	TGC	2	6	580099	580104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837238
10557	NC_021814	TTG	2	6	580128	580133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837238
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10559	NC_021814	CCGC	2	8	580185	580192	0 %	0 %	25 %	75 %	525837238
10560	NC_021814	GAC	2	6	580278	580283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837238
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10565	NC_021814	TCTG	2	8	580414	580421	0 %	50 %	25 %	25 %	525837238
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10584	NC_021814	CGG	2	6	581381	581386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837238
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10591	NC_021814	CGGCG	2	10	581930	581939	0 %	0 %	60 %	40 %	525837239
10592	NC_021814	GGC	2	6	581970	581975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837239
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10602	NC_021814	TTG	2	6	582544	582549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837239
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10612	NC_021814	CG	3	6	582927	582932	0 %	0 %	50 %	50 %	525840562
10613	NC_021814	CGC	3	9	583054	583062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840562
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10615	NC_021814	CCA	2	6	583126	583131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840562
10616	NC_021814	CAT	2	6	583148	583153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840562
10617	NC_021814	GTT	2	6	583157	583162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840562
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10619	NC_021814	GTA	2	6	583523	583528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840562
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10621	NC_021814	TCA	2	6	583566	583571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840562
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10978	NC_021814	AAT	2	6	605264	605269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837258
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10981	NC_021814	TCG	2	6	605445	605450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837258
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