MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_021814	AAG	2	6	551917	551922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837214
10003	NC_021814	AGC	2	6	552019	552024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837214
10004	NC_021814	A	6	6	552047	552052	100 %	0 %	0 %	0 %	525837214
10005	NC_021814	AGC	2	6	552083	552088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837214
10006	NC_021814	T	6	6	552099	552104	0 %	100 %	0 %	0 %	525837214
10007	NC_021814	CGC	2	6	552148	552153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837214
10008	NC_021814	AACGAA	2	12	552324	552335	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525837214
10009	NC_021814	CTGG	2	8	552356	552363	0 %	25 %	50 %	25 %	525837214
10010	NC_021814	TAT	2	6	552369	552374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837214
10011	NC_021814	TTA	2	6	552386	552391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837214
10012	NC_021814	GCC	2	6	552436	552441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837214
10013	NC_021814	AAGA	2	8	552459	552466	75 %	0 %	25 %	0 %	525837214
10014	NC_021814	GCA	2	6	552549	552554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837214
10015	NC_021814	CAG	2	6	552579	552584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837214
10016	NC_021814	G	6	6	552614	552619	0 %	0 %	100 %	0 %	525837214
10017	NC_021814	GAT	2	6	552648	552653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837214
10018	NC_021814	GGA	2	6	552705	552710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525837214
10019	NC_021814	TTTAA	2	10	552829	552838	40 %	60 %	0 %	0 %	525837214
10020	NC_021814	AGC	2	6	552959	552964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837215
10021	NC_021814	GGC	2	6	552989	552994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837215
10022	NC_021814	TGC	2	6	553073	553078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837215
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10027	NC_021814	CTG	2	6	553448	553453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837217
10028	NC_021814	TAAGGA	2	12	553474	553485	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525837217
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10030	NC_021814	CGG	2	6	553689	553694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837217
10031	NC_021814	GCC	2	6	553839	553844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837217
10032	NC_021814	CGC	2	6	553893	553898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837217
10033	NC_021814	ATCAG	2	10	553905	553914	40 %	20 %	20 %	20 %	525837217
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10040	NC_021814	CGC	2	6	554279	554284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840554
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10043	NC_021814	GGC	2	6	554320	554325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840554
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10045	NC_021814	TCTG	2	8	554520	554527	0 %	50 %	25 %	25 %	525840554
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10052	NC_021814	TGGA	2	8	554971	554978	25 %	25 %	50 %	0 %	525837218
10053	NC_021814	A	6	6	554978	554983	100 %	0 %	0 %	0 %	525837218
10054	NC_021814	T	7	7	555092	555098	0 %	100 %	0 %	0 %	525837218
10055	NC_021814	A	6	6	555118	555123	100 %	0 %	0 %	0 %	525837218
10056	NC_021814	GCG	2	6	555215	555220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837218
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10058	NC_021814	CAT	2	6	555280	555285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837218
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10060	NC_021814	TGA	2	6	555345	555350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837218
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10065	NC_021814	GGC	2	6	555510	555515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837219
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10071	NC_021814	CGGG	2	8	555802	555809	0 %	0 %	75 %	25 %	525837219
10072	NC_021814	AAT	2	6	556223	556228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837220
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10080	NC_021814	TTG	2	6	556574	556579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837220
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10088	NC_021814	TG	3	6	556974	556979	0 %	50 %	50 %	0 %	525837220
10089	NC_021814	CTT	2	6	556992	556997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837220
10090	NC_021814	TA	3	6	557467	557472	50 %	50 %	0 %	0 %	525837221
10091	NC_021814	TAT	2	6	557702	557707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837221
10092	NC_021814	ATCG	2	8	557708	557715	25 %	25 %	25 %	25 %	525837221
10093	NC_021814	TG	3	6	557717	557722	0 %	50 %	50 %	0 %	525837221
10094	NC_021814	GA	3	6	557790	557795	50 %	0 %	50 %	0 %	525837221
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10099	NC_021814	ATT	2	6	557974	557979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837221
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10103	NC_021814	CTG	2	6	558156	558161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837221
10104	NC_021814	GAAT	2	8	558198	558205	50 %	25 %	25 %	0 %	525837221
10105	NC_021814	TTG	2	6	558502	558507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840555
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10107	NC_021814	TTG	2	6	558589	558594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840555
10108	NC_021814	AAG	2	6	558606	558611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840555
10109	NC_021814	GTC	2	6	558744	558749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840555
10110	NC_021814	CAG	2	6	558796	558801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840555
10111	NC_021814	AGC	2	6	558845	558850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840555
10112	NC_021814	AAC	2	6	558862	558867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525840555
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10114	NC_021814	ATA	2	6	558997	559002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840555
10115	NC_021814	TG	3	6	559015	559020	0 %	50 %	50 %	0 %	525840555
10116	NC_021814	GAA	2	6	559023	559028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840555
10117	NC_021814	CGG	3	9	559129	559137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840555
10118	NC_021814	A	6	6	559212	559217	100 %	0 %	0 %	0 %	525840555
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10120	NC_021814	A	7	7	559236	559242	100 %	0 %	0 %	0 %	525840555
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10344	NC_021814	TG	3	6	570659	570664	0 %	50 %	50 %	0 %	525837229
10345	NC_021814	TGG	2	6	570693	570698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837229
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10348	NC_021814	TTCACT	2	12	570810	570821	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525840561
10349	NC_021814	GCG	2	6	570830	570835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840561
10350	NC_021814	GCC	4	12	570847	570858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840561
10351	NC_021814	CGG	2	6	570915	570920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840561
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10353	NC_021814	TGC	2	6	571013	571018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840561
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10356	NC_021814	GGC	2	6	571149	571154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840561
10357	NC_021814	TGG	2	6	571193	571198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840561
10358	NC_021814	CGG	2	6	571239	571244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840561
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10360	NC_021814	GCT	2	6	571350	571355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840561
10361	NC_021814	GCT	2	6	571398	571403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840561
10362	NC_021814	CTG	2	6	571423	571428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840561
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10477	NC_021814	CG	3	6	576424	576429	0 %	0 %	50 %	50 %	525837233
10478	NC_021814	GC	3	6	576430	576435	0 %	0 %	50 %	50 %	525837233
10479	NC_021814	GTC	2	6	576458	576463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837233
10480	NC_021814	GAT	2	6	576472	576477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837233
10481	NC_021814	AGC	2	6	576503	576508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837233
10482	NC_021814	TGT	2	6	576576	576581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837233
10483	NC_021814	GGT	2	6	576611	576616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837234
10484	NC_021814	TGA	2	6	576644	576649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837234
10485	NC_021814	GCA	2	6	576674	576679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837234
10486	NC_021814	CAC	2	6	576708	576713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837234
10487	NC_021814	GC	4	8	576876	576883	0 %	0 %	50 %	50 %	525837234
10488	NC_021814	TGA	2	6	576887	576892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837234
10489	NC_021814	GC	4	8	576894	576901	0 %	0 %	50 %	50 %	525837234
10490	NC_021814	GCA	3	9	576914	576922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837234
10491	NC_021814	TCA	2	6	576962	576967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837234
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10499	NC_021814	GC	3	6	577124	577129	0 %	0 %	50 %	50 %	525837235
10500	NC_021814	CAT	2	6	577224	577229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837235

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