MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9502	NC_021814	TGGT	2	8	525579	525586	0 %	50 %	50 %	0 %	525837191
9503	NC_021814	TCG	2	6	525668	525673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837191
9504	NC_021814	GCA	2	6	525679	525684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837191
9505	NC_021814	GCT	2	6	525740	525745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837191
9506	NC_021814	CGC	2	6	525850	525855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837191
9507	NC_021814	ATT	2	6	525870	525875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837191
9508	NC_021814	A	6	6	525966	525971	100 %	0 %	0 %	0 %	525837192
9509	NC_021814	TTG	2	6	525993	525998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837192
9510	NC_021814	GGC	2	6	526075	526080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837192
9511	NC_021814	A	8	8	526084	526091	100 %	0 %	0 %	0 %	525837192
9512	NC_021814	CTAT	2	8	526182	526189	25 %	50 %	0 %	25 %	525837192
9513	NC_021814	CAA	2	6	526255	526260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837192
9514	NC_021814	TA	3	6	526281	526286	50 %	50 %	0 %	0 %	525837192
9515	NC_021814	TGG	2	6	526362	526367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837192
9516	NC_021814	CGC	2	6	526372	526377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837192
9517	NC_021814	ATG	2	6	526382	526387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837192
9518	NC_021814	AGC	2	6	526621	526626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837192
9519	NC_021814	CGG	2	6	526677	526682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837192
9520	NC_021814	TAA	2	6	526828	526833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837192
9521	NC_021814	GCA	2	6	526869	526874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837192
9522	NC_021814	CGC	2	6	526948	526953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837192
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9525	NC_021814	GGT	2	6	526987	526992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837192
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9527	NC_021814	TGC	2	6	527124	527129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837192
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9532	NC_021814	AGG	2	6	527562	527567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525837192
9533	NC_021814	TCA	2	6	527634	527639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837193
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9537	NC_021814	A	8	8	527789	527796	100 %	0 %	0 %	0 %	525837193
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9542	NC_021814	TCG	2	6	527973	527978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837193
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9544	NC_021814	TGG	2	6	528224	528229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837193
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9548	NC_021814	GTC	2	6	528414	528419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837193
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9552	NC_021814	GTA	2	6	528623	528628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837193
9553	NC_021814	CGT	2	6	528667	528672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837193
9554	NC_021814	TTAAT	2	10	528690	528699	40 %	60 %	0 %	0 %	525837193
9555	NC_021814	TGC	2	6	528719	528724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837194
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9557	NC_021814	TACC	2	8	528812	528819	25 %	25 %	0 %	50 %	525837194
9558	NC_021814	GTC	2	6	528974	528979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837194
9559	NC_021814	TTGA	2	8	528985	528992	25 %	50 %	25 %	0 %	525837194
9560	NC_021814	TGT	2	6	529062	529067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837194
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9564	NC_021814	GGAAAG	2	12	529245	529256	50 %	0 %	50 %	0 %	525837194
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9569	NC_021814	GCGATA	2	12	529499	529510	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525837194
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9584	NC_021814	AAACA	2	10	530219	530228	80 %	0 %	0 %	20 %	525837194
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9593	NC_021814	AAGT	2	8	530842	530849	50 %	25 %	25 %	0 %	525840552
9594	NC_021814	GGA	2	6	530871	530876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525840552
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9598	NC_021814	GAT	2	6	530946	530951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840552
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9601	NC_021814	CGG	2	6	531053	531058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840552
9602	NC_021814	TAC	2	6	531064	531069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840552
9603	NC_021814	T	6	6	531119	531124	0 %	100 %	0 %	0 %	525840552
9604	NC_021814	GTCG	2	8	531187	531194	0 %	25 %	50 %	25 %	525840552
9605	NC_021814	A	6	6	531243	531248	100 %	0 %	0 %	0 %	525837195
9606	NC_021814	ATT	2	6	531260	531265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837195
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9608	NC_021814	TGGC	2	8	531316	531323	0 %	25 %	50 %	25 %	525837195
9609	NC_021814	GTT	2	6	531335	531340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837195
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9612	NC_021814	GAA	2	6	531545	531550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837195
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9615	NC_021814	GC	3	6	531802	531807	0 %	0 %	50 %	50 %	525837195
9616	NC_021814	AAGA	2	8	531815	531822	75 %	0 %	25 %	0 %	525837195
9617	NC_021814	GCG	2	6	531878	531883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837195
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9990	NC_021814	TCT	2	6	550943	550948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837213
9991	NC_021814	TGC	2	6	550981	550986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837213
9992	NC_021814	AG	3	6	551006	551011	50 %	0 %	50 %	0 %	525837213
9993	NC_021814	T	6	6	551097	551102	0 %	100 %	0 %	0 %	525837213
9994	NC_021814	ATCGT	2	10	551134	551143	20 %	40 %	20 %	20 %	525837213
9995	NC_021814	ATT	2	6	551145	551150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837213
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9997	NC_021814	TGC	2	6	551245	551250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837213
9998	NC_021814	TA	3	6	551650	551655	50 %	50 %	0 %	0 %	525837214
9999	NC_021814	AGA	2	6	551671	551676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837214
10000	NC_021814	CATA	2	8	551695	551702	50 %	25 %	0 %	25 %	525837214

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