MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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85002	NC_021814	TCA	2	6	4641912	4641917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840278
85003	NC_021814	ACC	2	6	4641984	4641989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840278
85004	NC_021814	GAA	2	6	4642124	4642129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840278
85005	NC_021814	CGG	2	6	4642138	4642143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840278
85006	NC_021814	GGC	2	6	4642233	4642238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840278
85007	NC_021814	ATC	2	6	4642269	4642274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840278
85008	NC_021814	GGC	2	6	4642323	4642328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840278
85009	NC_021814	CATC	2	8	4642343	4642350	25 %	25 %	0 %	50 %	525840278
85010	NC_021814	GCGG	2	8	4642379	4642386	0 %	0 %	75 %	25 %	525840278
85011	NC_021814	CGC	2	6	4642502	4642507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840278
85012	NC_021814	GCT	2	6	4642508	4642513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840278
85013	NC_021814	TGA	2	6	4642543	4642548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840278
85014	NC_021814	ATG	2	6	4642549	4642554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840278
85015	NC_021814	GATT	2	8	4642555	4642562	25 %	50 %	25 %	0 %	525840278
85016	NC_021814	GCG	3	9	4642653	4642661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840278
85017	NC_021814	TAT	2	6	4642805	4642810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840278
85018	NC_021814	CGC	2	6	4642822	4642827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840278
85019	NC_021814	GGCG	2	8	4642859	4642866	0 %	0 %	75 %	25 %	525840278
85020	NC_021814	GCCCG	2	10	4642871	4642880	0 %	0 %	40 %	60 %	525840278
85021	NC_021814	GC	3	6	4642887	4642892	0 %	0 %	50 %	50 %	525840278
85022	NC_021814	CGCC	2	8	4642927	4642934	0 %	0 %	25 %	75 %	525840278
85023	NC_021814	TGA	2	6	4643065	4643070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840279
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85047	NC_021814	GC	3	6	4643897	4643902	0 %	0 %	50 %	50 %	525840279
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85053	NC_021814	CAG	3	9	4643994	4644002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840279
85054	NC_021814	TCG	2	6	4644020	4644025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840279
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85089	NC_021814	AAT	2	6	4646152	4646157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840281
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85105	NC_021814	GC	3	6	4647489	4647494	0 %	0 %	50 %	50 %	525840282
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85114	NC_021814	A	6	6	4647916	4647921	100 %	0 %	0 %	0 %	525840282
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85465	NC_021814	AGA	2	6	4665059	4665064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840295
85466	NC_021814	GAC	2	6	4665072	4665077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840295
85467	NC_021814	GAC	2	6	4665150	4665155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840295
85468	NC_021814	AGT	2	6	4665163	4665168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840295
85469	NC_021814	CAG	2	6	4665171	4665176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840295
85470	NC_021814	CAA	2	6	4665263	4665268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525840295
85471	NC_021814	AGCGAT	2	12	4665334	4665345	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525840295
85472	NC_021814	AG	3	6	4665426	4665431	50 %	0 %	50 %	0 %	525840295
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85474	NC_021814	TGC	2	6	4665636	4665641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840295
85475	NC_021814	TAA	2	6	4665656	4665661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840295
85476	NC_021814	A	6	6	4665756	4665761	100 %	0 %	0 %	0 %	525840295
85477	NC_021814	GAA	2	6	4665768	4665773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840295
85478	NC_021814	TGC	2	6	4665784	4665789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840295
85479	NC_021814	CTT	2	6	4666148	4666153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840296
85480	NC_021814	GC	3	6	4666206	4666211	0 %	0 %	50 %	50 %	525840296
85481	NC_021814	AGA	2	6	4666212	4666217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840296
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85485	NC_021814	TTC	2	6	4666383	4666388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840296
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85487	NC_021814	ACTTT	2	10	4666525	4666534	20 %	60 %	0 %	20 %	525840296
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85489	NC_021814	GC	3	6	4667022	4667027	0 %	0 %	50 %	50 %	525840297
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85496	NC_021814	CTG	2	6	4667235	4667240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840297
85497	NC_021814	TGG	3	9	4667260	4667268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840297
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85499	NC_021814	AAT	2	6	4667482	4667487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840298
85500	NC_021814	CGC	2	6	4667488	4667493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840298

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