MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
84501	NC_021814	CTG	2	6	4614139	4614144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840267
84502	NC_021814	GTG	2	6	4614151	4614156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840267
84503	NC_021814	AAG	2	6	4614175	4614180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840267
84504	NC_021814	CAT	2	6	4614189	4614194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840268
84505	NC_021814	AAT	2	6	4614211	4614216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840268
84506	NC_021814	GTC	2	6	4614289	4614294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840268
84507	NC_021814	GCT	2	6	4614384	4614389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840268
84508	NC_021814	GCC	2	6	4614393	4614398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840268
84509	NC_021814	GGC	2	6	4614412	4614417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840268
84510	NC_021814	GAT	2	6	4614442	4614447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840268
84511	NC_021814	GC	3	6	4614482	4614487	0 %	0 %	50 %	50 %	525840268
84512	NC_021814	CTG	2	6	4614496	4614501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840268
84513	NC_021814	TGG	2	6	4614512	4614517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840268
84514	NC_021814	ATT	2	6	4614541	4614546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840268
84515	NC_021814	CGG	2	6	4614570	4614575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840268
84516	NC_021814	CAT	3	9	4614588	4614596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840268
84517	NC_021814	CTG	3	9	4614631	4614639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840268
84518	NC_021814	GCTGGT	2	12	4614642	4614653	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	525840268
84519	NC_021814	CGCTG	2	10	4614681	4614690	0 %	20 %	40 %	40 %	525840268
84520	NC_021814	CG	3	6	4614733	4614738	0 %	0 %	50 %	50 %	525840268
84521	NC_021814	GGCG	2	8	4614786	4614793	0 %	0 %	75 %	25 %	525840268
84522	NC_021814	GCC	2	6	4614927	4614932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840268
84523	NC_021814	CT	3	6	4614955	4614960	0 %	50 %	0 %	50 %	525840268
84524	NC_021814	TGG	2	6	4614988	4614993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840268
84525	NC_021814	CTG	2	6	4615021	4615026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840268
84526	NC_021814	TCAA	2	8	4617204	4617211	50 %	25 %	0 %	25 %	525840269
84527	NC_021814	TAA	2	6	4617215	4617220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840269
84528	NC_021814	CAA	2	6	4617233	4617238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525840269
84529	NC_021814	AAT	2	6	4617320	4617325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840269
84530	NC_021814	CGAAA	2	10	4617384	4617393	60 %	0 %	20 %	20 %	525840269
84531	NC_021814	ATA	2	6	4617471	4617476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840269
84532	NC_021814	TAAA	2	8	4617524	4617531	75 %	25 %	0 %	0 %	525840269
84533	NC_021814	GAT	2	6	4617587	4617592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840269
84534	NC_021814	ACGAGA	2	12	4617685	4617696	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525840269
84535	NC_021814	AAT	2	6	4617704	4617709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840269
84536	NC_021814	ATGCG	2	10	4617732	4617741	20 %	20 %	40 %	20 %	525840269
84537	NC_021814	TGAA	2	8	4617819	4617826	50 %	25 %	25 %	0 %	525840269
84538	NC_021814	AAG	2	6	4617837	4617842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840269
84539	NC_021814	GAAA	2	8	4617871	4617878	75 %	0 %	25 %	0 %	525840269
84540	NC_021814	GCG	2	6	4617885	4617890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840269
84541	NC_021814	ATC	2	6	4617927	4617932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840269
84542	NC_021814	ACC	3	9	4617966	4617974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840269
84543	NC_021814	ATA	2	6	4617994	4617999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840269
84544	NC_021814	CCG	2	6	4618008	4618013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840269
84545	NC_021814	CCA	2	6	4618024	4618029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840269
84546	NC_021814	ATA	2	6	4618056	4618061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840269
84547	NC_021814	AGG	2	6	4618105	4618110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525840269
84548	NC_021814	ACC	2	6	4618122	4618127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840269
84549	NC_021814	AATA	2	8	4618135	4618142	75 %	25 %	0 %	0 %	525840269
84550	NC_021814	ATA	2	6	4618218	4618223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840269
84551	NC_021814	GAT	2	6	4618304	4618309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840269
84552	NC_021814	TAA	2	6	4618318	4618323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840269
84553	NC_021814	GTC	2	6	4618487	4618492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840269
84554	NC_021814	TGC	2	6	4618622	4618627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841307
84555	NC_021814	CTG	2	6	4618632	4618637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841307
84556	NC_021814	AAT	2	6	4618655	4618660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525841307
84557	NC_021814	TCG	2	6	4618662	4618667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841307
84558	NC_021814	TCG	2	6	4618701	4618706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841307
84559	NC_021814	TCT	2	6	4619166	4619171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525841308
84560	NC_021814	CGC	2	6	4619353	4619358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841309
84561	NC_021814	CAC	2	6	4619396	4619401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525841309
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84563	NC_021814	GC	3	6	4619557	4619562	0 %	0 %	50 %	50 %	525841309
84564	NC_021814	A	6	6	4619585	4619590	100 %	0 %	0 %	0 %	525841309
84565	NC_021814	CGCC	2	8	4619596	4619603	0 %	0 %	25 %	75 %	525841309
84566	NC_021814	GC	3	6	4619671	4619676	0 %	0 %	50 %	50 %	525841309
84567	NC_021814	ACG	2	6	4619691	4619696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525841309
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84569	NC_021814	GC	3	6	4619767	4619772	0 %	0 %	50 %	50 %	525841309
84570	NC_021814	CCG	2	6	4619785	4619790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841309
84571	NC_021814	GCA	2	6	4619830	4619835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525841309
84572	NC_021814	AAAG	2	8	4619840	4619847	75 %	0 %	25 %	0 %	525841309
84573	NC_021814	TTC	2	6	4619873	4619878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525841309
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84577	NC_021814	CTT	2	6	4620004	4620009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525841309
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84580	NC_021814	GC	3	6	4620147	4620152	0 %	0 %	50 %	50 %	525841309
84581	NC_021814	GCC	2	6	4620165	4620170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841309
84582	NC_021814	TGA	2	6	4620289	4620294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525841309
84583	NC_021814	CGT	2	6	4620341	4620346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841309
84584	NC_021814	TTC	2	6	4620356	4620361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525841309
84585	NC_021814	GTC	2	6	4620402	4620407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841309
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84587	NC_021814	GTC	2	6	4620492	4620497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841309
84588	NC_021814	TGGC	2	8	4620509	4620516	0 %	25 %	50 %	25 %	525841309
84589	NC_021814	ATG	2	6	4620573	4620578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525841309
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84592	NC_021814	CGGGC	2	10	4620746	4620755	0 %	0 %	60 %	40 %	525841309
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84594	NC_021814	T	6	6	4621009	4621014	0 %	100 %	0 %	0 %	525841309
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84597	NC_021814	GC	3	6	4621120	4621125	0 %	0 %	50 %	50 %	525841310
84598	NC_021814	GAAA	2	8	4621140	4621147	75 %	0 %	25 %	0 %	525841310
84599	NC_021814	GC	3	6	4621152	4621157	0 %	0 %	50 %	50 %	525841310
84600	NC_021814	A	6	6	4621158	4621163	100 %	0 %	0 %	0 %	525841310
84601	NC_021814	AAT	2	6	4621165	4621170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525841310
84602	NC_021814	TCA	2	6	4621191	4621196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525841310
84603	NC_021814	GTC	2	6	4621215	4621220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841311
84604	NC_021814	ACG	2	6	4621245	4621250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525841311
84605	NC_021814	TTA	2	6	4621277	4621282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525841311
84606	NC_021814	GCG	2	6	4621310	4621315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525841311
84607	NC_021814	GCC	2	6	4621494	4621499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841311
84608	NC_021814	ATA	2	6	4621507	4621512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525841311
84609	NC_021814	CGGTT	2	10	4621517	4621526	0 %	40 %	40 %	20 %	525841311
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84611	NC_021814	TCA	2	6	4621625	4621630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525841311
84612	NC_021814	ATGG	2	8	4621635	4621642	25 %	25 %	50 %	0 %	525841311
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84614	NC_021814	CTG	2	6	4621740	4621745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841311
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84616	NC_021814	CAG	3	9	4621824	4621832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525841311
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84618	NC_021814	GC	3	6	4621886	4621891	0 %	0 %	50 %	50 %	525841311
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