MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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84002	NC_021814	CTG	2	6	4586085	4586090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840248
84003	NC_021814	CTG	2	6	4586214	4586219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840248
84004	NC_021814	GAA	2	6	4586280	4586285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840248
84005	NC_021814	GCA	2	6	4586286	4586291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840248
84006	NC_021814	CTG	2	6	4586328	4586333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840248
84007	NC_021814	GAA	2	6	4586334	4586339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840248
84008	NC_021814	TGG	2	6	4586350	4586355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840248
84009	NC_021814	GGT	2	6	4586363	4586368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840248
84010	NC_021814	TGCC	2	8	4586404	4586411	0 %	25 %	25 %	50 %	525840248
84011	NC_021814	GCT	2	6	4586477	4586482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840248
84012	NC_021814	TCG	2	6	4586497	4586502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840248
84013	NC_021814	GTG	2	6	4586553	4586558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840248
84014	NC_021814	TTC	3	9	4586583	4586591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840248
84015	NC_021814	ACCG	2	8	4586595	4586602	25 %	0 %	25 %	50 %	525840248
84016	NC_021814	A	6	6	4586604	4586609	100 %	0 %	0 %	0 %	525840248
84017	NC_021814	GACC	2	8	4586681	4586688	25 %	0 %	25 %	50 %	525840248
84018	NC_021814	TGA	2	6	4586779	4586784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840248
84019	NC_021814	CG	3	6	4586837	4586842	0 %	0 %	50 %	50 %	525840248
84020	NC_021814	ATG	2	6	4586845	4586850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840248
84021	NC_021814	GAAC	2	8	4586879	4586886	50 %	0 %	25 %	25 %	525840248
84022	NC_021814	TGA	2	6	4586909	4586914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840248
84023	NC_021814	GC	3	6	4586938	4586943	0 %	0 %	50 %	50 %	525840248
84024	NC_021814	CGT	2	6	4587030	4587035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840248
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84030	NC_021814	CGT	2	6	4587243	4587248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840248
84031	NC_021814	GAA	2	6	4587309	4587314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840248
84032	NC_021814	GGC	3	9	4587326	4587334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840248
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84034	NC_021814	TGC	2	6	4587448	4587453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840248
84035	NC_021814	TTGA	2	8	4587501	4587508	25 %	50 %	25 %	0 %	525840248
84036	NC_021814	GCTG	2	8	4587509	4587516	0 %	25 %	50 %	25 %	525840248
84037	NC_021814	GC	3	6	4587521	4587526	0 %	0 %	50 %	50 %	525840248
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84040	NC_021814	T	7	7	4588337	4588343	0 %	100 %	0 %	0 %	525841302
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84045	NC_021814	ACT	2	6	4588569	4588574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525841302
84046	NC_021814	ACTT	2	8	4588620	4588627	25 %	50 %	0 %	25 %	525841302
84047	NC_021814	GTAA	2	8	4588633	4588640	50 %	25 %	25 %	0 %	525841302
84048	NC_021814	TTCT	2	8	4588654	4588661	0 %	75 %	0 %	25 %	525841302
84049	NC_021814	TGA	2	6	4588730	4588735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525841302
84050	NC_021814	ATA	2	6	4588752	4588757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525841302
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84053	NC_021814	GAG	2	6	4589131	4589136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525840249
84054	NC_021814	TCA	2	6	4589138	4589143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840249
84055	NC_021814	GAT	2	6	4589167	4589172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840249
84056	NC_021814	CTG	2	6	4589188	4589193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840249
84057	NC_021814	TCA	2	6	4589246	4589251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525841303
84058	NC_021814	AAGA	2	8	4589355	4589362	75 %	0 %	25 %	0 %	525841303
84059	NC_021814	CT	3	6	4589387	4589392	0 %	50 %	0 %	50 %	525841303
84060	NC_021814	ATCCC	2	10	4589452	4589461	20 %	20 %	0 %	60 %	525841303
84061	NC_021814	TC	3	6	4589492	4589497	0 %	50 %	0 %	50 %	525841303
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84064	NC_021814	ATC	2	6	4589645	4589650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525841303
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84066	NC_021814	T	7	7	4590060	4590066	0 %	100 %	0 %	0 %	525840250
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84087	NC_021814	GGCA	2	8	4592342	4592349	25 %	0 %	50 %	25 %	525840253
84088	NC_021814	A	6	6	4592467	4592472	100 %	0 %	0 %	0 %	525840253
84089	NC_021814	CGG	2	6	4592513	4592518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840253
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84100	NC_021814	CAG	2	6	4592918	4592923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840254
84101	NC_021814	AT	3	6	4592975	4592980	50 %	50 %	0 %	0 %	525840254
84102	NC_021814	ACC	2	6	4593021	4593026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840254
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84104	NC_021814	CCT	2	6	4593142	4593147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525840254
84105	NC_021814	CAA	2	6	4593149	4593154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525840254
84106	NC_021814	CCT	2	6	4593196	4593201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525840254
84107	NC_021814	GCC	2	6	4593205	4593210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840254
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84113	NC_021814	CAG	2	6	4593560	4593565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840254
84114	NC_021814	CG	3	6	4593566	4593571	0 %	0 %	50 %	50 %	525840254
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84116	NC_021814	GCA	2	6	4593694	4593699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840254
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84233	NC_021814	TGCGCT	2	12	4600839	4600850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840261
84234	NC_021814	GAT	2	6	4600851	4600856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840261
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84239	NC_021814	GCGT	2	8	4601123	4601130	0 %	25 %	50 %	25 %	525840261
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84343	NC_021814	A	7	7	4605997	4606003	100 %	0 %	0 %	0 %	525840263
84344	NC_021814	GGC	2	6	4606007	4606012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840263
84345	NC_021814	CGA	2	6	4606039	4606044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840263
84346	NC_021814	CTTT	2	8	4606047	4606054	0 %	75 %	0 %	25 %	525840263
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84465	NC_021814	CAT	2	6	4612362	4612367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840266
84466	NC_021814	GCG	2	6	4612396	4612401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840266
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