MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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81502	NC_021814	GC	3	6	4450866	4450871	0 %	0 %	50 %	50 %	525840149
81503	NC_021814	CGG	2	6	4450873	4450878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840149
81504	NC_021814	GCC	2	6	4450914	4450919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840149
81505	NC_021814	CCA	2	6	4450930	4450935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840149
81506	NC_021814	GCC	2	6	4450964	4450969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840149
81507	NC_021814	ACG	2	6	4451067	4451072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840149
81508	NC_021814	GCC	2	6	4451087	4451092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840149
81509	NC_021814	TAA	2	6	4451134	4451139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840149
81510	NC_021814	TCG	2	6	4451166	4451171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840149
81511	NC_021814	CA	3	6	4451376	4451381	50 %	0 %	0 %	50 %	525840149
81512	NC_021814	CCA	2	6	4451453	4451458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840149
81513	NC_021814	AGT	2	6	4451629	4451634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840150
81514	NC_021814	TTG	2	6	4451643	4451648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840150
81515	NC_021814	ATC	2	6	4451661	4451666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840150
81516	NC_021814	TGC	2	6	4451679	4451684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840150
81517	NC_021814	CTCG	2	8	4451693	4451700	0 %	25 %	25 %	50 %	525840150
81518	NC_021814	T	7	7	4451707	4451713	0 %	100 %	0 %	0 %	525840150
81519	NC_021814	GC	3	6	4451734	4451739	0 %	0 %	50 %	50 %	525840150
81520	NC_021814	T	7	7	4451781	4451787	0 %	100 %	0 %	0 %	525840150
81521	NC_021814	CG	3	6	4452124	4452129	0 %	0 %	50 %	50 %	525840151
81522	NC_021814	CGG	2	6	4452169	4452174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840151
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81526	NC_021814	TGC	2	6	4452364	4452369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840151
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81530	NC_021814	GCG	2	6	4452568	4452573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840151
81531	NC_021814	CGC	2	6	4452580	4452585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840151
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81534	NC_021814	CTG	2	6	4452723	4452728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840151
81535	NC_021814	GTCT	2	8	4452745	4452752	0 %	50 %	25 %	25 %	525840151
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81542	NC_021814	CG	3	6	4453253	4453258	0 %	0 %	50 %	50 %	525840151
81543	NC_021814	AG	3	6	4453307	4453312	50 %	0 %	50 %	0 %	525840151
81544	NC_021814	CG	3	6	4453336	4453341	0 %	0 %	50 %	50 %	525840151
81545	NC_021814	C	6	6	4453370	4453375	0 %	0 %	0 %	100 %	525840151
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81549	NC_021814	CTG	2	6	4453698	4453703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840151
81550	NC_021814	GCC	2	6	4453759	4453764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840151
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81553	NC_021814	CGG	2	6	4453965	4453970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840151
81554	NC_021814	TGG	2	6	4453981	4453986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840151
81555	NC_021814	AGAT	2	8	4454035	4454042	50 %	25 %	25 %	0 %	525840151
81556	NC_021814	CTG	2	6	4454076	4454081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840151
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81558	NC_021814	CGG	2	6	4454189	4454194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840151
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81561	NC_021814	GGA	2	6	4454258	4454263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525840151
81562	NC_021814	AGCA	2	8	4454344	4454351	50 %	0 %	25 %	25 %	525840151
81563	NC_021814	AGCG	2	8	4454361	4454368	25 %	0 %	50 %	25 %	525840151
81564	NC_021814	AGCGC	2	10	4454518	4454527	20 %	0 %	40 %	40 %	525840151
81565	NC_021814	GC	3	6	4454542	4454547	0 %	0 %	50 %	50 %	525840151
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81569	NC_021814	CG	5	10	4454768	4454777	0 %	0 %	50 %	50 %	525840151
81570	NC_021814	TCA	2	6	4454785	4454790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840151
81571	NC_021814	CA	3	6	4455106	4455111	50 %	0 %	0 %	50 %	525840152
81572	NC_021814	CTG	3	9	4455128	4455136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840152
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81582	NC_021814	TGA	2	6	4455638	4455643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840153
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81585	NC_021814	GAAA	2	8	4455743	4455750	75 %	0 %	25 %	0 %	525840153
81586	NC_021814	GGC	2	6	4455794	4455799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840153
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81588	NC_021814	AGCCGC	2	12	4455982	4455993	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525840153
81589	NC_021814	CGA	2	6	4455995	4456000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840153
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81598	NC_021814	TGC	2	6	4456616	4456621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840154
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81600	NC_021814	ACT	2	6	4456646	4456651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840154
81601	NC_021814	TGG	2	6	4456664	4456669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840154
81602	NC_021814	GGC	2	6	4456723	4456728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840154
81603	NC_021814	CGG	2	6	4456800	4456805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840154
81604	NC_021814	TTC	2	6	4456807	4456812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840154
81605	NC_021814	CAT	2	6	4456836	4456841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840154
81606	NC_021814	AGC	2	6	4456905	4456910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840154
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81608	NC_021814	GC	4	8	4456949	4456956	0 %	0 %	50 %	50 %	525840155
81609	NC_021814	CTGG	2	8	4457009	4457016	0 %	25 %	50 %	25 %	525840155
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81612	NC_021814	CTT	2	6	4457144	4457149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840155
81613	NC_021814	GAA	2	6	4457202	4457207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840155
81614	NC_021814	A	6	6	4457209	4457214	100 %	0 %	0 %	0 %	525840155
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81616	NC_021814	GCG	2	6	4457307	4457312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840155
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