MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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81002	NC_021814	CAT	2	6	4424091	4424096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840128
81003	NC_021814	CGG	2	6	4424126	4424131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840128
81004	NC_021814	CAT	2	6	4424199	4424204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840128
81005	NC_021814	CAG	2	6	4424295	4424300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840128
81006	NC_021814	GGC	2	6	4424657	4424662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840129
81007	NC_021814	ATCA	2	8	4424703	4424710	50 %	25 %	0 %	25 %	525840129
81008	NC_021814	TCG	2	6	4424805	4424810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840129
81009	NC_021814	GCTG	2	8	4424902	4424909	0 %	25 %	50 %	25 %	525840129
81010	NC_021814	TC	3	6	4424952	4424957	0 %	50 %	0 %	50 %	525840129
81011	NC_021814	CTAT	2	8	4425013	4425020	25 %	50 %	0 %	25 %	525840129
81012	NC_021814	T	6	6	4425056	4425061	0 %	100 %	0 %	0 %	525840129
81013	NC_021814	CGT	2	6	4425105	4425110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840129
81014	NC_021814	GACA	2	8	4425162	4425169	50 %	0 %	25 %	25 %	525840129
81015	NC_021814	GCA	2	6	4425215	4425220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840129
81016	NC_021814	TGGCG	2	10	4425302	4425311	0 %	20 %	60 %	20 %	525840129
81017	NC_021814	TCA	2	6	4425392	4425397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840129
81018	NC_021814	ATT	2	6	4425400	4425405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840129
81019	NC_021814	CAC	2	6	4425410	4425415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840129
81020	NC_021814	GGCA	2	8	4425423	4425430	25 %	0 %	50 %	25 %	525840129
81021	NC_021814	CGT	2	6	4425563	4425568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841274
81022	NC_021814	CT	3	6	4425587	4425592	0 %	50 %	0 %	50 %	525841274
81023	NC_021814	GTC	2	6	4425609	4425614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841274
81024	NC_021814	CGG	2	6	4425637	4425642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525841274
81025	NC_021814	GCA	2	6	4425653	4425658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525841274
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81027	NC_021814	GAACG	2	10	4425691	4425700	40 %	0 %	40 %	20 %	525841274
81028	NC_021814	GC	3	6	4425781	4425786	0 %	0 %	50 %	50 %	525841274
81029	NC_021814	GC	3	6	4425795	4425800	0 %	0 %	50 %	50 %	525841274
81030	NC_021814	ATT	2	6	4425855	4425860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525841274
81031	NC_021814	GCCA	2	8	4425897	4425904	25 %	0 %	25 %	50 %	525841274
81032	NC_021814	TGG	2	6	4425924	4425929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525841274
81033	NC_021814	CG	3	6	4425938	4425943	0 %	0 %	50 %	50 %	525841274
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81037	NC_021814	GC	3	6	4426106	4426111	0 %	0 %	50 %	50 %	525841274
81038	NC_021814	GGA	2	6	4426118	4426123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525841274
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81042	NC_021814	GCA	2	6	4426289	4426294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525841274
81043	NC_021814	TGGG	2	8	4426314	4426321	0 %	25 %	75 %	0 %	525841274
81044	NC_021814	A	6	6	4426404	4426409	100 %	0 %	0 %	0 %	525841274
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81051	NC_021814	GC	3	6	4426728	4426733	0 %	0 %	50 %	50 %	525840130
81052	NC_021814	CGC	2	6	4426770	4426775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840130
81053	NC_021814	TGG	2	6	4426776	4426781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840130
81054	NC_021814	GAA	2	6	4426807	4426812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840130
81055	NC_021814	CAGCG	2	10	4426816	4426825	20 %	0 %	40 %	40 %	525840130
81056	NC_021814	TCA	2	6	4426848	4426853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840130
81057	NC_021814	CAT	2	6	4426876	4426881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840130
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81059	NC_021814	ACTG	2	8	4426907	4426914	25 %	25 %	25 %	25 %	525840130
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81067	NC_021814	GCGCG	2	10	4427161	4427170	0 %	0 %	60 %	40 %	525840130
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81100	NC_021814	GCTG	2	8	4428612	4428619	0 %	25 %	50 %	25 %	525840131
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81117	NC_021814	GCG	3	9	4430478	4430486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840132
81118	NC_021814	CGA	2	6	4430538	4430543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840132
81119	NC_021814	TGC	2	6	4430568	4430573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840132
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81121	NC_021814	GC	3	6	4430670	4430675	0 %	0 %	50 %	50 %	525840132
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81221	NC_021814	TGGC	2	8	4435850	4435857	0 %	25 %	50 %	25 %	525840137
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81232	NC_021814	GTAT	2	8	4436431	4436438	25 %	50 %	25 %	0 %	525840138
81233	NC_021814	GCT	2	6	4436475	4436480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840138
81234	NC_021814	CGA	2	6	4436504	4436509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840138
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81236	NC_021814	GC	4	8	4436564	4436571	0 %	0 %	50 %	50 %	525840138
81237	NC_021814	TC	3	6	4436577	4436582	0 %	50 %	0 %	50 %	525840138
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81264	NC_021814	TGA	2	6	4437580	4437585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840139
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81333	NC_021814	ATC	2	6	4440865	4440870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840141
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81336	NC_021814	CTTAT	2	10	4441040	4441049	20 %	60 %	0 %	20 %	525840141
81337	NC_021814	GGGC	2	8	4441121	4441128	0 %	0 %	75 %	25 %	525840141
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81340	NC_021814	CCG	2	6	4441209	4441214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840141
81341	NC_021814	A	7	7	4441219	4441225	100 %	0 %	0 %	0 %	525840141
81342	NC_021814	TAA	2	6	4441354	4441359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525841276
81343	NC_021814	ATG	2	6	4441407	4441412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525841276
81344	NC_021814	TGG	2	6	4441469	4441474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840142
81345	NC_021814	CCG	2	6	4441512	4441517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840142
81346	NC_021814	CGC	2	6	4441525	4441530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840142
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81348	NC_021814	CGG	2	6	4441595	4441600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840142
81349	NC_021814	TGA	2	6	4441632	4441637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840142
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81351	NC_021814	TGC	2	6	4441730	4441735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840142
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81377	NC_021814	CT	3	6	4443859	4443864	0 %	50 %	0 %	50 %	525840144
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81466	NC_021814	GCT	2	6	4449176	4449181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841280
81467	NC_021814	CG	3	6	4449263	4449268	0 %	0 %	50 %	50 %	525841280
81468	NC_021814	CGC	2	6	4449326	4449331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841280
81469	NC_021814	TAT	2	6	4449356	4449361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525841280
81470	NC_021814	TGGC	2	8	4449362	4449369	0 %	25 %	50 %	25 %	525841280
81471	NC_021814	CGC	2	6	4449383	4449388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841280
81472	NC_021814	GTG	2	6	4449420	4449425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525841280
81473	NC_021814	GAT	2	6	4449512	4449517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525841280
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81491	NC_021814	CCG	2	6	4450561	4450566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840149
81492	NC_021814	CGCGG	2	10	4450582	4450591	0 %	0 %	60 %	40 %	525840149
81493	NC_021814	ATA	2	6	4450595	4450600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840149
81494	NC_021814	CAGG	2	8	4450659	4450666	25 %	0 %	50 %	25 %	525840149
81495	NC_021814	CAG	2	6	4450685	4450690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840149
81496	NC_021814	CCA	2	6	4450693	4450698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840149
81497	NC_021814	CCG	2	6	4450702	4450707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840149
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81499	NC_021814	TGC	2	6	4450791	4450796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840149
81500	NC_021814	CGT	2	6	4450843	4450848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840149

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