MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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79002	NC_021814	T	7	7	4318768	4318774	0 %	100 %	0 %	0 %	525841254
79003	NC_021814	T	6	6	4318819	4318824	0 %	100 %	0 %	0 %	525841254
79004	NC_021814	TCC	2	6	4318861	4318866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525841254
79005	NC_021814	CGC	2	6	4319071	4319076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840056
79006	NC_021814	GCC	2	6	4319092	4319097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840056
79007	NC_021814	ATT	2	6	4319201	4319206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840056
79008	NC_021814	A	7	7	4319231	4319237	100 %	0 %	0 %	0 %	525840056
79009	NC_021814	AGC	2	6	4319325	4319330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840056
79010	NC_021814	TGG	2	6	4319361	4319366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840056
79011	NC_021814	TCG	2	6	4319454	4319459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840056
79012	NC_021814	CGG	2	6	4319472	4319477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840056
79013	NC_021814	AAG	2	6	4319496	4319501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840056
79014	NC_021814	ATC	2	6	4319517	4319522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840056
79015	NC_021814	CGGGTA	2	12	4319700	4319711	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525840056
79016	NC_021814	TTC	2	6	4319742	4319747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840056
79017	NC_021814	GAG	2	6	4319762	4319767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525840056
79018	NC_021814	GCA	2	6	4319827	4319832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840056
79019	NC_021814	TCA	2	6	4319851	4319856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840056
79020	NC_021814	CGG	3	9	4319881	4319889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840056
79021	NC_021814	GA	3	6	4319907	4319912	50 %	0 %	50 %	0 %	525840056
79022	NC_021814	TGA	2	6	4319944	4319949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840056
79023	NC_021814	ACG	2	6	4319965	4319970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840056
79024	NC_021814	CGC	2	6	4320067	4320072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840056
79025	NC_021814	AGC	2	6	4320248	4320253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840056
79026	NC_021814	A	6	6	4320262	4320267	100 %	0 %	0 %	0 %	525840056
79027	NC_021814	CGC	2	6	4320277	4320282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840056
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79029	NC_021814	CG	3	6	4320319	4320324	0 %	0 %	50 %	50 %	525840056
79030	NC_021814	AGG	2	6	4320501	4320506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525840056
79031	NC_021814	GTT	2	6	4320532	4320537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840056
79032	NC_021814	A	7	7	4320564	4320570	100 %	0 %	0 %	0 %	525840056
79033	NC_021814	ATC	2	6	4320593	4320598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840057
79034	NC_021814	TCT	2	6	4320612	4320617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840057
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79037	NC_021814	CATGAC	2	12	4320808	4320819	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525840057
79038	NC_021814	GA	3	6	4320862	4320867	50 %	0 %	50 %	0 %	525840057
79039	NC_021814	GTC	2	6	4320906	4320911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840057
79040	NC_021814	CGGG	2	8	4321100	4321107	0 %	0 %	75 %	25 %	525840058
79041	NC_021814	TGA	2	6	4321258	4321263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840058
79042	NC_021814	GGC	2	6	4321274	4321279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840058
79043	NC_021814	CTGG	2	8	4321364	4321371	0 %	25 %	50 %	25 %	525840058
79044	NC_021814	TAC	2	6	4321484	4321489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840058
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79046	NC_021814	CACTT	2	10	4321533	4321542	20 %	40 %	0 %	40 %	525840058
79047	NC_021814	GCA	2	6	4321555	4321560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840058
79048	NC_021814	GCA	2	6	4321644	4321649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840058
79049	NC_021814	AAC	2	6	4321667	4321672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525840058
79050	NC_021814	CAG	2	6	4321695	4321700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840058
79051	NC_021814	CAA	2	6	4327792	4327797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525840059
79052	NC_021814	TTC	2	6	4327883	4327888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840059
79053	NC_021814	GCT	2	6	4328043	4328048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840059
79054	NC_021814	TGG	2	6	4328053	4328058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840059
79055	NC_021814	GAA	2	6	4328065	4328070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840059
79056	NC_021814	TCA	2	6	4328076	4328081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840059
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79058	NC_021814	GCCT	2	8	4328128	4328135	0 %	25 %	25 %	50 %	525840059
79059	NC_021814	GGC	2	6	4328139	4328144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840059
79060	NC_021814	ACTT	2	8	4328332	4328339	25 %	50 %	0 %	25 %	525840059
79061	NC_021814	GGT	2	6	4328361	4328366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840059
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79065	NC_021814	A	6	6	4328502	4328507	100 %	0 %	0 %	0 %	525841255
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79067	NC_021814	TGGC	2	8	4328518	4328525	0 %	25 %	50 %	25 %	525841255
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79074	NC_021814	GC	3	6	4328770	4328775	0 %	0 %	50 %	50 %	525841255
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79085	NC_021814	CTA	2	6	4329204	4329209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525841255
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79087	NC_021814	T	6	6	4329338	4329343	0 %	100 %	0 %	0 %	525841255
79088	NC_021814	GGTT	2	8	4329362	4329369	0 %	50 %	50 %	0 %	525841255
79089	NC_021814	ATG	2	6	4329399	4329404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525841255
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79100	NC_021814	CAA	2	6	4329857	4329862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525841255
79101	NC_021814	TGT	2	6	4329932	4329937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840060
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79104	NC_021814	GC	3	6	4330039	4330044	0 %	0 %	50 %	50 %	525840060
79105	NC_021814	ATC	2	6	4330054	4330059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840060
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79464	NC_021814	AGC	2	6	4349264	4349269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840074
79465	NC_021814	ATC	2	6	4349359	4349364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840074
79466	NC_021814	CGGG	2	8	4349365	4349372	0 %	0 %	75 %	25 %	525840074
79467	NC_021814	AGC	2	6	4349489	4349494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840075
79468	NC_021814	CTG	2	6	4349758	4349763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840075
79469	NC_021814	ATCG	2	8	4349860	4349867	25 %	25 %	25 %	25 %	525840075
79470	NC_021814	ATC	2	6	4349950	4349955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840075
79471	NC_021814	CAT	2	6	4349997	4350002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840075
79472	NC_021814	CCA	2	6	4350059	4350064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840075
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79475	NC_021814	TTG	2	6	4350116	4350121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840075
79476	NC_021814	TGG	2	6	4350122	4350127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840075
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79481	NC_021814	TGC	2	6	4350351	4350356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840075
79482	NC_021814	GTGAA	2	10	4350395	4350404	40 %	20 %	40 %	0 %	525840075
79483	NC_021814	ACTG	2	8	4350420	4350427	25 %	25 %	25 %	25 %	525840075
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79485	NC_021814	CGTT	2	8	4350467	4350474	0 %	50 %	25 %	25 %	525840075
79486	NC_021814	A	6	6	4350610	4350615	100 %	0 %	0 %	0 %	525840075
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79488	NC_021814	GGC	2	6	4350660	4350665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840075
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79490	NC_021814	CTG	2	6	4350739	4350744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840075
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79492	NC_021814	GCA	2	6	4350777	4350782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840075
79493	NC_021814	GCA	2	6	4350799	4350804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840075
79494	NC_021814	CTG	2	6	4350862	4350867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840075
79495	NC_021814	ACG	2	6	4350929	4350934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840075
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79497	NC_021814	CGC	2	6	4351124	4351129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840076
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79499	NC_021814	CGAC	2	8	4351288	4351295	25 %	0 %	25 %	50 %	525840076
79500	NC_021814	GCT	2	6	4351337	4351342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840076

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