MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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78002	NC_021814	ATCA	2	8	4269179	4269186	50 %	25 %	0 %	25 %	525840018
78003	NC_021814	CTC	2	6	4269197	4269202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525840018
78004	NC_021814	T	7	7	4269225	4269231	0 %	100 %	0 %	0 %	525840018
78005	NC_021814	CGC	2	6	4269808	4269813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840019
78006	NC_021814	GCG	2	6	4269901	4269906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840019
78007	NC_021814	GAC	2	6	4269931	4269936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840019
78008	NC_021814	GC	3	6	4269945	4269950	0 %	0 %	50 %	50 %	525840019
78009	NC_021814	CTC	2	6	4269971	4269976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525840019
78010	NC_021814	GAT	2	6	4270006	4270011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840019
78011	NC_021814	GAC	2	6	4270096	4270101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840019
78012	NC_021814	CTC	2	6	4270103	4270108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525840019
78013	NC_021814	CGCC	2	8	4270116	4270123	0 %	0 %	25 %	75 %	525840019
78014	NC_021814	CTGG	2	8	4270139	4270146	0 %	25 %	50 %	25 %	525840019
78015	NC_021814	CGA	2	6	4270168	4270173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840019
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78017	NC_021814	GA	3	6	4270279	4270284	50 %	0 %	50 %	0 %	525840019
78018	NC_021814	ATCTTC	2	12	4270307	4270318	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525840019
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78021	NC_021814	CG	3	6	4270594	4270599	0 %	0 %	50 %	50 %	525840019
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78024	NC_021814	CAC	2	6	4270655	4270660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840019
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78044	NC_021814	CCA	2	6	4271326	4271331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840019
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78053	NC_021814	GTT	2	6	4271732	4271737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840019
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78055	NC_021814	GA	3	6	4272038	4272043	50 %	0 %	50 %	0 %	525840020
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78102	NC_021814	A	6	6	4274253	4274258	100 %	0 %	0 %	0 %	525840022
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78233	NC_021814	GTC	2	6	4282051	4282056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840028
78234	NC_021814	GAC	2	6	4282059	4282064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840028
78235	NC_021814	GCT	2	6	4282079	4282084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840028
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78237	NC_021814	ATC	2	6	4282191	4282196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840028
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78239	NC_021814	GC	3	6	4282228	4282233	0 %	0 %	50 %	50 %	525840028
78240	NC_021814	GCG	2	6	4282255	4282260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840028
78241	NC_021814	CGT	2	6	4282263	4282268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840028
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78244	NC_021814	GC	3	6	4282432	4282437	0 %	0 %	50 %	50 %	525840029
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78248	NC_021814	GGC	2	6	4282781	4282786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840029
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78252	NC_021814	AAC	2	6	4282912	4282917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525840029
78253	NC_021814	TTG	2	6	4282920	4282925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840029
78254	NC_021814	GCG	2	6	4282932	4282937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840029
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78261	NC_021814	GCGATT	2	12	4283264	4283275	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525841249
78262	NC_021814	GGC	2	6	4283281	4283286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525841249
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78264	NC_021814	A	6	6	4283420	4283425	100 %	0 %	0 %	0 %	525841249
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78275	NC_021814	ACG	2	6	4283733	4283738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525841249
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78294	NC_021814	TGT	2	6	4284335	4284340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525841250
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78301	NC_021814	GGTT	2	8	4284529	4284536	0 %	50 %	50 %	0 %	525841250
78302	NC_021814	GCCG	2	8	4284538	4284545	0 %	0 %	50 %	50 %	525841250
78303	NC_021814	GCT	2	6	4284582	4284587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841250
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78306	NC_021814	AAC	2	6	4284653	4284658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525841250
78307	NC_021814	GGT	2	6	4284660	4284665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525841250
78308	NC_021814	CTG	2	6	4284673	4284678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841250
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78313	NC_021814	CG	3	6	4284782	4284787	0 %	0 %	50 %	50 %	525841250
78314	NC_021814	GC	3	6	4284802	4284807	0 %	0 %	50 %	50 %	525841250
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78319	NC_021814	AAC	2	6	4284992	4284997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525841250
78320	NC_021814	GC	4	8	4285024	4285031	0 %	0 %	50 %	50 %	525841250
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78323	NC_021814	ATC	2	6	4285165	4285170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525841250
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78333	NC_021814	CAG	2	6	4286692	4286697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840030
78334	NC_021814	GAT	2	6	4286820	4286825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840030
78335	NC_021814	CTT	2	6	4286835	4286840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840030
78336	NC_021814	CGA	2	6	4286849	4286854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840030
78337	NC_021814	GAT	2	6	4286950	4286955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840030
78338	NC_021814	CAAAAT	2	12	4286980	4286991	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525840030
78339	NC_021814	AG	3	6	4286992	4286997	50 %	0 %	50 %	0 %	525840030
78340	NC_021814	GA	3	6	4287027	4287032	50 %	0 %	50 %	0 %	525840030
78341	NC_021814	GCC	2	6	4287044	4287049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840030
78342	NC_021814	GCC	2	6	4287125	4287130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840030
78343	NC_021814	TGCC	2	8	4287153	4287160	0 %	25 %	25 %	50 %	525840030
78344	NC_021814	GCG	2	6	4287161	4287166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840030
78345	NC_021814	TGC	2	6	4287210	4287215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840030
78346	NC_021814	A	6	6	4287267	4287272	100 %	0 %	0 %	0 %	525840030
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78348	NC_021814	CGG	2	6	4287339	4287344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840030
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78466	NC_021814	CAC	2	6	4292394	4292399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840034
78467	NC_021814	ATG	2	6	4292424	4292429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840034
78468	NC_021814	GCCA	2	8	4292469	4292476	25 %	0 %	25 %	50 %	525840034
78469	NC_021814	ATC	2	6	4292494	4292499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840034
78470	NC_021814	CGCC	2	8	4292525	4292532	0 %	0 %	25 %	75 %	525840034
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78472	NC_021814	CAC	2	6	4292559	4292564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840034
78473	NC_021814	CAG	2	6	4292565	4292570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840034
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78477	NC_021814	CGTT	2	8	4292668	4292675	0 %	50 %	25 %	25 %	525840035
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78481	NC_021814	GC	3	6	4292850	4292855	0 %	0 %	50 %	50 %	525840035
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78492	NC_021814	GC	3	6	4293272	4293277	0 %	0 %	50 %	50 %	525840035
78493	NC_021814	GGC	2	6	4293304	4293309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840035
78494	NC_021814	ATG	2	6	4293350	4293355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840035
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78496	NC_021814	CGCGC	2	10	4293487	4293496	0 %	0 %	40 %	60 %	525840035
78497	NC_021814	CAA	2	6	4293568	4293573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525840035
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78499	NC_021814	CTG	2	6	4293652	4293657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840035
78500	NC_021814	ACG	2	6	4293661	4293666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840035

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