MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
76001	NC_021814	TGA	2	6	4159089	4159094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525839931
76002	NC_021814	GC	3	6	4159096	4159101	0 %	0 %	50 %	50 %	525839931
76003	NC_021814	GGC	2	6	4159114	4159119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839931
76004	NC_021814	GGGCTG	2	12	4159123	4159134	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	525839931
76005	NC_021814	GCA	3	9	4159155	4159163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839931
76006	NC_021814	TGGG	2	8	4159196	4159203	0 %	25 %	75 %	0 %	525839931
76007	NC_021814	CGAT	2	8	4159384	4159391	25 %	25 %	25 %	25 %	525839932
76008	NC_021814	TGC	2	6	4159474	4159479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839932
76009	NC_021814	CTT	2	6	4159503	4159508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525839932
76010	NC_021814	AGCG	2	8	4159520	4159527	25 %	0 %	50 %	25 %	525839932
76011	NC_021814	GCCA	2	8	4159554	4159561	25 %	0 %	25 %	50 %	525839932
76012	NC_021814	GCG	2	6	4159612	4159617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839932
76013	NC_021814	ATC	2	6	4159633	4159638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839932
76014	NC_021814	CCA	2	6	4159643	4159648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525839932
76015	NC_021814	C	6	6	4159723	4159728	0 %	0 %	0 %	100 %	525839933
76016	NC_021814	GTC	2	6	4159732	4159737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839933
76017	NC_021814	ACG	2	6	4159766	4159771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839933
76018	NC_021814	CGG	2	6	4159807	4159812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839933
76019	NC_021814	TCA	2	6	4159839	4159844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839933
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76021	NC_021814	CAGC	2	8	4159958	4159965	25 %	0 %	25 %	50 %	525839933
76022	NC_021814	AGG	2	6	4159989	4159994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525839933
76023	NC_021814	TCG	2	6	4160122	4160127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839933
76024	NC_021814	GC	3	6	4160224	4160229	0 %	0 %	50 %	50 %	525839933
76025	NC_021814	GCC	2	6	4160237	4160242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839933
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76031	NC_021814	GCG	2	6	4160472	4160477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839934
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76035	NC_021814	GTA	2	6	4160558	4160563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525839934
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76042	NC_021814	T	7	7	4160875	4160881	0 %	100 %	0 %	0 %	525839934
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76049	NC_021814	TTC	2	6	4161468	4161473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525839935
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76052	NC_021814	GCG	2	6	4161574	4161579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839935
76053	NC_021814	AGTAC	2	10	4161587	4161596	40 %	20 %	20 %	20 %	525839935
76054	NC_021814	CGGA	2	8	4161601	4161608	25 %	0 %	50 %	25 %	525839935
76055	NC_021814	GGC	2	6	4161615	4161620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839935
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76059	NC_021814	TAC	2	6	4161753	4161758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839935
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76062	NC_021814	CTG	2	6	4161954	4161959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839935
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76081	NC_021814	CGA	2	6	4162654	4162659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839936
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76116	NC_021814	TTA	2	6	4164166	4164171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525839937
76117	NC_021814	CAT	2	6	4164219	4164224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839937
76118	NC_021814	TACC	2	8	4164457	4164464	25 %	25 %	0 %	50 %	525839938
76119	NC_021814	AAT	2	6	4164488	4164493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525839938
76120	NC_021814	GCC	2	6	4164530	4164535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839938
76121	NC_021814	GTT	2	6	4164593	4164598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525839938
76122	NC_021814	ATC	3	9	4164638	4164646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839938
76123	NC_021814	AGA	2	6	4164656	4164661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525839938
76124	NC_021814	GC	4	8	4164686	4164693	0 %	0 %	50 %	50 %	525839938
76125	NC_021814	CCA	2	6	4164698	4164703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525839938
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76127	NC_021814	TCA	2	6	4164969	4164974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839938
76128	NC_021814	ACA	2	6	4165020	4165025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525839938
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76131	NC_021814	AAAAT	2	10	4165188	4165197	80 %	20 %	0 %	0 %	525841229
76132	NC_021814	GGC	2	6	4165732	4165737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839939
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76134	NC_021814	GGC	2	6	4165808	4165813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839939
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76136	NC_021814	TCG	2	6	4166022	4166027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839939
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76143	NC_021814	CGG	2	6	4166241	4166246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839939
76144	NC_021814	CGC	2	6	4166266	4166271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839939
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76146	NC_021814	GTG	2	6	4166339	4166344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525839939
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76148	NC_021814	CTG	2	6	4166465	4166470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839939
76149	NC_021814	CG	3	6	4166527	4166532	0 %	0 %	50 %	50 %	525839939
76150	NC_021814	TGC	2	6	4166565	4166570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839939
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76201	NC_021814	ACA	2	6	4169278	4169283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525839942
76202	NC_021814	GCT	2	6	4169314	4169319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839942
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76215	NC_021814	GACC	2	8	4169908	4169915	25 %	0 %	25 %	50 %	525839942
76216	NC_021814	GC	3	6	4169945	4169950	0 %	0 %	50 %	50 %	525839942
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76220	NC_021814	GGCCG	2	10	4170109	4170118	0 %	0 %	60 %	40 %	525839942
76221	NC_021814	CGA	2	6	4170166	4170171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839942
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76223	NC_021814	GTC	2	6	4170200	4170205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839942
76224	NC_021814	GACA	2	8	4170288	4170295	50 %	0 %	25 %	25 %	525839942
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76226	NC_021814	CGC	2	6	4170357	4170362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839943
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76228	NC_021814	CTG	2	6	4170423	4170428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839943
76229	NC_021814	CGA	2	6	4170435	4170440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839943
76230	NC_021814	GC	3	6	4170534	4170539	0 %	0 %	50 %	50 %	525839943
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76454	NC_021814	A	6	6	4182760	4182765	100 %	0 %	0 %	0 %	525841233
76455	NC_021814	TCG	2	6	4182794	4182799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841233
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76470	NC_021814	CGC	2	6	4183653	4183658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839951
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76490	NC_021814	CGG	2	6	4184457	4184462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839953
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76492	NC_021814	CCG	2	6	4184509	4184514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839953
76493	NC_021814	GCTG	2	8	4184533	4184540	0 %	25 %	50 %	25 %	525839953
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76496	NC_021814	AAG	2	6	4184649	4184654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525839953
76497	NC_021814	GCC	2	6	4184671	4184676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839953
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