MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
64501	NC_021814	GCA	2	6	3520508	3520513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839485
64502	NC_021814	GCGA	2	8	3520634	3520641	25 %	0 %	50 %	25 %	525839485
64503	NC_021814	TTTC	2	8	3520649	3520656	0 %	75 %	0 %	25 %	525839485
64504	NC_021814	CCG	2	6	3520718	3520723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839485
64505	NC_021814	AT	3	6	3520747	3520752	50 %	50 %	0 %	0 %	525839485
64506	NC_021814	CGC	2	6	3520769	3520774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839485
64507	NC_021814	CAG	2	6	3520782	3520787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839485
64508	NC_021814	CGC	2	6	3520809	3520814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839485
64509	NC_021814	ATA	2	6	3520861	3520866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525839485
64510	NC_021814	ATC	2	6	3520881	3520886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839485
64511	NC_021814	GAT	2	6	3520887	3520892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525839485
64512	NC_021814	AGCCC	2	10	3520992	3521001	20 %	0 %	20 %	60 %	525839485
64513	NC_021814	AGT	2	6	3521021	3521026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525839485
64514	NC_021814	ATC	2	6	3521056	3521061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839485
64515	NC_021814	CCG	2	6	3521062	3521067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839485
64516	NC_021814	GGC	2	6	3521070	3521075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839485
64517	NC_021814	TTG	2	6	3521203	3521208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525839485
64518	NC_021814	CAGCG	2	10	3521301	3521310	20 %	0 %	40 %	40 %	525839485
64519	NC_021814	GAT	2	6	3521313	3521318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525839485
64520	NC_021814	ATG	2	6	3521323	3521328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525839485
64521	NC_021814	GCT	2	6	3521343	3521348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839485
64522	NC_021814	A	6	6	3521349	3521354	100 %	0 %	0 %	0 %	525839485
64523	NC_021814	CGTT	2	8	3521597	3521604	0 %	50 %	25 %	25 %	525841116
64524	NC_021814	GTA	2	6	3521616	3521621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525841116
64525	NC_021814	AGC	2	6	3521686	3521691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525841116
64526	NC_021814	ATA	2	6	3521722	3521727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525841116
64527	NC_021814	TCA	2	6	3521767	3521772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525841116
64528	NC_021814	CAC	2	6	3521793	3521798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525841116
64529	NC_021814	CTG	2	6	3521811	3521816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841116
64530	NC_021814	CG	3	6	3521851	3521856	0 %	0 %	50 %	50 %	525841116
64531	NC_021814	TCAT	2	8	3521899	3521906	25 %	50 %	0 %	25 %	525841116
64532	NC_021814	CAC	2	6	3521910	3521915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525841116
64533	NC_021814	CGG	2	6	3521943	3521948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525841116
64534	NC_021814	TCA	2	6	3521965	3521970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525841116
64535	NC_021814	TAT	2	6	3522023	3522028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525841116
64536	NC_021814	ACG	2	6	3522040	3522045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525841116
64537	NC_021814	TCC	2	6	3522091	3522096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525841116
64538	NC_021814	CGT	2	6	3522164	3522169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841116
64539	NC_021814	TGA	2	6	3522241	3522246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525841116
64540	NC_021814	AAC	2	6	3522262	3522267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525841116
64541	NC_021814	TCT	2	6	3522325	3522330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525841116
64542	NC_021814	CGT	2	6	3522363	3522368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841116
64543	NC_021814	GTA	2	6	3522390	3522395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525841116
64544	NC_021814	TCG	2	6	3522457	3522462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841116
64545	NC_021814	CAA	2	6	3522491	3522496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525841116
64546	NC_021814	TG	3	6	3522555	3522560	0 %	50 %	50 %	0 %	525841116
64547	NC_021814	CAT	2	6	3522570	3522575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525841116
64548	NC_021814	CATA	2	8	3522584	3522591	50 %	25 %	0 %	25 %	525841116
64549	NC_021814	AGT	2	6	3522618	3522623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525841116
64550	NC_021814	TAA	2	6	3522737	3522742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525841116
64551	NC_021814	CGG	2	6	3522834	3522839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525841116
64552	NC_021814	TG	3	6	3522847	3522852	0 %	50 %	50 %	0 %	525841116
64553	NC_021814	GCG	2	6	3522872	3522877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525841116
64554	NC_021814	GCCGT	2	10	3523066	3523075	0 %	20 %	40 %	40 %	525841116
64555	NC_021814	AAC	2	6	3523084	3523089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525841116
64556	NC_021814	ATT	2	6	3523173	3523178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525841116
64557	NC_021814	AGGA	2	8	3523215	3523222	50 %	0 %	50 %	0 %	525841116
64558	NC_021814	CAA	2	6	3523424	3523429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525839486
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64561	NC_021814	AAC	2	6	3523627	3523632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525839486
64562	NC_021814	GGAG	2	8	3523636	3523643	25 %	0 %	75 %	0 %	525839486
64563	NC_021814	GCG	2	6	3523655	3523660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839486
64564	NC_021814	CAT	2	6	3523725	3523730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839486
64565	NC_021814	GCC	2	6	3523734	3523739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839486
64566	NC_021814	TA	3	6	3523868	3523873	50 %	50 %	0 %	0 %	525839486
64567	NC_021814	CGG	2	6	3523877	3523882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839486
64568	NC_021814	ATA	2	6	3523901	3523906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525839486
64569	NC_021814	GCG	2	6	3523911	3523916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839486
64570	NC_021814	CGGA	2	8	3523961	3523968	25 %	0 %	50 %	25 %	525839486
64571	NC_021814	TTC	2	6	3523974	3523979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525839486
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64577	NC_021814	CG	3	6	3524241	3524246	0 %	0 %	50 %	50 %	525839486
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64582	NC_021814	CGC	2	6	3524454	3524459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839486
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64584	NC_021814	CAAA	2	8	3524650	3524657	75 %	0 %	0 %	25 %	525839487
64585	NC_021814	A	6	6	3524737	3524742	100 %	0 %	0 %	0 %	525839487
64586	NC_021814	CA	3	6	3524756	3524761	50 %	0 %	0 %	50 %	525839487
64587	NC_021814	A	6	6	3524797	3524802	100 %	0 %	0 %	0 %	525839487
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64591	NC_021814	GCC	2	6	3525070	3525075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839487
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64601	NC_021814	TGA	2	6	3525683	3525688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525839487
64602	NC_021814	T	6	6	3525724	3525729	0 %	100 %	0 %	0 %	525839487
64603	NC_021814	TTTC	2	8	3525746	3525753	0 %	75 %	0 %	25 %	525839487
64604	NC_021814	AC	3	6	3525786	3525791	50 %	0 %	0 %	50 %	525839487
64605	NC_021814	CGGT	2	8	3525797	3525804	0 %	25 %	50 %	25 %	525839487
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64609	NC_021814	CGAT	2	8	3526125	3526132	25 %	25 %	25 %	25 %	525839488
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64616	NC_021814	TGC	2	6	3526671	3526676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839488
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64711	NC_021814	CA	3	6	3532935	3532940	50 %	0 %	0 %	50 %	525841119
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64713	NC_021814	T	7	7	3533013	3533019	0 %	100 %	0 %	0 %	525841119
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64718	NC_021814	TGC	2	6	3533729	3533734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841120
64719	NC_021814	TCCC	2	8	3533769	3533776	0 %	25 %	0 %	75 %	525841120
64720	NC_021814	CAT	3	9	3533805	3533813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525841120
64721	NC_021814	TAA	2	6	3533824	3533829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525841120
64722	NC_021814	ATA	2	6	3533870	3533875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525841120
64723	NC_021814	TTG	2	6	3533948	3533953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525841120
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64725	NC_021814	AAT	2	6	3534045	3534050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525841120
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64731	NC_021814	TCCT	2	8	3534430	3534437	0 %	50 %	0 %	50 %	525841120
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