MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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64003	NC_021814	GCC	2	6	3494578	3494583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839464
64004	NC_021814	CAA	2	6	3494662	3494667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525839465
64005	NC_021814	CTG	2	6	3494713	3494718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839465
64006	NC_021814	AAT	2	6	3494785	3494790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525839465
64007	NC_021814	GCC	2	6	3494805	3494810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839465
64008	NC_021814	CCAT	2	8	3494880	3494887	25 %	25 %	0 %	50 %	525839465
64009	NC_021814	CGC	2	6	3494987	3494992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839465
64010	NC_021814	GGC	2	6	3495082	3495087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839465
64011	NC_021814	CG	3	6	3495096	3495101	0 %	0 %	50 %	50 %	525839465
64012	NC_021814	TCC	2	6	3495113	3495118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525839465
64013	NC_021814	ACA	2	6	3495141	3495146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525839465
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64017	NC_021814	GC	3	6	3495274	3495279	0 %	0 %	50 %	50 %	525839466
64018	NC_021814	GTT	2	6	3495287	3495292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525839466
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64020	NC_021814	GCA	2	6	3495316	3495321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839466
64021	NC_021814	CG	3	6	3495346	3495351	0 %	0 %	50 %	50 %	525839466
64022	NC_021814	CCA	2	6	3495428	3495433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525839466
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64028	NC_021814	CGTTAA	2	12	3495551	3495562	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525839466
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64035	NC_021814	CCCA	2	8	3495777	3495784	25 %	0 %	0 %	75 %	525839466
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64051	NC_021814	ACG	2	6	3496781	3496786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839467
64052	NC_021814	GCG	2	6	3496814	3496819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839467
64053	NC_021814	CTT	2	6	3496845	3496850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525839467
64054	NC_021814	CTTC	2	8	3496944	3496951	0 %	50 %	0 %	50 %	525839467
64055	NC_021814	CTT	2	6	3496959	3496964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525839467
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64059	NC_021814	CG	3	6	3497013	3497018	0 %	0 %	50 %	50 %	525839467
64060	NC_021814	GCA	2	6	3497025	3497030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839467
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64072	NC_021814	GC	3	6	3497669	3497674	0 %	0 %	50 %	50 %	525839468
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64084	NC_021814	CGA	2	6	3498040	3498045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839469
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64088	NC_021814	A	7	7	3498355	3498361	100 %	0 %	0 %	0 %	525839469
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64116	NC_021814	CTG	2	6	3500007	3500012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839470
64117	NC_021814	TGT	2	6	3500018	3500023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525839470
64118	NC_021814	CGG	2	6	3500048	3500053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839470
64119	NC_021814	ACT	2	6	3500065	3500070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839470
64120	NC_021814	TTG	2	6	3500089	3500094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525839470
64121	NC_021814	CTT	2	6	3500159	3500164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525839470
64122	NC_021814	ATC	2	6	3500229	3500234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839470
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64124	NC_021814	ATC	2	6	3500339	3500344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839470
64125	NC_021814	CGG	2	6	3500375	3500380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839470
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64128	NC_021814	A	7	7	3500509	3500515	100 %	0 %	0 %	0 %	525839470
64129	NC_021814	TAC	2	6	3500682	3500687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839471
64130	NC_021814	CTT	2	6	3500791	3500796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525839471
64131	NC_021814	CGC	2	6	3500809	3500814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839471
64132	NC_021814	CG	3	6	3500823	3500828	0 %	0 %	50 %	50 %	525839471
64133	NC_021814	CGT	2	6	3500836	3500841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839471
64134	NC_021814	GAC	2	6	3500843	3500848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839471
64135	NC_021814	GCC	3	9	3500873	3500881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839471
64136	NC_021814	CCA	2	6	3500896	3500901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525839471
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64138	NC_021814	CCA	2	6	3500963	3500968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525839472
64139	NC_021814	TGA	2	6	3500996	3501001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525839472
64140	NC_021814	TGC	2	6	3501004	3501009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839472
64141	NC_021814	GCC	2	6	3501015	3501020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839472
64142	NC_021814	GCG	2	6	3501061	3501066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839472
64143	NC_021814	CTGCGC	2	12	3501111	3501122	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	525839472
64144	NC_021814	A	6	6	3501129	3501134	100 %	0 %	0 %	0 %	525839472
64145	NC_021814	TGC	2	6	3501163	3501168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839472
64146	NC_021814	GTG	2	6	3501210	3501215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525839472
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64148	NC_021814	CG	3	6	3501231	3501236	0 %	0 %	50 %	50 %	525839472
64149	NC_021814	GC	3	6	3501328	3501333	0 %	0 %	50 %	50 %	525839472
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64152	NC_021814	CTG	2	6	3501408	3501413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839472
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64155	NC_021814	CCTGCA	2	12	3501518	3501529	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525839472
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64347	NC_021814	GAAC	2	8	3511524	3511531	50 %	0 %	25 %	25 %	525839481
64348	NC_021814	TGC	2	6	3511612	3511617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839481
64349	NC_021814	CAC	2	6	3511653	3511658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525839481
64350	NC_021814	CAG	2	6	3511713	3511718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839481
64351	NC_021814	GC	3	6	3511722	3511727	0 %	0 %	50 %	50 %	525839481
64352	NC_021814	ACG	2	6	3511740	3511745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839481
64353	NC_021814	GCA	2	6	3511756	3511761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839481
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64355	NC_021814	TCA	2	6	3511850	3511855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839481
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64359	NC_021814	TGG	2	6	3512081	3512086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525839481
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64361	NC_021814	CAC	2	6	3512176	3512181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525839481
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64363	NC_021814	GCA	2	6	3512249	3512254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839481
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64378	NC_021814	T	6	6	3513570	3513575	0 %	100 %	0 %	0 %	525839481
64379	NC_021814	ATG	2	6	3513586	3513591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525839481
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64384	NC_021814	TCA	2	6	3513822	3513827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839482
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64423	NC_021814	TGA	2	6	3516295	3516300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525841115
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64449	NC_021814	CA	3	6	3517416	3517421	50 %	0 %	0 %	50 %	525839483
64450	NC_021814	ATC	2	6	3517474	3517479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839483
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64456	NC_021814	GCT	2	6	3517930	3517935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839483
64457	NC_021814	CTT	2	6	3517993	3517998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525839483
64458	NC_021814	GC	3	6	3518033	3518038	0 %	0 %	50 %	50 %	525839483
64459	NC_021814	GGCT	2	8	3518159	3518166	0 %	25 %	50 %	25 %	525839483
64460	NC_021814	ACTT	2	8	3518219	3518226	25 %	50 %	0 %	25 %	525839483
64461	NC_021814	GC	4	8	3518244	3518251	0 %	0 %	50 %	50 %	525839483
64462	NC_021814	TACGAC	2	12	3518342	3518353	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525839483
64463	NC_021814	GCCGG	2	10	3518369	3518378	0 %	0 %	60 %	40 %	525839483
64464	NC_021814	T	6	6	3518423	3518428	0 %	100 %	0 %	0 %	525839483
64465	NC_021814	CTGGT	2	10	3518510	3518519	0 %	40 %	40 %	20 %	525839483
64466	NC_021814	CTC	2	6	3518533	3518538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525839483
64467	NC_021814	TGC	2	6	3518563	3518568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839483
64468	NC_021814	GTG	2	6	3518599	3518604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525839483
64469	NC_021814	GAC	2	6	3518605	3518610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839483
64470	NC_021814	CGG	2	6	3518617	3518622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839483
64471	NC_021814	TGG	2	6	3518629	3518634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525839483
64472	NC_021814	GGA	2	6	3518887	3518892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525839483
64473	NC_021814	CTG	2	6	3518996	3519001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839483
64474	NC_021814	CATG	2	8	3519013	3519020	25 %	25 %	25 %	25 %	525839483
64475	NC_021814	AGG	2	6	3519097	3519102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525839483
64476	NC_021814	TACGC	2	10	3519116	3519125	20 %	20 %	20 %	40 %	525839483
64477	NC_021814	AGT	2	6	3519268	3519273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525839484
64478	NC_021814	CCG	2	6	3519295	3519300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839484
64479	NC_021814	TC	3	6	3519314	3519319	0 %	50 %	0 %	50 %	525839484
64480	NC_021814	TTC	2	6	3519338	3519343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525839484
64481	NC_021814	CAT	2	6	3519466	3519471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839484
64482	NC_021814	CAA	2	6	3519521	3519526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525839484
64483	NC_021814	CAGG	3	12	3519578	3519589	25 %	0 %	50 %	25 %	525839484
64484	NC_021814	CTG	2	6	3519668	3519673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839484
64485	NC_021814	GCTG	2	8	3519718	3519725	0 %	25 %	50 %	25 %	525839484
64486	NC_021814	CGTG	2	8	3519745	3519752	0 %	25 %	50 %	25 %	525839484
64487	NC_021814	CCA	3	9	3519784	3519792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525839484
64488	NC_021814	CCG	2	6	3519793	3519798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839484
64489	NC_021814	GCT	2	6	3519809	3519814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839484
64490	NC_021814	ACA	2	6	3519856	3519861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525839484
64491	NC_021814	GCG	2	6	3520042	3520047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839484
64492	NC_021814	CTT	2	6	3520084	3520089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525839484
64493	NC_021814	ATA	2	6	3520106	3520111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525839484
64494	NC_021814	CG	4	8	3520225	3520232	0 %	0 %	50 %	50 %	525839485
64495	NC_021814	CAC	2	6	3520248	3520253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525839485
64496	NC_021814	TAA	2	6	3520298	3520303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525839485
64497	NC_021814	CA	3	6	3520367	3520372	50 %	0 %	0 %	50 %	525839485
64498	NC_021814	GCCA	2	8	3520441	3520448	25 %	0 %	25 %	50 %	525839485
64499	NC_021814	CAG	2	6	3520482	3520487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839485
64500	NC_021814	AAT	2	6	3520494	3520499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525839485

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