MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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63002	NC_021814	TGG	2	6	3441053	3441058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525839423
63003	NC_021814	GGA	2	6	3441063	3441068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525839423
63004	NC_021814	GCT	2	6	3441078	3441083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839423
63005	NC_021814	GAA	2	6	3441105	3441110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525839423
63006	NC_021814	ACA	2	6	3441140	3441145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525839423
63007	NC_021814	CTG	2	6	3441148	3441153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839423
63008	NC_021814	AAACT	2	10	3441167	3441176	60 %	20 %	0 %	20 %	525839423
63009	NC_021814	GCG	2	6	3441188	3441193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839423
63010	NC_021814	CGG	2	6	3441219	3441224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839423
63011	NC_021814	AAGC	2	8	3441285	3441292	50 %	0 %	25 %	25 %	525839423
63012	NC_021814	CCG	2	6	3441301	3441306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839423
63013	NC_021814	GGGCTG	2	12	3441382	3441393	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	525839423
63014	NC_021814	CGC	2	6	3441428	3441433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839423
63015	NC_021814	GGC	2	6	3441450	3441455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839423
63016	NC_021814	ACGGTG	2	12	3441460	3441471	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525839423
63017	NC_021814	ACC	2	6	3441538	3441543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525839423
63018	NC_021814	ATT	2	6	3441559	3441564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525839423
63019	NC_021814	GAAGA	2	10	3441565	3441574	60 %	0 %	40 %	0 %	525839423
63020	NC_021814	CGC	3	9	3441585	3441593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839423
63021	NC_021814	TTAC	2	8	3441612	3441619	25 %	50 %	0 %	25 %	525839423
63022	NC_021814	AGC	2	6	3441653	3441658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839423
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63026	NC_021814	GCC	2	6	3441906	3441911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839424
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63030	NC_021814	CGG	2	6	3442069	3442074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839424
63031	NC_021814	CG	3	6	3442086	3442091	0 %	0 %	50 %	50 %	525839424
63032	NC_021814	GCT	2	6	3442124	3442129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839424
63033	NC_021814	GCTG	2	8	3442207	3442214	0 %	25 %	50 %	25 %	525839424
63034	NC_021814	T	6	6	3442293	3442298	0 %	100 %	0 %	0 %	525839424
63035	NC_021814	TGC	2	6	3442324	3442329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839424
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63039	NC_021814	GCC	2	6	3442429	3442434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839424
63040	NC_021814	CGG	3	9	3442502	3442510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839424
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63042	NC_021814	CCCG	2	8	3442569	3442576	0 %	0 %	25 %	75 %	525839424
63043	NC_021814	CG	3	6	3442575	3442580	0 %	0 %	50 %	50 %	525839424
63044	NC_021814	CTG	2	6	3442607	3442612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839424
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63047	NC_021814	TTA	2	6	3442728	3442733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525839424
63048	NC_021814	GCT	5	15	3442745	3442759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839424
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63050	NC_021814	GTG	2	6	3442776	3442781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525839424
63051	NC_021814	GGC	2	6	3442868	3442873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839424
63052	NC_021814	TG	4	8	3442882	3442889	0 %	50 %	50 %	0 %	525839424
63053	NC_021814	ATG	2	6	3442899	3442904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525839424
63054	NC_021814	CTG	2	6	3442905	3442910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839424
63055	NC_021814	ACGCCA	2	12	3442928	3442939	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	525839424
63056	NC_021814	CTT	2	6	3443018	3443023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525839424
63057	NC_021814	CCG	2	6	3443059	3443064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839424
63058	NC_021814	CGT	2	6	3443285	3443290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839424
63059	NC_021814	CAG	2	6	3443340	3443345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839424
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63061	NC_021814	TGAT	2	8	3443456	3443463	25 %	50 %	25 %	0 %	525839424
63062	NC_021814	CAT	2	6	3443479	3443484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839425
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63065	NC_021814	CGA	2	6	3443625	3443630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839425
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63084	NC_021814	GGAA	2	8	3444450	3444457	50 %	0 %	50 %	0 %	525839426
63085	NC_021814	CGG	2	6	3444501	3444506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839426
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63088	NC_021814	CAG	2	6	3444666	3444671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839426
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63091	NC_021814	CCAG	2	8	3444776	3444783	25 %	0 %	25 %	50 %	525839426
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63101	NC_021814	CAA	2	6	3445444	3445449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525839427
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63104	NC_021814	GC	3	6	3445546	3445551	0 %	0 %	50 %	50 %	525839427
63105	NC_021814	TGA	2	6	3445682	3445687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525839427
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63108	NC_021814	AT	3	6	3445710	3445715	50 %	50 %	0 %	0 %	525839427
63109	NC_021814	GACA	2	8	3445725	3445732	50 %	0 %	25 %	25 %	525839427
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63111	NC_021814	AT	3	6	3445787	3445792	50 %	50 %	0 %	0 %	525839427
63112	NC_021814	CGAT	2	8	3445811	3445818	25 %	25 %	25 %	25 %	525839427
63113	NC_021814	A	7	7	3445819	3445825	100 %	0 %	0 %	0 %	525839427
63114	NC_021814	GCAATT	2	12	3446267	3446278	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525839428
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63116	NC_021814	CGA	2	6	3446335	3446340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839428
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63233	NC_021814	CTG	2	6	3452412	3452417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839433
63234	NC_021814	CGCC	2	8	3452454	3452461	0 %	0 %	25 %	75 %	525839433
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63239	NC_021814	GCT	2	6	3452738	3452743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839433
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63465	NC_021814	CAG	2	6	3464343	3464348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839440
63466	NC_021814	CCATGA	2	12	3464353	3464364	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525839440
63467	NC_021814	GT	3	6	3464404	3464409	0 %	50 %	50 %	0 %	525839440
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63492	NC_021814	TCG	2	6	3466516	3466521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839443
63493	NC_021814	CTGG	2	8	3466526	3466533	0 %	25 %	50 %	25 %	525839443
63494	NC_021814	CTG	2	6	3466534	3466539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839443
63495	NC_021814	GAC	2	6	3466602	3466607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839443
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63497	NC_021814	GGCA	2	8	3466647	3466654	25 %	0 %	50 %	25 %	525839443
63498	NC_021814	CGC	2	6	3466704	3466709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839443
63499	NC_021814	ATTA	2	8	3466723	3466730	50 %	50 %	0 %	0 %	525839443
63500	NC_021814	TAA	2	6	3467036	3467041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525839444

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