MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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61502	NC_021814	ACC	2	6	3363503	3363508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525839361
61503	NC_021814	GA	3	6	3363570	3363575	50 %	0 %	50 %	0 %	525839361
61504	NC_021814	CCCGCG	2	12	3363700	3363711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839362
61505	NC_021814	CAG	2	6	3363730	3363735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839362
61506	NC_021814	AGC	2	6	3363742	3363747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839362
61507	NC_021814	CGT	2	6	3363772	3363777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839362
61508	NC_021814	CAT	2	6	3363789	3363794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839362
61509	NC_021814	CGG	2	6	3363871	3363876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839362
61510	NC_021814	CAG	2	6	3363877	3363882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839362
61511	NC_021814	AGGT	2	8	3363908	3363915	25 %	25 %	50 %	0 %	525839362
61512	NC_021814	GCG	2	6	3363918	3363923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839362
61513	NC_021814	CAG	2	6	3363982	3363987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839362
61514	NC_021814	CG	3	6	3364110	3364115	0 %	0 %	50 %	50 %	525839362
61515	NC_021814	CGC	3	9	3364119	3364127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839362
61516	NC_021814	GAT	2	6	3364141	3364146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525839362
61517	NC_021814	CAG	2	6	3364171	3364176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839362
61518	NC_021814	A	6	6	3364207	3364212	100 %	0 %	0 %	0 %	525839362
61519	NC_021814	GAC	2	6	3364214	3364219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839362
61520	NC_021814	CAT	2	6	3364252	3364257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839362
61521	NC_021814	ATA	2	6	3364337	3364342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525839362
61522	NC_021814	TGA	2	6	3364359	3364364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525839362
61523	NC_021814	GGC	2	6	3364367	3364372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839362
61524	NC_021814	CAT	2	6	3364453	3364458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839362
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61526	NC_021814	TTA	2	6	3364519	3364524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525839363
61527	NC_021814	GCTC	2	8	3364550	3364557	0 %	25 %	25 %	50 %	525839363
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61531	NC_021814	GTGG	2	8	3364800	3364807	0 %	25 %	75 %	0 %	525839363
61532	NC_021814	AAT	2	6	3364812	3364817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525839363
61533	NC_021814	GTG	2	6	3364819	3364824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525839363
61534	NC_021814	CGCC	2	8	3364883	3364890	0 %	0 %	25 %	75 %	525839363
61535	NC_021814	GC	3	6	3364931	3364936	0 %	0 %	50 %	50 %	525839363
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61538	NC_021814	CG	4	8	3364978	3364985	0 %	0 %	50 %	50 %	525839363
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61541	NC_021814	TTA	2	6	3365212	3365217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525839363
61542	NC_021814	ATA	2	6	3365230	3365235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525839363
61543	NC_021814	TGG	2	6	3365240	3365245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525839363
61544	NC_021814	CGC	2	6	3365330	3365335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839363
61545	NC_021814	T	7	7	3365345	3365351	0 %	100 %	0 %	0 %	525839363
61546	NC_021814	GTT	2	6	3365354	3365359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525839363
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61550	NC_021814	T	6	6	3365562	3365567	0 %	100 %	0 %	0 %	525839364
61551	NC_021814	GCGCAA	2	12	3365577	3365588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839364
61552	NC_021814	TGGAT	2	10	3365604	3365613	20 %	40 %	40 %	0 %	525839364
61553	NC_021814	TTGT	2	8	3365667	3365674	0 %	75 %	25 %	0 %	525839364
61554	NC_021814	TC	3	6	3365720	3365725	0 %	50 %	0 %	50 %	525839364
61555	NC_021814	GCG	2	6	3365791	3365796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839364
61556	NC_021814	TAA	2	6	3365837	3365842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525839364
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61564	NC_021814	CAC	2	6	3366225	3366230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525839365
61565	NC_021814	CAG	2	6	3366360	3366365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839365
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61587	NC_021814	AAG	2	6	3367535	3367540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525839366
61588	NC_021814	CGC	2	6	3367671	3367676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839366
61589	NC_021814	TAT	2	6	3367818	3367823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525839366
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61599	NC_021814	A	6	6	3368569	3368574	100 %	0 %	0 %	0 %	525839366
61600	NC_021814	TC	3	6	3368577	3368582	0 %	50 %	0 %	50 %	525839366
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61612	NC_021814	CCG	2	6	3369200	3369205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839366
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61963	NC_021814	CTT	2	6	3386036	3386041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525839380
61964	NC_021814	CG	3	6	3386072	3386077	0 %	0 %	50 %	50 %	525839380
61965	NC_021814	GAT	2	6	3386127	3386132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525839380
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61967	NC_021814	CACTTT	2	12	3386220	3386231	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525839380
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