MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
61001	NC_021814	CGC	2	6	3339257	3339262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839343
61002	NC_021814	GTG	2	6	3339321	3339326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525839343
61003	NC_021814	ACC	2	6	3339370	3339375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525839343
61004	NC_021814	CACGC	2	10	3339418	3339427	20 %	0 %	20 %	60 %	525839343
61005	NC_021814	GC	3	6	3339437	3339442	0 %	0 %	50 %	50 %	525839343
61006	NC_021814	CGA	2	6	3339443	3339448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839343
61007	NC_021814	GGC	2	6	3339465	3339470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839343
61008	NC_021814	GC	3	6	3339485	3339490	0 %	0 %	50 %	50 %	525839343
61009	NC_021814	GC	3	6	3339530	3339535	0 %	0 %	50 %	50 %	525839343
61010	NC_021814	CAG	2	6	3339627	3339632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839343
61011	NC_021814	GCTG	2	8	3339653	3339660	0 %	25 %	50 %	25 %	525839343
61012	NC_021814	ATC	2	6	3339670	3339675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839343
61013	NC_021814	ATG	2	6	3339682	3339687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525839343
61014	NC_021814	CAGC	2	8	3339759	3339766	25 %	0 %	25 %	50 %	525839343
61015	NC_021814	GGC	2	6	3339768	3339773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839343
61016	NC_021814	AACA	2	8	3339774	3339781	75 %	0 %	0 %	25 %	525839343
61017	NC_021814	GGC	2	6	3339806	3339811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839343
61018	NC_021814	CGC	2	6	3339869	3339874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839343
61019	NC_021814	CGG	2	6	3339976	3339981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839344
61020	NC_021814	GCG	2	6	3340030	3340035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839344
61021	NC_021814	CTT	2	6	3340093	3340098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525839344
61022	NC_021814	CGAT	2	8	3340113	3340120	25 %	25 %	25 %	25 %	525839344
61023	NC_021814	CCG	2	6	3340126	3340131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839344
61024	NC_021814	CCT	2	6	3340192	3340197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525839344
61025	NC_021814	CGT	2	6	3340247	3340252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839344
61026	NC_021814	C	6	6	3340268	3340273	0 %	0 %	0 %	100 %	525839344
61027	NC_021814	GCG	2	6	3340274	3340279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839344
61028	NC_021814	CTGG	2	8	3340295	3340302	0 %	25 %	50 %	25 %	525839344
61029	NC_021814	AGCG	2	8	3340377	3340384	25 %	0 %	50 %	25 %	525839344
61030	NC_021814	GACCA	2	10	3340482	3340491	40 %	0 %	20 %	40 %	525839344
61031	NC_021814	ACG	2	6	3340495	3340500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839344
61032	NC_021814	CAG	2	6	3340514	3340519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839344
61033	NC_021814	ATCA	2	8	3340550	3340557	50 %	25 %	0 %	25 %	525839344
61034	NC_021814	CGG	2	6	3340571	3340576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839344
61035	NC_021814	CGCCA	2	10	3340610	3340619	20 %	0 %	20 %	60 %	525839344
61036	NC_021814	CAG	3	9	3340640	3340648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839344
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61038	NC_021814	CAG	2	6	3340724	3340729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839344
61039	NC_021814	TAA	2	6	3340751	3340756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525839344
61040	NC_021814	CGG	2	6	3340758	3340763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839344
61041	NC_021814	CGCC	2	8	3340815	3340822	0 %	0 %	25 %	75 %	525841102
61042	NC_021814	CCG	2	6	3340916	3340921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841102
61043	NC_021814	AAT	2	6	3340935	3340940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525841102
61044	NC_021814	GCC	2	6	3340952	3340957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841102
61045	NC_021814	GCA	2	6	3340971	3340976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525841102
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61047	NC_021814	CAG	3	9	3341074	3341082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525841102
61048	NC_021814	CG	3	6	3341119	3341124	0 %	0 %	50 %	50 %	525841102
61049	NC_021814	CCG	2	6	3341135	3341140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841102
61050	NC_021814	GC	3	6	3341238	3341243	0 %	0 %	50 %	50 %	525841102
61051	NC_021814	CCA	2	6	3341268	3341273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525841102
61052	NC_021814	TTCC	2	8	3341289	3341296	0 %	50 %	0 %	50 %	525841102
61053	NC_021814	TTG	2	6	3341308	3341313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525841102
61054	NC_021814	TGC	2	6	3341346	3341351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841102
61055	NC_021814	GGC	2	6	3341399	3341404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525841102
61056	NC_021814	GGC	2	6	3341409	3341414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525841102
61057	NC_021814	GGT	2	6	3341554	3341559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525841102
61058	NC_021814	GAAT	2	8	3341564	3341571	50 %	25 %	25 %	0 %	525841102
61059	NC_021814	AGC	2	6	3341703	3341708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839345
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61061	NC_021814	GAC	2	6	3341794	3341799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839345
61062	NC_021814	CATC	2	8	3341802	3341809	25 %	25 %	0 %	50 %	525839345
61063	NC_021814	CGCTG	2	10	3341812	3341821	0 %	20 %	40 %	40 %	525839345
61064	NC_021814	ACG	2	6	3341934	3341939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839345
61065	NC_021814	TGC	2	6	3342049	3342054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839345
61066	NC_021814	GTTG	2	8	3342115	3342122	0 %	50 %	50 %	0 %	525839345
61067	NC_021814	CGG	2	6	3342126	3342131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839345
61068	NC_021814	AAC	3	9	3342172	3342180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525839345
61069	NC_021814	TGG	2	6	3342362	3342367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525839345
61070	NC_021814	AT	3	6	3342380	3342385	50 %	50 %	0 %	0 %	525839345
61071	NC_021814	GCC	2	6	3342448	3342453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839345
61072	NC_021814	ATTCC	2	10	3342472	3342481	20 %	40 %	0 %	40 %	525839345
61073	NC_021814	TGTT	2	8	3342505	3342512	0 %	75 %	25 %	0 %	525839345
61074	NC_021814	GCC	2	6	3342541	3342546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839345
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61076	NC_021814	TACGCA	2	12	3342624	3342635	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525839345
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61078	NC_021814	T	6	6	3342795	3342800	0 %	100 %	0 %	0 %	525839345
61079	NC_021814	CCA	2	6	3342879	3342884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525839345
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61081	NC_021814	CAGC	2	8	3342985	3342992	25 %	0 %	25 %	50 %	525839345
61082	NC_021814	GTA	2	6	3342994	3342999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525839345
61083	NC_021814	GTTC	2	8	3343011	3343018	0 %	50 %	25 %	25 %	525839345
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61085	NC_021814	TGC	2	6	3343112	3343117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839345
61086	NC_021814	GTCC	2	8	3343213	3343220	0 %	25 %	25 %	50 %	525839345
61087	NC_021814	TGAAT	2	10	3343227	3343236	40 %	40 %	20 %	0 %	525839345
61088	NC_021814	AGT	2	6	3343252	3343257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525839345
61089	NC_021814	GGAC	2	8	3343311	3343318	25 %	0 %	50 %	25 %	525839345
61090	NC_021814	TCAAC	2	10	3343332	3343341	40 %	20 %	0 %	40 %	525839345
61091	NC_021814	GTT	2	6	3343414	3343419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525839345
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61094	NC_021814	ACTG	2	8	3343529	3343536	25 %	25 %	25 %	25 %	525839345
61095	NC_021814	TGCATC	2	12	3343544	3343555	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525839345
61096	NC_021814	ACC	2	6	3343568	3343573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525839345
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61098	NC_021814	TGG	4	12	3343614	3343625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525839345
61099	NC_021814	TCT	2	6	3343706	3343711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525839345
61100	NC_021814	CCG	2	6	3343722	3343727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839345
61101	NC_021814	AGAC	2	8	3343737	3343744	50 %	0 %	25 %	25 %	525839345
61102	NC_021814	CTA	2	6	3343764	3343769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839345
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61104	NC_021814	GCC	2	6	3344123	3344128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841103
61105	NC_021814	CTCTT	2	10	3344163	3344172	0 %	60 %	0 %	40 %	525841103
61106	NC_021814	CGG	2	6	3344177	3344182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525841103
61107	NC_021814	TGC	2	6	3344187	3344192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841103
61108	NC_021814	GCT	2	6	3344197	3344202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841103
61109	NC_021814	GAC	2	6	3344211	3344216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525841103
61110	NC_021814	GCT	3	9	3344239	3344247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841103
61111	NC_021814	TGC	2	6	3344250	3344255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841103
61112	NC_021814	ATC	2	6	3344256	3344261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525841103
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61114	NC_021814	CGTC	2	8	3344290	3344297	0 %	25 %	25 %	50 %	525841103
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61116	NC_021814	CGT	2	6	3344341	3344346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841103
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61343	NC_021814	CG	3	6	3354493	3354498	0 %	0 %	50 %	50 %	525839353
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61345	NC_021814	GC	3	6	3354509	3354514	0 %	0 %	50 %	50 %	525839353
61346	NC_021814	TGCG	2	8	3354596	3354603	0 %	25 %	50 %	25 %	525839353
61347	NC_021814	GGC	2	6	3354628	3354633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839353
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61465	NC_021814	CA	3	6	3361826	3361831	50 %	0 %	0 %	50 %	525839360
61466	NC_021814	CGG	2	6	3361844	3361849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839360
61467	NC_021814	CAA	2	6	3361917	3361922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525839360
61468	NC_021814	GCG	2	6	3361939	3361944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839360
61469	NC_021814	AGCC	2	8	3361977	3361984	25 %	0 %	25 %	50 %	525839360
61470	NC_021814	CGGCG	2	10	3361991	3362000	0 %	0 %	60 %	40 %	525839360
61471	NC_021814	TTAA	2	8	3362004	3362011	50 %	50 %	0 %	0 %	525839360
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61481	NC_021814	CTG	3	9	3362379	3362387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839360
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61493	NC_021814	TCG	2	6	3362871	3362876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839361
61494	NC_021814	GAC	2	6	3363043	3363048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839361
61495	NC_021814	GCA	2	6	3363081	3363086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839361
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61499	NC_021814	CGG	2	6	3363424	3363429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839361
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