MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021814	GCG	2	6	298129	298134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837029
5502	NC_021814	CAT	2	6	298206	298211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837029
5503	NC_021814	CGC	2	6	298232	298237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837029
5504	NC_021814	GCTC	2	8	298253	298260	0 %	25 %	25 %	50 %	525837029
5505	NC_021814	T	7	7	298287	298293	0 %	100 %	0 %	0 %	525837029
5506	NC_021814	GA	3	6	298381	298386	50 %	0 %	50 %	0 %	525837029
5507	NC_021814	CGG	2	6	298394	298399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837029
5508	NC_021814	GCG	2	6	298423	298428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837029
5509	NC_021814	CG	4	8	298501	298508	0 %	0 %	50 %	50 %	525837029
5510	NC_021814	GCG	2	6	298553	298558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837029
5511	NC_021814	GC	3	6	298587	298592	0 %	0 %	50 %	50 %	525837029
5512	NC_021814	CGT	2	6	298620	298625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837029
5513	NC_021814	TTG	2	6	298635	298640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837029
5514	NC_021814	ACG	2	6	298922	298927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837030
5515	NC_021814	TGA	2	6	298944	298949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837030
5516	NC_021814	TCG	2	6	298986	298991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837030
5517	NC_021814	ACT	2	6	299033	299038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837030
5518	NC_021814	GTT	2	6	299088	299093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837030
5519	NC_021814	TC	3	6	299143	299148	0 %	50 %	0 %	50 %	525837030
5520	NC_021814	TGGCGA	2	12	299150	299161	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525837030
5521	NC_021814	GC	3	6	299164	299169	0 %	0 %	50 %	50 %	525837030
5522	NC_021814	ATA	2	6	299366	299371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837030
5523	NC_021814	GCG	2	6	299429	299434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837030
5524	NC_021814	CGAC	2	8	299447	299454	25 %	0 %	25 %	50 %	525837030
5525	NC_021814	TCT	2	6	299491	299496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837030
5526	NC_021814	AG	3	6	299520	299525	50 %	0 %	50 %	0 %	525837030
5527	NC_021814	AAC	2	6	299573	299578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837030
5528	NC_021814	AAT	2	6	299630	299635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837030
5529	NC_021814	GTC	3	9	299650	299658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837031
5530	NC_021814	A	7	7	299664	299670	100 %	0 %	0 %	0 %	525837031
5531	NC_021814	TTA	2	6	299767	299772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837031
5532	NC_021814	TAA	2	6	299789	299794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837031
5533	NC_021814	CCTGG	2	10	299819	299828	0 %	20 %	40 %	40 %	525837031
5534	NC_021814	GAA	2	6	299868	299873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837031
5535	NC_021814	GC	3	6	299904	299909	0 %	0 %	50 %	50 %	525837031
5536	NC_021814	GAA	2	6	299916	299921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837031
5537	NC_021814	TGG	2	6	299949	299954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837031
5538	NC_021814	TAA	2	6	299958	299963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837031
5539	NC_021814	ATG	2	6	300010	300015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837032
5540	NC_021814	GCT	2	6	300024	300029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837032
5541	NC_021814	CGC	2	6	300089	300094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837032
5542	NC_021814	GC	3	6	300254	300259	0 %	0 %	50 %	50 %	525837032
5543	NC_021814	TGA	2	6	300270	300275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837032
5544	NC_021814	CG	3	6	300287	300292	0 %	0 %	50 %	50 %	525837032
5545	NC_021814	ATC	2	6	300322	300327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837032
5546	NC_021814	AGC	2	6	300346	300351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837032
5547	NC_021814	ACGG	2	8	300424	300431	25 %	0 %	50 %	25 %	525837032
5548	NC_021814	GTGC	2	8	300463	300470	0 %	25 %	50 %	25 %	525837032
5549	NC_021814	CAG	2	6	300478	300483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837032
5550	NC_021814	GGC	3	9	300556	300564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837032
5551	NC_021814	GGT	2	6	300595	300600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837032
5552	NC_021814	CAG	2	6	300649	300654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837032
5553	NC_021814	AGA	2	6	300690	300695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837032
5554	NC_021814	GCT	2	6	300945	300950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837033
5555	NC_021814	GCG	2	6	300967	300972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837033
5556	NC_021814	CGG	2	6	301010	301015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837033
5557	NC_021814	GGT	2	6	301029	301034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837033
5558	NC_021814	CAA	2	6	301042	301047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837033
5559	NC_021814	TGG	2	6	301087	301092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837033
5560	NC_021814	A	7	7	301194	301200	100 %	0 %	0 %	0 %	525837033
5561	NC_021814	GGT	2	6	301307	301312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837033
5562	NC_021814	GTA	2	6	301380	301385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837033
5563	NC_021814	TGG	2	6	301423	301428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837033
5564	NC_021814	AATG	2	8	301430	301437	50 %	25 %	25 %	0 %	525837033
5565	NC_021814	GGAC	2	8	301448	301455	25 %	0 %	50 %	25 %	525837033
5566	NC_021814	ACC	2	6	301575	301580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837033
5567	NC_021814	CCG	2	6	301759	301764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837033
5568	NC_021814	ACGGT	2	10	301771	301780	20 %	20 %	40 %	20 %	525837033
5569	NC_021814	GTG	2	6	301782	301787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837033
5570	NC_021814	TTC	2	6	301790	301795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837033
5571	NC_021814	A	6	6	302246	302251	100 %	0 %	0 %	0 %	525837034
5572	NC_021814	TTC	2	6	302300	302305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837034
5573	NC_021814	GGC	2	6	302336	302341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837034
5574	NC_021814	ATT	3	9	302344	302352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837034
5575	NC_021814	TTG	2	6	302353	302358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837034
5576	NC_021814	A	6	6	302359	302364	100 %	0 %	0 %	0 %	525837034
5577	NC_021814	CTGG	2	8	302428	302435	0 %	25 %	50 %	25 %	525837034
5578	NC_021814	CAGC	2	8	302464	302471	25 %	0 %	25 %	50 %	525837034
5579	NC_021814	GAC	2	6	302490	302495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837034
5580	NC_021814	TGA	2	6	302531	302536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837034
5581	NC_021814	CCT	2	6	302566	302571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525837034
5582	NC_021814	GAA	2	6	302604	302609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837034
5583	NC_021814	CT	3	6	302613	302618	0 %	50 %	0 %	50 %	525837034
5584	NC_021814	A	6	6	302646	302651	100 %	0 %	0 %	0 %	525837034
5585	NC_021814	GAT	2	6	302736	302741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837034
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5587	NC_021814	CAG	2	6	302856	302861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837034
5588	NC_021814	CGG	2	6	302889	302894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837034
5589	NC_021814	AGA	2	6	302912	302917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837034
5590	NC_021814	A	6	6	303060	303065	100 %	0 %	0 %	0 %	525837034
5591	NC_021814	CGT	2	6	303081	303086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837034
5592	NC_021814	TTA	2	6	303094	303099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837034
5593	NC_021814	AAT	2	6	303100	303105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837034
5594	NC_021814	AAG	2	6	303216	303221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837035
5595	NC_021814	AG	3	6	303220	303225	50 %	0 %	50 %	0 %	525837035
5596	NC_021814	TCG	2	6	303301	303306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837035
5597	NC_021814	GC	4	8	303365	303372	0 %	0 %	50 %	50 %	525837035
5598	NC_021814	TCA	2	6	303418	303423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837035
5599	NC_021814	TCACG	2	10	303425	303434	20 %	20 %	20 %	40 %	525837035
5600	NC_021814	TGG	2	6	303485	303490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837035
5601	NC_021814	AGT	2	6	303569	303574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837035
5602	NC_021814	CGG	2	6	303641	303646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837035
5603	NC_021814	TAA	2	6	303648	303653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837035
5604	NC_021814	TGG	2	6	303655	303660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837035
5605	NC_021814	CGG	2	6	303705	303710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837035
5606	NC_021814	CGAAC	2	10	303714	303723	40 %	0 %	20 %	40 %	525837035
5607	NC_021814	GA	3	6	303757	303762	50 %	0 %	50 %	0 %	525837035
5608	NC_021814	GCG	2	6	303764	303769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837035
5609	NC_021814	AGCCCA	2	12	303862	303873	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	525837035
5610	NC_021814	TGC	2	6	303885	303890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837035
5611	NC_021814	GC	3	6	303985	303990	0 %	0 %	50 %	50 %	525837035
5612	NC_021814	CCG	2	6	304055	304060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837035
5613	NC_021814	GC	3	6	304071	304076	0 %	0 %	50 %	50 %	525837035
5614	NC_021814	ACGC	2	8	304077	304084	25 %	0 %	25 %	50 %	525837035
5615	NC_021814	CAG	2	6	304089	304094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837035
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5617	NC_021814	GTC	2	6	304218	304223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837035
5618	NC_021814	AC	3	6	304282	304287	50 %	0 %	0 %	50 %	525837035
5619	NC_021814	GAATAT	2	12	304292	304303	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525837035
5620	NC_021814	GCG	2	6	304313	304318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837035
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5622	NC_021814	T	6	6	304386	304391	0 %	100 %	0 %	0 %	525837036
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5865	NC_021814	CGT	2	6	318097	318102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840500
5866	NC_021814	TGC	2	6	318107	318112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840500
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5870	NC_021814	TGC	2	6	318368	318373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840500
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5880	NC_021814	TCG	2	6	319072	319077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837050
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5883	NC_021814	GGC	2	6	319199	319204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837050
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5896	NC_021814	ACG	2	6	319737	319742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837051
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5932	NC_021814	CT	3	6	322841	322846	0 %	50 %	0 %	50 %	525837052
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5988	NC_021814	TGA	2	6	325443	325448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837055
5989	NC_021814	CAT	2	6	325449	325454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837055
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5991	NC_021814	A	6	6	325573	325578	100 %	0 %	0 %	0 %	525837055
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