MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
59001	NC_021814	GCTT	2	8	3230429	3230436	0 %	50 %	25 %	25 %	525841088
59002	NC_021814	CAG	2	6	3230454	3230459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525841088
59003	NC_021814	TAC	2	6	3230494	3230499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525841088
59004	NC_021814	CATC	2	8	3230539	3230546	25 %	25 %	0 %	50 %	525841088
59005	NC_021814	TA	3	6	3230578	3230583	50 %	50 %	0 %	0 %	525841088
59006	NC_021814	CTGA	2	8	3230644	3230651	25 %	25 %	25 %	25 %	525841088
59007	NC_021814	ATA	2	6	3230674	3230679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525841088
59008	NC_021814	TCG	2	6	3230708	3230713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841088
59009	NC_021814	CCG	2	6	3230775	3230780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841088
59010	NC_021814	TC	3	6	3230784	3230789	0 %	50 %	0 %	50 %	525841088
59011	NC_021814	TCCG	2	8	3230824	3230831	0 %	25 %	25 %	50 %	525841088
59012	NC_021814	CCG	3	9	3230829	3230837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841088
59013	NC_021814	CCT	2	6	3230841	3230846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525841088
59014	NC_021814	GCG	2	6	3230847	3230852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525841088
59015	NC_021814	CCTG	2	8	3230883	3230890	0 %	25 %	25 %	50 %	525841088
59016	NC_021814	CCCCG	2	10	3230897	3230906	0 %	0 %	20 %	80 %	525841088
59017	NC_021814	CTG	3	9	3230965	3230973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841088
59018	NC_021814	CA	3	6	3231005	3231010	50 %	0 %	0 %	50 %	525841088
59019	NC_021814	GTCC	2	8	3231013	3231020	0 %	25 %	25 %	50 %	525841088
59020	NC_021814	GCC	2	6	3231045	3231050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841088
59021	NC_021814	TGA	2	6	3231117	3231122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525841088
59022	NC_021814	CGC	2	6	3231167	3231172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841088
59023	NC_021814	TCA	2	6	3231237	3231242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525841088
59024	NC_021814	CAG	2	6	3231265	3231270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525841088
59025	NC_021814	TAA	3	9	3231287	3231295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525841088
59026	NC_021814	GGTCAT	2	12	3231297	3231308	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525841088
59027	NC_021814	CGT	2	6	3231378	3231383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841088
59028	NC_021814	GTT	2	6	3231406	3231411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525841088
59029	NC_021814	GAA	2	6	3231465	3231470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525841088
59030	NC_021814	CAG	2	6	3231508	3231513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525841088
59031	NC_021814	CGT	3	9	3231516	3231524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841088
59032	NC_021814	TGCG	2	8	3231554	3231561	0 %	25 %	50 %	25 %	525841088
59033	NC_021814	TGC	2	6	3231665	3231670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841088
59034	NC_021814	CCG	2	6	3231747	3231752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841088
59035	NC_021814	CAGC	2	8	3231754	3231761	25 %	0 %	25 %	50 %	525841088
59036	NC_021814	TGC	2	6	3231806	3231811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841088
59037	NC_021814	TCCG	2	8	3231899	3231906	0 %	25 %	25 %	50 %	525841088
59038	NC_021814	GCT	2	6	3231930	3231935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841088
59039	NC_021814	CGC	2	6	3231944	3231949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841088
59040	NC_021814	CGC	2	6	3231951	3231956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841088
59041	NC_021814	GTC	2	6	3231997	3232002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841088
59042	NC_021814	GTCC	2	8	3232023	3232030	0 %	25 %	25 %	50 %	525841088
59043	NC_021814	CCGTTG	2	12	3232088	3232099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841088
59044	NC_021814	GCC	2	6	3232169	3232174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841088
59045	NC_021814	CG	3	6	3232182	3232187	0 %	0 %	50 %	50 %	525841088
59046	NC_021814	GCT	2	6	3232231	3232236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841088
59047	NC_021814	CTG	2	6	3232270	3232275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841088
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59049	NC_021814	CGTC	2	8	3232347	3232354	0 %	25 %	25 %	50 %	525841088
59050	NC_021814	TGC	2	6	3232395	3232400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841088
59051	NC_021814	CAC	2	6	3232453	3232458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525841088
59052	NC_021814	GCC	2	6	3232462	3232467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841088
59053	NC_021814	CGC	2	6	3232468	3232473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841088
59054	NC_021814	TCCG	2	8	3232475	3232482	0 %	25 %	25 %	50 %	525841088
59055	NC_021814	CTGG	2	8	3232551	3232558	0 %	25 %	50 %	25 %	525841088
59056	NC_021814	TCG	2	6	3232619	3232624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841088
59057	NC_021814	CTGCGT	2	12	3232639	3232650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841088
59058	NC_021814	GTC	2	6	3232670	3232675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841088
59059	NC_021814	CAC	2	6	3232678	3232683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525841088
59060	NC_021814	CCG	2	6	3232721	3232726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841088
59061	NC_021814	ACC	2	6	3232827	3232832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525841088
59062	NC_021814	CTGC	2	8	3232849	3232856	0 %	25 %	25 %	50 %	525841088
59063	NC_021814	GGT	3	9	3232864	3232872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525841088
59064	NC_021814	CG	3	6	3232935	3232940	0 %	0 %	50 %	50 %	525841088
59065	NC_021814	GC	3	6	3232941	3232946	0 %	0 %	50 %	50 %	525841088
59066	NC_021814	TCA	2	6	3233004	3233009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525841088
59067	NC_021814	CCCG	2	8	3233045	3233052	0 %	0 %	25 %	75 %	525841088
59068	NC_021814	CAC	2	6	3233056	3233061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525841088
59069	NC_021814	CCA	2	6	3233097	3233102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525841088
59070	NC_021814	GCC	2	6	3233116	3233121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841088
59071	NC_021814	TG	3	6	3233165	3233170	0 %	50 %	50 %	0 %	525841088
59072	NC_021814	GCT	2	6	3233194	3233199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841088
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59075	NC_021814	CAG	2	6	3233272	3233277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525841088
59076	NC_021814	ATGCC	2	10	3233280	3233289	20 %	20 %	20 %	40 %	525841088
59077	NC_021814	GCA	2	6	3233337	3233342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525841088
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59080	NC_021814	TGG	2	6	3233399	3233404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525841088
59081	NC_021814	TCATCG	2	12	3233471	3233482	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525841088
59082	NC_021814	GCC	2	6	3233505	3233510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841088
59083	NC_021814	TGGC	2	8	3233543	3233550	0 %	25 %	50 %	25 %	525841088
59084	NC_021814	GCA	2	6	3233607	3233612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525841088
59085	NC_021814	GGT	2	6	3233626	3233631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525841088
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59088	NC_021814	GCC	2	6	3233754	3233759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841088
59089	NC_021814	CCG	2	6	3233774	3233779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841088
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59091	NC_021814	CCA	2	6	3233808	3233813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525841088
59092	NC_021814	TG	3	6	3233861	3233866	0 %	50 %	50 %	0 %	525841088
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59096	NC_021814	CG	4	8	3234031	3234038	0 %	0 %	50 %	50 %	525841088
59097	NC_021814	CCG	2	6	3234039	3234044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841088
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59102	NC_021814	GC	3	6	3234267	3234272	0 %	0 %	50 %	50 %	525841088
59103	NC_021814	ATC	2	6	3234289	3234294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525841088
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59106	NC_021814	GCCA	2	8	3234362	3234369	25 %	0 %	25 %	50 %	525839266
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59111	NC_021814	T	8	8	3234587	3234594	0 %	100 %	0 %	0 %	525839266
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59114	NC_021814	CAGG	2	8	3234735	3234742	25 %	0 %	50 %	25 %	525839266
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59116	NC_021814	ATC	2	6	3234831	3234836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839267
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59233	NC_021814	CCG	2	6	3240058	3240063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839269
59234	NC_021814	CCG	2	6	3240070	3240075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839269
59235	NC_021814	TCCG	2	8	3240076	3240083	0 %	25 %	25 %	50 %	525839269
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59339	NC_021814	CAT	2	6	3244441	3244446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525841091
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59466	NC_021814	AAT	2	6	3252152	3252157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525839278
59467	NC_021814	GCC	2	6	3252252	3252257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839278
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59470	NC_021814	GTC	2	6	3252616	3252621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839279
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59492	NC_021814	TCG	2	6	3253601	3253606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839280
59493	NC_021814	AGC	2	6	3253607	3253612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839280
59494	NC_021814	CAC	2	6	3253653	3253658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525839280
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59496	NC_021814	CCT	2	6	3253716	3253721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525839280
59497	NC_021814	CGC	2	6	3253758	3253763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839280
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59499	NC_021814	CGGTTT	2	12	3253791	3253802	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	525839280
59500	NC_021814	CGGCC	2	10	3253816	3253825	0 %	0 %	40 %	60 %	525839280

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