MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
58501	NC_021814	TCAT	2	8	3197269	3197276	25 %	50 %	0 %	25 %	525839246
58502	NC_021814	CTC	2	6	3197284	3197289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525839246
58503	NC_021814	GCT	2	6	3197293	3197298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839246
58504	NC_021814	ATC	2	6	3197332	3197337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839246
58505	NC_021814	TTGA	2	8	3197398	3197405	25 %	50 %	25 %	0 %	525839246
58506	NC_021814	AGTC	2	8	3197426	3197433	25 %	25 %	25 %	25 %	525839246
58507	NC_021814	GCA	2	6	3197490	3197495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839246
58508	NC_021814	AAGT	2	8	3197538	3197545	50 %	25 %	25 %	0 %	525839246
58509	NC_021814	TGGCG	2	10	3197559	3197568	0 %	20 %	60 %	20 %	525839246
58510	NC_021814	ATC	2	6	3197612	3197617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839246
58511	NC_021814	AGC	2	6	3197644	3197649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839246
58512	NC_021814	CTGA	2	8	3197887	3197894	25 %	25 %	25 %	25 %	525839246
58513	NC_021814	AAGG	2	8	3197959	3197966	50 %	0 %	50 %	0 %	525839246
58514	NC_021814	AAT	2	6	3197971	3197976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525839246
58515	NC_021814	ATTA	2	8	3198183	3198190	50 %	50 %	0 %	0 %	525839247
58516	NC_021814	GGT	2	6	3198230	3198235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525839247
58517	NC_021814	CCG	2	6	3198315	3198320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839247
58518	NC_021814	GCA	2	6	3198384	3198389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839247
58519	NC_021814	CCAT	2	8	3198459	3198466	25 %	25 %	0 %	50 %	525839247
58520	NC_021814	ACC	2	6	3198474	3198479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525839247
58521	NC_021814	CGC	2	6	3198595	3198600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839247
58522	NC_021814	TGCT	2	8	3198612	3198619	0 %	50 %	25 %	25 %	525839247
58523	NC_021814	AAT	2	6	3198713	3198718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525839247
58524	NC_021814	GCT	2	6	3198743	3198748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839247
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58527	NC_021814	TGG	2	6	3198796	3198801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525839247
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58529	NC_021814	GCA	2	6	3198874	3198879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839247
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58531	NC_021814	AAG	2	6	3199045	3199050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525839247
58532	NC_021814	CGG	2	6	3199113	3199118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839247
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58534	NC_021814	CCG	2	6	3199149	3199154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839247
58535	NC_021814	TCGCT	2	10	3199255	3199264	0 %	40 %	20 %	40 %	525839247
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58537	NC_021814	T	7	7	3199365	3199371	0 %	100 %	0 %	0 %	525839247
58538	NC_021814	CGC	2	6	3199372	3199377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839247
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58541	NC_021814	AGC	2	6	3199412	3199417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839247
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58545	NC_021814	CCG	2	6	3199543	3199548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839248
58546	NC_021814	TGA	2	6	3199614	3199619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525839248
58547	NC_021814	C	6	6	3199623	3199628	0 %	0 %	0 %	100 %	525839248
58548	NC_021814	TCA	2	6	3199709	3199714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839248
58549	NC_021814	CGG	2	6	3199732	3199737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839248
58550	NC_021814	GCG	2	6	3199770	3199775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839248
58551	NC_021814	AAT	2	6	3199855	3199860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525839248
58552	NC_021814	CG	3	6	3199873	3199878	0 %	0 %	50 %	50 %	525839248
58553	NC_021814	GCC	2	6	3199892	3199897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839248
58554	NC_021814	ACC	2	6	3199915	3199920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525839248
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58556	NC_021814	CGG	2	6	3200022	3200027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839248
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58558	NC_021814	CAG	4	12	3200050	3200061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839248
58559	NC_021814	CGC	2	6	3200083	3200088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839248
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58561	NC_021814	CT	3	6	3200218	3200223	0 %	50 %	0 %	50 %	525839248
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58582	NC_021814	CT	3	6	3201458	3201463	0 %	50 %	0 %	50 %	525839249
58583	NC_021814	CGG	2	6	3201606	3201611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839249
58584	NC_021814	CGTC	2	8	3201673	3201680	0 %	25 %	25 %	50 %	525839249
58585	NC_021814	CAA	2	6	3201774	3201779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525839249
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58590	NC_021814	CCA	2	6	3202061	3202066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525841075
58591	NC_021814	CAAA	2	8	3202112	3202119	75 %	0 %	0 %	25 %	525841075
58592	NC_021814	TCCA	2	8	3202165	3202172	25 %	25 %	0 %	50 %	525841075
58593	NC_021814	A	9	9	3202237	3202245	100 %	0 %	0 %	0 %	525841075
58594	NC_021814	GC	3	6	3202439	3202444	0 %	0 %	50 %	50 %	525839250
58595	NC_021814	GAT	2	6	3202501	3202506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525839250
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58600	NC_021814	TGA	2	6	3202932	3202937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525839250
58601	NC_021814	CG	3	6	3202979	3202984	0 %	0 %	50 %	50 %	525839250
58602	NC_021814	GCC	2	6	3203037	3203042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839250
58603	NC_021814	CGCCTG	2	12	3203190	3203201	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	525839250
58604	NC_021814	GGC	2	6	3203235	3203240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839250
58605	NC_021814	CTG	2	6	3203313	3203318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839250
58606	NC_021814	GCC	2	6	3203358	3203363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839250
58607	NC_021814	CGTAT	2	10	3203379	3203388	20 %	40 %	20 %	20 %	525839250
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58611	NC_021814	CGC	2	6	3203462	3203467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839250
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58616	NC_021814	CCG	2	6	3203838	3203843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839251
58617	NC_021814	CGG	2	6	3203898	3203903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839251
58618	NC_021814	GCC	2	6	3203905	3203910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839251
58619	NC_021814	TCG	2	6	3203924	3203929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839251
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58632	NC_021814	TGC	2	6	3204853	3204858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839252
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58635	NC_021814	GAA	3	9	3204948	3204956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525839252
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58642	NC_021814	GC	3	6	3205258	3205263	0 %	0 %	50 %	50 %	525839252
58643	NC_021814	CTG	2	6	3205404	3205409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839252
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58646	NC_021814	GCTG	2	8	3205589	3205596	0 %	25 %	50 %	25 %	525839252
58647	NC_021814	CTGG	2	8	3205627	3205634	0 %	25 %	50 %	25 %	525839252
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58683	NC_021814	TACG	2	8	3208906	3208913	25 %	25 %	25 %	25 %	525839254
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58712	NC_021814	AT	3	6	3211323	3211328	50 %	50 %	0 %	0 %	525839257
58713	NC_021814	GCATC	2	10	3211407	3211416	20 %	20 %	20 %	40 %	525839257
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58728	NC_021814	A	6	6	3212154	3212159	100 %	0 %	0 %	0 %	525839258
58729	NC_021814	CCGCAA	2	12	3212172	3212183	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	525839258
58730	NC_021814	AGA	2	6	3212222	3212227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525839258
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58850	NC_021814	TTA	2	6	3221427	3221432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525839263
58851	NC_021814	CCA	2	6	3221433	3221438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525839263
58852	NC_021814	CTGA	2	8	3221489	3221496	25 %	25 %	25 %	25 %	525839263
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58854	NC_021814	ACC	2	6	3221531	3221536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525839263
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58951	NC_021814	CT	3	6	3228178	3228183	0 %	50 %	0 %	50 %	525841084
58952	NC_021814	TTG	2	6	3228186	3228191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525841084
58953	NC_021814	T	6	6	3228198	3228203	0 %	100 %	0 %	0 %	525841084
58954	NC_021814	AATCA	2	10	3228612	3228621	60 %	20 %	0 %	20 %	525841085
58955	NC_021814	ATA	2	6	3228669	3228674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525841085
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58958	NC_021814	AT	3	6	3228735	3228740	50 %	50 %	0 %	0 %	525841085
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58968	NC_021814	CAT	2	6	3229081	3229086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525841086
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58972	NC_021814	CAT	2	6	3229195	3229200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525841086
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58999	NC_021814	ACAT	2	8	3230408	3230415	50 %	25 %	0 %	25 %	525841088
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