MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 87728

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021812	CCA	2	6	203215	203220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826635
3502	NC_021812	CTG	2	6	203288	203293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826635
3503	NC_021812	GAC	2	6	203354	203359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826635
3504	NC_021812	TGC	2	6	203379	203384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826635
3505	NC_021812	GGC	2	6	203420	203425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826635
3506	NC_021812	GCGA	2	8	203437	203444	25 %	0 %	50 %	25 %	525826635
3507	NC_021812	CTG	2	6	203486	203491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826635
3508	NC_021812	CGCC	2	8	203522	203529	0 %	0 %	25 %	75 %	525826635
3509	NC_021812	GGATGA	2	12	203535	203546	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	525826635
3510	NC_021812	AGC	2	6	203628	203633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826635
3511	NC_021812	CCTT	2	8	203676	203683	0 %	50 %	0 %	50 %	525826635
3512	NC_021812	CAC	3	9	203693	203701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826635
3513	NC_021812	CCG	2	6	203752	203757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826635
3514	NC_021812	CAG	2	6	203777	203782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826635
3515	NC_021812	GCG	2	6	203788	203793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826635
3516	NC_021812	TTG	2	6	203819	203824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826635
3517	NC_021812	GCGCCA	2	12	203833	203844	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525826635
3518	NC_021812	CAT	2	6	203953	203958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826635
3519	NC_021812	TGT	2	6	203964	203969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826635
3520	NC_021812	GGCA	2	8	203979	203986	25 %	0 %	50 %	25 %	525826635
3521	NC_021812	GTGAT	2	10	204079	204088	20 %	40 %	40 %	0 %	525826635
3522	NC_021812	A	6	6	204205	204210	100 %	0 %	0 %	0 %	525826635
3523	NC_021812	CG	3	6	204214	204219	0 %	0 %	50 %	50 %	525826635
3524	NC_021812	AAT	2	6	204271	204276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826635
3525	NC_021812	CGT	2	6	204332	204337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826635
3526	NC_021812	GGC	2	6	204401	204406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826635
3527	NC_021812	CCG	2	6	204424	204429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826635
3528	NC_021812	CAG	2	6	204449	204454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826635
3529	NC_021812	GTT	2	6	204497	204502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826635
3530	NC_021812	CTAT	2	8	204566	204573	25 %	50 %	0 %	25 %	525826636
3531	NC_021812	AGT	2	6	204576	204581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826636
3532	NC_021812	CAGC	2	8	204603	204610	25 %	0 %	25 %	50 %	525826636
3533	NC_021812	CGG	2	6	204636	204641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826636
3534	NC_021812	CGTCC	2	10	204649	204658	0 %	20 %	20 %	60 %	525826636
3535	NC_021812	GCGT	2	8	204874	204881	0 %	25 %	50 %	25 %	525826636
3536	NC_021812	TAT	2	6	204954	204959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826636
3537	NC_021812	CACC	2	8	205062	205069	25 %	0 %	0 %	75 %	525826636
3538	NC_021812	GCA	2	6	205070	205075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826636
3539	NC_021812	TTG	2	6	205102	205107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826636
3540	NC_021812	ATCC	2	8	205141	205148	25 %	25 %	0 %	50 %	525826636
3541	NC_021812	GGTC	2	8	205213	205220	0 %	25 %	50 %	25 %	525826636
3542	NC_021812	GCG	2	6	205281	205286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826636
3543	NC_021812	CAG	2	6	205309	205314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826636
3544	NC_021812	CCT	2	6	205317	205322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525826636
3545	NC_021812	AT	3	6	205359	205364	50 %	50 %	0 %	0 %	525826636
3546	NC_021812	GATC	2	8	205395	205402	25 %	25 %	25 %	25 %	525826636
3547	NC_021812	CTG	2	6	205405	205410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826636
3548	NC_021812	TCA	2	6	205419	205424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826636
3549	NC_021812	GCG	2	6	205438	205443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826636
3550	NC_021812	CAG	2	6	205447	205452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826636
3551	NC_021812	ATAA	2	8	205538	205545	75 %	25 %	0 %	0 %	525826636
3552	NC_021812	CAG	2	6	205615	205620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826636
3553	NC_021812	GGC	3	9	205621	205629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826636
3554	NC_021812	AGGGA	2	10	205664	205673	40 %	0 %	60 %	0 %	525826636
3555	NC_021812	CGT	2	6	205810	205815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826636
3556	NC_021812	GCC	3	9	205816	205824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826636
3557	NC_021812	CG	3	6	205849	205854	0 %	0 %	50 %	50 %	525826636
3558	NC_021812	GAC	2	6	205861	205866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826636
3559	NC_021812	A	6	6	205906	205911	100 %	0 %	0 %	0 %	525826636
3560	NC_021812	CAC	2	6	206014	206019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826636
3561	NC_021812	T	6	6	206022	206027	0 %	100 %	0 %	0 %	525826636
3562	NC_021812	GCT	2	6	206031	206036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826636
3563	NC_021812	GTG	2	6	206042	206047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826636
3564	NC_021812	CCAGCG	2	12	206088	206099	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525826636
3565	NC_021812	GCG	2	6	206184	206189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826636
3566	NC_021812	AGCCG	2	10	206199	206208	20 %	0 %	40 %	40 %	525826636
3567	NC_021812	TCA	2	6	206274	206279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826636
3568	NC_021812	GCG	2	6	206298	206303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826636
3569	NC_021812	A	6	6	206304	206309	100 %	0 %	0 %	0 %	525826636
3570	NC_021812	TTC	2	6	206320	206325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826636
3571	NC_021812	CGT	3	9	206352	206360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826636
3572	NC_021812	TCA	2	6	206361	206366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826636
3573	NC_021812	TCA	2	6	206370	206375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826636
3574	NC_021812	GCG	2	6	206470	206475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826636
3575	NC_021812	GCT	2	6	206491	206496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826636
3576	NC_021812	TCG	2	6	206537	206542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826636
3577	NC_021812	CGT	2	6	206574	206579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826636
3578	NC_021812	TTGC	2	8	206605	206612	0 %	50 %	25 %	25 %	525826636
3579	NC_021812	GC	3	6	206617	206622	0 %	0 %	50 %	50 %	525826636
3580	NC_021812	TAAA	2	8	206646	206653	75 %	25 %	0 %	0 %	525826636
3581	NC_021812	CGC	2	6	206751	206756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826636
3582	NC_021812	ACTTC	2	10	206829	206838	20 %	40 %	0 %	40 %	525826636
3583	NC_021812	TTG	2	6	206914	206919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826636
3584	NC_021812	GAA	2	6	206961	206966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826636
3585	NC_021812	CAGC	2	8	206977	206984	25 %	0 %	25 %	50 %	525826636
3586	NC_021812	CTT	2	6	207018	207023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826636
3587	NC_021812	CGC	2	6	207085	207090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826636
3588	NC_021812	T	6	6	207098	207103	0 %	100 %	0 %	0 %	525826636
3589	NC_021812	GT	4	8	207136	207143	0 %	50 %	50 %	0 %	525826636
3590	NC_021812	GC	3	6	207184	207189	0 %	0 %	50 %	50 %	525826636
3591	NC_021812	CGG	2	6	207220	207225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826636
3592	NC_021812	GCC	2	6	207325	207330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826636
3593	NC_021812	GCG	2	6	207438	207443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826636
3594	NC_021812	CGC	2	6	207468	207473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826636
3595	NC_021812	CA	3	6	207507	207512	50 %	0 %	0 %	50 %	525826636
3596	NC_021812	GC	3	6	207662	207667	0 %	0 %	50 %	50 %	525826637
3597	NC_021812	ATC	2	6	207684	207689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826637
3598	NC_021812	TAC	2	6	207752	207757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826637
3599	NC_021812	GC	3	6	207758	207763	0 %	0 %	50 %	50 %	525826637
3600	NC_021812	AG	3	6	207795	207800	50 %	0 %	50 %	0 %	525826637
3601	NC_021812	GGC	2	6	207801	207806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826637
3602	NC_021812	GGGC	2	8	207964	207971	0 %	0 %	75 %	25 %	525826637
3603	NC_021812	GGCGC	2	10	208050	208059	0 %	0 %	60 %	40 %	525826637
3604	NC_021812	A	6	6	208098	208103	100 %	0 %	0 %	0 %	525826637
3605	NC_021812	CGG	2	6	208114	208119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826637
3606	NC_021812	GCG	2	6	208228	208233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826637
3607	NC_021812	TCC	2	6	208242	208247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525826637
3608	NC_021812	CGG	2	6	208256	208261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826637
3609	NC_021812	CGC	2	6	208304	208309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826637
3610	NC_021812	TTC	2	6	208325	208330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826637
3611	NC_021812	GCAG	2	8	208378	208385	25 %	0 %	50 %	25 %	525826637
3612	NC_021812	CAT	2	6	208393	208398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826637
3613	NC_021812	CTG	2	6	208727	208732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826637
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3615	NC_021812	ATC	2	6	208811	208816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826637
3616	NC_021812	AG	3	6	208834	208839	50 %	0 %	50 %	0 %	525826637
3617	NC_021812	GGA	2	6	209084	209089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525826638
3618	NC_021812	GCC	2	6	209109	209114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826638
3619	NC_021812	ATGA	2	8	209139	209146	50 %	25 %	25 %	0 %	525826638
3620	NC_021812	GCA	3	9	209201	209209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826638
3621	NC_021812	GGCA	2	8	209238	209245	25 %	0 %	50 %	25 %	525826638
3622	NC_021812	AAG	2	6	209251	209256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826638
3623	NC_021812	CG	3	6	209264	209269	0 %	0 %	50 %	50 %	525826638
3624	NC_021812	AGC	2	6	209275	209280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826638
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3627	NC_021812	CCGGC	2	10	209370	209379	0 %	0 %	40 %	60 %	525826639
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3631	NC_021812	GTC	2	6	209465	209470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826639
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3643	NC_021812	TCA	2	6	209785	209790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826640
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3732	NC_021812	GGC	2	6	215175	215180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826643
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3744	NC_021812	CAGG	2	8	215847	215854	25 %	0 %	50 %	25 %	525826643
3745	NC_021812	GTT	2	6	215889	215894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826643
3746	NC_021812	GAT	2	6	216009	216014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826643
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3748	NC_021812	ATG	2	6	216213	216218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826644
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3750	NC_021812	CAAC	2	8	216241	216248	50 %	0 %	0 %	50 %	525826644
3751	NC_021812	TGA	2	6	216253	216258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826644
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3753	NC_021812	ATG	2	6	216370	216375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826644
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3772	NC_021812	CGA	2	6	217599	217604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826645
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3775	NC_021812	A	6	6	217745	217750	100 %	0 %	0 %	0 %	525826645
3776	NC_021812	A	6	6	217752	217757	100 %	0 %	0 %	0 %	525826645
3777	NC_021812	CGC	2	6	217845	217850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826645
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3847	NC_021812	GCG	2	6	221990	221995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826650
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3865	NC_021812	CAT	2	6	222965	222970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826651
3866	NC_021812	GACCG	2	10	222989	222998	20 %	0 %	40 %	40 %	525826651
3867	NC_021812	CCG	2	6	223057	223062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826651
3868	NC_021812	CCCG	2	8	223088	223095	0 %	0 %	25 %	75 %	525826651
3869	NC_021812	GCG	2	6	223123	223128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826651
3870	NC_021812	GTAC	2	8	223129	223136	25 %	25 %	25 %	25 %	525826651
3871	NC_021812	CCG	2	6	223276	223281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826651
3872	NC_021812	CGT	2	6	223369	223374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826651
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3874	NC_021812	TCT	2	6	223578	223583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826651
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3880	NC_021812	GCC	2	6	223955	223960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826651
3881	NC_021812	CTG	2	6	224015	224020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826651
3882	NC_021812	TCC	2	6	224022	224027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525826651
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3884	NC_021812	CCT	2	6	224202	224207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525826652
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3887	NC_021812	ATG	2	6	224264	224269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826652
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3893	NC_021812	ACC	2	6	224483	224488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826652
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3918	NC_021812	CG	3	6	225985	225990	0 %	0 %	50 %	50 %	525826652
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3922	NC_021812	GGCG	2	8	226127	226134	0 %	0 %	75 %	25 %	525826652
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3930	NC_021812	GAC	2	6	226519	226524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826652
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3932	NC_021812	GCC	2	6	226624	226629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826652
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3944	NC_021812	GCCA	2	8	227042	227049	25 %	0 %	25 %	50 %	525826652
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3976	NC_021812	A	6	6	228948	228953	100 %	0 %	0 %	0 %	525826653
3977	NC_021812	CCAG	2	8	229060	229067	25 %	0 %	25 %	50 %	525826653
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3988	NC_021812	GAG	2	6	229844	229849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525826654
3989	NC_021812	GCC	2	6	229925	229930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826654
3990	NC_021812	GGCG	2	8	229973	229980	0 %	0 %	75 %	25 %	525826654
3991	NC_021812	CGCC	2	8	230044	230051	0 %	0 %	25 %	75 %	525826654
3992	NC_021812	GTG	2	6	230060	230065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826654
3993	NC_021812	CGG	2	6	230077	230082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826654
3994	NC_021812	TCG	2	6	230105	230110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826654
3995	NC_021812	GGC	2	6	230120	230125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826654
3996	NC_021812	CGC	2	6	230153	230158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826654
3997	NC_021812	ATT	2	6	230348	230353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826655
3998	NC_021812	CGC	2	6	230401	230406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826655
3999	NC_021812	GCT	2	6	230446	230451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826655
4000	NC_021812	TGGC	2	8	230481	230488	0 %	25 %	50 %	25 %	525826655

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