MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 87728

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_021812	CAT	2	6	1010658	1010663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827274
18003	NC_021812	TCAG	2	8	1011160	1011167	25 %	25 %	25 %	25 %	525827275
18004	NC_021812	CGGCC	2	10	1011175	1011184	0 %	0 %	40 %	60 %	525827275
18005	NC_021812	CAG	2	6	1011214	1011219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827275
18006	NC_021812	TCA	2	6	1011260	1011265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827275
18007	NC_021812	CGC	2	6	1011306	1011311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827275
18008	NC_021812	AGC	2	6	1011320	1011325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827275
18009	NC_021812	CTG	2	6	1011334	1011339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827275
18010	NC_021812	CAG	2	6	1011370	1011375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827275
18011	NC_021812	GCA	2	6	1011378	1011383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827275
18012	NC_021812	CTG	2	6	1011388	1011393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827275
18013	NC_021812	GCC	2	6	1011429	1011434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827275
18014	NC_021812	TGC	2	6	1011453	1011458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827275
18015	NC_021812	GCG	2	6	1011584	1011589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827275
18016	NC_021812	AGC	2	6	1011593	1011598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827275
18017	NC_021812	CAT	2	6	1011684	1011689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827275
18018	NC_021812	AAC	2	6	1011690	1011695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525827275
18019	NC_021812	CAG	2	6	1011739	1011744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827275
18020	NC_021812	GTT	2	6	1011762	1011767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525827275
18021	NC_021812	TCAT	2	8	1011851	1011858	25 %	50 %	0 %	25 %	525827275
18022	NC_021812	CGG	2	6	1012043	1012048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827276
18023	NC_021812	CAG	2	6	1012098	1012103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827276
18024	NC_021812	GCC	2	6	1012150	1012155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827276
18025	NC_021812	CCG	2	6	1012163	1012168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827276
18026	NC_021812	CAG	2	6	1012221	1012226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827276
18027	NC_021812	GCC	2	6	1012246	1012251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827276
18028	NC_021812	ACC	2	6	1012270	1012275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827276
18029	NC_021812	CCA	2	6	1012322	1012327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827276
18030	NC_021812	CCA	2	6	1012406	1012411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827276
18031	NC_021812	CGC	2	6	1012412	1012417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827276
18032	NC_021812	CAG	2	6	1012452	1012457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827276
18033	NC_021812	GCA	3	9	1012472	1012480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827276
18034	NC_021812	CCA	2	6	1012484	1012489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827276
18035	NC_021812	GCA	2	6	1012490	1012495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827276
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18037	NC_021812	TCT	2	6	1012517	1012522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525827276
18038	NC_021812	CGG	2	6	1012596	1012601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827276
18039	NC_021812	CGC	2	6	1012635	1012640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827276
18040	NC_021812	CAG	2	6	1012656	1012661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827276
18041	NC_021812	CGC	2	6	1012709	1012714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827276
18042	NC_021812	GAT	2	6	1012716	1012721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827276
18043	NC_021812	GCC	3	9	1012729	1012737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827276
18044	NC_021812	AGT	2	6	1012766	1012771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827276
18045	NC_021812	TCAGCG	2	12	1012772	1012783	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525827276
18046	NC_021812	GCC	3	9	1012816	1012824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827276
18047	NC_021812	CAG	3	9	1012827	1012835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827276
18048	NC_021812	CAG	2	6	1012851	1012856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827276
18049	NC_021812	GCG	2	6	1012901	1012906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827276
18050	NC_021812	CGG	2	6	1012952	1012957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827276
18051	NC_021812	CAGCGC	2	12	1013007	1013018	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525827276
18052	NC_021812	CCT	2	6	1013024	1013029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525827276
18053	NC_021812	CGT	2	6	1013090	1013095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827276
18054	NC_021812	CAG	2	6	1013103	1013108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827276
18055	NC_021812	CAG	2	6	1013154	1013159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827276
18056	NC_021812	CCG	2	6	1013161	1013166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827276
18057	NC_021812	GCA	4	12	1013177	1013188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827276
18058	NC_021812	CTT	2	6	1013199	1013204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525827276
18059	NC_021812	GCCA	2	8	1013212	1013219	25 %	0 %	25 %	50 %	525827276
18060	NC_021812	CAG	4	12	1013220	1013231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827276
18061	NC_021812	CAG	2	6	1013238	1013243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827276
18062	NC_021812	ATG	2	6	1013245	1013250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827276
18063	NC_021812	TCA	2	6	1013339	1013344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827277
18064	NC_021812	GCGCG	2	10	1013408	1013417	0 %	0 %	60 %	40 %	525827277
18065	NC_021812	CAG	2	6	1013451	1013456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827277
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18067	NC_021812	GCA	2	6	1013575	1013580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827277
18068	NC_021812	GCTG	2	8	1013597	1013604	0 %	25 %	50 %	25 %	525827277
18069	NC_021812	CGC	2	6	1013609	1013614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827277
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18081	NC_021812	CCG	2	6	1014158	1014163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827277
18082	NC_021812	CTG	2	6	1014168	1014173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827277
18083	NC_021812	CCA	2	6	1014221	1014226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827277
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18085	NC_021812	CCA	2	6	1014362	1014367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827277
18086	NC_021812	CGCC	2	8	1014434	1014441	0 %	0 %	25 %	75 %	525827277
18087	NC_021812	CAG	2	6	1014453	1014458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827277
18088	NC_021812	GGT	2	6	1014477	1014482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525827277
18089	NC_021812	GTGCAG	2	12	1014492	1014503	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525827277
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18092	NC_021812	CCAG	2	8	1014629	1014636	25 %	0 %	25 %	50 %	525827277
18093	NC_021812	TGG	2	6	1014659	1014664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525827277
18094	NC_021812	GC	3	6	1014787	1014792	0 %	0 %	50 %	50 %	525827277
18095	NC_021812	GCA	3	9	1014854	1014862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827277
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18097	NC_021812	GCC	2	6	1014957	1014962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827277
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18099	NC_021812	GCA	2	6	1015013	1015018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827277
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18102	NC_021812	GGC	2	6	1015124	1015129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827278
18103	NC_021812	TGG	3	9	1015132	1015140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525827278
18104	NC_021812	GCG	2	6	1015144	1015149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827278
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18109	NC_021812	CGG	3	9	1015244	1015252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827278
18110	NC_021812	CAG	2	6	1015275	1015280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827278
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18112	NC_021812	GTA	2	6	1015431	1015436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827279
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18114	NC_021812	A	6	6	1015487	1015492	100 %	0 %	0 %	0 %	525827279
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18231	NC_021812	TGA	2	6	1020692	1020697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827284
18232	NC_021812	CTT	2	6	1020701	1020706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525827284
18233	NC_021812	GC	3	6	1020725	1020730	0 %	0 %	50 %	50 %	525827284
18234	NC_021812	CCG	2	6	1020748	1020753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827284
18235	NC_021812	GCG	2	6	1020836	1020841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827284
18236	NC_021812	CGG	2	6	1020845	1020850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827284
18237	NC_021812	ACCG	2	8	1020903	1020910	25 %	0 %	25 %	50 %	525827284
18238	NC_021812	AG	3	6	1020915	1020920	50 %	0 %	50 %	0 %	525827284
18239	NC_021812	AGT	2	6	1020954	1020959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827284
18240	NC_021812	CG	3	6	1020961	1020966	0 %	0 %	50 %	50 %	525827284
18241	NC_021812	TCA	2	6	1020983	1020988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827284
18242	NC_021812	GCG	2	6	1021004	1021009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827284
18243	NC_021812	CGG	2	6	1021031	1021036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827284
18244	NC_021812	CAGG	2	8	1021037	1021044	25 %	0 %	50 %	25 %	525827284
18245	NC_021812	CAG	3	9	1021062	1021070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827284
18246	NC_021812	GC	3	6	1021074	1021079	0 %	0 %	50 %	50 %	525827284
18247	NC_021812	CGT	2	6	1021091	1021096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827284
18248	NC_021812	GGT	2	6	1021152	1021157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525827284
18249	NC_021812	TCA	2	6	1021210	1021215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827284
18250	NC_021812	GGC	2	6	1021233	1021238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827284
18251	NC_021812	CGC	2	6	1021248	1021253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827284
18252	NC_021812	CAC	2	6	1021284	1021289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827284
18253	NC_021812	CAG	2	6	1021290	1021295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827284
18254	NC_021812	ATGG	2	8	1021323	1021330	25 %	25 %	50 %	0 %	525827284
18255	NC_021812	GC	3	6	1021335	1021340	0 %	0 %	50 %	50 %	525827284
18256	NC_021812	TGC	2	6	1021356	1021361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827284
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18259	NC_021812	TCG	2	6	1021435	1021440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827284
18260	NC_021812	GCG	2	6	1021829	1021834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827285
18261	NC_021812	GCT	2	6	1021843	1021848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827285
18262	NC_021812	CGG	2	6	1021886	1021891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827285
18263	NC_021812	CGCC	2	8	1021917	1021924	0 %	0 %	25 %	75 %	525827285
18264	NC_021812	ATG	2	6	1021940	1021945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827285
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18268	NC_021812	A	6	6	1022092	1022097	100 %	0 %	0 %	0 %	525827285
18269	NC_021812	AAT	2	6	1022119	1022124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525827285
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18275	NC_021812	GTT	2	6	1022408	1022413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525827286
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18278	NC_021812	CGT	2	6	1022484	1022489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827286
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18296	NC_021812	GCAAA	2	10	1023322	1023331	60 %	0 %	20 %	20 %	525827287
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18302	NC_021812	AT	3	6	1023546	1023551	50 %	50 %	0 %	0 %	525827287
18303	NC_021812	TCA	2	6	1023556	1023561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827287
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18310	NC_021812	GAAA	2	8	1023736	1023743	75 %	0 %	25 %	0 %	525827287
18311	NC_021812	A	6	6	1023776	1023781	100 %	0 %	0 %	0 %	525827287
18312	NC_021812	TCT	2	6	1023793	1023798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525827287
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18318	NC_021812	CTG	2	6	1024178	1024183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827288
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18321	NC_021812	GCC	2	6	1024245	1024250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827288
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18330	NC_021812	CAG	2	6	1024742	1024747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827288
18331	NC_021812	GCG	2	6	1024755	1024760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827288
18332	NC_021812	GCC	2	6	1024805	1024810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827288
18333	NC_021812	TCT	2	6	1024815	1024820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525827288
18334	NC_021812	GTA	2	6	1024847	1024852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827288
18335	NC_021812	CCA	2	6	1024858	1024863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827288
18336	NC_021812	TCG	3	9	1024920	1024928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827288
18337	NC_021812	CGG	2	6	1024946	1024951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827288
18338	NC_021812	CTG	2	6	1026679	1026684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827289
18339	NC_021812	T	6	6	1026779	1026784	0 %	100 %	0 %	0 %	525827289
18340	NC_021812	ATA	2	6	1026799	1026804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525827289
18341	NC_021812	GGC	2	6	1026805	1026810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827289
18342	NC_021812	T	6	6	1026817	1026822	0 %	100 %	0 %	0 %	525827289
18343	NC_021812	TTG	2	6	1026827	1026832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525827289
18344	NC_021812	AAT	2	6	1026852	1026857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525827289
18345	NC_021812	TGA	2	6	1026894	1026899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827289
18346	NC_021812	CAT	2	6	1026921	1026926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827289
18347	NC_021812	CGGGG	2	10	1027027	1027036	0 %	0 %	80 %	20 %	525827289
18348	NC_021812	GCC	2	6	1027049	1027054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827289
18349	NC_021812	GCT	2	6	1027070	1027075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827289
18350	NC_021812	GCTGC	2	10	1027077	1027086	0 %	20 %	40 %	40 %	525827289
18351	NC_021812	GCC	2	6	1027087	1027092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827289
18352	NC_021812	ATT	2	6	1027093	1027098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525827289
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18354	NC_021812	GCT	3	9	1027215	1027223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827289
18355	NC_021812	GCTG	2	8	1027239	1027246	0 %	25 %	50 %	25 %	525827289
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18361	NC_021812	CTG	2	6	1027732	1027737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827290
18362	NC_021812	GCT	2	6	1027740	1027745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827290
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18449	NC_021812	CAAT	2	8	1031225	1031232	50 %	25 %	0 %	25 %	525827293
18450	NC_021812	GCAT	2	8	1031299	1031306	25 %	25 %	25 %	25 %	525827293
18451	NC_021812	GCG	2	6	1031620	1031625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827293
18452	NC_021812	ATG	2	6	1031650	1031655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827293
18453	NC_021812	AATCAA	2	12	1031679	1031690	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525827293
18454	NC_021812	GTCA	2	8	1031745	1031752	25 %	25 %	25 %	25 %	525827293
18455	NC_021812	AGC	2	6	1031844	1031849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830259
18456	NC_021812	TGCGT	2	10	1031869	1031878	0 %	40 %	40 %	20 %	525830259
18457	NC_021812	TCG	2	6	1031934	1031939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830259
18458	NC_021812	CAC	2	6	1031978	1031983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525830259
18459	NC_021812	CAG	2	6	1032002	1032007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830259
18460	NC_021812	GCA	2	6	1032034	1032039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830259
18461	NC_021812	GC	3	6	1032047	1032052	0 %	0 %	50 %	50 %	525830259
18462	NC_021812	CCG	2	6	1032093	1032098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830259
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18464	NC_021812	AAG	3	9	1032387	1032395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525830260
18465	NC_021812	CGA	2	6	1032406	1032411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830260
18466	NC_021812	AAT	2	6	1032519	1032524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830260
18467	NC_021812	GGC	2	6	1032554	1032559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830260
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18469	NC_021812	ATA	2	6	1032663	1032668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830260
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18472	NC_021812	CTTA	2	8	1032799	1032806	25 %	50 %	0 %	25 %	525827295
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18480	NC_021812	CAG	2	6	1033110	1033115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827295
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18484	NC_021812	CG	3	6	1033193	1033198	0 %	0 %	50 %	50 %	525827295
18485	NC_021812	CTT	2	6	1033202	1033207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525827295
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18487	NC_021812	CGCC	2	8	1033286	1033293	0 %	0 %	25 %	75 %	525827295
18488	NC_021812	GC	6	12	1033339	1033350	0 %	0 %	50 %	50 %	525827295
18489	NC_021812	TGA	2	6	1033400	1033405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827295
18490	NC_021812	CAG	2	6	1033431	1033436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827295
18491	NC_021812	GAA	2	6	1033458	1033463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525827295
18492	NC_021812	GCG	2	6	1033550	1033555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827295
18493	NC_021812	ACCG	2	8	1033635	1033642	25 %	0 %	25 %	50 %	525827295
18494	NC_021812	GAA	2	6	1033647	1033652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525827295
18495	NC_021812	ATC	2	6	1033672	1033677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827295
18496	NC_021812	CGC	2	6	1033698	1033703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827295
18497	NC_021812	GCA	2	6	1033723	1033728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827295
18498	NC_021812	AAC	2	6	1033729	1033734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525827295
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18500	NC_021812	CAG	2	6	1033902	1033907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827295

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