MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 87728

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_021812	GCT	2	6	958401	958406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827232
17003	NC_021812	C	6	6	958421	958426	0 %	0 %	0 %	100 %	525827232
17004	NC_021812	CCG	4	12	958448	958459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827232
17005	NC_021812	GCT	2	6	958461	958466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827232
17006	NC_021812	GAC	2	6	958467	958472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827232
17007	NC_021812	CGT	2	6	958522	958527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827232
17008	NC_021812	T	6	6	958543	958548	0 %	100 %	0 %	0 %	525827232
17009	NC_021812	GCC	2	6	958619	958624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827232
17010	NC_021812	CGC	2	6	958723	958728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827232
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17012	NC_021812	GC	3	6	958779	958784	0 %	0 %	50 %	50 %	525827232
17013	NC_021812	TTA	2	6	958805	958810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525827232
17014	NC_021812	CGC	2	6	958819	958824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827232
17015	NC_021812	TTA	2	6	958841	958846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525827232
17016	NC_021812	CTG	2	6	958900	958905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827232
17017	NC_021812	CAG	2	6	958933	958938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827232
17018	NC_021812	T	6	6	958951	958956	0 %	100 %	0 %	0 %	525827232
17019	NC_021812	TGC	2	6	958973	958978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827232
17020	NC_021812	GCG	2	6	959002	959007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827232
17021	NC_021812	GTC	2	6	959062	959067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827232
17022	NC_021812	CAG	2	6	959086	959091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827232
17023	NC_021812	CGA	2	6	959126	959131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827232
17024	NC_021812	TGAA	2	8	959138	959145	50 %	25 %	25 %	0 %	525827232
17025	NC_021812	CCA	2	6	959250	959255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827232
17026	NC_021812	CGC	3	9	959265	959273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827232
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17030	NC_021812	AGCG	2	8	959321	959328	25 %	0 %	50 %	25 %	525827232
17031	NC_021812	GCC	2	6	959375	959380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827232
17032	NC_021812	CG	3	6	959407	959412	0 %	0 %	50 %	50 %	525827232
17033	NC_021812	CGA	2	6	959420	959425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827232
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17040	NC_021812	ACC	2	6	959888	959893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827233
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17043	NC_021812	CG	3	6	959970	959975	0 %	0 %	50 %	50 %	525827233
17044	NC_021812	CGCTG	2	10	959980	959989	0 %	20 %	40 %	40 %	525827233
17045	NC_021812	GCC	2	6	960005	960010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827233
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17048	NC_021812	TGC	2	6	960192	960197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827233
17049	NC_021812	ATTT	2	8	960229	960236	25 %	75 %	0 %	0 %	525827233
17050	NC_021812	AGC	2	6	960243	960248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827233
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17052	NC_021812	TGA	2	6	960454	960459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827233
17053	NC_021812	TGA	2	6	960542	960547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827233
17054	NC_021812	A	6	6	960547	960552	100 %	0 %	0 %	0 %	525827234
17055	NC_021812	TCG	2	6	960584	960589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827234
17056	NC_021812	TGG	2	6	960610	960615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525827234
17057	NC_021812	CGG	2	6	960693	960698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827234
17058	NC_021812	TGA	2	6	960720	960725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827234
17059	NC_021812	GTCG	2	8	960813	960820	0 %	25 %	50 %	25 %	525827234
17060	NC_021812	GCC	4	12	960877	960888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827234
17061	NC_021812	GCC	2	6	960904	960909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827234
17062	NC_021812	CG	3	6	961001	961006	0 %	0 %	50 %	50 %	525827234
17063	NC_021812	CAGGCG	2	12	961009	961020	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	525827234
17064	NC_021812	GTACC	2	10	961053	961062	20 %	20 %	20 %	40 %	525827234
17065	NC_021812	AGCC	2	8	961095	961102	25 %	0 %	25 %	50 %	525827234
17066	NC_021812	GGCGCA	2	12	961125	961136	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	525827234
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17068	NC_021812	GCA	2	6	961226	961231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827234
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17070	NC_021812	TCAG	2	8	961295	961302	25 %	25 %	25 %	25 %	525827234
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17074	NC_021812	TGAG	2	8	961533	961540	25 %	25 %	50 %	0 %	525827234
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17084	NC_021812	GGCG	2	8	962083	962090	0 %	0 %	75 %	25 %	525827235
17085	NC_021812	CCT	2	6	962115	962120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525827235
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17088	NC_021812	GCT	2	6	962173	962178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827235
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17090	NC_021812	AAC	2	6	962252	962257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525827235
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17093	NC_021812	A	6	6	962339	962344	100 %	0 %	0 %	0 %	525827235
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17097	NC_021812	TCG	2	6	962580	962585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827235
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17101	NC_021812	CTG	2	6	962663	962668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827235
17102	NC_021812	T	6	6	962803	962808	0 %	100 %	0 %	0 %	525827235
17103	NC_021812	CG	3	6	962834	962839	0 %	0 %	50 %	50 %	525827235
17104	NC_021812	A	6	6	962847	962852	100 %	0 %	0 %	0 %	525827235
17105	NC_021812	GCATC	3	15	962886	962900	20 %	20 %	20 %	40 %	525827235
17106	NC_021812	TGA	2	6	962983	962988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827235
17107	NC_021812	CCG	2	6	963016	963021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827235
17108	NC_021812	TGG	2	6	963048	963053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525827235
17109	NC_021812	GAC	2	6	963076	963081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827235
17110	NC_021812	GCC	2	6	963179	963184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827235
17111	NC_021812	TCA	2	6	963231	963236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827235
17112	NC_021812	TC	4	8	963270	963277	0 %	50 %	0 %	50 %	525827236
17113	NC_021812	CGTG	2	8	963287	963294	0 %	25 %	50 %	25 %	525827236
17114	NC_021812	GCTG	2	8	963340	963347	0 %	25 %	50 %	25 %	525827236
17115	NC_021812	GGT	2	6	963353	963358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525827236
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17120	NC_021812	A	6	6	963535	963540	100 %	0 %	0 %	0 %	525827236
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17241	NC_021812	TCA	2	6	969465	969470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830251
17242	NC_021812	T	8	8	969524	969531	0 %	100 %	0 %	0 %	525830251
17243	NC_021812	TGGC	2	8	969536	969543	0 %	25 %	50 %	25 %	525830251
17244	NC_021812	T	6	6	969586	969591	0 %	100 %	0 %	0 %	525830251
17245	NC_021812	TCA	2	6	969627	969632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830251
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17254	NC_021812	AC	4	8	970025	970032	50 %	0 %	0 %	50 %	525830252
17255	NC_021812	AAG	2	6	970040	970045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525830252
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17262	NC_021812	ATC	2	6	970310	970315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827242
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17264	NC_021812	GC	3	6	970374	970379	0 %	0 %	50 %	50 %	525827242
17265	NC_021812	CCAGA	2	10	970507	970516	40 %	0 %	20 %	40 %	525827242
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17269	NC_021812	CAA	2	6	970653	970658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525827242
17270	NC_021812	ATG	2	6	970718	970723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827242
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17272	NC_021812	ACA	3	9	970820	970828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525827242
17273	NC_021812	A	7	7	970846	970852	100 %	0 %	0 %	0 %	525827242
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17352	NC_021812	TGCCT	2	10	975577	975586	0 %	40 %	20 %	40 %	525830253
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17357	NC_021812	A	6	6	975729	975734	100 %	0 %	0 %	0 %	525830253
17358	NC_021812	AGT	2	6	975746	975751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830253
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17482	NC_021812	GCG	2	6	983100	983105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827252
17483	NC_021812	CAC	2	6	983122	983127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827252
17484	NC_021812	CGCCTG	2	12	983165	983176	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	525827252
17485	NC_021812	GGCG	2	8	983177	983184	0 %	0 %	75 %	25 %	525827252
17486	NC_021812	GCA	2	6	983221	983226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827252
17487	NC_021812	GAGCA	2	10	983247	983256	40 %	0 %	40 %	20 %	525827252
17488	NC_021812	CAC	2	6	983294	983299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827252
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17490	NC_021812	CAG	2	6	983328	983333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827252
17491	NC_021812	GCCCC	2	10	983336	983345	0 %	0 %	20 %	80 %	525827252
17492	NC_021812	CAT	2	6	983374	983379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827252
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17494	NC_021812	ATG	2	6	983396	983401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827252
17495	NC_021812	GCG	2	6	983431	983436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827252
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17500	NC_021812	T	8	8	983622	983629	0 %	100 %	0 %	0 %	525827252

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