MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 87728

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021812	ATGCG	2	10	57370	57379	20 %	20 %	40 %	20 %	525826518
1002	NC_021812	TGG	2	6	57418	57423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826518
1003	NC_021812	ATAA	2	8	57577	57584	75 %	25 %	0 %	0 %	525826519
1004	NC_021812	T	6	6	57634	57639	0 %	100 %	0 %	0 %	525826519
1005	NC_021812	CGT	2	6	57670	57675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826519
1006	NC_021812	GC	3	6	57691	57696	0 %	0 %	50 %	50 %	525826519
1007	NC_021812	AGC	2	6	57699	57704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826519
1008	NC_021812	TTCC	2	8	57744	57751	0 %	50 %	0 %	50 %	525826519
1009	NC_021812	CGC	2	6	57801	57806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826519
1010	NC_021812	CAGC	2	8	57826	57833	25 %	0 %	25 %	50 %	525826519
1011	NC_021812	GGCA	2	8	57865	57872	25 %	0 %	50 %	25 %	525826519
1012	NC_021812	GAG	2	6	57903	57908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525826519
1013	NC_021812	TAT	2	6	57909	57914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826519
1014	NC_021812	TTG	2	6	57918	57923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826519
1015	NC_021812	CGC	2	6	58129	58134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826520
1016	NC_021812	CAG	2	6	58136	58141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826520
1017	NC_021812	CGCA	2	8	58237	58244	25 %	0 %	25 %	50 %	525826520
1018	NC_021812	A	6	6	58247	58252	100 %	0 %	0 %	0 %	525826520
1019	NC_021812	CTG	2	6	58286	58291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826520
1020	NC_021812	T	6	6	58334	58339	0 %	100 %	0 %	0 %	525826520
1021	NC_021812	TTA	2	6	58354	58359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826520
1022	NC_021812	GC	3	6	58363	58368	0 %	0 %	50 %	50 %	525826520
1023	NC_021812	ATAA	2	8	58382	58389	75 %	25 %	0 %	0 %	525826520
1024	NC_021812	TAA	2	6	58405	58410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826520
1025	NC_021812	GAA	2	6	58424	58429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826520
1026	NC_021812	CCG	2	6	58440	58445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826520
1027	NC_021812	TCT	2	6	58480	58485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826520
1028	NC_021812	CGC	2	6	58553	58558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826520
1029	NC_021812	A	6	6	58586	58591	100 %	0 %	0 %	0 %	525826520
1030	NC_021812	A	6	6	58605	58610	100 %	0 %	0 %	0 %	525826520
1031	NC_021812	TTC	2	6	58627	58632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826520
1032	NC_021812	ATT	2	6	58683	58688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826521
1033	NC_021812	AGCAAT	2	12	58811	58822	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525826521
1034	NC_021812	CTG	2	6	58892	58897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826521
1035	NC_021812	CAAC	2	8	58929	58936	50 %	0 %	0 %	50 %	525826521
1036	NC_021812	ATA	2	6	58967	58972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826521
1037	NC_021812	GC	3	6	59075	59080	0 %	0 %	50 %	50 %	525826521
1038	NC_021812	GC	3	6	59082	59087	0 %	0 %	50 %	50 %	525826521
1039	NC_021812	ATC	2	6	59117	59122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826521
1040	NC_021812	GAT	2	6	59125	59130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826521
1041	NC_021812	CCG	2	6	59132	59137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826521
1042	NC_021812	GGC	2	6	59176	59181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826521
1043	NC_021812	GC	3	6	59186	59191	0 %	0 %	50 %	50 %	525826521
1044	NC_021812	TGC	2	6	59204	59209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826521
1045	NC_021812	CTGC	2	8	59249	59256	0 %	25 %	25 %	50 %	525826521
1046	NC_021812	ACC	2	6	59321	59326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826521
1047	NC_021812	CA	3	6	59337	59342	50 %	0 %	0 %	50 %	525826521
1048	NC_021812	TAA	2	6	59364	59369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826521
1049	NC_021812	A	6	6	59381	59386	100 %	0 %	0 %	0 %	525826521
1050	NC_021812	GCA	2	6	59493	59498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826522
1051	NC_021812	CAG	2	6	59500	59505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826522
1052	NC_021812	GCG	2	6	59533	59538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826522
1053	NC_021812	CG	4	8	59550	59557	0 %	0 %	50 %	50 %	525826522
1054	NC_021812	CCT	2	6	59586	59591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525826522
1055	NC_021812	TGGT	2	8	59700	59707	0 %	50 %	50 %	0 %	525826522
1056	NC_021812	A	6	6	59724	59729	100 %	0 %	0 %	0 %	525826522
1057	NC_021812	CGT	2	6	59773	59778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826522
1058	NC_021812	CATG	2	8	59834	59841	25 %	25 %	25 %	25 %	525826522
1059	NC_021812	A	6	6	60198	60203	100 %	0 %	0 %	0 %	525826523
1060	NC_021812	GGC	2	6	60212	60217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826523
1061	NC_021812	AAC	2	6	60227	60232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826523
1062	NC_021812	TCT	2	6	60233	60238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826523
1063	NC_021812	GGT	2	6	60321	60326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826523
1064	NC_021812	TAA	2	6	60359	60364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826523
1065	NC_021812	GGC	2	6	60425	60430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826523
1066	NC_021812	CAG	2	6	60533	60538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826523
1067	NC_021812	ACC	2	6	60576	60581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826523
1068	NC_021812	TTC	2	6	60582	60587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826523
1069	NC_021812	TAC	2	6	60737	60742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826523
1070	NC_021812	GCG	2	6	60760	60765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826523
1071	NC_021812	CAT	2	6	60771	60776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826523
1072	NC_021812	GCGT	2	8	60781	60788	0 %	25 %	50 %	25 %	525826523
1073	NC_021812	TCT	2	6	60922	60927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826524
1074	NC_021812	CGC	2	6	60935	60940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826524
1075	NC_021812	TTCT	2	8	60989	60996	0 %	75 %	0 %	25 %	525826524
1076	NC_021812	AGC	2	6	61009	61014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826524
1077	NC_021812	CG	3	6	61025	61030	0 %	0 %	50 %	50 %	525826524
1078	NC_021812	CGC	2	6	61055	61060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826524
1079	NC_021812	CAG	2	6	61067	61072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826524
1080	NC_021812	TCG	2	6	61129	61134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826524
1081	NC_021812	TGT	2	6	61145	61150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826524
1082	NC_021812	CGG	2	6	61176	61181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826524
1083	NC_021812	CGG	2	6	61191	61196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826524
1084	NC_021812	GTT	2	6	61200	61205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826524
1085	NC_021812	CGAAT	2	10	61207	61216	40 %	20 %	20 %	20 %	525826524
1086	NC_021812	AG	3	6	61233	61238	50 %	0 %	50 %	0 %	525826524
1087	NC_021812	TCG	2	6	61294	61299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826524
1088	NC_021812	TCGC	2	8	61331	61338	0 %	25 %	25 %	50 %	525826524
1089	NC_021812	CGC	2	6	61415	61420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826524
1090	NC_021812	GCC	3	9	61440	61448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826524
1091	NC_021812	CAG	2	6	61452	61457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826524
1092	NC_021812	AG	3	6	61456	61461	50 %	0 %	50 %	0 %	525826524
1093	NC_021812	AGCG	2	8	61492	61499	25 %	0 %	50 %	25 %	525826524
1094	NC_021812	TTA	2	6	61552	61557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826524
1095	NC_021812	CTC	2	6	61599	61604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525826524
1096	NC_021812	TC	3	6	61625	61630	0 %	50 %	0 %	50 %	525826524
1097	NC_021812	CAT	3	9	61640	61648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826524
1098	NC_021812	GGC	2	6	61677	61682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826524
1099	NC_021812	GCC	2	6	61701	61706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826524
1100	NC_021812	CAG	3	9	61716	61724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826524
1101	NC_021812	GTT	2	6	61772	61777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826524
1102	NC_021812	T	6	6	61816	61821	0 %	100 %	0 %	0 %	525826525
1103	NC_021812	TCT	2	6	61910	61915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826525
1104	NC_021812	TCG	2	6	61932	61937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826525
1105	NC_021812	T	7	7	61960	61966	0 %	100 %	0 %	0 %	525826525
1106	NC_021812	GCC	3	9	61967	61975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826525
1107	NC_021812	TGC	2	6	62083	62088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826525
1108	NC_021812	CTT	2	6	62145	62150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826525
1109	NC_021812	TGT	2	6	62186	62191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826525
1110	NC_021812	CATGG	2	10	62269	62278	20 %	20 %	40 %	20 %	525826525
1111	NC_021812	ATT	2	6	62392	62397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826526
1112	NC_021812	TTA	2	6	62418	62423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826526
1113	NC_021812	GTTT	2	8	62460	62467	0 %	75 %	25 %	0 %	525826526
1114	NC_021812	TCG	2	6	62472	62477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826526
1115	NC_021812	GCT	2	6	62518	62523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826526
1116	NC_021812	CTT	2	6	62644	62649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826526
1117	NC_021812	CAGATT	2	12	62698	62709	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525826526
1118	NC_021812	CGA	2	6	62710	62715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826526
1119	NC_021812	TTC	2	6	62747	62752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826526
1120	NC_021812	CCG	2	6	63008	63013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826527
1121	NC_021812	ACC	2	6	63025	63030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826527
1122	NC_021812	T	6	6	63031	63036	0 %	100 %	0 %	0 %	525826527
1123	NC_021812	CGC	2	6	63078	63083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826527
1124	NC_021812	ACC	2	6	63148	63153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826527
1125	NC_021812	GGC	2	6	63659	63664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826528
1126	NC_021812	GCC	2	6	63768	63773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826528
1127	NC_021812	GCAC	2	8	63777	63784	25 %	0 %	25 %	50 %	525826528
1128	NC_021812	GAG	2	6	63807	63812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525826528
1129	NC_021812	GCG	2	6	63837	63842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826528
1130	NC_021812	GAT	2	6	63868	63873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826528
1131	NC_021812	AGGT	2	8	63927	63934	25 %	25 %	50 %	0 %	525826528
1132	NC_021812	AGA	2	6	63966	63971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826528
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1134	NC_021812	GCG	2	6	64233	64238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826528
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1165	NC_021812	CAT	2	6	65811	65816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826530
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1225	NC_021812	CGAT	2	8	68486	68493	25 %	25 %	25 %	25 %	525826531
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1231	NC_021812	CCA	2	6	68756	68761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826532
1232	NC_021812	GCGGA	2	10	68764	68773	20 %	0 %	60 %	20 %	525826532
1233	NC_021812	ACCG	2	8	68814	68821	25 %	0 %	25 %	50 %	525826532
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1237	NC_021812	GC	3	6	69066	69071	0 %	0 %	50 %	50 %	525826532
1238	NC_021812	CGGCG	2	10	69167	69176	0 %	0 %	60 %	40 %	525826532
1239	NC_021812	GGC	2	6	69225	69230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826532
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1242	NC_021812	GCG	2	6	69369	69374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826532
1243	NC_021812	CAC	2	6	69381	69386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826532
1244	NC_021812	CG	3	6	69402	69407	0 %	0 %	50 %	50 %	525826532
1245	NC_021812	ACC	2	6	69430	69435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826532
1246	NC_021812	CGG	2	6	69501	69506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826532
1247	NC_021812	GGCG	2	8	69542	69549	0 %	0 %	75 %	25 %	525826532
1248	NC_021812	T	7	7	69608	69614	0 %	100 %	0 %	0 %	525826532
1249	NC_021812	TGA	2	6	69616	69621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826532
1250	NC_021812	TAAA	2	8	69645	69652	75 %	25 %	0 %	0 %	525826532
1251	NC_021812	AGT	2	6	69656	69661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826532
1252	NC_021812	CCG	2	6	69733	69738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826532
1253	NC_021812	CAC	2	6	69774	69779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826532
1254	NC_021812	AG	3	6	69814	69819	50 %	0 %	50 %	0 %	525826532
1255	NC_021812	TAA	2	6	69840	69845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826532
1256	NC_021812	CGGG	2	8	69854	69861	0 %	0 %	75 %	25 %	525826532
1257	NC_021812	GGCA	2	8	69879	69886	25 %	0 %	50 %	25 %	525826532
1258	NC_021812	GC	3	6	70001	70006	0 %	0 %	50 %	50 %	525826532
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1261	NC_021812	CAG	3	9	70062	70070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826532
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1273	NC_021812	CG	3	6	70942	70947	0 %	0 %	50 %	50 %	525826533
1274	NC_021812	CCG	2	6	70967	70972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826533
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