MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 87728

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_021812	GAT	2	6	649829	649834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826997
11502	NC_021812	GGC	2	6	649853	649858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826997
11503	NC_021812	C	6	6	649870	649875	0 %	0 %	0 %	100 %	525826997
11504	NC_021812	TCG	2	6	649921	649926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826997
11505	NC_021812	ATT	2	6	649932	649937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826997
11506	NC_021812	CTG	3	9	649944	649952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826997
11507	NC_021812	GCG	2	6	650013	650018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826997
11508	NC_021812	GC	3	6	650023	650028	0 %	0 %	50 %	50 %	525826997
11509	NC_021812	TGC	2	6	650029	650034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826997
11510	NC_021812	CTG	2	6	650049	650054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826997
11511	NC_021812	ACCA	2	8	650067	650074	50 %	0 %	0 %	50 %	525826997
11512	NC_021812	GTG	2	6	650202	650207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826997
11513	NC_021812	CTAT	2	8	650218	650225	25 %	50 %	0 %	25 %	525826997
11514	NC_021812	ACG	2	6	650240	650245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826997
11515	NC_021812	AAT	2	6	650263	650268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826997
11516	NC_021812	TGA	2	6	650347	650352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826998
11517	NC_021812	GAA	2	6	650370	650375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826998
11518	NC_021812	GAA	2	6	650394	650399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826998
11519	NC_021812	GCA	2	6	650444	650449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826998
11520	NC_021812	CAT	2	6	650486	650491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826998
11521	NC_021812	GTG	2	6	650551	650556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826998
11522	NC_021812	ATG	2	6	650587	650592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826998
11523	NC_021812	GTG	2	6	650739	650744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826999
11524	NC_021812	CTG	2	6	650887	650892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826999
11525	NC_021812	ATA	2	6	650893	650898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826999
11526	NC_021812	GA	3	6	651073	651078	50 %	0 %	50 %	0 %	525827000
11527	NC_021812	TC	3	6	651106	651111	0 %	50 %	0 %	50 %	525827000
11528	NC_021812	CGTTT	2	10	651202	651211	0 %	60 %	20 %	20 %	525827000
11529	NC_021812	GCAT	2	8	651320	651327	25 %	25 %	25 %	25 %	525827000
11530	NC_021812	CGG	2	6	651347	651352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827000
11531	NC_021812	GGC	2	6	651395	651400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827000
11532	NC_021812	GCCA	2	8	651515	651522	25 %	0 %	25 %	50 %	525827000
11533	NC_021812	CAG	3	9	651574	651582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827000
11534	NC_021812	ATC	2	6	651625	651630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827000
11535	NC_021812	ACAGCG	2	12	651747	651758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827000
11536	NC_021812	ATA	2	6	651809	651814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525827000
11537	NC_021812	AGC	2	6	651818	651823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827000
11538	NC_021812	CAG	2	6	651835	651840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827000
11539	NC_021812	TCA	2	6	652080	652085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827000
11540	NC_021812	GCG	2	6	652102	652107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827000
11541	NC_021812	CAG	2	6	652126	652131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827000
11542	NC_021812	GGC	2	6	652136	652141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827000
11543	NC_021812	GCC	2	6	652208	652213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827000
11544	NC_021812	CGAA	2	8	652245	652252	50 %	0 %	25 %	25 %	525827000
11545	NC_021812	GCG	2	6	652266	652271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827000
11546	NC_021812	AGT	2	6	652326	652331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827000
11547	NC_021812	CGG	2	6	652362	652367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827000
11548	NC_021812	ATCC	2	8	652423	652430	25 %	25 %	0 %	50 %	525827000
11549	NC_021812	CGC	2	6	652509	652514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827000
11550	NC_021812	TCA	2	6	652515	652520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827000
11551	NC_021812	CAC	2	6	652537	652542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827000
11552	NC_021812	GCG	2	6	652567	652572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827000
11553	NC_021812	CGG	4	12	652610	652621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827000
11554	NC_021812	A	6	6	652629	652634	100 %	0 %	0 %	0 %	525827000
11555	NC_021812	TCCA	2	8	652667	652674	25 %	25 %	0 %	50 %	525827000
11556	NC_021812	GCG	2	6	652742	652747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827000
11557	NC_021812	CG	3	6	652777	652782	0 %	0 %	50 %	50 %	525827000
11558	NC_021812	CAG	2	6	652958	652963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827000
11559	NC_021812	GCA	2	6	652998	653003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827000
11560	NC_021812	CCA	2	6	653046	653051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827000
11561	NC_021812	TGA	2	6	653064	653069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827000
11562	NC_021812	CGA	2	6	653115	653120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827000
11563	NC_021812	GCG	2	6	653155	653160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827000
11564	NC_021812	GCTC	2	8	653187	653194	0 %	25 %	25 %	50 %	525827000
11565	NC_021812	CTT	2	6	653202	653207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525827000
11566	NC_021812	GCG	2	6	653229	653234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827000
11567	NC_021812	GGTT	2	8	653277	653284	0 %	50 %	50 %	0 %	525827000
11568	NC_021812	TCA	2	6	653351	653356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827000
11569	NC_021812	TTAA	2	8	653360	653367	50 %	50 %	0 %	0 %	525827000
11570	NC_021812	TCT	2	6	653438	653443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525827000
11571	NC_021812	AGC	2	6	653531	653536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827000
11572	NC_021812	GTT	2	6	653555	653560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525827000
11573	NC_021812	TTC	2	6	653646	653651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525827001
11574	NC_021812	GCA	2	6	653671	653676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827001
11575	NC_021812	CGG	2	6	653774	653779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827001
11576	NC_021812	T	6	6	653783	653788	0 %	100 %	0 %	0 %	525827001
11577	NC_021812	CCA	2	6	653809	653814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827001
11578	NC_021812	GCG	2	6	653876	653881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827001
11579	NC_021812	GCA	2	6	653887	653892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827001
11580	NC_021812	CGA	2	6	654004	654009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827001
11581	NC_021812	TCA	2	6	654024	654029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827001
11582	NC_021812	ACCTT	2	10	654054	654063	20 %	40 %	0 %	40 %	525827001
11583	NC_021812	GCT	2	6	654194	654199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827001
11584	NC_021812	GTC	2	6	654303	654308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827001
11585	NC_021812	CCA	2	6	654406	654411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827001
11586	NC_021812	CG	4	8	654455	654462	0 %	0 %	50 %	50 %	525827001
11587	NC_021812	CG	3	6	654583	654588	0 %	0 %	50 %	50 %	525827001
11588	NC_021812	TCG	2	6	654657	654662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827001
11589	NC_021812	CGT	2	6	654791	654796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827001
11590	NC_021812	GTT	2	6	654878	654883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525827001
11591	NC_021812	CTG	2	6	654914	654919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827001
11592	NC_021812	TCA	2	6	655017	655022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827001
11593	NC_021812	GAT	2	6	655041	655046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827001
11594	NC_021812	ATA	2	6	655062	655067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525827001
11595	NC_021812	CAAC	2	8	655076	655083	50 %	0 %	0 %	50 %	525827001
11596	NC_021812	TCA	2	6	655090	655095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827001
11597	NC_021812	ATA	2	6	655113	655118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525827001
11598	NC_021812	CGC	2	6	655384	655389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827002
11599	NC_021812	TGT	2	6	655426	655431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525827002
11600	NC_021812	GTG	2	6	655502	655507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525827002
11601	NC_021812	T	6	6	655554	655559	0 %	100 %	0 %	0 %	525827002
11602	NC_021812	TGT	2	6	655585	655590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525827002
11603	NC_021812	TGG	2	6	655614	655619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525827002
11604	NC_021812	CT	3	6	655734	655739	0 %	50 %	0 %	50 %	525827002
11605	NC_021812	ATA	2	6	655753	655758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525827002
11606	NC_021812	CTGGTG	2	12	655797	655808	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	525827002
11607	NC_021812	A	6	6	655849	655854	100 %	0 %	0 %	0 %	525827002
11608	NC_021812	CAAG	2	8	655864	655871	50 %	0 %	25 %	25 %	525827002
11609	NC_021812	CGC	2	6	655880	655885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827002
11610	NC_021812	T	7	7	655912	655918	0 %	100 %	0 %	0 %	525827002
11611	NC_021812	CTG	2	6	655920	655925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827002
11612	NC_021812	GCT	2	6	655938	655943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827002
11613	NC_021812	T	6	6	656034	656039	0 %	100 %	0 %	0 %	525827002
11614	NC_021812	TTCA	2	8	656058	656065	25 %	50 %	0 %	25 %	525827002
11615	NC_021812	GC	3	6	656079	656084	0 %	0 %	50 %	50 %	525827002
11616	NC_021812	CAC	2	6	656087	656092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827002
11617	NC_021812	CTG	2	6	656142	656147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827002
11618	NC_021812	GCG	2	6	656164	656169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827002
11619	NC_021812	CG	3	6	656273	656278	0 %	0 %	50 %	50 %	525827002
11620	NC_021812	TATC	2	8	656309	656316	25 %	50 %	0 %	25 %	525827002
11621	NC_021812	CAT	2	6	656322	656327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827002
11622	NC_021812	CGC	2	6	656359	656364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827002
11623	NC_021812	TCC	2	6	656370	656375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525827002
11624	NC_021812	TG	3	6	656392	656397	0 %	50 %	50 %	0 %	525827002
11625	NC_021812	CCG	2	6	656484	656489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827002
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11641	NC_021812	CTGG	2	8	657271	657278	0 %	25 %	50 %	25 %	525827003
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11655	NC_021812	CAG	2	6	657763	657768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827003
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11728	NC_021812	AGT	2	6	662227	662232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827009
11729	NC_021812	GCT	2	6	662233	662238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827009
11730	NC_021812	T	6	6	662244	662249	0 %	100 %	0 %	0 %	525827009
11731	NC_021812	TGG	2	6	662302	662307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525827009
11732	NC_021812	TTG	2	6	662456	662461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525827009
11733	NC_021812	TAT	2	6	662509	662514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525827009
11734	NC_021812	CAGCTC	2	12	662537	662548	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525827009
11735	NC_021812	GAA	2	6	662571	662576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525827009
11736	NC_021812	CTTA	2	8	662661	662668	25 %	50 %	0 %	25 %	525827010
11737	NC_021812	TTG	2	6	662686	662691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525827010
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11850	NC_021812	CAG	2	6	668532	668537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827015
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11854	NC_021812	AGAAC	2	10	668780	668789	60 %	0 %	20 %	20 %	525827015
11855	NC_021812	AATA	2	8	668790	668797	75 %	25 %	0 %	0 %	525827015
11856	NC_021812	CTT	2	6	668903	668908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525827015
11857	NC_021812	A	7	7	668976	668982	100 %	0 %	0 %	0 %	525827015
11858	NC_021812	GCA	2	6	668983	668988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827015
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11981	NC_021812	CA	3	6	676868	676873	50 %	0 %	0 %	50 %	525830197
11982	NC_021812	CAC	2	6	676884	676889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525830197
11983	NC_021812	ATG	2	6	676922	676927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830197
11984	NC_021812	ACC	3	9	676948	676956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525830197
11985	NC_021812	GA	4	8	676958	676965	50 %	0 %	50 %	0 %	525830197
11986	NC_021812	ACT	2	6	676987	676992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830197
11987	NC_021812	CGG	2	6	677664	677669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830198
11988	NC_021812	GCT	2	6	677716	677721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830198
11989	NC_021812	CCAG	2	8	677801	677808	25 %	0 %	25 %	50 %	525830198
11990	NC_021812	AAT	2	6	677844	677849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830198
11991	NC_021812	GC	3	6	677861	677866	0 %	0 %	50 %	50 %	525830198
11992	NC_021812	ACA	2	6	677905	677910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525830198
11993	NC_021812	CGC	2	6	677979	677984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830198
11994	NC_021812	ACC	2	6	678007	678012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525830198
11995	NC_021812	GCTG	2	8	678047	678054	0 %	25 %	50 %	25 %	525830198
11996	NC_021812	TA	3	6	678077	678082	50 %	50 %	0 %	0 %	525830198
11997	NC_021812	CCG	2	6	678140	678145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830198
11998	NC_021812	CAG	2	6	678159	678164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830198
11999	NC_021812	AATA	2	8	678207	678214	75 %	25 %	0 %	0 %	525830198
12000	NC_021812	CACCGC	2	12	678288	678299	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	525830198

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