MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 87728

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_021812	AACTC	2	10	395846	395855	40 %	20 %	0 %	40 %	525826784
7003	NC_021812	AAT	2	6	395898	395903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826784
7004	NC_021812	CAG	2	6	395922	395927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826784
7005	NC_021812	CTCA	2	8	395988	395995	25 %	25 %	0 %	50 %	525826784
7006	NC_021812	CATAT	2	10	396000	396009	40 %	40 %	0 %	20 %	525826784
7007	NC_021812	CCG	2	6	396031	396036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826784
7008	NC_021812	AAC	2	6	396051	396056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826784
7009	NC_021812	AAT	2	6	396057	396062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826784
7010	NC_021812	CTG	2	6	396129	396134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826784
7011	NC_021812	TTTG	2	8	396206	396213	0 %	75 %	25 %	0 %	525826784
7012	NC_021812	ATG	2	6	396301	396306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826784
7013	NC_021812	CCAAC	2	10	396317	396326	40 %	0 %	0 %	60 %	525826784
7014	NC_021812	TCC	2	6	396336	396341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525826784
7015	NC_021812	TGT	2	6	396385	396390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826784
7016	NC_021812	GTA	2	6	396439	396444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826784
7017	NC_021812	TAA	2	6	396450	396455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826784
7018	NC_021812	CAT	2	6	396579	396584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826784
7019	NC_021812	TAA	2	6	396597	396602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826784
7020	NC_021812	GAT	2	6	396715	396720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830144
7021	NC_021812	CGG	2	6	396739	396744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830144
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7025	NC_021812	TTC	2	6	396860	396865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525830144
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7028	NC_021812	ATCC	2	8	397037	397044	25 %	25 %	0 %	50 %	525830144
7029	NC_021812	TCG	2	6	397164	397169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826785
7030	NC_021812	GTT	2	6	397210	397215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826785
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7033	NC_021812	GGC	2	6	397335	397340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826785
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7035	NC_021812	ACG	2	6	397400	397405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826785
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7039	NC_021812	T	6	6	397703	397708	0 %	100 %	0 %	0 %	525826785
7040	NC_021812	T	6	6	397710	397715	0 %	100 %	0 %	0 %	525826785
7041	NC_021812	CCG	2	6	397722	397727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826785
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7043	NC_021812	GCA	2	6	397849	397854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826785
7044	NC_021812	CTG	2	6	397859	397864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826785
7045	NC_021812	TTC	2	6	397937	397942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826785
7046	NC_021812	CGT	2	6	397967	397972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826785
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7050	NC_021812	TTG	2	6	398535	398540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826786
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7052	NC_021812	T	6	6	398588	398593	0 %	100 %	0 %	0 %	525826786
7053	NC_021812	TTG	2	6	398643	398648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826786
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7055	NC_021812	GAAGT	2	10	398738	398747	40 %	20 %	40 %	0 %	525826786
7056	NC_021812	TAA	2	6	398825	398830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830145
7057	NC_021812	TTG	2	6	398906	398911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525830145
7058	NC_021812	GGA	2	6	398922	398927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525830145
7059	NC_021812	CAAC	2	8	398951	398958	50 %	0 %	0 %	50 %	525830145
7060	NC_021812	TAA	2	6	399367	399372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826787
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7065	NC_021812	TCT	2	6	399759	399764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826787
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7069	NC_021812	T	8	8	399922	399929	0 %	100 %	0 %	0 %	525826787
7070	NC_021812	ATG	2	6	399940	399945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826787
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7073	NC_021812	TTA	2	6	400084	400089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525830146
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7087	NC_021812	TGGCC	2	10	400748	400757	0 %	20 %	40 %	40 %	525826789
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7092	NC_021812	A	6	6	401189	401194	100 %	0 %	0 %	0 %	525830147
7093	NC_021812	ATG	2	6	401229	401234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830147
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7095	NC_021812	GCG	2	6	401306	401311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830147
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7101	NC_021812	AAT	2	6	401749	401754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826790
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7103	NC_021812	TAA	2	6	401894	401899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826790
7104	NC_021812	AGCA	2	8	402046	402053	50 %	0 %	25 %	25 %	525826790
7105	NC_021812	GCC	2	6	402075	402080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826790
7106	NC_021812	GCA	2	6	402129	402134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826790
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7109	NC_021812	GGA	2	6	402279	402284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525826790
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7112	NC_021812	ATT	2	6	402408	402413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826791
7113	NC_021812	CT	3	6	402482	402487	0 %	50 %	0 %	50 %	525826791
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7117	NC_021812	CAT	2	6	402611	402616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826791
7118	NC_021812	GCCA	2	8	402623	402630	25 %	0 %	25 %	50 %	525826791
7119	NC_021812	GC	3	6	402693	402698	0 %	0 %	50 %	50 %	525826791
7120	NC_021812	AAT	2	6	402700	402705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826791
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7122	NC_021812	ATA	2	6	402760	402765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826791
7123	NC_021812	TATTT	2	10	402788	402797	20 %	80 %	0 %	0 %	525826791
7124	NC_021812	TCT	2	6	402804	402809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826791
7125	NC_021812	TCA	3	9	402811	402819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826791
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7142	NC_021812	GGAG	2	8	403804	403811	25 %	0 %	75 %	0 %	525826792
7143	NC_021812	GAA	2	6	403820	403825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826792
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7145	NC_021812	GC	3	6	403898	403903	0 %	0 %	50 %	50 %	525826793
7146	NC_021812	CAGC	2	8	403904	403911	25 %	0 %	25 %	50 %	525826793
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7153	NC_021812	T	7	7	404208	404214	0 %	100 %	0 %	0 %	525826793
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7206	NC_021812	CT	3	6	406608	406613	0 %	50 %	0 %	50 %	525830149
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7230	NC_021812	TGA	2	6	407661	407666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826797
7231	NC_021812	ATC	2	6	407750	407755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826797
7232	NC_021812	TCA	2	6	407850	407855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826797
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7238	NC_021812	TAACTC	2	12	408253	408264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826797
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7240	NC_021812	TC	3	6	408303	408308	0 %	50 %	0 %	50 %	525826797
7241	NC_021812	AAT	2	6	408311	408316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826797
7242	NC_021812	T	6	6	408316	408321	0 %	100 %	0 %	0 %	525826797
7243	NC_021812	TTCA	2	8	408380	408387	25 %	50 %	0 %	25 %	525826797
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7367	NC_021812	GAC	2	6	415443	415448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826802
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7371	NC_021812	ATG	2	6	415610	415615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826802
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7380	NC_021812	CTT	2	6	415920	415925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826802
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7384	NC_021812	CGGG	2	8	416077	416084	0 %	0 %	75 %	25 %	525826802
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7391	NC_021812	T	6	6	416712	416717	0 %	100 %	0 %	0 %	525830152
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7480	NC_021812	AGGCGC	2	12	421100	421111	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	525826806
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7484	NC_021812	GC	4	8	421346	421353	0 %	0 %	50 %	50 %	525826806
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7488	NC_021812	GGC	2	6	421483	421488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826806
7489	NC_021812	GGAC	2	8	421512	421519	25 %	0 %	50 %	25 %	525826806
7490	NC_021812	GC	3	6	421521	421526	0 %	0 %	50 %	50 %	525826806
7491	NC_021812	CGA	2	6	421611	421616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826806
7492	NC_021812	CGT	2	6	421636	421641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826806
7493	NC_021812	GCA	2	6	421661	421666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826806
7494	NC_021812	GC	3	6	421676	421681	0 %	0 %	50 %	50 %	525826806
7495	NC_021812	CGT	2	6	421884	421889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826806
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7497	NC_021812	GCA	2	6	422058	422063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826806
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