MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 87728

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021812	GGC	2	6	340235	340240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826740
6002	NC_021812	ATG	2	6	340275	340280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826740
6003	NC_021812	CAA	2	6	340282	340287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826740
6004	NC_021812	GGC	2	6	340361	340366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826740
6005	NC_021812	CAAA	2	8	340371	340378	75 %	0 %	0 %	25 %	525826740
6006	NC_021812	CGG	2	6	340431	340436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826740
6007	NC_021812	TTTC	2	8	340437	340444	0 %	75 %	0 %	25 %	525826740
6008	NC_021812	AAC	2	6	340475	340480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826740
6009	NC_021812	GAT	2	6	340490	340495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826740
6010	NC_021812	CTAC	2	8	340527	340534	25 %	25 %	0 %	50 %	525826740
6011	NC_021812	CAA	2	6	340540	340545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826740
6012	NC_021812	CTG	2	6	340580	340585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826740
6013	NC_021812	GAT	2	6	340586	340591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826740
6014	NC_021812	GAC	2	6	340592	340597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826740
6015	NC_021812	TGA	2	6	340627	340632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826740
6016	NC_021812	TCG	2	6	340635	340640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826740
6017	NC_021812	ATT	2	6	340666	340671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826740
6018	NC_021812	CCG	2	6	340898	340903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830132
6019	NC_021812	CCCG	2	8	340904	340911	0 %	0 %	25 %	75 %	525830132
6020	NC_021812	ATT	2	6	340921	340926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525830132
6021	NC_021812	ATC	2	6	340942	340947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830132
6022	NC_021812	ATG	2	6	340955	340960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830132
6023	NC_021812	GC	3	6	340976	340981	0 %	0 %	50 %	50 %	525830132
6024	NC_021812	GAT	2	6	341017	341022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830132
6025	NC_021812	GCG	2	6	341042	341047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830132
6026	NC_021812	CGG	2	6	341124	341129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830132
6027	NC_021812	CGT	2	6	341212	341217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830132
6028	NC_021812	ATC	2	6	341318	341323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830132
6029	NC_021812	CTC	2	6	341402	341407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525830132
6030	NC_021812	ATT	2	6	341463	341468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525830132
6031	NC_021812	CGC	2	6	341478	341483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830132
6032	NC_021812	AGT	2	6	341509	341514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830132
6033	NC_021812	GGT	2	6	341530	341535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525830132
6034	NC_021812	CAT	2	6	341580	341585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830132
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6036	NC_021812	TGG	2	6	341792	341797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525830132
6037	NC_021812	GAAT	2	8	341801	341808	50 %	25 %	25 %	0 %	525830132
6038	NC_021812	TTC	2	6	341835	341840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525830132
6039	NC_021812	GCA	2	6	341970	341975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830132
6040	NC_021812	CGC	2	6	342143	342148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830132
6041	NC_021812	TGGC	2	8	342182	342189	0 %	25 %	50 %	25 %	525830132
6042	NC_021812	ATATC	2	10	342240	342249	40 %	40 %	0 %	20 %	525830132
6043	NC_021812	AGCG	2	8	342289	342296	25 %	0 %	50 %	25 %	525830132
6044	NC_021812	TA	3	6	342323	342328	50 %	50 %	0 %	0 %	525830132
6045	NC_021812	GCC	2	6	342337	342342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830132
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6047	NC_021812	TGA	2	6	342634	342639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826741
6048	NC_021812	CCG	2	6	342724	342729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826741
6049	NC_021812	CG	3	6	342732	342737	0 %	0 %	50 %	50 %	525826741
6050	NC_021812	GGCA	2	8	342738	342745	25 %	0 %	50 %	25 %	525826741
6051	NC_021812	CGA	2	6	342752	342757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826741
6052	NC_021812	TGA	2	6	342760	342765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826741
6053	NC_021812	CCG	2	6	342807	342812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826741
6054	NC_021812	CT	3	6	342852	342857	0 %	50 %	0 %	50 %	525826741
6055	NC_021812	GCC	2	6	342900	342905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826741
6056	NC_021812	CTG	2	6	343041	343046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826741
6057	NC_021812	TC	3	6	343077	343082	0 %	50 %	0 %	50 %	525826741
6058	NC_021812	CCG	2	6	343141	343146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826741
6059	NC_021812	A	6	6	343269	343274	100 %	0 %	0 %	0 %	525826741
6060	NC_021812	CGC	2	6	343309	343314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826741
6061	NC_021812	CCG	2	6	343359	343364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826741
6062	NC_021812	GAA	2	6	343413	343418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826741
6063	NC_021812	GC	3	6	343431	343436	0 %	0 %	50 %	50 %	525826741
6064	NC_021812	GACC	2	8	343440	343447	25 %	0 %	25 %	50 %	525826741
6065	NC_021812	GC	3	6	343573	343578	0 %	0 %	50 %	50 %	525826741
6066	NC_021812	CTG	2	6	343614	343619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826741
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6069	NC_021812	GGC	2	6	343788	343793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826741
6070	NC_021812	CGT	2	6	343847	343852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826741
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6075	NC_021812	CAG	2	6	344253	344258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826742
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6079	NC_021812	ACC	2	6	344376	344381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826742
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6083	NC_021812	CGC	2	6	344599	344604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826742
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6086	NC_021812	GCA	2	6	344681	344686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826742
6087	NC_021812	CAG	2	6	344751	344756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826742
6088	NC_021812	ATA	2	6	344860	344865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826742
6089	NC_021812	ATT	2	6	344907	344912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826742
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6091	NC_021812	CTT	2	6	345049	345054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826743
6092	NC_021812	CTT	2	6	345062	345067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826743
6093	NC_021812	CCG	2	6	345076	345081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826743
6094	NC_021812	TTGA	2	8	345188	345195	25 %	50 %	25 %	0 %	525826743
6095	NC_021812	GCCAT	2	10	345201	345210	20 %	20 %	20 %	40 %	525826743
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6097	NC_021812	GCCA	2	8	345447	345454	25 %	0 %	25 %	50 %	525826743
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6101	NC_021812	GGGT	2	8	345624	345631	0 %	25 %	75 %	0 %	525826743
6102	NC_021812	CCG	2	6	345657	345662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826743
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6106	NC_021812	CGC	2	6	345982	345987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826743
6107	NC_021812	TCAT	2	8	346020	346027	25 %	50 %	0 %	25 %	525826743
6108	NC_021812	TCA	2	6	346080	346085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826743
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6110	NC_021812	GCC	2	6	346113	346118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826743
6111	NC_021812	CCG	2	6	346141	346146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826743
6112	NC_021812	CAA	2	6	346148	346153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826743
6113	NC_021812	GCA	2	6	346176	346181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826743
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6115	NC_021812	C	6	6	346273	346278	0 %	0 %	0 %	100 %	525826743
6116	NC_021812	GCG	2	6	346325	346330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826743
6117	NC_021812	GC	4	8	346522	346529	0 %	0 %	50 %	50 %	525826744
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6122	NC_021812	TAC	2	6	346668	346673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826744
6123	NC_021812	GCC	2	6	346696	346701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826744
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6125	NC_021812	CTG	2	6	346750	346755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826744
6126	NC_021812	GCC	2	6	346789	346794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826744
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6232	NC_021812	GCT	2	6	353851	353856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826748
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6243	NC_021812	AAAG	2	8	354810	354817	75 %	0 %	25 %	0 %	525826749
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6250	NC_021812	CATTA	2	10	355164	355173	40 %	40 %	0 %	20 %	525830134
6251	NC_021812	GCT	2	6	355178	355183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830134
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6353	NC_021812	GCCC	2	8	360042	360049	0 %	0 %	25 %	75 %	525826754
6354	NC_021812	CA	3	6	360060	360065	50 %	0 %	0 %	50 %	525826754
6355	NC_021812	TCGC	2	8	360077	360084	0 %	25 %	25 %	50 %	525826754
6356	NC_021812	GAT	2	6	360088	360093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826754
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6362	NC_021812	GTG	2	6	360376	360381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826754
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6364	NC_021812	CTCTG	2	10	360509	360518	0 %	40 %	20 %	40 %	525826755
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6366	NC_021812	GGT	2	6	360695	360700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826755
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6368	NC_021812	TTG	3	9	360790	360798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826755
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6370	NC_021812	CTG	2	6	360951	360956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826755
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6479	NC_021812	CAG	2	6	367845	367850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826761
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6488	NC_021812	CCG	2	6	368350	368355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826762
6489	NC_021812	GCC	2	6	368379	368384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826762
6490	NC_021812	AGC	2	6	368389	368394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826762
6491	NC_021812	CCG	2	6	368414	368419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826762
6492	NC_021812	CG	4	8	368447	368454	0 %	0 %	50 %	50 %	525826762
6493	NC_021812	GCA	2	6	368536	368541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826762
6494	NC_021812	GCA	2	6	368567	368572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826762
6495	NC_021812	GAA	2	6	368576	368581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826762
6496	NC_021812	CTT	2	6	368591	368596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826762
6497	NC_021812	GC	3	6	368627	368632	0 %	0 %	50 %	50 %	525826762
6498	NC_021812	CATC	2	8	368651	368658	25 %	25 %	0 %	50 %	525826762
6499	NC_021812	GCC	2	6	368730	368735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826762
6500	NC_021812	GCG	2	6	368801	368806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826762

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