MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578 plasmid pSEEH1578_01

Total Repeats: 1901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021811	TGC	2	6	29190	29195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525811142
502	NC_021811	ACA	2	6	29237	29242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525811142
503	NC_021811	TGT	2	6	29252	29257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525811142
504	NC_021811	TGT	2	6	29276	29281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525811142
505	NC_021811	AAC	2	6	29285	29290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525811142
506	NC_021811	TG	3	6	29321	29326	0 %	50 %	50 %	0 %	525811142
507	NC_021811	TTC	2	6	29332	29337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525811142
508	NC_021811	CTTT	2	8	29378	29385	0 %	75 %	0 %	25 %	525811142
509	NC_021811	ACG	2	6	29479	29484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525811142
510	NC_021811	GCCA	2	8	29541	29548	25 %	0 %	25 %	50 %	525811142
511	NC_021811	CAG	2	6	29578	29583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525811142
512	NC_021811	GAC	2	6	29760	29765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525811142
513	NC_021811	CTG	2	6	29773	29778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525811142
514	NC_021811	T	6	6	29799	29804	0 %	100 %	0 %	0 %	525811142
515	NC_021811	T	7	7	29901	29907	0 %	100 %	0 %	0 %	525811142
516	NC_021811	AGG	2	6	29928	29933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525811142
517	NC_021811	CCAT	2	8	29978	29985	25 %	25 %	0 %	50 %	525811142
518	NC_021811	GAC	2	6	30036	30041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525811142
519	NC_021811	GTTT	2	8	30119	30126	0 %	75 %	25 %	0 %	525811142
520	NC_021811	T	7	7	30124	30130	0 %	100 %	0 %	0 %	525811142
521	NC_021811	ACGAT	2	10	30179	30188	40 %	20 %	20 %	20 %	525811142
522	NC_021811	GGCA	2	8	30252	30259	25 %	0 %	50 %	25 %	525811142
523	NC_021811	TGCC	2	8	30514	30521	0 %	25 %	25 %	50 %	525811142
524	NC_021811	CAA	2	6	30672	30677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525811142
525	NC_021811	GTT	2	6	30702	30707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525811142
526	NC_021811	GAA	3	9	30716	30724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525811142
527	NC_021811	GTCAT	2	10	30746	30755	20 %	40 %	20 %	20 %	525811142
528	NC_021811	CGAA	2	8	30786	30793	50 %	0 %	25 %	25 %	525811142
529	NC_021811	CAA	2	6	30895	30900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525811143
530	NC_021811	AACA	2	8	30941	30948	75 %	0 %	0 %	25 %	525811143
531	NC_021811	CAT	2	6	30994	30999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525811143
532	NC_021811	TGC	2	6	31028	31033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525811143
533	NC_021811	TCATCC	2	12	31092	31103	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	525811143
534	NC_021811	CTT	2	6	31155	31160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525811143
535	NC_021811	TCAC	2	8	31170	31177	25 %	25 %	0 %	50 %	525811143
536	NC_021811	A	6	6	31419	31424	100 %	0 %	0 %	0 %	525811144
537	NC_021811	GAT	2	6	31434	31439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525811144
538	NC_021811	GCT	2	6	31458	31463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525811144
539	NC_021811	TGA	2	6	31529	31534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525811144
540	NC_021811	ATT	2	6	31536	31541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525811144
541	NC_021811	GA	3	6	31615	31620	50 %	0 %	50 %	0 %	525811144
542	NC_021811	ATT	2	6	31635	31640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525811144
543	NC_021811	A	6	6	31656	31661	100 %	0 %	0 %	0 %	525811144
544	NC_021811	TTC	2	6	31673	31678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525811144
545	NC_021811	CAGG	2	8	31708	31715	25 %	0 %	50 %	25 %	525811144
546	NC_021811	AAC	2	6	31734	31739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525811144
547	NC_021811	GGC	2	6	31841	31846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525811145
548	NC_021811	AAT	2	6	31870	31875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525811145
549	NC_021811	CAA	2	6	31890	31895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525811145
550	NC_021811	CAG	2	6	32056	32061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525811145
551	NC_021811	CAG	2	6	32140	32145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525811145
552	NC_021811	AAT	2	6	32152	32157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525811145
553	NC_021811	ATT	2	6	32182	32187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525811145
554	NC_021811	ATCA	2	8	32221	32228	50 %	25 %	0 %	25 %	525811145
555	NC_021811	TCA	2	6	32319	32324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525811145
556	NC_021811	GCTG	2	8	32325	32332	0 %	25 %	50 %	25 %	525811145
557	NC_021811	TCA	2	6	32339	32344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525811145
558	NC_021811	TCA	2	6	32385	32390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525811145
559	NC_021811	CTT	2	6	32439	32444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525811145
560	NC_021811	CGA	2	6	32459	32464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525811145
561	NC_021811	GC	3	6	32533	32538	0 %	0 %	50 %	50 %	525811145
562	NC_021811	GAT	2	6	32596	32601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525811145
563	NC_021811	CAG	2	6	32655	32660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525811145
564	NC_021811	TCA	2	6	32676	32681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525811145
565	NC_021811	GGA	2	6	33392	33397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525811146
566	NC_021811	CTG	2	6	33424	33429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525811146
567	NC_021811	ATC	2	6	33460	33465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525811146
568	NC_021811	TG	3	6	33504	33509	0 %	50 %	50 %	0 %	525811146
569	NC_021811	TCA	2	6	33548	33553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525811147
570	NC_021811	TTC	2	6	33571	33576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525811147
571	NC_021811	CCT	2	6	33594	33599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525811147
572	NC_021811	ACA	2	6	33858	33863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525811148
573	NC_021811	CCG	2	6	33864	33869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525811148
574	NC_021811	CAC	2	6	33876	33881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525811148
575	NC_021811	TGT	3	9	33951	33959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525811148
576	NC_021811	CAG	2	6	34012	34017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525811148
577	NC_021811	GCC	2	6	34124	34129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525811148
578	NC_021811	CTG	2	6	34140	34145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525811148
579	NC_021811	GTG	2	6	34205	34210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525811148
580	NC_021811	TGCA	2	8	34228	34235	25 %	25 %	25 %	25 %	525811148
581	NC_021811	ACC	2	6	34312	34317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525811148
582	NC_021811	TGGA	2	8	34366	34373	25 %	25 %	50 %	0 %	525811148
583	NC_021811	TCCGG	2	10	34380	34389	0 %	20 %	40 %	40 %	525811148
584	NC_021811	CCG	2	6	34407	34412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525811148
585	NC_021811	TCA	2	6	34439	34444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525811148
586	NC_021811	ATC	2	6	34513	34518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525811148
587	NC_021811	CAG	2	6	34576	34581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525811148
588	NC_021811	GAC	2	6	34638	34643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525811148
589	NC_021811	ACA	2	6	34697	34702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525811148
590	NC_021811	GCT	2	6	34828	34833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525811148
591	NC_021811	ACATC	2	10	34856	34865	40 %	20 %	0 %	40 %	525811148
592	NC_021811	CAC	3	9	34881	34889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525811148
593	NC_021811	CCGG	2	8	34911	34918	0 %	0 %	50 %	50 %	525811148
594	NC_021811	TTC	2	6	35029	35034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525811148
595	NC_021811	GCC	2	6	35174	35179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525811148
596	NC_021811	GGCG	2	8	35256	35263	0 %	0 %	75 %	25 %	525811148
597	NC_021811	CGTTC	2	10	35328	35337	0 %	40 %	20 %	40 %	525811149
598	NC_021811	AAG	2	6	35366	35371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525811149
599	NC_021811	CCAG	2	8	35620	35627	25 %	0 %	25 %	50 %	525811149
600	NC_021811	GA	3	6	35645	35650	50 %	0 %	50 %	0 %	525811149
601	NC_021811	ATC	2	6	35652	35657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525811149
602	NC_021811	GCT	2	6	35662	35667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525811150
603	NC_021811	TAA	2	6	35695	35700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525811150
604	NC_021811	CCGG	2	8	35735	35742	0 %	0 %	50 %	50 %	525811150
605	NC_021811	TAT	2	6	35817	35822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525811150
606	NC_021811	T	6	6	35864	35869	0 %	100 %	0 %	0 %	525811150
607	NC_021811	GCA	2	6	35877	35882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525811150
608	NC_021811	CA	3	6	35959	35964	50 %	0 %	0 %	50 %	525811150
609	NC_021811	GCC	2	6	36024	36029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525811150
610	NC_021811	T	7	7	36037	36043	0 %	100 %	0 %	0 %	525811150
611	NC_021811	AGGC	2	8	36113	36120	25 %	0 %	50 %	25 %	525811150
612	NC_021811	TAC	2	6	36192	36197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525811150
613	NC_021811	TTC	2	6	36253	36258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525811150
614	NC_021811	ATG	2	6	36323	36328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525811150
615	NC_021811	ATT	2	6	36332	36337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525811150
616	NC_021811	AGTG	2	8	36470	36477	25 %	25 %	50 %	0 %	525811151
617	NC_021811	TTC	2	6	36481	36486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525811151
618	NC_021811	CCT	2	6	36635	36640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525811151
619	NC_021811	TCA	2	6	36674	36679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525811151
620	NC_021811	TGC	2	6	36691	36696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525811151
621	NC_021811	CAGC	2	8	36707	36714	25 %	0 %	25 %	50 %	525811151
622	NC_021811	CCA	2	6	36797	36802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525811151
623	NC_021811	CAG	2	6	36822	36827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525811151
624	NC_021811	CAT	2	6	36831	36836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525811151
625	NC_021811	TCA	2	6	36857	36862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525811151
626	NC_021811	TCA	2	6	36907	36912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525811151
627	NC_021811	CCAG	2	8	36986	36993	25 %	0 %	25 %	50 %	525811151
628	NC_021811	GTACGG	2	12	37002	37013	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525811151
629	NC_021811	TGC	2	6	37066	37071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525811151
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631	NC_021811	GTAAC	2	10	37101	37110	40 %	20 %	20 %	20 %	525811151
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754	NC_021811	CTG	2	6	44915	44920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525811160
755	NC_021811	CA	3	6	44942	44947	50 %	0 %	0 %	50 %	525811160
756	NC_021811	GCG	2	6	44989	44994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525811161
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759	NC_021811	GAC	2	6	45120	45125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525811161
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762	NC_021811	CTG	2	6	45368	45373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525811162
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786	NC_021811	GGCAC	2	10	46700	46709	20 %	0 %	40 %	40 %	525811165
787	NC_021811	CGG	2	6	46725	46730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525811165
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871	NC_021811	AT	3	6	51533	51538	50 %	50 %	0 %	0 %	525811173
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879	NC_021811	CAA	2	6	51819	51824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525811173
880	NC_021811	ACC	2	6	51847	51852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525811173
881	NC_021811	TC	3	6	52009	52014	0 %	50 %	0 %	50 %	525811173
882	NC_021811	GTAAC	2	10	52065	52074	40 %	20 %	20 %	20 %	525811173
883	NC_021811	GATC	2	8	52080	52087	25 %	25 %	25 %	25 %	525811173
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991	NC_021811	GT	3	6	59200	59205	0 %	50 %	50 %	0 %	525811181
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999	NC_021811	CTTT	2	8	60130	60137	0 %	75 %	0 %	25 %	525811182
1000	NC_021811	AGA	2	6	60158	60163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525811182

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