MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus Bmb9393 plasmid pBmb9393

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021657	AAAT	2	8	1139	1146	75 %	25 %	0 %	0 %	521147366
2	NC_021657	AT	3	6	1145	1150	50 %	50 %	0 %	0 %	521147366
3	NC_021657	ACAA	2	8	1160	1167	75 %	0 %	0 %	25 %	521147366
4	NC_021657	T	6	6	1192	1197	0 %	100 %	0 %	0 %	521147366
5	NC_021657	T	6	6	1238	1243	0 %	100 %	0 %	0 %	521147366
6	NC_021657	TA	3	6	1290	1295	50 %	50 %	0 %	0 %	521147366
7	NC_021657	TAA	2	6	1305	1310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	521147366
8	NC_021657	TTC	2	6	1459	1464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	521147367
9	NC_021657	T	6	6	1500	1505	0 %	100 %	0 %	0 %	521147367
10	NC_021657	A	6	6	1563	1568	100 %	0 %	0 %	0 %	521147367
11	NC_021657	GATA	2	8	1572	1579	50 %	25 %	25 %	0 %	521147367
12	NC_021657	T	6	6	1622	1627	0 %	100 %	0 %	0 %	521147367
13	NC_021657	AAT	2	6	1649	1654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	521147367
14	NC_021657	TTA	2	6	1719	1724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	521147367
15	NC_021657	AAT	2	6	1725	1730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	521147367
16	NC_021657	TAT	3	9	1773	1781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	521147367
17	NC_021657	T	6	6	1791	1796	0 %	100 %	0 %	0 %	521147367
18	NC_021657	GAACTT	2	12	1797	1808	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	521147367
19	NC_021657	TTG	2	6	1858	1863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	521147367
20	NC_021657	TAATA	2	10	1866	1875	60 %	40 %	0 %	0 %	521147367
21	NC_021657	ATTT	2	8	1896	1903	25 %	75 %	0 %	0 %	521147367
22	NC_021657	ATC	2	6	1936	1941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	521147367
23	NC_021657	T	7	7	1944	1950	0 %	100 %	0 %	0 %	521147367
24	NC_021657	CTAC	2	8	1994	2001	25 %	25 %	0 %	50 %	521147367
25	NC_021657	T	7	7	2002	2008	0 %	100 %	0 %	0 %	521147367
26	NC_021657	ATT	2	6	2032	2037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	521147367
27	NC_021657	TCA	2	6	2063	2068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	521147367
28	NC_021657	CATTA	2	10	2071	2080	40 %	40 %	0 %	20 %	521147367
29	NC_021657	TGC	2	6	2120	2125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	521147367
30	NC_021657	AT	3	6	2129	2134	50 %	50 %	0 %	0 %	521147367
31	NC_021657	CAT	2	6	2137	2142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	521147367
32	NC_021657	TA	3	6	2223	2228	50 %	50 %	0 %	0 %	521147367
33	NC_021657	TC	3	6	2304	2309	0 %	50 %	0 %	50 %	521147367
34	NC_021657	TAA	2	6	2322	2327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	521147367
35	NC_021657	T	6	6	2353	2358	0 %	100 %	0 %	0 %	521147367
36	NC_021657	TATG	2	8	2447	2454	25 %	50 %	25 %	0 %	521147368
37	NC_021657	T	6	6	2455	2460	0 %	100 %	0 %	0 %	521147368
38	NC_021657	T	7	7	2505	2511	0 %	100 %	0 %	0 %	521147368
39	NC_021657	TTA	2	6	2574	2579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	521147368
40	NC_021657	AAGA	2	8	2587	2594	75 %	0 %	25 %	0 %	521147368
41	NC_021657	A	7	7	2625	2631	100 %	0 %	0 %	0 %	521147368
42	NC_021657	T	6	6	2646	2651	0 %	100 %	0 %	0 %	521147368
43	NC_021657	TTC	2	6	2666	2671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	521147368
44	NC_021657	CAA	2	6	2692	2697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	521147368

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.