MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus agalactiae ILRI112 complete genome

Total Repeats: 39151

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021507	AAT	2	6	68	73	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512697425
2	NC_021507	GAA	2	6	92	97	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512697425
3	NC_021507	AAC	2	6	114	119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512697425
4	NC_021507	CAG	2	6	165	170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512697425
5	NC_021507	T	6	6	179	184	0 %	100 %	0 %	0 %	512697425
6	NC_021507	CTC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512697425
7	NC_021507	TTA	2	6	228	233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512697425
8	NC_021507	TGAAA	2	10	247	256	60 %	20 %	20 %	0 %	512697425
9	NC_021507	ATTTAC	2	12	351	362	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	512697425
10	NC_021507	G	7	7	558	564	0 %	0 %	100 %	0 %	512697425
11	NC_021507	CTA	2	6	587	592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512697425
12	NC_021507	CTG	2	6	651	656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512697425
13	NC_021507	TTA	2	6	663	668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512697425
14	NC_021507	GTCA	2	8	677	684	25 %	25 %	25 %	25 %	512697425
15	NC_021507	GAA	2	6	704	709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512697425
16	NC_021507	AAAAG	2	10	712	721	80 %	0 %	20 %	0 %	512697425
17	NC_021507	TGAT	2	8	744	751	25 %	50 %	25 %	0 %	512697425
18	NC_021507	TTC	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512697425
19	NC_021507	TACA	2	8	822	829	50 %	25 %	0 %	25 %	512697425
20	NC_021507	AGA	2	6	886	891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512697425
21	NC_021507	CAC	2	6	936	941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512697425
22	NC_021507	ACGT	2	8	1047	1054	25 %	25 %	25 %	25 %	512697425
23	NC_021507	AGA	2	6	1189	1194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512697425
24	NC_021507	TAA	2	6	1384	1389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512697425
25	NC_021507	A	6	6	1393	1398	100 %	0 %	0 %	0 %	512697425
26	NC_021507	AAAAT	2	10	1446	1455	80 %	20 %	0 %	0 %	512697425
27	NC_021507	AATA	2	8	1631	1638	75 %	25 %	0 %	0 %	512697426
28	NC_021507	TCT	2	6	1645	1650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512697426
29	NC_021507	ATT	2	6	1869	1874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512697426
30	NC_021507	AAC	2	6	1915	1920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512697426
31	NC_021507	ACA	2	6	2004	2009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512697426
32	NC_021507	AAACT	2	10	2029	2038	60 %	20 %	0 %	20 %	512697426
33	NC_021507	ATT	2	6	2049	2054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512697426
34	NC_021507	TGC	2	6	2069	2074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512697426
35	NC_021507	CAA	2	6	2079	2084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512697426
36	NC_021507	AAAT	2	8	2129	2136	75 %	25 %	0 %	0 %	512697426
37	NC_021507	TAA	2	6	2204	2209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512697426
38	NC_021507	GTT	2	6	2220	2225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512697426
39	NC_021507	GAT	2	6	2265	2270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512697426
40	NC_021507	TCT	2	6	2290	2295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512697426
41	NC_021507	CCT	2	6	2378	2383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512697426
42	NC_021507	CGATT	2	10	2656	2665	20 %	40 %	20 %	20 %	512697426
43	NC_021507	TAA	2	6	2728	2733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512697426
44	NC_021507	ACTA	2	8	2745	2752	50 %	25 %	0 %	25 %	512697426
45	NC_021507	TA	4	8	2830	2837	50 %	50 %	0 %	0 %	512697427
46	NC_021507	TAA	2	6	2858	2863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512697427
47	NC_021507	TTG	2	6	2878	2883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512697427
48	NC_021507	ACAGA	2	10	2931	2940	60 %	0 %	20 %	20 %	512697427
49	NC_021507	GAT	2	6	2943	2948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512697427
50	NC_021507	A	8	8	2950	2957	100 %	0 %	0 %	0 %	512697427
51	NC_021507	AAAG	2	8	2985	2992	75 %	0 %	25 %	0 %	512697427
52	NC_021507	ATC	2	6	2995	3000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512697427
53	NC_021507	AGG	2	6	3011	3016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512697427
54	NC_021507	TTA	2	6	3071	3076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512697427
55	NC_021507	CAGA	2	8	3150	3157	50 %	0 %	25 %	25 %	512697427
56	NC_021507	TTTA	2	8	3180	3187	25 %	75 %	0 %	0 %	512697427
57	NC_021507	TAAAA	2	10	3260	3269	80 %	20 %	0 %	0 %	512697427
58	NC_021507	A	6	6	3266	3271	100 %	0 %	0 %	0 %	512697427
59	NC_021507	ATT	2	6	3329	3334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512697427
60	NC_021507	TTC	2	6	3338	3343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512697427
61	NC_021507	GA	3	6	3367	3372	50 %	0 %	50 %	0 %	512697427
62	NC_021507	T	6	6	3404	3409	0 %	100 %	0 %	0 %	512697427
63	NC_021507	TAT	2	6	3535	3540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512697427
64	NC_021507	TAC	2	6	3560	3565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512697427
65	NC_021507	TTGA	2	8	3627	3634	25 %	50 %	25 %	0 %	512697427
66	NC_021507	A	6	6	3682	3687	100 %	0 %	0 %	0 %	512697427
67	NC_021507	TA	3	6	3694	3699	50 %	50 %	0 %	0 %	512697427
68	NC_021507	TTG	2	6	3733	3738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512697428
69	NC_021507	A	6	6	3744	3749	100 %	0 %	0 %	0 %	512697428
70	NC_021507	TG	3	6	3759	3764	0 %	50 %	50 %	0 %	512697428
71	NC_021507	A	6	6	3780	3785	100 %	0 %	0 %	0 %	512697428
72	NC_021507	ATG	2	6	3858	3863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512697428
73	NC_021507	A	7	7	3890	3896	100 %	0 %	0 %	0 %	512697428
74	NC_021507	A	7	7	4212	4218	100 %	0 %	0 %	0 %	512697429
75	NC_021507	CAG	2	6	4485	4490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512697430
76	NC_021507	TTTA	2	8	4525	4532	25 %	75 %	0 %	0 %	512697430
77	NC_021507	GCT	2	6	4559	4564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512697430
78	NC_021507	A	7	7	4655	4661	100 %	0 %	0 %	0 %	512697430
79	NC_021507	AAAT	2	8	4735	4742	75 %	25 %	0 %	0 %	512697430
80	NC_021507	TGA	3	9	4795	4803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512697430
81	NC_021507	TCAA	2	8	4901	4908	50 %	25 %	0 %	25 %	512697430
82	NC_021507	A	6	6	4929	4934	100 %	0 %	0 %	0 %	512697430
83	NC_021507	AGA	2	6	5041	5046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512697430
84	NC_021507	GTT	2	6	5057	5062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512697430
85	NC_021507	AAC	2	6	5080	5085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512697430
86	NC_021507	TGA	2	6	5113	5118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512697430
87	NC_021507	TGA	2	6	5137	5142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512697430
88	NC_021507	AGT	2	6	5194	5199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512697430
89	NC_021507	GAA	3	9	5219	5227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512697430
90	NC_021507	TGA	3	9	5239	5247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512697430
91	NC_021507	GCT	2	6	5312	5317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512697430
92	NC_021507	ATC	2	6	5319	5324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512697430
93	NC_021507	ACTT	2	8	5339	5346	25 %	50 %	0 %	25 %	512697430
94	NC_021507	CTG	2	6	5349	5354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512697430
95	NC_021507	GCT	2	6	5408	5413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512697430
96	NC_021507	TAT	2	6	5416	5421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512697430
97	NC_021507	ATG	2	6	5469	5474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512697430
98	NC_021507	AAG	2	6	5508	5513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512697430
99	NC_021507	GAA	2	6	5528	5533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512697430
100	NC_021507	TAG	2	6	5588	5593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512697430
101	NC_021507	TTG	2	6	5687	5692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512697431
102	NC_021507	ATA	2	6	5732	5737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512697431
103	NC_021507	A	6	6	5766	5771	100 %	0 %	0 %	0 %	512697431
104	NC_021507	AGA	2	6	5790	5795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512697431
105	NC_021507	A	6	6	5840	5845	100 %	0 %	0 %	0 %	512697431
106	NC_021507	TTTAT	2	10	5846	5855	20 %	80 %	0 %	0 %	512697431
107	NC_021507	ACT	2	6	5863	5868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512697431
108	NC_021507	CTTA	2	8	5905	5912	25 %	50 %	0 %	25 %	512697431
109	NC_021507	ACA	2	6	5915	5920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512697431
110	NC_021507	AT	3	6	5944	5949	50 %	50 %	0 %	0 %	512697431
111	NC_021507	GAT	2	6	5950	5955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512697431
112	NC_021507	CTG	2	6	5999	6004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512697431
113	NC_021507	TAT	2	6	6027	6032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512697431
114	NC_021507	TTA	2	6	6104	6109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512697431
115	NC_021507	ATG	2	6	6137	6142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512697431
116	NC_021507	ATT	3	9	6188	6196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512697431
117	NC_021507	A	6	6	6215	6220	100 %	0 %	0 %	0 %	512697431
118	NC_021507	ATT	2	6	6260	6265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512697432
119	NC_021507	GTG	2	6	6279	6284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512697432
120	NC_021507	AGT	2	6	6302	6307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512697432
121	NC_021507	A	7	7	6390	6396	100 %	0 %	0 %	0 %	512697432
122	NC_021507	AT	3	6	6445	6450	50 %	50 %	0 %	0 %	512697432
123	NC_021507	T	6	6	6483	6488	0 %	100 %	0 %	0 %	512697432
124	NC_021507	TGA	2	6	6491	6496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512697432
125	NC_021507	GCA	2	6	6504	6509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512697432
126	NC_021507	A	7	7	6580	6586	100 %	0 %	0 %	0 %	512697432
127	NC_021507	TTC	2	6	6828	6833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512697432
128	NC_021507	CAG	2	6	6916	6921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512697432
129	NC_021507	ATT	2	6	6927	6932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512697432
130	NC_021507	A	6	6	6963	6968	100 %	0 %	0 %	0 %	512697432
131	NC_021507	AAC	2	6	7000	7005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512697432
132	NC_021507	TCG	2	6	7064	7069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512697432
133	NC_021507	TGA	2	6	7142	7147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512697432
134	NC_021507	A	6	6	7153	7158	100 %	0 %	0 %	0 %	512697432
135	NC_021507	TAGC	2	8	7192	7199	25 %	25 %	25 %	25 %	512697432
136	NC_021507	ACA	2	6	7217	7222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512697432
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