MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus agalactiae ILRI005 complete genome

Total Repeats: 40861

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021486	AAC	2	6	114	119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512543720
2	NC_021486	CAG	2	6	165	170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512543720
3	NC_021486	T	6	6	179	184	0 %	100 %	0 %	0 %	512543720
4	NC_021486	CTC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512543720
5	NC_021486	TTA	2	6	228	233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543720
6	NC_021486	TGAAA	2	10	247	256	60 %	20 %	20 %	0 %	512543720
7	NC_021486	ATTTAC	2	12	351	362	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	512543720
8	NC_021486	G	7	7	558	564	0 %	0 %	100 %	0 %	512543720
9	NC_021486	CTA	2	6	587	592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512543720
10	NC_021486	CTG	2	6	651	656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512543720
11	NC_021486	TTA	2	6	663	668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543720
12	NC_021486	GTCA	2	8	677	684	25 %	25 %	25 %	25 %	512543720
13	NC_021486	GAA	2	6	704	709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512543720
14	NC_021486	AAAAG	2	10	712	721	80 %	0 %	20 %	0 %	512543720
15	NC_021486	TGAT	2	8	744	751	25 %	50 %	25 %	0 %	512543720
16	NC_021486	TTC	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512543720
17	NC_021486	TACA	2	8	822	829	50 %	25 %	0 %	25 %	512543720
18	NC_021486	AGA	2	6	886	891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512543720
19	NC_021486	CAC	2	6	936	941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512543720
20	NC_021486	ATG	2	6	1158	1163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543720
21	NC_021486	AGA	2	6	1189	1194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512543720
22	NC_021486	TAA	2	6	1384	1389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512543720
23	NC_021486	A	6	6	1393	1398	100 %	0 %	0 %	0 %	512543720
24	NC_021486	AAAAT	2	10	1446	1455	80 %	20 %	0 %	0 %	512543720
25	NC_021486	AATA	2	8	1631	1638	75 %	25 %	0 %	0 %	512543721
26	NC_021486	TCT	2	6	1645	1650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512543721
27	NC_021486	ATT	2	6	1869	1874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543721
28	NC_021486	AAC	2	6	1915	1920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512543721
29	NC_021486	ACA	2	6	2004	2009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512543721
30	NC_021486	AAACT	2	10	2029	2038	60 %	20 %	0 %	20 %	512543721
31	NC_021486	ATT	2	6	2049	2054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543721
32	NC_021486	TGC	2	6	2069	2074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512543721
33	NC_021486	CAA	2	6	2079	2084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512543721
34	NC_021486	AAAT	2	8	2129	2136	75 %	25 %	0 %	0 %	512543721
35	NC_021486	TAA	2	6	2204	2209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512543721
36	NC_021486	GTT	2	6	2220	2225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512543721
37	NC_021486	GAT	2	6	2265	2270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543721
38	NC_021486	TCT	2	6	2290	2295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512543721
39	NC_021486	CCT	2	6	2378	2383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512543721
40	NC_021486	CGATT	2	10	2656	2665	20 %	40 %	20 %	20 %	512543721
41	NC_021486	TAA	2	6	2728	2733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512543721
42	NC_021486	ACTA	2	8	2745	2752	50 %	25 %	0 %	25 %	512543721
43	NC_021486	ATG	2	6	2811	2816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543722
44	NC_021486	TA	4	8	2830	2837	50 %	50 %	0 %	0 %	512543722
45	NC_021486	TAA	2	6	2858	2863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512543722
46	NC_021486	TTG	2	6	2878	2883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512543722
47	NC_021486	ACAGA	2	10	2931	2940	60 %	0 %	20 %	20 %	512543722
48	NC_021486	GAT	2	6	2943	2948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543722
49	NC_021486	A	8	8	2950	2957	100 %	0 %	0 %	0 %	512543722
50	NC_021486	A	7	7	2985	2991	100 %	0 %	0 %	0 %	512543722
51	NC_021486	ATC	2	6	2995	3000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512543722
52	NC_021486	AGG	2	6	3011	3016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512543722
53	NC_021486	TTA	2	6	3071	3076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543722
54	NC_021486	CAGA	2	8	3150	3157	50 %	0 %	25 %	25 %	512543722
55	NC_021486	TTTA	2	8	3180	3187	25 %	75 %	0 %	0 %	512543722
56	NC_021486	TAAAA	2	10	3260	3269	80 %	20 %	0 %	0 %	512543722
57	NC_021486	A	6	6	3266	3271	100 %	0 %	0 %	0 %	512543722
58	NC_021486	ATT	2	6	3329	3334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543722
59	NC_021486	TTC	2	6	3338	3343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512543722
60	NC_021486	GA	3	6	3367	3372	50 %	0 %	50 %	0 %	512543722
61	NC_021486	CAG	2	6	3378	3383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512543722
62	NC_021486	T	6	6	3404	3409	0 %	100 %	0 %	0 %	512543722
63	NC_021486	TAT	2	6	3535	3540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543722
64	NC_021486	TAC	2	6	3560	3565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512543722
65	NC_021486	TTGA	2	8	3627	3634	25 %	50 %	25 %	0 %	512543722
66	NC_021486	A	6	6	3682	3687	100 %	0 %	0 %	0 %	512543722
67	NC_021486	TA	3	6	3694	3699	50 %	50 %	0 %	0 %	512543722
68	NC_021486	TTG	2	6	3733	3738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512543723
69	NC_021486	A	6	6	3744	3749	100 %	0 %	0 %	0 %	512543723
70	NC_021486	ATG	2	6	3858	3863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543723
71	NC_021486	A	7	7	3890	3896	100 %	0 %	0 %	0 %	512543723
72	NC_021486	A	7	7	4211	4217	100 %	0 %	0 %	0 %	512543724
73	NC_021486	CAG	2	6	4484	4489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512543725
74	NC_021486	TTTA	2	8	4524	4531	25 %	75 %	0 %	0 %	512543725
75	NC_021486	GCT	2	6	4558	4563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512543725
76	NC_021486	A	7	7	4654	4660	100 %	0 %	0 %	0 %	512543725
77	NC_021486	AAAT	2	8	4734	4741	75 %	25 %	0 %	0 %	512543725
78	NC_021486	TGA	3	9	4794	4802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543725
79	NC_021486	TCAA	2	8	4900	4907	50 %	25 %	0 %	25 %	512543725
80	NC_021486	A	6	6	4928	4933	100 %	0 %	0 %	0 %	512543725
81	NC_021486	AGA	2	6	5040	5045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512543725
82	NC_021486	GTT	2	6	5056	5061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512543725
83	NC_021486	AAC	2	6	5079	5084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512543725
84	NC_021486	TGA	2	6	5112	5117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543725
85	NC_021486	TGA	2	6	5136	5141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543725
86	NC_021486	AGT	2	6	5193	5198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543725
87	NC_021486	GAA	3	9	5218	5226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512543725
88	NC_021486	TGA	3	9	5238	5246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543725
89	NC_021486	GCT	2	6	5311	5316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512543725
90	NC_021486	ATC	2	6	5318	5323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512543725
91	NC_021486	ACTT	2	8	5338	5345	25 %	50 %	0 %	25 %	512543725
92	NC_021486	CTG	2	6	5348	5353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512543725
93	NC_021486	GCT	2	6	5407	5412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512543725
94	NC_021486	TAT	2	6	5415	5420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543725
95	NC_021486	ATG	2	6	5468	5473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543725
96	NC_021486	AAG	2	6	5507	5512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512543725
97	NC_021486	GAA	2	6	5527	5532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512543725
98	NC_021486	TAG	2	6	5587	5592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543725
99	NC_021486	TTG	2	6	5686	5691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512543726
100	NC_021486	ATA	2	6	5731	5736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512543726
101	NC_021486	A	7	7	5765	5771	100 %	0 %	0 %	0 %	512543726
102	NC_021486	AGA	2	6	5789	5794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512543726
103	NC_021486	AGT	2	6	5817	5822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543726
104	NC_021486	ATTT	2	8	5844	5851	25 %	75 %	0 %	0 %	512543726
105	NC_021486	ACT	2	6	5862	5867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512543726
106	NC_021486	CTTA	2	8	5904	5911	25 %	50 %	0 %	25 %	512543726
107	NC_021486	ACA	2	6	5914	5919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512543726
108	NC_021486	AT	3	6	5943	5948	50 %	50 %	0 %	0 %	512543726
109	NC_021486	GAT	2	6	5949	5954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543726
110	NC_021486	CTG	2	6	5998	6003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512543726
111	NC_021486	TAT	2	6	6026	6031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543726
112	NC_021486	TTA	2	6	6103	6108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543726
113	NC_021486	ATG	2	6	6136	6141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543726
114	NC_021486	ATT	3	9	6187	6195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543726
115	NC_021486	A	6	6	6214	6219	100 %	0 %	0 %	0 %	512543726
116	NC_021486	ATT	2	6	6259	6264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543727
117	NC_021486	GTG	2	6	6278	6283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512543727
118	NC_021486	AGT	2	6	6301	6306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543727
119	NC_021486	A	7	7	6389	6395	100 %	0 %	0 %	0 %	512543727
120	NC_021486	AT	3	6	6444	6449	50 %	50 %	0 %	0 %	512543727
121	NC_021486	T	6	6	6482	6487	0 %	100 %	0 %	0 %	512543727
122	NC_021486	TGA	2	6	6490	6495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543727
123	NC_021486	GCA	2	6	6503	6508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512543727
124	NC_021486	A	7	7	6579	6585	100 %	0 %	0 %	0 %	512543727
125	NC_021486	TTC	2	6	6827	6832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512543727
126	NC_021486	CAG	2	6	6915	6920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512543727
127	NC_021486	ATT	2	6	6926	6931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543727
128	NC_021486	A	6	6	6962	6967	100 %	0 %	0 %	0 %	512543727
129	NC_021486	TCG	2	6	7063	7068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512543727
130	NC_021486	TGA	2	6	7141	7146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543727
131	NC_021486	A	6	6	7152	7157	100 %	0 %	0 %	0 %	512543727
132	NC_021486	TCGA	2	8	7161	7168	25 %	25 %	25 %	25 %	512543727
133	NC_021486	TAGC	2	8	7191	7198	25 %	25 %	25 %	25 %	512543727
134	NC_021486	ACA	2	6	7216	7221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512543727
135	NC_021486	ACCA	2	8	7281	7288	50 %	0 %	0 %	50 %	512543727
136	NC_021486	CTT	2	6	7294	7299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512543727
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263	NC_021486	ATA	2	6	13026	13031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512543733
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267	NC_021486	AAG	2	6	13137	13142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512543733
268	NC_021486	GGATA	2	10	13144	13153	40 %	20 %	40 %	0 %	512543733
269	NC_021486	A	7	7	13172	13178	100 %	0 %	0 %	0 %	512543733
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