MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus agalactiae ILRI005 complete genome

Total Repeats: 40861

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021486	GT	3	6	60271	60276	0 %	50 %	50 %	0 %	512543769
1002	NC_021486	AAT	2	6	60377	60382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512543769
1003	NC_021486	TG	3	6	60491	60496	0 %	50 %	50 %	0 %	512543769
1004	NC_021486	CAT	2	6	60520	60525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512543769
1005	NC_021486	CAC	2	6	60627	60632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512543769
1006	NC_021486	ACA	2	6	60682	60687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512543769
1007	NC_021486	CAG	2	6	60692	60697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512543769
1008	NC_021486	GAAG	2	8	60796	60803	50 %	0 %	50 %	0 %	512543769
1009	NC_021486	GGA	2	6	60817	60822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512543769
1010	NC_021486	AGG	2	6	60828	60833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512543769
1011	NC_021486	TTA	2	6	60864	60869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543770
1012	NC_021486	GTT	2	6	60887	60892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512543770
1013	NC_021486	TAT	2	6	60897	60902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543770
1014	NC_021486	GAT	2	6	60914	60919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543770
1015	NC_021486	TGA	2	6	60927	60932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543770
1016	NC_021486	ATT	2	6	60969	60974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543770
1017	NC_021486	TAAA	2	8	61008	61015	75 %	25 %	0 %	0 %	512543770
1018	NC_021486	GAA	2	6	61061	61066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512543770
1019	NC_021486	TGT	2	6	61543	61548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512543771
1020	NC_021486	A	7	7	61571	61577	100 %	0 %	0 %	0 %	512543771
1021	NC_021486	TAA	2	6	61627	61632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512543771
1022	NC_021486	TAT	2	6	61652	61657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543771
1023	NC_021486	TGA	2	6	61690	61695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543771
1024	NC_021486	GAA	3	9	61723	61731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512543771
1025	NC_021486	TAA	2	6	61738	61743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512543771
1026	NC_021486	CTA	2	6	61764	61769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512543771
1027	NC_021486	ACT	2	6	61896	61901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512543771
1028	NC_021486	AAC	2	6	61912	61917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512543771
1029	NC_021486	GTTAT	2	10	61974	61983	20 %	60 %	20 %	0 %	512543771
1030	NC_021486	GAT	2	6	61991	61996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543771
1031	NC_021486	ATT	2	6	62016	62021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543771
1032	NC_021486	TAT	2	6	62130	62135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543771
1033	NC_021486	TAA	2	6	62164	62169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512543771
1034	NC_021486	AATT	2	8	62172	62179	50 %	50 %	0 %	0 %	512543771
1035	NC_021486	TGG	2	6	62204	62209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512543771
1036	NC_021486	A	6	6	62219	62224	100 %	0 %	0 %	0 %	512543771
1037	NC_021486	ATG	3	9	62328	62336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543771
1038	NC_021486	GAT	2	6	62345	62350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543771
1039	NC_021486	A	6	6	62379	62384	100 %	0 %	0 %	0 %	512543771
1040	NC_021486	AGT	2	6	62408	62413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543771
1041	NC_021486	TA	3	6	62465	62470	50 %	50 %	0 %	0 %	512543771
1042	NC_021486	GACAC	2	10	62489	62498	40 %	0 %	20 %	40 %	512543771
1043	NC_021486	A	6	6	62647	62652	100 %	0 %	0 %	0 %	512543772
1044	NC_021486	GGC	2	6	62681	62686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512543772
1045	NC_021486	AGA	2	6	62696	62701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512543772
1046	NC_021486	AAAT	2	8	62702	62709	75 %	25 %	0 %	0 %	512543772
1047	NC_021486	TTGG	2	8	62717	62724	0 %	50 %	50 %	0 %	512543772
1048	NC_021486	TGG	2	6	62860	62865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512543772
1049	NC_021486	GAG	2	6	62898	62903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512543772
1050	NC_021486	CAAG	2	8	62969	62976	50 %	0 %	25 %	25 %	512543772
1051	NC_021486	ATT	2	6	62985	62990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543772
1052	NC_021486	CAT	2	6	63053	63058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512543772
1053	NC_021486	TGC	2	6	63161	63166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512543772
1054	NC_021486	GAA	2	6	63234	63239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512543772
1055	NC_021486	TCCG	2	8	63262	63269	0 %	25 %	25 %	50 %	512543772
1056	NC_021486	TTC	2	6	63289	63294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512543772
1057	NC_021486	AAC	2	6	63391	63396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512543772
1058	NC_021486	GC	3	6	63492	63497	0 %	0 %	50 %	50 %	512543772
1059	NC_021486	CTG	2	6	63571	63576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512543772
1060	NC_021486	ATC	2	6	63582	63587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512543772
1061	NC_021486	TTGA	2	8	63606	63613	25 %	50 %	25 %	0 %	512543772
1062	NC_021486	ATG	2	6	63672	63677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543772
1063	NC_021486	ATTG	2	8	63731	63738	25 %	50 %	25 %	0 %	512543772
1064	NC_021486	GAA	2	6	63756	63761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512543772
1065	NC_021486	AGA	3	9	63830	63838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512543772
1066	NC_021486	GAA	2	6	63867	63872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512543772
1067	NC_021486	TTA	2	6	63896	63901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543772
1068	NC_021486	TGA	2	6	63914	63919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543772
1069	NC_021486	GTA	2	6	64119	64124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543773
1070	NC_021486	GAA	2	6	64163	64168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512543773
1071	NC_021486	AGTT	2	8	64276	64283	25 %	50 %	25 %	0 %	512543773
1072	NC_021486	CAG	2	6	64296	64301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512543773
1073	NC_021486	A	7	7	64321	64327	100 %	0 %	0 %	0 %	512543773
1074	NC_021486	CCTA	2	8	64361	64368	25 %	25 %	0 %	50 %	512543773
1075	NC_021486	TTGAT	2	10	64386	64395	20 %	60 %	20 %	0 %	512543773
1076	NC_021486	ATTT	2	8	64415	64422	25 %	75 %	0 %	0 %	512543773
1077	NC_021486	ATG	2	6	64431	64436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543773
1078	NC_021486	A	6	6	64452	64457	100 %	0 %	0 %	0 %	512543773
1079	NC_021486	ATATTT	2	12	64488	64499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543773
1080	NC_021486	A	6	6	64558	64563	100 %	0 %	0 %	0 %	512543773
1081	NC_021486	ACTT	2	8	64581	64588	25 %	50 %	0 %	25 %	512543773
1082	NC_021486	TAT	2	6	64698	64703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543773
1083	NC_021486	TTA	2	6	64721	64726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543773
1084	NC_021486	ATA	2	6	64793	64798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512543773
1085	NC_021486	TAA	2	6	64818	64823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512543773
1086	NC_021486	AAT	2	6	64849	64854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512543773
1087	NC_021486	GTT	2	6	64879	64884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512543773
1088	NC_021486	TA	3	6	65000	65005	50 %	50 %	0 %	0 %	512543773
1089	NC_021486	GAA	2	6	65246	65251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512543774
1090	NC_021486	AG	3	6	65285	65290	50 %	0 %	50 %	0 %	512543774
1091	NC_021486	GCT	2	6	65339	65344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512543774
1092	NC_021486	TGA	2	6	65353	65358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543774
1093	NC_021486	TTA	2	6	65375	65380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543774
1094	NC_021486	CCT	2	6	65387	65392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512543774
1095	NC_021486	AAC	2	6	65404	65409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512543774
1096	NC_021486	CAAA	2	8	65449	65456	75 %	0 %	0 %	25 %	512543774
1097	NC_021486	TAG	2	6	65490	65495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543774
1098	NC_021486	TGA	2	6	65536	65541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543774
1099	NC_021486	TAG	2	6	65632	65637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543774
1100	NC_021486	GCC	2	6	65656	65661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512543774
1101	NC_021486	TAT	2	6	65747	65752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543774
1102	NC_021486	ATT	2	6	65774	65779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543774
1103	NC_021486	CAG	2	6	65787	65792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512543774
1104	NC_021486	TGAAA	2	10	65800	65809	60 %	20 %	20 %	0 %	512543774
1105	NC_021486	GCT	2	6	65822	65827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512543774
1106	NC_021486	A	6	6	65997	66002	100 %	0 %	0 %	0 %	512543774
1107	NC_021486	GAA	2	6	66074	66079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512543774
1108	NC_021486	TAT	2	6	66130	66135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543774
1109	NC_021486	CGTACC	2	12	66137	66148	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	512543774
1110	NC_021486	ATAA	2	8	66201	66208	75 %	25 %	0 %	0 %	512543774
1111	NC_021486	GAA	2	6	66362	66367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512543775
1112	NC_021486	TGTTT	2	10	66372	66381	0 %	80 %	20 %	0 %	512543775
1113	NC_021486	AGG	2	6	66439	66444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512543775
1114	NC_021486	ATC	2	6	66603	66608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512543775
1115	NC_021486	ATG	2	6	66661	66666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543775
1116	NC_021486	T	6	6	66679	66684	0 %	100 %	0 %	0 %	512543775
1117	NC_021486	TGG	2	6	66689	66694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512543775
1118	NC_021486	ATG	2	6	66748	66753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543775
1119	NC_021486	TAA	2	6	66775	66780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512543775
1120	NC_021486	ATA	2	6	66781	66786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512543775
1121	NC_021486	GAA	2	6	66806	66811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512543776
1122	NC_021486	ATT	2	6	66855	66860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543776
1123	NC_021486	GTT	2	6	66861	66866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512543776
1124	NC_021486	ATG	2	6	66919	66924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543776
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