MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus agalactiae 09mas018883 complete genome

Total Repeats: 41464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021485	AAC	2	6	85028	85033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512538314
1502	NC_021485	GTT	2	6	85042	85047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538314
1503	NC_021485	GTT	2	6	85078	85083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538314
1504	NC_021485	TGC	2	6	85095	85100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538314
1505	NC_021485	TC	3	6	85124	85129	0 %	50 %	0 %	50 %	512538314
1506	NC_021485	GAA	2	6	85144	85149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538314
1507	NC_021485	TTAA	2	8	85152	85159	50 %	50 %	0 %	0 %	512538314
1508	NC_021485	GTG	3	9	85404	85412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512538315
1509	NC_021485	CGT	2	6	85454	85459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538315
1510	NC_021485	GTT	2	6	85559	85564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538315
1511	NC_021485	AAG	2	6	85569	85574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538315
1512	NC_021485	CGTG	2	8	85582	85589	0 %	25 %	50 %	25 %	512538315
1513	NC_021485	AGC	2	6	85651	85656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512538315
1514	NC_021485	CTG	2	6	85671	85676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538315
1515	NC_021485	AGC	2	6	85678	85683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512538315
1516	NC_021485	GGT	2	6	85697	85702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512538315
1517	NC_021485	TAAT	2	8	85718	85725	50 %	50 %	0 %	0 %	512538315
1518	NC_021485	TTTA	2	8	85797	85804	25 %	75 %	0 %	0 %	512538316
1519	NC_021485	CTT	2	6	85816	85821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512538316
1520	NC_021485	TTAG	2	8	85915	85922	25 %	50 %	25 %	0 %	512538316
1521	NC_021485	TTG	2	6	85988	85993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538316
1522	NC_021485	TTC	2	6	86015	86020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512538316
1523	NC_021485	TTG	2	6	86027	86032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538316
1524	NC_021485	AGGT	2	8	86051	86058	25 %	25 %	50 %	0 %	512538316
1525	NC_021485	CGT	2	6	86059	86064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538316
1526	NC_021485	CAAT	2	8	86113	86120	50 %	25 %	0 %	25 %	512538316
1527	NC_021485	CTG	2	6	86129	86134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538316
1528	NC_021485	ACA	2	6	86212	86217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512538316
1529	NC_021485	GTA	2	6	86219	86224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538316
1530	NC_021485	TGG	2	6	86225	86230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512538316
1531	NC_021485	TTCCA	2	10	86310	86319	20 %	40 %	0 %	40 %	512538316
1532	NC_021485	T	6	6	86431	86436	0 %	100 %	0 %	0 %	512538316
1533	NC_021485	ACA	2	6	86437	86442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512538316
1534	NC_021485	CAA	2	6	86449	86454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512538316
1535	NC_021485	TCCAA	2	10	86469	86478	40 %	20 %	0 %	40 %	512538316
1536	NC_021485	ACA	2	6	86575	86580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512538316
1537	NC_021485	ATT	2	6	86593	86598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538316
1538	NC_021485	CTTT	2	8	86600	86607	0 %	75 %	0 %	25 %	512538316
1539	NC_021485	ATT	2	6	86698	86703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538316
1540	NC_021485	TCTT	2	8	86710	86717	0 %	75 %	0 %	25 %	512538316
1541	NC_021485	CAG	2	6	86750	86755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512538316
1542	NC_021485	A	7	7	86765	86771	100 %	0 %	0 %	0 %	512538316
1543	NC_021485	AGA	2	6	86811	86816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538316
1544	NC_021485	AT	3	6	86817	86822	50 %	50 %	0 %	0 %	512538316
1545	NC_021485	A	6	6	86836	86841	100 %	0 %	0 %	0 %	512538316
1546	NC_021485	CAA	2	6	86846	86851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512538316
1547	NC_021485	ATTT	2	8	86871	86878	25 %	75 %	0 %	0 %	512538316
1548	NC_021485	ATT	2	6	86890	86895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538316
1549	NC_021485	CAA	2	6	86899	86904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512538316
1550	NC_021485	TCA	2	6	86917	86922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538316
1551	NC_021485	AAC	2	6	86984	86989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512538316
1552	NC_021485	ACA	2	6	87034	87039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512538316
1553	NC_021485	GAATA	2	10	87040	87049	60 %	20 %	20 %	0 %	512538316
1554	NC_021485	AGC	2	6	87187	87192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512538317
1555	NC_021485	GAA	2	6	87203	87208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538317
1556	NC_021485	CGC	2	6	87247	87252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512538317
1557	NC_021485	TGA	2	6	87319	87324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538317
1558	NC_021485	GAT	2	6	87362	87367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538317
1559	NC_021485	T	6	6	87382	87387	0 %	100 %	0 %	0 %	512538317
1560	NC_021485	GAA	2	6	87443	87448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538317
1561	NC_021485	TTA	2	6	87471	87476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538317
1562	NC_021485	CAT	2	6	87492	87497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538317
1563	NC_021485	TAT	2	6	87523	87528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538317
1564	NC_021485	CCA	2	6	87569	87574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512538317
1565	NC_021485	AGA	3	9	87586	87594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538317
1566	NC_021485	GAT	2	6	87611	87616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538317
1567	NC_021485	AAAT	2	8	87773	87780	75 %	25 %	0 %	0 %	512538317
1568	NC_021485	AGA	2	6	87902	87907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538318
1569	NC_021485	ATTGAA	2	12	87912	87923	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	512538318
1570	NC_021485	GTT	2	6	87930	87935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538318
1571	NC_021485	TCG	2	6	88188	88193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538319
1572	NC_021485	ACAA	2	8	88235	88242	75 %	0 %	0 %	25 %	512538319
1573	NC_021485	ATA	2	6	88251	88256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512538319
1574	NC_021485	GTA	2	6	88314	88319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538320
1575	NC_021485	ACTT	2	8	88325	88332	25 %	50 %	0 %	25 %	512538320
1576	NC_021485	A	7	7	88362	88368	100 %	0 %	0 %	0 %	512538320
1577	NC_021485	AGC	2	6	88373	88378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512538320
1578	NC_021485	CGT	2	6	88440	88445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538320
1579	NC_021485	CGT	2	6	88479	88484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538320
1580	NC_021485	CGT	2	6	88545	88550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538320
1581	NC_021485	GTAAAG	2	12	88597	88608	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	512538320
1582	NC_021485	A	6	6	88629	88634	100 %	0 %	0 %	0 %	512538320
1583	NC_021485	CGT	2	6	88676	88681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538321
1584	NC_021485	TCA	2	6	88781	88786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538321
1585	NC_021485	TGC	2	6	88831	88836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538321
1586	NC_021485	GCT	2	6	88844	88849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538321
1587	NC_021485	GCT	3	9	88853	88861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538321
1588	NC_021485	TGC	2	6	88948	88953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538321
1589	NC_021485	TCC	2	6	89014	89019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512538321
1590	NC_021485	CGT	3	9	89024	89032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538321
1591	NC_021485	AAT	2	6	89108	89113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512538322
1592	NC_021485	TGA	2	6	89123	89128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538322
1593	NC_021485	CT	3	6	89195	89200	0 %	50 %	0 %	50 %	512538322
1594	NC_021485	TCG	2	6	89201	89206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538322
1595	NC_021485	GCA	2	6	89232	89237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512538322
1596	NC_021485	ATCA	2	8	89243	89250	50 %	25 %	0 %	25 %	512538322
1597	NC_021485	ATC	2	6	89313	89318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538322
1598	NC_021485	CAA	2	6	89494	89499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512538322
1599	NC_021485	CAG	2	6	89530	89535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512538322
1600	NC_021485	A	6	6	89544	89549	100 %	0 %	0 %	0 %	512538322
1601	NC_021485	GAT	2	6	89550	89555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538322
1602	NC_021485	A	6	6	89601	89606	100 %	0 %	0 %	0 %	512538322
1603	NC_021485	GTAG	2	8	89634	89641	25 %	25 %	50 %	0 %	512538322
1604	NC_021485	A	6	6	89917	89922	100 %	0 %	0 %	0 %	512538322
1605	NC_021485	ATG	2	6	89934	89939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538322
1606	NC_021485	GAA	2	6	89970	89975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538322
1607	NC_021485	A	6	6	90011	90016	100 %	0 %	0 %	0 %	512538322
1608	NC_021485	ATAA	2	8	90019	90026	75 %	25 %	0 %	0 %	512538322
1609	NC_021485	TTA	2	6	90111	90116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538323
1610	NC_021485	ACT	2	6	90134	90139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538323
1611	NC_021485	A	6	6	90174	90179	100 %	0 %	0 %	0 %	512538323
1612	NC_021485	GTG	2	6	90198	90203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512538323
1613	NC_021485	TCG	2	6	90214	90219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538323
1614	NC_021485	GCT	3	9	90224	90232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538323
1615	NC_021485	ATG	2	6	90264	90269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538323
1616	NC_021485	CAA	2	6	90291	90296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512538323
1617	NC_021485	GAC	2	6	90317	90322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512538323
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1619	NC_021485	TGC	2	6	90394	90399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538323
1620	NC_021485	ATT	2	6	90410	90415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538323
1621	NC_021485	ATG	2	6	97624	97629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538324
1622	NC_021485	A	6	6	97630	97635	100 %	0 %	0 %	0 %	512538324
1623	NC_021485	TAT	2	6	97662	97667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538324
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1989	NC_021485	A	6	6	116094	116099	100 %	0 %	0 %	0 %	512538345
1990	NC_021485	TGC	2	6	116107	116112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538345
1991	NC_021485	TTA	3	9	116133	116141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538345
1992	NC_021485	TTA	2	6	116252	116257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538345
1993	NC_021485	AAAAC	2	10	116285	116294	80 %	0 %	0 %	20 %	512538345
1994	NC_021485	CAG	2	6	116370	116375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512538345
1995	NC_021485	TTGT	2	8	116502	116509	0 %	75 %	25 %	0 %	512538345
1996	NC_021485	CTG	3	9	116532	116540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538345
1997	NC_021485	A	6	6	116588	116593	100 %	0 %	0 %	0 %	512538345
1998	NC_021485	TTGG	2	8	116606	116613	0 %	50 %	50 %	0 %	512538345
1999	NC_021485	TGC	2	6	116713	116718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538345
2000	NC_021485	AGA	2	6	116728	116733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538345

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