MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus iniae SF1

Total Repeats: 40316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021314	T	6	6	132	137	0 %	100 %	0 %	0 %	508126651
2	NC_021314	T	6	6	191	196	0 %	100 %	0 %	0 %	508126651
3	NC_021314	AAC	2	6	278	283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508126651
4	NC_021314	CTG	2	6	303	308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508126651
5	NC_021314	ACT	2	6	357	362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508126651
6	NC_021314	AGA	2	6	364	369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126651
7	NC_021314	T	6	6	399	404	0 %	100 %	0 %	0 %	508126651
8	NC_021314	TTG	2	6	432	437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	508126651
9	NC_021314	GCT	2	6	506	511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508126651
10	NC_021314	TTAT	2	8	554	561	25 %	75 %	0 %	0 %	508126651
11	NC_021314	ACTT	2	8	591	598	25 %	50 %	0 %	25 %	508126651
12	NC_021314	TTA	2	6	743	748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126651
13	NC_021314	TGA	2	6	754	759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126651
14	NC_021314	AAG	2	6	798	803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126651
15	NC_021314	ATA	4	12	831	842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508126651
16	NC_021314	GAA	2	6	893	898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126651
17	NC_021314	ACC	2	6	943	948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	508126651
18	NC_021314	TAA	2	6	979	984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508126651
19	NC_021314	TTAGT	2	10	1086	1095	20 %	60 %	20 %	0 %	508126651
20	NC_021314	AGC	2	6	1135	1140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	508126651
21	NC_021314	TAT	2	6	1183	1188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126651
22	NC_021314	GAA	2	6	1196	1201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126651
23	NC_021314	ATG	2	6	1227	1232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126651
24	NC_021314	CAA	2	6	1254	1259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508126651
25	NC_021314	TGG	2	6	1354	1359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	508126651
26	NC_021314	TTC	2	6	1377	1382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508126651
27	NC_021314	TAA	2	6	1390	1395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508126651
28	NC_021314	ATTGAG	2	12	1433	1444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126651
29	NC_021314	TAA	2	6	1637	1642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508126652
30	NC_021314	CTATTC	2	12	1703	1714	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	508126652
31	NC_021314	CTT	2	6	1863	1868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508126652
32	NC_021314	ATT	2	6	1876	1881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126652
33	NC_021314	AAC	2	6	1922	1927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508126652
34	NC_021314	GTT	2	6	1933	1938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	508126652
35	NC_021314	ATT	2	6	2043	2048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126652
36	NC_021314	TAT	2	6	2055	2060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126652
37	NC_021314	GCA	2	6	2077	2082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	508126652
38	NC_021314	AAT	2	6	2137	2142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508126652
39	NC_021314	TTA	2	6	2188	2193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126652
40	NC_021314	TCA	2	6	2257	2262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508126652
41	NC_021314	TGA	2	6	2271	2276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126652
42	NC_021314	TTTTC	2	10	2294	2303	0 %	80 %	0 %	20 %	508126652
43	NC_021314	TTTA	2	8	2316	2323	25 %	75 %	0 %	0 %	508126652
44	NC_021314	CTT	2	6	2353	2358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508126652
45	NC_021314	GTT	2	6	2413	2418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	508126652
46	NC_021314	GAA	2	6	2560	2565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126652
47	NC_021314	CATTT	2	10	2601	2610	20 %	60 %	0 %	20 %	508126652
48	NC_021314	TTGA	2	8	2623	2630	25 %	50 %	25 %	0 %	508126652
49	NC_021314	GAT	2	6	2710	2715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126652
50	NC_021314	GAA	2	6	2716	2721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126652
51	NC_021314	TC	3	6	2837	2842	0 %	50 %	0 %	50 %	508126653
52	NC_021314	A	6	6	2852	2857	100 %	0 %	0 %	0 %	508126653
53	NC_021314	A	6	6	2888	2893	100 %	0 %	0 %	0 %	508126653
54	NC_021314	AATG	2	8	2897	2904	50 %	25 %	25 %	0 %	508126653
55	NC_021314	ATT	2	6	2960	2965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126653
56	NC_021314	ATG	2	6	2966	2971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126653
57	NC_021314	A	7	7	2998	3004	100 %	0 %	0 %	0 %	508126653
58	NC_021314	TTTA	2	8	3298	3305	25 %	75 %	0 %	0 %	508126654
59	NC_021314	GCT	2	6	3332	3337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508126654
60	NC_021314	CAA	2	6	3351	3356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508126654
61	NC_021314	TAAA	2	8	3399	3406	75 %	25 %	0 %	0 %	508126654
62	NC_021314	A	7	7	3428	3434	100 %	0 %	0 %	0 %	508126654
63	NC_021314	CAA	2	6	3441	3446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508126654
64	NC_021314	TGA	3	9	3568	3576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126654
65	NC_021314	TTG	2	6	3612	3617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	508126654
66	NC_021314	AATT	2	8	3651	3658	50 %	50 %	0 %	0 %	508126654
67	NC_021314	TAA	2	6	3679	3684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508126654
68	NC_021314	A	6	6	3702	3707	100 %	0 %	0 %	0 %	508126654
69	NC_021314	A	6	6	3759	3764	100 %	0 %	0 %	0 %	508126654
70	NC_021314	AGA	2	6	3778	3783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126654
71	NC_021314	AATT	2	8	3802	3809	50 %	50 %	0 %	0 %	508126654
72	NC_021314	GAA	3	9	3818	3826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126654
73	NC_021314	ATT	2	6	3841	3846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126654
74	NC_021314	AAC	2	6	3853	3858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508126654
75	NC_021314	TGA	2	6	3886	3891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126654
76	NC_021314	GAT	2	6	3911	3916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126654
77	NC_021314	TGC	2	6	3946	3951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508126654
78	NC_021314	GTT	3	9	3968	3976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	508126654
79	NC_021314	AGA	3	9	3991	3999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126654
80	NC_021314	GAA	2	6	4019	4024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126654
81	NC_021314	TTA	2	6	4100	4105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126654
82	NC_021314	ACTT	2	8	4115	4122	25 %	50 %	0 %	25 %	508126654
83	NC_021314	AAG	2	6	4137	4142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126654
84	NC_021314	AGC	2	6	4183	4188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	508126654
85	NC_021314	TAT	2	6	4192	4197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126654
86	NC_021314	ATG	2	6	4245	4250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126654
87	NC_021314	AAG	2	6	4284	4289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126654
88	NC_021314	AGA	2	6	4303	4308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126654
89	NC_021314	TGT	2	6	4321	4326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	508126654
90	NC_021314	A	6	6	4365	4370	100 %	0 %	0 %	0 %	508126654
91	NC_021314	TTG	2	6	4447	4452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	508126655
92	NC_021314	ATA	2	6	4480	4485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508126655
93	NC_021314	ATA	2	6	4492	4497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508126655
94	NC_021314	A	7	7	4555	4561	100 %	0 %	0 %	0 %	508126655
95	NC_021314	TTA	2	6	4588	4593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126655
96	NC_021314	A	6	6	4600	4605	100 %	0 %	0 %	0 %	508126655
97	NC_021314	AAT	2	6	4635	4640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508126655
98	NC_021314	ATT	2	6	4661	4666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126655
99	NC_021314	TTA	2	6	4670	4675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126655
100	NC_021314	ATGAT	2	10	4690	4699	40 %	40 %	20 %	0 %	508126655
101	NC_021314	TAT	2	6	4700	4705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126655
102	NC_021314	ATG	2	6	4708	4713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126655
103	NC_021314	ATT	2	6	4788	4793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126655
104	NC_021314	TTA	2	6	4864	4869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126655
105	NC_021314	TGA	2	6	4895	4900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126655
106	NC_021314	TTTA	2	8	4951	4958	25 %	75 %	0 %	0 %	508126655
107	NC_021314	AAC	2	6	4965	4970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508126655
108	NC_021314	ATT	2	6	5020	5025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126656
109	NC_021314	AT	3	6	5134	5139	50 %	50 %	0 %	0 %	508126656
110	NC_021314	TTG	2	6	5160	5165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	508126656
111	NC_021314	GAA	2	6	5225	5230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126656
112	NC_021314	GAT	2	6	5252	5257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126656
113	NC_021314	TGC	3	9	5260	5268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508126656
114	NC_021314	ATTT	2	8	5272	5279	25 %	75 %	0 %	0 %	508126656
115	NC_021314	ATA	2	6	5331	5336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508126656
116	NC_021314	TCCAAA	2	12	5389	5400	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	508126656
117	NC_021314	TAG	2	6	5524	5529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126656
118	NC_021314	GAA	2	6	5564	5569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126656
119	NC_021314	GAATT	2	10	5580	5589	40 %	40 %	20 %	0 %	508126656
120	NC_021314	T	6	6	5588	5593	0 %	100 %	0 %	0 %	508126656
121	NC_021314	TGA	2	6	5596	5601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126656
122	NC_021314	A	7	7	5652	5658	100 %	0 %	0 %	0 %	508126656
123	NC_021314	ATT	2	6	5783	5788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126656
124	NC_021314	TGA	2	6	5902	5907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126656
125	NC_021314	A	6	6	5913	5918	100 %	0 %	0 %	0 %	508126656
126	NC_021314	TTA	2	6	5960	5965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126656
127	NC_021314	ATT	2	6	6006	6011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126656
128	NC_021314	TCT	2	6	6057	6062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508126656
129	NC_021314	TTA	2	6	6158	6163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126656
130	NC_021314	ATT	2	6	6203	6208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126656
131	NC_021314	TCA	2	6	6220	6225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508126656
132	NC_021314	AGA	2	6	6253	6258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126656
133	NC_021314	A	7	7	6305	6311	100 %	0 %	0 %	0 %	508126656
134	NC_021314	ATT	2	6	6320	6325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126656
135	NC_021314	TGA	2	6	6355	6360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126656
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153	NC_021314	ATT	3	9	7154	7162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126656
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267	NC_021314	CAA	2	6	11683	11688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508126661
268	NC_021314	TAA	2	6	11711	11716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508126661
269	NC_021314	ATC	2	6	11789	11794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508126661
270	NC_021314	GCA	3	9	11799	11807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	508126661
271	NC_021314	TATT	2	8	11822	11829	25 %	75 %	0 %	0 %	508126661
272	NC_021314	TGA	2	6	11873	11878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126661
273	NC_021314	A	6	6	11891	11896	100 %	0 %	0 %	0 %	508126661
274	NC_021314	ATG	2	6	11947	11952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126661
275	NC_021314	TAT	2	6	11957	11962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126661
276	NC_021314	AT	3	6	11978	11983	50 %	50 %	0 %	0 %	508126661
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278	NC_021314	AAT	2	6	12058	12063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508126661
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280	NC_021314	TGA	2	6	12247	12252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126662
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291	NC_021314	AG	3	6	12692	12697	50 %	0 %	50 %	0 %	508126662
292	NC_021314	A	6	6	12744	12749	100 %	0 %	0 %	0 %	508126662
293	NC_021314	T	7	7	12760	12766	0 %	100 %	0 %	0 %	508126662
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299	NC_021314	ATT	2	6	13171	13176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126662
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302	NC_021314	ATT	2	6	13238	13243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126662
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382	NC_021314	TTA	2	6	18118	18123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126666
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385	NC_021314	TTC	2	6	18223	18228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508126666
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390	NC_021314	AAAC	2	8	18524	18531	75 %	0 %	0 %	25 %	508126666
391	NC_021314	TGA	2	6	18599	18604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126666
392	NC_021314	ATG	2	6	18707	18712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126666
393	NC_021314	CGA	2	6	18713	18718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	508126666
394	NC_021314	CGA	3	9	18722	18730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	508126666
395	NC_021314	TTC	2	6	18820	18825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508126666
396	NC_021314	GTA	2	6	18859	18864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126666
397	NC_021314	CAAC	2	8	18886	18893	50 %	0 %	0 %	50 %	508126666
398	NC_021314	GCTT	2	8	18967	18974	0 %	50 %	25 %	25 %	508126667
399	NC_021314	GTT	2	6	19075	19080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	508126667
400	NC_021314	TTG	2	6	19179	19184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	508126667
401	NC_021314	TCA	2	6	19192	19197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508126667
402	NC_021314	CAT	2	6	19224	19229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508126667
403	NC_021314	CTTTC	2	10	19551	19560	0 %	60 %	0 %	40 %	508126668
404	NC_021314	CAGG	2	8	19592	19599	25 %	0 %	50 %	25 %	508126668
405	NC_021314	TCT	2	6	19609	19614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508126668
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410	NC_021314	GTA	2	6	20023	20028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126668
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421	NC_021314	T	7	7	20323	20329	0 %	100 %	0 %	0 %	508126670
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427	NC_021314	ATT	2	6	20813	20818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126670
428	NC_021314	TAT	2	6	20819	20824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126670
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440	NC_021314	TAT	2	6	21425	21430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126670
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