MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus iniae SF1

Total Repeats: 40316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021314	TAA	2	6	165963	165968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508126829
3002	NC_021314	GAA	2	6	166054	166059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126829
3003	NC_021314	CTG	2	6	166067	166072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508126829
3004	NC_021314	GTC	2	6	166081	166086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508126829
3005	NC_021314	ATG	2	6	166157	166162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126829
3006	NC_021314	GAA	2	6	166174	166179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126829
3007	NC_021314	ACT	2	6	166268	166273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508126829
3008	NC_021314	CGAA	2	8	166312	166319	50 %	0 %	25 %	25 %	508126829
3009	NC_021314	AAG	2	6	166355	166360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126829
3010	NC_021314	AAG	2	6	166421	166426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126829
3011	NC_021314	ACA	2	6	166447	166452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508126829
3012	NC_021314	GAT	2	6	166453	166458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126829
3013	NC_021314	TGA	2	6	166488	166493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126829
3014	NC_021314	AAAG	2	8	166545	166552	75 %	0 %	25 %	0 %	508126829
3015	NC_021314	GCT	2	6	166573	166578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508126829
3016	NC_021314	GGT	2	6	166606	166611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	508126829
3017	NC_021314	AAT	2	6	166645	166650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508126829
3018	NC_021314	GAA	2	6	166816	166821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126829
3019	NC_021314	GTTAT	2	10	166871	166880	20 %	60 %	20 %	0 %	508126829
3020	NC_021314	ATT	2	6	166903	166908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126829
3021	NC_021314	ACA	2	6	167008	167013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508126829
3022	NC_021314	ATC	2	6	167054	167059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508126829
3023	NC_021314	CAA	2	6	167272	167277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508126829
3024	NC_021314	GAG	2	6	167401	167406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	508126829
3025	NC_021314	T	6	6	167408	167413	0 %	100 %	0 %	0 %	508126829
3026	NC_021314	ATG	2	6	167495	167500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126829
3027	NC_021314	ATGC	2	8	167554	167561	25 %	25 %	25 %	25 %	508126829
3028	NC_021314	TAT	2	6	167595	167600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126829
3029	NC_021314	TGAA	2	8	167642	167649	50 %	25 %	25 %	0 %	508126829
3030	NC_021314	GAA	2	6	167725	167730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126829
3031	NC_021314	ATT	2	6	167794	167799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126829
3032	NC_021314	AAG	2	6	167819	167824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126829
3033	NC_021314	ATG	2	6	167852	167857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126829
3034	NC_021314	AAG	2	6	168002	168007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126829
3035	NC_021314	ACC	2	6	168036	168041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	508126829
3036	NC_021314	AAGG	2	8	168085	168092	50 %	0 %	50 %	0 %	508126829
3037	NC_021314	TGA	2	6	168153	168158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126829
3038	NC_021314	GAAG	2	8	168181	168188	50 %	0 %	50 %	0 %	508126829
3039	NC_021314	CAAG	2	8	168208	168215	50 %	0 %	25 %	25 %	508126829
3040	NC_021314	AGC	2	6	168231	168236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	508126829
3041	NC_021314	AATT	2	8	168269	168276	50 %	50 %	0 %	0 %	508126829
3042	NC_021314	A	6	6	168349	168354	100 %	0 %	0 %	0 %	508126829
3043	NC_021314	A	6	6	168665	168670	100 %	0 %	0 %	0 %	508126830
3044	NC_021314	GCT	2	6	168682	168687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508126830
3045	NC_021314	TAG	2	6	168704	168709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126830
3046	NC_021314	CTTGTA	2	12	168715	168726	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	508126830
3047	NC_021314	A	7	7	168774	168780	100 %	0 %	0 %	0 %	508126830
3048	NC_021314	ATCGCA	2	12	168813	168824	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	508126830
3049	NC_021314	GAA	2	6	168868	168873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126830
3050	NC_021314	CTG	2	6	168881	168886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508126830
3051	NC_021314	ATG	2	6	168971	168976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126830
3052	NC_021314	GAA	2	6	168988	168993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126830
3053	NC_021314	ATT	2	6	169063	169068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126830
3054	NC_021314	TGA	2	6	169074	169079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126830
3055	NC_021314	AGT	2	6	169108	169113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126830
3056	NC_021314	A	6	6	169116	169121	100 %	0 %	0 %	0 %	508126830
3057	NC_021314	AAG	2	6	169148	169153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126830
3058	NC_021314	CAAA	2	8	169163	169170	75 %	0 %	0 %	25 %	508126830
3059	NC_021314	A	6	6	169363	169368	100 %	0 %	0 %	0 %	508126831
3060	NC_021314	TGA	2	6	169382	169387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126831
3061	NC_021314	ATT	2	6	169390	169395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126831
3062	NC_021314	TTCT	2	8	169414	169421	0 %	75 %	0 %	25 %	508126831
3063	NC_021314	TAT	2	6	169448	169453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126831
3064	NC_021314	TAG	2	6	169469	169474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126831
3065	NC_021314	CTTT	2	8	169505	169512	0 %	75 %	0 %	25 %	508126831
3066	NC_021314	ATT	2	6	169524	169529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126831
3067	NC_021314	ATA	2	6	169532	169537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508126831
3068	NC_021314	TAT	2	6	169542	169547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126831
3069	NC_021314	T	6	6	169630	169635	0 %	100 %	0 %	0 %	508126831
3070	NC_021314	A	6	6	169636	169641	100 %	0 %	0 %	0 %	508126831
3071	NC_021314	GAT	2	6	169671	169676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126831
3072	NC_021314	AGG	2	6	169722	169727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	508126831
3073	NC_021314	ATT	2	6	169783	169788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126831
3074	NC_021314	GGT	2	6	169807	169812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	508126831
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3076	NC_021314	TTG	2	6	169822	169827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	508126831
3077	NC_021314	TTA	2	6	169840	169845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126831
3078	NC_021314	TAA	2	6	169854	169859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508126831
3079	NC_021314	AGT	2	6	169894	169899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126831
3080	NC_021314	TTA	2	6	169972	169977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126831
3081	NC_021314	TA	3	6	169985	169990	50 %	50 %	0 %	0 %	508126831
3082	NC_021314	ATA	2	6	170003	170008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508126831
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3084	NC_021314	GAAG	2	8	170164	170171	50 %	0 %	50 %	0 %	508126831
3085	NC_021314	TTA	2	6	170538	170543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126832
3086	NC_021314	GCA	2	6	170577	170582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	508126832
3087	NC_021314	CCT	2	6	170685	170690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	508126832
3088	NC_021314	ATG	2	6	170812	170817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126832
3089	NC_021314	ACT	2	6	170976	170981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508126832
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3091	NC_021314	TC	3	6	171034	171039	0 %	50 %	0 %	50 %	508126832
3092	NC_021314	ATA	2	6	171119	171124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508126833
3093	NC_021314	CTAGCA	2	12	171203	171214	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	508126833
3094	NC_021314	CAA	2	6	171276	171281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508126833
3095	NC_021314	TTC	2	6	171381	171386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508126833
3096	NC_021314	A	6	6	171496	171501	100 %	0 %	0 %	0 %	508126833
3097	NC_021314	AGG	2	6	171558	171563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	508126833
3098	NC_021314	T	6	6	171580	171585	0 %	100 %	0 %	0 %	508126833
3099	NC_021314	GCT	2	6	171596	171601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508126833
3100	NC_021314	CGG	2	6	171611	171616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	508126833
3101	NC_021314	T	6	6	171648	171653	0 %	100 %	0 %	0 %	508126833
3102	NC_021314	CTT	2	6	171657	171662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508126833
3103	NC_021314	T	6	6	171681	171686	0 %	100 %	0 %	0 %	508126833
3104	NC_021314	CAT	2	6	171738	171743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508126833
3105	NC_021314	CGC	2	6	171870	171875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	508126833
3106	NC_021314	T	6	6	171876	171881	0 %	100 %	0 %	0 %	508126833
3107	NC_021314	TATTT	2	10	171898	171907	20 %	80 %	0 %	0 %	508126833
3108	NC_021314	GAG	2	6	171961	171966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	508126833
3109	NC_021314	CCA	2	6	172019	172024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	508126833
3110	NC_021314	AAG	2	6	172025	172030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126833
3111	NC_021314	TGTCT	2	10	172060	172069	0 %	60 %	20 %	20 %	508126833
3112	NC_021314	CTT	2	6	172156	172161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508126834
3113	NC_021314	AAT	2	6	172216	172221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508126834
3114	NC_021314	T	6	6	172295	172300	0 %	100 %	0 %	0 %	508126834
3115	NC_021314	GTT	2	6	172327	172332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	508126834
3116	NC_021314	CCCA	2	8	172420	172427	25 %	0 %	0 %	75 %	508126834
3117	NC_021314	CCA	2	6	172461	172466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	508126834
3118	NC_021314	CAG	2	6	172501	172506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	508126834
3119	NC_021314	TGCA	2	8	172537	172544	25 %	25 %	25 %	25 %	508126834
3120	NC_021314	CAG	2	6	172588	172593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	508126834
3121	NC_021314	TAA	2	6	172604	172609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508126834
3122	NC_021314	AGTA	2	8	172616	172623	50 %	25 %	25 %	0 %	508126834
3123	NC_021314	CATA	2	8	172666	172673	50 %	25 %	0 %	25 %	508126834
3124	NC_021314	TAA	2	6	172765	172770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508126834
3125	NC_021314	AGC	2	6	172899	172904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	508126835
3126	NC_021314	ATA	2	6	172948	172953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508126835
3127	NC_021314	TCT	2	6	172981	172986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508126835
3128	NC_021314	CCT	2	6	173104	173109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	508126835
3129	NC_021314	GCA	3	9	173113	173121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	508126835
3130	NC_021314	AGC	2	6	173124	173129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	508126835
3131	NC_021314	TCA	2	6	173153	173158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508126835
3132	NC_021314	TCAATA	2	12	173245	173256	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	508126835
3133	NC_021314	GCGT	2	8	173294	173301	0 %	25 %	50 %	25 %	508126835
3134	NC_021314	TTG	2	6	173317	173322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	508126835
3135	NC_021314	TTTTA	2	10	173352	173361	20 %	80 %	0 %	0 %	508126835
3136	NC_021314	CTT	2	6	173381	173386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508126835
3137	NC_021314	TCACA	2	10	173393	173402	40 %	20 %	0 %	40 %	508126835
3138	NC_021314	ATCA	2	8	173454	173461	50 %	25 %	0 %	25 %	508126835
3139	NC_021314	GAT	2	6	173484	173489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126835
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3143	NC_021314	AAG	2	6	174018	174023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126836
3144	NC_021314	TCT	2	6	174056	174061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508126836
3145	NC_021314	T	6	6	174237	174242	0 %	100 %	0 %	0 %	508126836
3146	NC_021314	GTTG	2	8	174271	174278	0 %	50 %	50 %	0 %	508126836
3147	NC_021314	TTG	2	6	174309	174314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	508126836
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3151	NC_021314	AAG	2	6	174476	174481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126837
3152	NC_021314	ATA	2	6	174500	174505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508126837
3153	NC_021314	TAT	2	6	174561	174566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126837
3154	NC_021314	ATA	2	6	174569	174574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508126837
3155	NC_021314	TCA	2	6	174657	174662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508126837
3156	NC_021314	CT	3	6	174670	174675	0 %	50 %	0 %	50 %	508126837
3157	NC_021314	ATC	2	6	174710	174715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508126837
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3160	NC_021314	TTCA	2	8	174844	174851	25 %	50 %	0 %	25 %	508126837
3161	NC_021314	TCA	2	6	174890	174895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508126837
3162	NC_021314	TGA	2	6	175011	175016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126837
3163	NC_021314	TGA	2	6	175095	175100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126837
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3166	NC_021314	ATG	2	6	175262	175267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126837
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3233	NC_021314	GCT	2	6	178793	178798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508126841
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3237	NC_021314	TTGT	2	8	179376	179383	0 %	75 %	25 %	0 %	508126841
3238	NC_021314	CA	3	6	179477	179482	50 %	0 %	0 %	50 %	508126841
3239	NC_021314	GAA	2	6	179491	179496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126841
3240	NC_021314	TAT	2	6	179671	179676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126841
3241	NC_021314	ATG	2	6	179736	179741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126841
3242	NC_021314	ATT	2	6	179757	179762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126841
3243	NC_021314	A	6	6	179878	179883	100 %	0 %	0 %	0 %	508126842
3244	NC_021314	TTTC	2	8	179933	179940	0 %	75 %	0 %	25 %	508126842
3245	NC_021314	TTA	2	6	179999	180004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126842
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3247	NC_021314	A	7	7	180052	180058	100 %	0 %	0 %	0 %	508126842
3248	NC_021314	ATT	2	6	180160	180165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126842
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3364	NC_021314	TA	3	6	186495	186500	50 %	50 %	0 %	0 %	508126846
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3368	NC_021314	AAG	2	6	186771	186776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126846
3369	NC_021314	AAGAA	2	10	186783	186792	80 %	0 %	20 %	0 %	508126846
3370	NC_021314	GAAA	2	8	186824	186831	75 %	0 %	25 %	0 %	508126846
3371	NC_021314	TGA	2	6	186876	186881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126846
3372	NC_021314	AG	3	6	186916	186921	50 %	0 %	50 %	0 %	508126846
3373	NC_021314	AAG	2	6	186945	186950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126846
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3375	NC_021314	CAT	2	6	187057	187062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508126846
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3379	NC_021314	CAT	2	6	187280	187285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508126846
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3381	NC_021314	CCT	2	6	187341	187346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	508126846
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3384	NC_021314	AAG	2	6	187528	187533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126847
3385	NC_021314	TCA	2	6	187624	187629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508126847
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3387	NC_021314	GAA	2	6	187782	187787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126847
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3389	NC_021314	AG	3	6	187818	187823	50 %	0 %	50 %	0 %	508126847
3390	NC_021314	TAAT	2	8	187992	187999	50 %	50 %	0 %	0 %	508126847
3391	NC_021314	CTG	2	6	188115	188120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508126848
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3398	NC_021314	TTA	2	6	188634	188639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126849
3399	NC_021314	ATT	2	6	188649	188654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126849
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3401	NC_021314	A	6	6	188742	188747	100 %	0 %	0 %	0 %	508126849
3402	NC_021314	AGAAAG	2	12	188768	188779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126849
3403	NC_021314	TGA	2	6	188804	188809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126849
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3425	NC_021314	TGA	2	6	190356	190361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126851
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3442	NC_021314	TTC	2	6	191299	191304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508126854
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3451	NC_021314	A	7	7	191953	191959	100 %	0 %	0 %	0 %	508126854
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3479	NC_021314	TGT	2	6	193442	193447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	508126855
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3484	NC_021314	ACCA	2	8	193660	193667	50 %	0 %	0 %	50 %	508126855
3485	NC_021314	TG	3	6	193678	193683	0 %	50 %	50 %	0 %	508126855
3486	NC_021314	TGG	2	6	193685	193690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	508126855
3487	NC_021314	ACTTA	2	10	193723	193732	40 %	40 %	0 %	20 %	508126855
3488	NC_021314	GATG	2	8	193739	193746	25 %	25 %	50 %	0 %	508126855
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3490	NC_021314	ACCA	2	8	193768	193775	50 %	0 %	0 %	50 %	508126855
3491	NC_021314	ACT	2	6	193813	193818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508126855
3492	NC_021314	GAA	2	6	193820	193825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126855
3493	NC_021314	TTG	2	6	193828	193833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	508126855
3494	NC_021314	GTT	2	6	193836	193841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	508126855
3495	NC_021314	TGA	2	6	193874	193879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126855
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3499	NC_021314	AAC	2	6	194027	194032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508126855
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