MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus iniae SF1

Total Repeats: 40316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28119	NC_021314	TCA	2	6	1497780	1497785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508128131
28120	NC_021314	TCT	2	6	1497849	1497854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508128131
28121	NC_021314	ACT	2	6	1497906	1497911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508128131
28122	NC_021314	AGCAG	2	10	1497941	1497950	40 %	0 %	40 %	20 %	508128131
28123	NC_021314	TTA	2	6	1497951	1497956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508128131
28124	NC_021314	TCT	2	6	1498017	1498022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508128131
28125	NC_021314	TAA	2	6	1498036	1498041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508128131
28126	NC_021314	AATT	2	8	1498110	1498117	50 %	50 %	0 %	0 %	508128131
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28130	NC_021314	ACT	3	9	1498208	1498216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508128131
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28147	NC_021314	GTTA	2	8	1499138	1499145	25 %	50 %	25 %	0 %	508128132
28148	NC_021314	TAT	2	6	1499153	1499158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508128132
28149	NC_021314	GTC	2	6	1499293	1499298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508128132
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28151	NC_021314	TGAT	2	8	1499368	1499375	25 %	50 %	25 %	0 %	508128132
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28154	NC_021314	ATAA	2	8	1499556	1499563	75 %	25 %	0 %	0 %	508128132
28155	NC_021314	TGGT	2	8	1499591	1499598	0 %	50 %	50 %	0 %	508128132
28156	NC_021314	CAAGT	2	10	1499635	1499644	40 %	20 %	20 %	20 %	508128132
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28160	NC_021314	TAT	2	6	1499898	1499903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508128132
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28166	NC_021314	A	6	6	1500354	1500359	100 %	0 %	0 %	0 %	508128132
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28220	NC_021314	GTG	2	6	1503051	1503056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	508128136
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28222	NC_021314	ATC	2	6	1503135	1503140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508128136
28223	NC_021314	T	6	6	1503153	1503158	0 %	100 %	0 %	0 %	508128136
28224	NC_021314	TTG	2	6	1503195	1503200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	508128136
28225	NC_021314	CTGGC	2	10	1503291	1503300	0 %	20 %	40 %	40 %	508128136
28226	NC_021314	TCA	2	6	1503325	1503330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508128136
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28228	NC_021314	GTTT	2	8	1503356	1503363	0 %	75 %	25 %	0 %	508128136
28229	NC_021314	CTTG	2	8	1503377	1503384	0 %	50 %	25 %	25 %	508128136
28230	NC_021314	TC	3	6	1503445	1503450	0 %	50 %	0 %	50 %	508128136
28231	NC_021314	TGGC	2	8	1503529	1503536	0 %	25 %	50 %	25 %	508128136
28232	NC_021314	ATT	2	6	1503578	1503583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508128136
28233	NC_021314	ATC	2	6	1503593	1503598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508128136
28234	NC_021314	GCTTTA	2	12	1503602	1503613	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	508128136
28235	NC_021314	CTT	2	6	1503620	1503625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508128136
28236	NC_021314	A	6	6	1503681	1503686	100 %	0 %	0 %	0 %	508128136
28237	NC_021314	T	7	7	1503705	1503711	0 %	100 %	0 %	0 %	508128136
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28242	NC_021314	A	6	6	1503968	1503973	100 %	0 %	0 %	0 %	508128136
28243	NC_021314	GGA	2	6	1503974	1503979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	508128136
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28335	NC_021314	CAT	2	6	1508925	1508930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508128142
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28338	NC_021314	GCATCA	2	12	1509034	1509045	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	508128142
28339	NC_021314	CAAA	2	8	1509100	1509107	75 %	0 %	0 %	25 %	508128142
28340	NC_021314	ACTA	2	8	1509111	1509118	50 %	25 %	0 %	25 %	508128142
28341	NC_021314	AAT	2	6	1509132	1509137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508128142
28342	NC_021314	A	7	7	1509229	1509235	100 %	0 %	0 %	0 %	508128142
28343	NC_021314	AAT	2	6	1509243	1509248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508128142
28344	NC_021314	CCAA	2	8	1509281	1509288	50 %	0 %	0 %	50 %	508128142
28345	NC_021314	A	6	6	1509293	1509298	100 %	0 %	0 %	0 %	508128142
28346	NC_021314	GTT	2	6	1509386	1509391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	508128142
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28349	NC_021314	GAA	2	6	1509492	1509497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508128142
28350	NC_021314	TAA	2	6	1509525	1509530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508128142
28351	NC_021314	AAT	2	6	1509695	1509700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508128143
28352	NC_021314	TCT	2	6	1509728	1509733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508128143
28353	NC_021314	T	8	8	1509800	1509807	0 %	100 %	0 %	0 %	508128143
28354	NC_021314	TAAG	2	8	1509843	1509850	50 %	25 %	25 %	0 %	508128143
28355	NC_021314	CAT	2	6	1509958	1509963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508128143
28356	NC_021314	CAT	2	6	1509996	1510001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508128143
28357	NC_021314	GA	4	8	1510048	1510055	50 %	0 %	50 %	0 %	508128143
28358	NC_021314	TAT	2	6	1510101	1510106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508128143
28359	NC_021314	GAT	2	6	1510120	1510125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508128143
28360	NC_021314	TAA	2	6	1510132	1510137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508128143
28361	NC_021314	ATA	2	6	1510274	1510279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508128143
28362	NC_021314	AAT	2	6	1510306	1510311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508128143
28363	NC_021314	CTG	2	6	1510355	1510360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508128143
28364	NC_021314	CAA	2	6	1510372	1510377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508128143
28365	NC_021314	GCA	2	6	1510421	1510426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	508128143
28366	NC_021314	CCA	2	6	1510457	1510462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	508128143
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28368	NC_021314	TCTT	2	8	1510478	1510485	0 %	75 %	0 %	25 %	508128143
28369	NC_021314	CCT	2	6	1510550	1510555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	508128143
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28371	NC_021314	TCT	2	6	1510661	1510666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508128143
28372	NC_021314	CAA	2	6	1510674	1510679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508128143
28373	NC_021314	CAT	2	6	1510701	1510706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508128143
28374	NC_021314	TAAT	2	8	1510789	1510796	50 %	50 %	0 %	0 %	508128144
28375	NC_021314	TGC	2	6	1510798	1510803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508128144
28376	NC_021314	CAT	2	6	1510845	1510850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508128144
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28379	NC_021314	TCT	2	6	1510905	1510910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508128144
28380	NC_021314	AAT	2	6	1510935	1510940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508128144
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28382	NC_021314	ATA	2	6	1510978	1510983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508128144
28383	NC_021314	CAT	2	6	1511006	1511011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508128144
28384	NC_021314	TTC	2	6	1511044	1511049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508128144
28385	NC_021314	TAG	2	6	1511138	1511143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508128144
28386	NC_021314	CTT	2	6	1511216	1511221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508128144
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28390	NC_021314	T	6	6	1511607	1511612	0 %	100 %	0 %	0 %	508128145
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28395	NC_021314	ATA	2	6	1511746	1511751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508128145
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28399	NC_021314	GCA	2	6	1511879	1511884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	508128145
28400	NC_021314	ATCAA	2	10	1511930	1511939	60 %	20 %	0 %	20 %	508128145
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28402	NC_021314	CTG	2	6	1511972	1511977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508128145
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28404	NC_021314	A	6	6	1512034	1512039	100 %	0 %	0 %	0 %	508128145
28405	NC_021314	TTTCCG	2	12	1512050	1512061	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	508128145
28406	NC_021314	ATCA	2	8	1512070	1512077	50 %	25 %	0 %	25 %	508128145
28407	NC_021314	CT	3	6	1512083	1512088	0 %	50 %	0 %	50 %	508128145
28408	NC_021314	CT	3	6	1512152	1512157	0 %	50 %	0 %	50 %	508128146
28409	NC_021314	AATT	2	8	1512245	1512252	50 %	50 %	0 %	0 %	508128146
28410	NC_021314	GTA	2	6	1512285	1512290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508128146
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28414	NC_021314	AAGT	2	8	1512459	1512466	50 %	25 %	25 %	0 %	508128146
28415	NC_021314	TATT	2	8	1512560	1512567	25 %	75 %	0 %	0 %	508128146
28416	NC_021314	ACT	2	6	1512592	1512597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508128146
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28422	NC_021314	CCCA	2	8	1512789	1512796	25 %	0 %	0 %	75 %	508128146
28423	NC_021314	ATA	2	6	1512956	1512961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508128147
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28428	NC_021314	GAAA	2	8	1513261	1513268	75 %	0 %	25 %	0 %	508128147
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28432	NC_021314	T	6	6	1513390	1513395	0 %	100 %	0 %	0 %	508128147
28433	NC_021314	TAA	2	6	1513412	1513417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508128147
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28450	NC_021314	TTC	2	6	1514251	1514256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508128148
28451	NC_021314	GTT	2	6	1514261	1514266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	508128148
28452	NC_021314	TCA	2	6	1514330	1514335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508128148
28453	NC_021314	TCCTGA	2	12	1514557	1514568	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	508128148
28454	NC_021314	CCA	2	6	1514588	1514593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	508128148
28455	NC_021314	T	6	6	1514655	1514660	0 %	100 %	0 %	0 %	508128148
28456	NC_021314	T	6	6	1514704	1514709	0 %	100 %	0 %	0 %	508128148
28457	NC_021314	CTG	2	6	1514785	1514790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508128149
28458	NC_021314	TGAA	2	8	1514794	1514801	50 %	25 %	25 %	0 %	508128149
28459	NC_021314	T	6	6	1514818	1514823	0 %	100 %	0 %	0 %	508128149
28460	NC_021314	ATA	2	6	1514827	1514832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508128149
28461	NC_021314	TAAAT	2	10	1514837	1514846	60 %	40 %	0 %	0 %	508128149
28462	NC_021314	CAAAA	2	10	1514863	1514872	80 %	0 %	0 %	20 %	508128149
28463	NC_021314	TAA	2	6	1514929	1514934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508128149
28464	NC_021314	A	6	6	1514972	1514977	100 %	0 %	0 %	0 %	508128149
28465	NC_021314	GAT	3	9	1514998	1515006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508128149
28466	NC_021314	A	6	6	1515026	1515031	100 %	0 %	0 %	0 %	508128149
28467	NC_021314	CCA	2	6	1515065	1515070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	508128149
28468	NC_021314	CAA	2	6	1515126	1515131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508128149
28469	NC_021314	CAA	2	6	1515166	1515171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508128149
28470	NC_021314	T	7	7	1515187	1515193	0 %	100 %	0 %	0 %	508128149
28471	NC_021314	A	7	7	1515215	1515221	100 %	0 %	0 %	0 %	508128149
28472	NC_021314	ATG	2	6	1515396	1515401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508128149
28473	NC_021314	TGT	2	6	1515416	1515421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	508128149
28474	NC_021314	TTGT	3	12	1515418	1515429	0 %	75 %	25 %	0 %	508128149
28475	NC_021314	TAT	2	6	1515451	1515456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508128150
28476	NC_021314	GCAA	2	8	1515463	1515470	50 %	0 %	25 %	25 %	508128150
28477	NC_021314	CAA	2	6	1515510	1515515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508128150
28478	NC_021314	AAAG	2	8	1515644	1515651	75 %	0 %	25 %	0 %	508128150
28479	NC_021314	TCAA	2	8	1515845	1515852	50 %	25 %	0 %	25 %	508128150
28480	NC_021314	CAA	2	6	1515862	1515867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508128150
28481	NC_021314	ATA	2	6	1515875	1515880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508128150
28482	NC_021314	A	6	6	1515928	1515933	100 %	0 %	0 %	0 %	508128150
28483	NC_021314	ATG	2	6	1516323	1516328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508128151
28484	NC_021314	TCA	2	6	1516420	1516425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508128151
28485	NC_021314	CTT	2	6	1516445	1516450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508128151
28486	NC_021314	TCT	2	6	1516471	1516476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508128151
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28489	NC_021314	TTC	2	6	1516605	1516610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508128151
28490	NC_021314	AAT	2	6	1516646	1516651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508128151
28491	NC_021314	ATC	2	6	1516677	1516682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508128151
28492	NC_021314	TAA	2	6	1516703	1516708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508128151
28493	NC_021314	AGC	2	6	1516728	1516733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	508128151
28494	NC_021314	T	7	7	1516822	1516828	0 %	100 %	0 %	0 %	508128151
28495	NC_021314	T	7	7	1517038	1517044	0 %	100 %	0 %	0 %	508128152
28496	NC_021314	TCT	2	6	1517079	1517084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508128152
28497	NC_021314	C	6	6	1517085	1517090	0 %	0 %	0 %	100 %	508128152
28498	NC_021314	CAA	2	6	1517092	1517097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508128152
28499	NC_021314	ATC	2	6	1517271	1517276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508128153
28500	NC_021314	TGT	2	6	1517281	1517286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	508128153

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