MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus iniae SF1

Total Repeats: 40316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_021314	CAA	2	6	1330542	1330547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508127952
25003	NC_021314	CTATAT	2	12	1330572	1330583	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	508127952
25004	NC_021314	TAT	2	6	1330609	1330614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508127953
25005	NC_021314	AATA	2	8	1330634	1330641	75 %	25 %	0 %	0 %	508127953
25006	NC_021314	TAA	2	6	1330668	1330673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508127953
25007	NC_021314	AGC	2	6	1330803	1330808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	508127953
25008	NC_021314	GTT	2	6	1330840	1330845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	508127953
25009	NC_021314	AGTA	2	8	1330854	1330861	50 %	25 %	25 %	0 %	508127953
25010	NC_021314	T	7	7	1330862	1330868	0 %	100 %	0 %	0 %	508127953
25011	NC_021314	CAT	2	6	1330869	1330874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508127953
25012	NC_021314	CTT	2	6	1330895	1330900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508127953
25013	NC_021314	ATC	3	9	1330938	1330946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508127953
25014	NC_021314	CTG	2	6	1330970	1330975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508127953
25015	NC_021314	CTT	2	6	1331042	1331047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508127953
25016	NC_021314	TTC	2	6	1331076	1331081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508127953
25017	NC_021314	TTAG	2	8	1331119	1331126	25 %	50 %	25 %	0 %	508127953
25018	NC_021314	TGC	2	6	1331139	1331144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508127953
25019	NC_021314	TGC	2	6	1331151	1331156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508127953
25020	NC_021314	CCA	3	9	1331164	1331172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	508127953
25021	NC_021314	TCAG	2	8	1331209	1331216	25 %	25 %	25 %	25 %	508127953
25022	NC_021314	TTTG	2	8	1331278	1331285	0 %	75 %	25 %	0 %	508127954
25023	NC_021314	TCT	2	6	1331298	1331303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508127954
25024	NC_021314	ATA	2	6	1331312	1331317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508127954
25025	NC_021314	AAT	2	6	1331372	1331377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508127954
25026	NC_021314	TCT	2	6	1331484	1331489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508127954
25027	NC_021314	CCA	2	6	1331523	1331528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	508127954
25028	NC_021314	CTA	2	6	1331602	1331607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508127954
25029	NC_021314	CAG	2	6	1331638	1331643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	508127954
25030	NC_021314	GAC	2	6	1331755	1331760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	508127954
25031	NC_021314	ATTCA	2	10	1331792	1331801	40 %	40 %	0 %	20 %	508127954
25032	NC_021314	T	6	6	1331822	1331827	0 %	100 %	0 %	0 %	508127954
25033	NC_021314	TTC	2	6	1331843	1331848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508127954
25034	NC_021314	TGA	2	6	1331953	1331958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508127954
25035	NC_021314	CTT	2	6	1331971	1331976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508127954
25036	NC_021314	TCA	2	6	1331988	1331993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508127954
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25038	NC_021314	TAA	2	6	1332044	1332049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508127954
25039	NC_021314	CTTC	2	8	1332108	1332115	0 %	50 %	0 %	50 %	508127954
25040	NC_021314	CAA	2	6	1332136	1332141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508127954
25041	NC_021314	ACC	2	6	1332420	1332425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	508127955
25042	NC_021314	ACC	2	6	1332498	1332503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	508127955
25043	NC_021314	ACC	3	9	1332528	1332536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	508127955
25044	NC_021314	GCA	2	6	1332568	1332573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	508127955
25045	NC_021314	TGG	2	6	1332673	1332678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	508127955
25046	NC_021314	CAA	3	9	1332791	1332799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508127955
25047	NC_021314	AGTTAT	2	12	1332827	1332838	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	508127955
25048	NC_021314	TAA	2	6	1332866	1332871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508127955
25049	NC_021314	CCCATA	2	12	1332942	1332953	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	508127955
25050	NC_021314	ATG	2	6	1332989	1332994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508127955
25051	NC_021314	ATC	2	6	1333014	1333019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508127955
25052	NC_021314	GACT	2	8	1333059	1333066	25 %	25 %	25 %	25 %	508127955
25053	NC_021314	GAA	2	6	1333089	1333094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508127955
25054	NC_021314	TC	3	6	1333200	1333205	0 %	50 %	0 %	50 %	508127955
25055	NC_021314	ACC	2	6	1333233	1333238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	508127955
25056	NC_021314	CAAG	2	8	1333310	1333317	50 %	0 %	25 %	25 %	508127955
25057	NC_021314	CAA	2	6	1333319	1333324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508127955
25058	NC_021314	TGT	2	6	1333347	1333352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	508127955
25059	NC_021314	T	7	7	1333357	1333363	0 %	100 %	0 %	0 %	508127955
25060	NC_021314	CTT	2	6	1333391	1333396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508127955
25061	NC_021314	AAT	2	6	1333470	1333475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508127955
25062	NC_021314	TGA	2	6	1333536	1333541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508127955
25063	NC_021314	CAT	2	6	1333568	1333573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508127955
25064	NC_021314	CTG	2	6	1333664	1333669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508127955
25065	NC_021314	CAA	2	6	1333739	1333744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508127955
25066	NC_021314	TGA	2	6	1333757	1333762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508127955
25067	NC_021314	GAG	2	6	1333769	1333774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	508127955
25068	NC_021314	CAA	2	6	1333817	1333822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508127955
25069	NC_021314	TCA	2	6	1333834	1333839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508127955
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25071	NC_021314	TTA	2	6	1333957	1333962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508127955
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25100	NC_021314	CAA	2	6	1335394	1335399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508127956
25101	NC_021314	ATG	2	6	1335540	1335545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508127956
25102	NC_021314	TGC	2	6	1335587	1335592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508127956
25103	NC_021314	CAAGA	2	10	1335604	1335613	60 %	0 %	20 %	20 %	508127956
25104	NC_021314	A	6	6	1335613	1335618	100 %	0 %	0 %	0 %	508127956
25105	NC_021314	AGC	2	6	1335641	1335646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	508127956
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25107	NC_021314	CGT	2	6	1335740	1335745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508127956
25108	NC_021314	TAA	2	6	1335749	1335754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508127956
25109	NC_021314	TTAT	2	8	1335850	1335857	25 %	75 %	0 %	0 %	508127957
25110	NC_021314	TGGTT	2	10	1335880	1335889	0 %	60 %	40 %	0 %	508127957
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25116	NC_021314	T	6	6	1336331	1336336	0 %	100 %	0 %	0 %	508127958
25117	NC_021314	GTT	2	6	1336351	1336356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	508127958
25118	NC_021314	TCT	2	6	1336374	1336379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508127958
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25223	NC_021314	A	6	6	1344039	1344044	100 %	0 %	0 %	0 %	508127967
25224	NC_021314	A	7	7	1344089	1344095	100 %	0 %	0 %	0 %	508127967
25225	NC_021314	T	8	8	1344103	1344110	0 %	100 %	0 %	0 %	508127967
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25228	NC_021314	TGA	2	6	1344220	1344225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508127968
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25231	NC_021314	T	7	7	1344389	1344395	0 %	100 %	0 %	0 %	508127968
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25233	NC_021314	T	6	6	1344420	1344425	0 %	100 %	0 %	0 %	508127968
25234	NC_021314	CAA	2	6	1344455	1344460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508127968
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25349	NC_021314	TGTT	2	8	1350692	1350699	0 %	75 %	25 %	0 %	508127975
25350	NC_021314	TC	3	6	1350729	1350734	0 %	50 %	0 %	50 %	508127975
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25352	NC_021314	TCT	2	6	1350775	1350780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508127976
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25378	NC_021314	AAT	2	6	1352105	1352110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508127977
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25447	NC_021314	GAT	2	6	1355906	1355911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508127981
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25449	NC_021314	TCG	2	6	1355938	1355943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508127981
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25452	NC_021314	TGT	2	6	1356131	1356136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	508127982
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25454	NC_021314	CTT	2	6	1356268	1356273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508127982
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25458	NC_021314	ATT	2	6	1356407	1356412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508127982
25459	NC_021314	CA	3	6	1356649	1356654	50 %	0 %	0 %	50 %	508127983
25460	NC_021314	A	8	8	1356656	1356663	100 %	0 %	0 %	0 %	508127983
25461	NC_021314	A	6	6	1356675	1356680	100 %	0 %	0 %	0 %	508127983
25462	NC_021314	A	7	7	1356756	1356762	100 %	0 %	0 %	0 %	508127983
25463	NC_021314	ATT	3	9	1356844	1356852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508127984
25464	NC_021314	TTC	2	6	1356869	1356874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508127984
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25466	NC_021314	ATT	2	6	1356932	1356937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508127984
25467	NC_021314	GTTTT	2	10	1356983	1356992	0 %	80 %	20 %	0 %	508127984
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25469	NC_021314	ATT	2	6	1357012	1357017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508127984
25470	NC_021314	CAT	2	6	1357020	1357025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508127984
25471	NC_021314	T	6	6	1357032	1357037	0 %	100 %	0 %	0 %	508127984
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25490	NC_021314	TTA	2	6	1357935	1357940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508127985
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25497	NC_021314	GCAAA	2	10	1358344	1358353	60 %	0 %	20 %	20 %	508127985
25498	NC_021314	ACA	2	6	1358362	1358367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508127985
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