MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salinarchaeum sp. Harcht-Bsk1

Total Repeats: 76001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_021313	CTGA	2	8	530291	530298	25 %	25 %	25 %	25 %	510880590
12502	NC_021313	TGG	2	6	530400	530405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	510880590
12503	NC_021313	GTC	2	6	530463	530468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880590
12504	NC_021313	GAG	2	6	530845	530850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	510880591
12505	NC_021313	TCT	2	6	530855	530860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	510880591
12506	NC_021313	GAC	3	9	530878	530886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880591
12507	NC_021313	TCG	2	6	530900	530905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880591
12508	NC_021313	GAGC	2	8	530910	530917	25 %	0 %	50 %	25 %	510880591
12509	NC_021313	AAC	2	6	530935	530940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	510880591
12510	NC_021313	CGG	2	6	530985	530990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	510880591
12511	NC_021313	GGC	2	6	531066	531071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	510880591
12512	NC_021313	CCG	2	6	531080	531085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	510880591
12513	NC_021313	CGG	2	6	531108	531113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	510880591
12514	NC_021313	CGC	2	6	531117	531122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	510880591
12515	NC_021313	GGC	2	6	531124	531129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	510880591
12516	NC_021313	CGA	2	6	531135	531140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880591
12517	NC_021313	CGT	2	6	531156	531161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880591
12518	NC_021313	TCG	2	6	531218	531223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880591
12519	NC_021313	GGA	2	6	531231	531236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	510880591
12520	NC_021313	CGC	2	6	531264	531269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	510880591
12521	NC_021313	AGG	2	6	531305	531310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	510880591
12522	NC_021313	CGA	2	6	531511	531516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880592
12523	NC_021313	CGA	2	6	531541	531546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880592
12524	NC_021313	CGT	2	6	531646	531651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880592
12525	NC_021313	TCG	2	6	531714	531719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880592
12526	NC_021313	GAG	2	6	531746	531751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	510880592
12527	NC_021313	TCG	2	6	531753	531758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880592
12528	NC_021313	CCG	3	9	531796	531804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	510880592
12529	NC_021313	TCG	2	6	531849	531854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880592
12530	NC_021313	CTC	2	6	531860	531865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	510880592
12531	NC_021313	GGA	2	6	531922	531927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	510880592
12532	NC_021313	TCG	2	6	531957	531962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880592
12533	NC_021313	GCGG	2	8	532028	532035	0 %	0 %	75 %	25 %	510880592
12534	NC_021313	GGA	2	6	532090	532095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	510880592
12535	NC_021313	GGA	2	6	532102	532107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	510880592
12536	NC_021313	TCG	2	6	532108	532113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880592
12537	NC_021313	CTG	2	6	532115	532120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880592
12538	NC_021313	GC	3	6	532123	532128	0 %	0 %	50 %	50 %	510880592
12539	NC_021313	TCGT	2	8	532140	532147	0 %	50 %	25 %	25 %	510880592
12540	NC_021313	CAG	2	6	532187	532192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880592
12541	NC_021313	TCG	3	9	532237	532245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880592
12542	NC_021313	TCG	2	6	532257	532262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880592
12543	NC_021313	CGC	2	6	532303	532308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	510880592
12544	NC_021313	GAC	2	6	532322	532327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880592
12545	NC_021313	GTG	2	6	532559	532564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	510880593
12546	NC_021313	GCTC	2	8	532620	532627	0 %	25 %	25 %	50 %	510880593
12547	NC_021313	CGGT	2	8	532629	532636	0 %	25 %	50 %	25 %	510880593
12548	NC_021313	TC	3	6	532654	532659	0 %	50 %	0 %	50 %	510880593
12549	NC_021313	GAC	2	6	532702	532707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880593
12550	NC_021313	GCC	2	6	532711	532716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	510880593
12551	NC_021313	TCG	2	6	532770	532775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880593
12552	NC_021313	GAT	2	6	532783	532788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	510880593
12553	NC_021313	GGCG	2	8	532792	532799	0 %	0 %	75 %	25 %	510880593
12554	NC_021313	ACG	2	6	532820	532825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880593
12555	NC_021313	CCA	2	6	532850	532855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	510880593
12556	NC_021313	CGAACG	2	12	532936	532947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880593
12557	NC_021313	CGG	2	6	532968	532973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	510880593
12558	NC_021313	ACG	2	6	532986	532991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880593
12559	NC_021313	CGC	2	6	532996	533001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	510880593
12560	NC_021313	GC	3	6	533028	533033	0 %	0 %	50 %	50 %	510880593
12561	NC_021313	GTC	2	6	533072	533077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880593
12562	NC_021313	C	6	6	533147	533152	0 %	0 %	0 %	100 %	510880593
12563	NC_021313	TCG	2	6	533172	533177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880593
12564	NC_021313	GC	4	8	533179	533186	0 %	0 %	50 %	50 %	510880593
12565	NC_021313	TC	3	6	533187	533192	0 %	50 %	0 %	50 %	510880593
12566	NC_021313	ACG	2	6	533214	533219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880593
12567	NC_021313	TCGAGG	2	12	533265	533276	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	510880593
12568	NC_021313	CGA	2	6	533341	533346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880593
12569	NC_021313	CGA	2	6	533350	533355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880593
12570	NC_021313	CGA	2	6	533407	533412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880593
12571	NC_021313	GATC	2	8	533436	533443	25 %	25 %	25 %	25 %	510880593
12572	NC_021313	CGA	3	9	533505	533513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880594
12573	NC_021313	CCG	2	6	533534	533539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	510880594
12574	NC_021313	CGT	2	6	533553	533558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880594
12575	NC_021313	CCA	2	6	533601	533606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	510880594
12576	NC_021313	GAC	2	6	533647	533652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880594
12577	NC_021313	TCAGT	2	10	533673	533682	20 %	40 %	20 %	20 %	510880594
12578	NC_021313	CCT	2	6	533688	533693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	510880594
12579	NC_021313	GCG	2	6	533769	533774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	510880594
12580	NC_021313	CCGT	2	8	533799	533806	0 %	25 %	25 %	50 %	510880594
12581	NC_021313	CTG	2	6	533809	533814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880594
12582	NC_021313	CGT	2	6	533829	533834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880594
12583	NC_021313	TCG	2	6	533897	533902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880594
12584	NC_021313	TCG	2	6	533936	533941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880594
12585	NC_021313	GAGC	2	8	533973	533980	25 %	0 %	50 %	25 %	510880594
12586	NC_021313	AAG	2	6	534002	534007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	510880594
12587	NC_021313	CTC	2	6	534013	534018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	510880594
12588	NC_021313	CGT	2	6	534046	534051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880594
12589	NC_021313	GC	3	6	534078	534083	0 %	0 %	50 %	50 %	510880594
12590	NC_021313	AGG	2	6	534101	534106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	510880594
12591	NC_021313	CGAC	2	8	534116	534123	25 %	0 %	25 %	50 %	510880594
12592	NC_021313	GAC	2	6	534148	534153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880594
12593	NC_021313	CGT	3	9	534156	534164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880594
12594	NC_021313	CAG	2	6	534193	534198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880594
12595	NC_021313	ACT	2	6	534325	534330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	510880595
12596	NC_021313	GTC	2	6	534362	534367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880595
12597	NC_021313	CCGG	2	8	534384	534391	0 %	0 %	50 %	50 %	510880595
12598	NC_021313	GGA	2	6	534532	534537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	510880595
12599	NC_021313	TCG	2	6	534820	534825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880595
12600	NC_021313	CCT	2	6	534850	534855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	510880595
12601	NC_021313	GTT	2	6	534914	534919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	510880595
12602	NC_021313	GTC	2	6	534953	534958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880595
12603	NC_021313	CGT	2	6	534974	534979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880595
12604	NC_021313	GCG	2	6	534982	534987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	510880595
12605	NC_021313	CGA	2	6	535009	535014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880595
12606	NC_021313	GGC	2	6	535052	535057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	510880595
12607	NC_021313	GCG	2	6	535065	535070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	510880595
12608	NC_021313	GCC	2	6	535085	535090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	510880595
12609	NC_021313	GCCA	2	8	535097	535104	25 %	0 %	25 %	50 %	510880595
12610	NC_021313	GCCG	2	8	535147	535154	0 %	0 %	50 %	50 %	510880595
12611	NC_021313	CGT	2	6	535181	535186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880595
12612	NC_021313	CGAG	2	8	535242	535249	25 %	0 %	50 %	25 %	510880595
12613	NC_021313	AGC	2	6	535317	535322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880595
12614	NC_021313	GTT	2	6	535334	535339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	510880595
12615	NC_021313	CTCG	2	8	535346	535353	0 %	25 %	25 %	50 %	510880595
12616	NC_021313	CGC	2	6	535376	535381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	510880595
12617	NC_021313	CGT	2	6	535432	535437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880595
12618	NC_021313	CTC	2	6	535511	535516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	510880595
12619	NC_021313	CGT	2	6	535546	535551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880595
12620	NC_021313	GCGTC	2	10	535564	535573	0 %	20 %	40 %	40 %	510880595
12621	NC_021313	CTCGAC	2	12	535598	535609	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	510880595
12622	NC_021313	CGGC	2	8	535668	535675	0 %	0 %	50 %	50 %	510880595
12623	NC_021313	GCG	2	6	535690	535695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	510880595
12624	NC_021313	CCG	2	6	535769	535774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	510880595
12625	NC_021313	GTC	2	6	535831	535836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880596
12626	NC_021313	GACG	2	8	535848	535855	25 %	0 %	50 %	25 %	510880596
12627	NC_021313	CACC	2	8	535865	535872	25 %	0 %	0 %	75 %	510880596
12628	NC_021313	GTC	2	6	535957	535962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880596
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12631	NC_021313	CGGC	2	8	536024	536031	0 %	0 %	50 %	50 %	510880596
12632	NC_021313	CGT	2	6	536112	536117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880596
12633	NC_021313	GCT	2	6	536169	536174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880596
12634	NC_021313	AG	3	6	536187	536192	50 %	0 %	50 %	0 %	510880596
12635	NC_021313	GGC	2	6	536217	536222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	510880596
12636	NC_021313	CGCGA	2	10	536224	536233	20 %	0 %	40 %	40 %	510880596
12637	NC_021313	AGTCG	2	10	536259	536268	20 %	20 %	40 %	20 %	510880596
12638	NC_021313	GAC	2	6	536284	536289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880596
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12641	NC_021313	CTC	2	6	536365	536370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	510880596
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12643	NC_021313	CGT	2	6	536430	536435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880596
12644	NC_021313	CGA	2	6	536472	536477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880596
12645	NC_021313	TCGA	2	8	536479	536486	25 %	25 %	25 %	25 %	510880596
12646	NC_021313	TGGC	2	8	536497	536504	0 %	25 %	50 %	25 %	510880596
12647	NC_021313	CGA	2	6	536508	536513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880596
12648	NC_021313	TTC	2	6	536524	536529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	510880596
12649	NC_021313	CGA	2	6	536676	536681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880596
12650	NC_021313	ACCT	2	8	536716	536723	25 %	25 %	0 %	50 %	510880596
12651	NC_021313	GAA	2	6	536737	536742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	510880596
12652	NC_021313	CGA	2	6	536778	536783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880596
12653	NC_021313	CGG	2	6	536835	536840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	510880596
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12655	NC_021313	CGAG	2	8	536855	536862	25 %	0 %	50 %	25 %	510880596
12656	NC_021313	GAT	2	6	537026	537031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	510880597
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12660	NC_021313	GTCAG	2	10	537130	537139	20 %	20 %	40 %	20 %	510880597
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12723	NC_021313	ATC	2	6	539466	539471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	510880597
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12738	NC_021313	CGA	2	6	540077	540082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880598
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12843	NC_021313	GCT	2	6	544246	544251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880601
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12849	NC_021313	CTCG	2	8	544667	544674	0 %	25 %	25 %	50 %	510880601
12850	NC_021313	GTC	2	6	544733	544738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880601
12851	NC_021313	CA	3	6	544749	544754	50 %	0 %	0 %	50 %	510880601
12852	NC_021313	ACG	2	6	544803	544808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880601
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12854	NC_021313	CGT	2	6	544885	544890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880601
12855	NC_021313	GGC	2	6	544979	544984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	510880601
12856	NC_021313	CGA	2	6	545029	545034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880601
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12971	NC_021313	GCG	2	6	549968	549973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	510880607
12972	NC_021313	CGA	2	6	549986	549991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880607
12973	NC_021313	TCA	2	6	550007	550012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	510880607
12974	NC_021313	TCC	2	6	550099	550104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	510880607
12975	NC_021313	ACG	2	6	550111	550116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	510880607
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12981	NC_021313	CGT	2	6	550266	550271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	510880607
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12984	NC_021313	CG	3	6	550327	550332	0 %	0 %	50 %	50 %	510880607
12985	NC_021313	GCTT	2	8	550333	550340	0 %	50 %	25 %	25 %	510880607
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