MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Strawberry lethal yellows phytoplasma (CPA) str. NZSb11

Total Repeats: 23700

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021236	ATT	2	6	8	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675885
2	NC_021236	GAA	2	6	28	33	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675885
3	NC_021236	AGA	2	6	39	44	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675885
4	NC_021236	GAA	2	6	112	117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675885
5	NC_021236	A	9	9	116	124	100 %	0 %	0 %	0 %	501675885
6	NC_021236	TTA	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675885
7	NC_021236	AT	3	6	163	168	50 %	50 %	0 %	0 %	501675885
8	NC_021236	A	7	7	181	187	100 %	0 %	0 %	0 %	501675885
9	NC_021236	AAT	2	6	195	200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675885
10	NC_021236	AAAAG	2	10	208	217	80 %	0 %	20 %	0 %	501675885
11	NC_021236	ATTGAA	2	12	223	234	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	501675885
12	NC_021236	ATT	2	6	235	240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675885
13	NC_021236	A	7	7	274	280	100 %	0 %	0 %	0 %	501675885
14	NC_021236	AAATT	2	10	308	317	60 %	40 %	0 %	0 %	501675885
15	NC_021236	A	6	6	410	415	100 %	0 %	0 %	0 %	501675885
16	NC_021236	AGA	3	9	420	428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675885
17	NC_021236	AC	3	6	481	486	50 %	0 %	0 %	50 %	501675885
18	NC_021236	A	10	10	518	527	100 %	0 %	0 %	0 %	501675885
19	NC_021236	A	6	6	529	534	100 %	0 %	0 %	0 %	501675885
20	NC_021236	GAA	2	6	565	570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675885
21	NC_021236	CAAT	2	8	576	583	50 %	25 %	0 %	25 %	501675885
22	NC_021236	TGA	2	6	645	650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675885
23	NC_021236	T	6	6	691	696	0 %	100 %	0 %	0 %	501675885
24	NC_021236	TTTA	2	8	713	720	25 %	75 %	0 %	0 %	501675885
25	NC_021236	ATT	2	6	736	741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675885
26	NC_021236	A	6	6	768	773	100 %	0 %	0 %	0 %	501675885
27	NC_021236	TAT	2	6	774	779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675885
28	NC_021236	AGG	2	6	804	809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	501675885
29	NC_021236	ACC	2	6	842	847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675885
30	NC_021236	A	6	6	861	866	100 %	0 %	0 %	0 %	501675885
31	NC_021236	AAC	2	6	889	894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675885
32	NC_021236	AAG	2	6	911	916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675885
33	NC_021236	ATA	2	6	947	952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675885
34	NC_021236	ATT	2	6	981	986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675885
35	NC_021236	AATT	2	8	1014	1021	50 %	50 %	0 %	0 %	501675885
36	NC_021236	TTAA	2	8	1051	1058	50 %	50 %	0 %	0 %	501675885
37	NC_021236	A	9	9	1063	1071	100 %	0 %	0 %	0 %	501675885
38	NC_021236	A	6	6	1097	1102	100 %	0 %	0 %	0 %	501675885
39	NC_021236	TAGT	2	8	1112	1119	25 %	50 %	25 %	0 %	501675885
40	NC_021236	T	6	6	1123	1128	0 %	100 %	0 %	0 %	501675885
41	NC_021236	A	9	9	1156	1164	100 %	0 %	0 %	0 %	501675885
42	NC_021236	ATT	2	6	1237	1242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675885
43	NC_021236	T	7	7	1248	1254	0 %	100 %	0 %	0 %	501675885
44	NC_021236	A	6	6	1289	1294	100 %	0 %	0 %	0 %	501675885
45	NC_021236	A	8	8	1297	1304	100 %	0 %	0 %	0 %	501675885
46	NC_021236	A	7	7	1326	1332	100 %	0 %	0 %	0 %	501675885
47	NC_021236	A	6	6	1352	1357	100 %	0 %	0 %	0 %	501675885
48	NC_021236	AAT	2	6	1360	1365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675885
49	NC_021236	TAA	2	6	1432	1437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675886
50	NC_021236	T	7	7	1443	1449	0 %	100 %	0 %	0 %	501675886
51	NC_021236	AAC	2	6	1452	1457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675886
52	NC_021236	AT	3	6	1466	1471	50 %	50 %	0 %	0 %	501675886
53	NC_021236	A	8	8	1529	1536	100 %	0 %	0 %	0 %	501675886
54	NC_021236	AAG	2	6	1614	1619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675886
55	NC_021236	A	7	7	1661	1667	100 %	0 %	0 %	0 %	501675886
56	NC_021236	TCAA	2	8	1679	1686	50 %	25 %	0 %	25 %	501675886
57	NC_021236	T	6	6	1708	1713	0 %	100 %	0 %	0 %	501675886
58	NC_021236	AAATTA	2	12	1742	1753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675886
59	NC_021236	T	8	8	1784	1791	0 %	100 %	0 %	0 %	501675886
60	NC_021236	A	8	8	1794	1801	100 %	0 %	0 %	0 %	501675886
61	NC_021236	T	6	6	1805	1810	0 %	100 %	0 %	0 %	501675886
62	NC_021236	TCT	2	6	1823	1828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675886
63	NC_021236	A	7	7	1832	1838	100 %	0 %	0 %	0 %	501675886
64	NC_021236	AAG	2	6	1845	1850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675886
65	NC_021236	A	6	6	1875	1880	100 %	0 %	0 %	0 %	501675886
66	NC_021236	TCTAA	2	10	1898	1907	40 %	40 %	0 %	20 %	501675886
67	NC_021236	A	7	7	1914	1920	100 %	0 %	0 %	0 %	501675886
68	NC_021236	A	7	7	1964	1970	100 %	0 %	0 %	0 %	501675886
69	NC_021236	AATT	2	8	2031	2038	50 %	50 %	0 %	0 %	501675886
70	NC_021236	GAT	2	6	2084	2089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675886
71	NC_021236	A	7	7	2090	2096	100 %	0 %	0 %	0 %	501675886
72	NC_021236	T	7	7	2097	2103	0 %	100 %	0 %	0 %	501675886
73	NC_021236	GGAA	2	8	2140	2147	50 %	0 %	50 %	0 %	501675886
74	NC_021236	AATTT	2	10	2166	2175	40 %	60 %	0 %	0 %	501675886
75	NC_021236	A	6	6	2176	2181	100 %	0 %	0 %	0 %	501675886
76	NC_021236	TGT	2	6	2191	2196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675886
77	NC_021236	TAAA	2	8	2202	2209	75 %	25 %	0 %	0 %	501675886
78	NC_021236	GAT	2	6	2210	2215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675886
79	NC_021236	AGAA	2	8	2230	2237	75 %	0 %	25 %	0 %	501675886
80	NC_021236	T	7	7	2246	2252	0 %	100 %	0 %	0 %	501675886
81	NC_021236	AGA	2	6	2257	2262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675886
82	NC_021236	TAAA	2	8	2265	2272	75 %	25 %	0 %	0 %	501675886
83	NC_021236	TTGTT	2	10	2277	2286	0 %	80 %	20 %	0 %	501675886
84	NC_021236	A	6	6	2301	2306	100 %	0 %	0 %	0 %	501675886
85	NC_021236	A	6	6	2352	2357	100 %	0 %	0 %	0 %	501675886
86	NC_021236	CTT	2	6	2439	2444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675886
87	NC_021236	T	6	6	2454	2459	0 %	100 %	0 %	0 %	501675886
88	NC_021236	TAC	2	6	2491	2496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675886
89	NC_021236	AGA	3	9	2500	2508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675886
90	NC_021236	AGTTC	2	10	2510	2519	20 %	40 %	20 %	20 %	501675886
91	NC_021236	AGAA	2	8	2538	2545	75 %	0 %	25 %	0 %	501675886
92	NC_021236	A	8	8	3331	3338	100 %	0 %	0 %	0 %	501675887
93	NC_021236	A	8	8	3341	3348	100 %	0 %	0 %	0 %	501675887
94	NC_021236	AT	3	6	3372	3377	50 %	50 %	0 %	0 %	501675887
95	NC_021236	AAC	2	6	3383	3388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675887
96	NC_021236	ATT	2	6	3395	3400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675887
97	NC_021236	ATG	2	6	3404	3409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675887
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100	NC_021236	CTT	2	6	4464	4469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675888
101	NC_021236	T	6	6	4510	4515	0 %	100 %	0 %	0 %	501675888
102	NC_021236	AATAT	2	10	4537	4546	60 %	40 %	0 %	0 %	501675888
103	NC_021236	TGAA	2	8	5778	5785	50 %	25 %	25 %	0 %	501675889
104	NC_021236	GAT	2	6	5813	5818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675889
105	NC_021236	A	8	8	5825	5832	100 %	0 %	0 %	0 %	501675889
106	NC_021236	TTA	2	6	5843	5848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675889
107	NC_021236	GAT	2	6	5855	5860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675889
108	NC_021236	AGA	2	6	5875	5880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675889
109	NC_021236	ATAAAA	2	12	5925	5936	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	501675889
110	NC_021236	ATA	2	6	6030	6035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675889
111	NC_021236	T	6	6	6126	6131	0 %	100 %	0 %	0 %	501675889
112	NC_021236	ATT	2	6	6148	6153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675889
113	NC_021236	TAAT	2	8	6156	6163	50 %	50 %	0 %	0 %	501675889
114	NC_021236	ATTT	2	8	6183	6190	25 %	75 %	0 %	0 %	501675889
115	NC_021236	TAA	2	6	6196	6201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675889
116	NC_021236	AT	3	6	6203	6208	50 %	50 %	0 %	0 %	501675889
117	NC_021236	A	6	6	6215	6220	100 %	0 %	0 %	0 %	501675889
118	NC_021236	TTA	2	6	6256	6261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675889
119	NC_021236	A	7	7	6335	6341	100 %	0 %	0 %	0 %	501675889
120	NC_021236	A	7	7	6349	6355	100 %	0 %	0 %	0 %	501675889
121	NC_021236	AGA	2	6	6361	6366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675889
122	NC_021236	A	7	7	6386	6392	100 %	0 %	0 %	0 %	501675889
123	NC_021236	TAA	2	6	6438	6443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675889
124	NC_021236	AGT	2	6	6449	6454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675889
125	NC_021236	TAA	2	6	6472	6477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675889
126	NC_021236	A	6	6	6498	6503	100 %	0 %	0 %	0 %	501675889
127	NC_021236	ATTA	2	8	6538	6545	50 %	50 %	0 %	0 %	501675889
128	NC_021236	ACT	2	6	6549	6554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675889
129	NC_021236	TTG	2	6	6564	6569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675889
130	NC_021236	A	7	7	6601	6607	100 %	0 %	0 %	0 %	501675889
131	NC_021236	A	6	6	6614	6619	100 %	0 %	0 %	0 %	501675889
132	NC_021236	A	6	6	6627	6632	100 %	0 %	0 %	0 %	501675889
133	NC_021236	TTA	2	6	6657	6662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675889
134	NC_021236	A	6	6	6662	6667	100 %	0 %	0 %	0 %	501675889
135	NC_021236	AT	3	6	6715	6720	50 %	50 %	0 %	0 %	501675889
136	NC_021236	AGT	2	6	6722	6727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675889
137	NC_021236	A	7	7	6742	6748	100 %	0 %	0 %	0 %	501675889
138	NC_021236	T	6	6	6766	6771	0 %	100 %	0 %	0 %	501675889
139	NC_021236	AAATA	2	10	6798	6807	80 %	20 %	0 %	0 %	501675889
140	NC_021236	ATA	2	6	6846	6851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675889
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142	NC_021236	A	7	7	6866	6872	100 %	0 %	0 %	0 %	501675889
143	NC_021236	A	6	6	6882	6887	100 %	0 %	0 %	0 %	501675889
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406	NC_021236	CAA	2	6	22229	22234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675901
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