MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis TL13

Total Repeats: 35277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
32501	NC_021213	GCCA	2	8	1881653	1881660	25 %	0 %	25 %	50 %	499144140
32502	NC_021213	TCT	2	6	1881685	1881690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499144140
32503	NC_021213	AAG	2	6	1881779	1881784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499144140
32504	NC_021213	CAC	2	6	1881821	1881826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499144140
32505	NC_021213	TGT	2	6	1881945	1881950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499144140
32506	NC_021213	CTG	2	6	1881962	1881967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499144140
32507	NC_021213	TG	3	6	1881966	1881971	0 %	50 %	50 %	0 %	499144140
32508	NC_021213	GAA	2	6	1882061	1882066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499144140
32509	NC_021213	CTG	2	6	1882094	1882099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499144140
32510	NC_021213	GAC	2	6	1882197	1882202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499144140
32511	NC_021213	TGATTT	2	12	1882215	1882226	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	499144140
32512	NC_021213	T	6	6	1882291	1882296	0 %	100 %	0 %	0 %	499144140
32513	NC_021213	TAT	2	6	1882310	1882315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499144140
32514	NC_021213	AAAT	2	8	1882356	1882363	75 %	25 %	0 %	0 %	499144140
32515	NC_021213	GCC	2	6	1882600	1882605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499144141
32516	NC_021213	ATGG	2	8	1882620	1882627	25 %	25 %	50 %	0 %	499144141
32517	NC_021213	GAT	2	6	1882723	1882728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499144141
32518	NC_021213	TCTTG	2	10	1882779	1882788	0 %	60 %	20 %	20 %	499144141
32519	NC_021213	GTT	2	6	1882813	1882818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499144141
32520	NC_021213	AGT	2	6	1882860	1882865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499144141
32521	NC_021213	ACC	2	6	1882978	1882983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499144141
32522	NC_021213	CAAG	2	8	1883017	1883024	50 %	0 %	25 %	25 %	499144141
32523	NC_021213	GAT	2	6	1883095	1883100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499144141
32524	NC_021213	CAG	2	6	1883106	1883111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499144141
32525	NC_021213	TTG	2	6	1883183	1883188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499144141
32526	NC_021213	ATG	2	6	1883189	1883194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499144141
32527	NC_021213	GTA	2	6	1883245	1883250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499144141
32528	NC_021213	T	6	6	1883368	1883373	0 %	100 %	0 %	0 %	499144141
32529	NC_021213	TGA	2	6	1883389	1883394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499144141
32530	NC_021213	CAC	2	6	1883418	1883423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499144141
32531	NC_021213	CCA	2	6	1883458	1883463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499144141
32532	NC_021213	ACT	2	6	1883486	1883491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144141
32533	NC_021213	TCT	2	6	1883492	1883497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499144141
32534	NC_021213	TTC	2	6	1883503	1883508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499144141
32535	NC_021213	TCC	2	6	1883591	1883596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499144141
32536	NC_021213	CAA	2	6	1883638	1883643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499144141
32537	NC_021213	A	8	8	1883642	1883649	100 %	0 %	0 %	0 %	499144141
32538	NC_021213	AT	3	6	1883802	1883807	50 %	50 %	0 %	0 %	499144142
32539	NC_021213	CAT	2	6	1883896	1883901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144142
32540	NC_021213	TCT	2	6	1884034	1884039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499144142
32541	NC_021213	TCA	2	6	1884096	1884101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144142
32542	NC_021213	TCTGTG	2	12	1884118	1884129	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	499144142
32543	NC_021213	CCT	2	6	1884159	1884164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499144142
32544	NC_021213	CTC	3	9	1884215	1884223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499144142
32545	NC_021213	TTG	2	6	1884281	1884286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499144142
32546	NC_021213	AAC	2	6	1884327	1884332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499144142
32547	NC_021213	ATG	2	6	1884410	1884415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499144142
32548	NC_021213	GATAG	2	10	1884487	1884496	40 %	20 %	40 %	0 %	499144142
32549	NC_021213	TCAAA	2	10	1884538	1884547	60 %	20 %	0 %	20 %	499144142
32550	NC_021213	CAA	2	6	1884554	1884559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499144142
32551	NC_021213	TTC	2	6	1884635	1884640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499144142
32552	NC_021213	GAG	2	6	1884671	1884676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499144142
32553	NC_021213	TCT	2	6	1884724	1884729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499144142
32554	NC_021213	TTTCT	2	10	1884737	1884746	0 %	80 %	0 %	20 %	499144142
32555	NC_021213	TCT	2	6	1884783	1884788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499144142
32556	NC_021213	AAC	2	6	1884819	1884824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499144142
32557	NC_021213	TCT	2	6	1884828	1884833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499144142
32558	NC_021213	A	6	6	1884843	1884848	100 %	0 %	0 %	0 %	499144142
32559	NC_021213	AAG	2	6	1884864	1884869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499144142
32560	NC_021213	TTTA	2	8	1884902	1884909	25 %	75 %	0 %	0 %	499144142
32561	NC_021213	TTCA	2	8	1884995	1885002	25 %	50 %	0 %	25 %	499144142
32562	NC_021213	GA	3	6	1885024	1885029	50 %	0 %	50 %	0 %	499144142
32563	NC_021213	AT	3	6	1885083	1885088	50 %	50 %	0 %	0 %	499144142
32564	NC_021213	CT	3	6	1885221	1885226	0 %	50 %	0 %	50 %	499144142
32565	NC_021213	GTT	2	6	1885230	1885235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499144142
32566	NC_021213	CAT	2	6	1885243	1885248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144142
32567	NC_021213	T	6	6	1885252	1885257	0 %	100 %	0 %	0 %	499144142
32568	NC_021213	TTG	2	6	1885286	1885291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499144142
32569	NC_021213	ACT	2	6	1885361	1885366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144142
32570	NC_021213	TAA	2	6	1885373	1885378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499144142
32571	NC_021213	TCC	2	6	1885387	1885392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499144142
32572	NC_021213	CCCGT	2	10	1885400	1885409	0 %	20 %	20 %	60 %	499144142
32573	NC_021213	TC	3	6	1885648	1885653	0 %	50 %	0 %	50 %	499144143
32574	NC_021213	GAT	2	6	1885692	1885697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499144143
32575	NC_021213	CTGG	2	8	1885716	1885723	0 %	25 %	50 %	25 %	499144143
32576	NC_021213	ATA	2	6	1885732	1885737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499144143
32577	NC_021213	ATC	2	6	1885746	1885751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144143
32578	NC_021213	AAT	2	6	1885800	1885805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499144143
32579	NC_021213	ACT	2	6	1885821	1885826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144143
32580	NC_021213	TGAGC	2	10	1885998	1886007	20 %	20 %	40 %	20 %	499144143
32581	NC_021213	AAG	2	6	1886019	1886024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499144143
32582	NC_021213	TAG	2	6	1886080	1886085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499144143
32583	NC_021213	TCA	2	6	1886132	1886137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144143
32584	NC_021213	T	7	7	1886190	1886196	0 %	100 %	0 %	0 %	499144143
32585	NC_021213	CA	3	6	1886197	1886202	50 %	0 %	0 %	50 %	499144143
32586	NC_021213	GATT	2	8	1886306	1886313	25 %	50 %	25 %	0 %	499144144
32587	NC_021213	ACA	2	6	1886353	1886358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499144144
32588	NC_021213	ACA	2	6	1886416	1886421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499144144
32589	NC_021213	ACG	2	6	1886451	1886456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499144144
32590	NC_021213	GAT	2	6	1886469	1886474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499144144
32591	NC_021213	AAT	2	6	1886555	1886560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499144144
32592	NC_021213	CAC	2	6	1886742	1886747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499144144
32593	NC_021213	GCAG	2	8	1886863	1886870	25 %	0 %	50 %	25 %	499144144
32594	NC_021213	TCAA	2	8	1886943	1886950	50 %	25 %	0 %	25 %	499144144
32595	NC_021213	CCT	2	6	1886971	1886976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499144144
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32597	NC_021213	TCAA	2	8	1887027	1887034	50 %	25 %	0 %	25 %	499144145
32598	NC_021213	CA	3	6	1887089	1887094	50 %	0 %	0 %	50 %	499144145
32599	NC_021213	TTTC	2	8	1887274	1887281	0 %	75 %	0 %	25 %	499144145
32600	NC_021213	ATC	2	6	1887320	1887325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144145
32601	NC_021213	CT	3	6	1887401	1887406	0 %	50 %	0 %	50 %	499144145
32602	NC_021213	TAG	2	6	1887429	1887434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499144145
32603	NC_021213	CGT	2	6	1887436	1887441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499144145
32604	NC_021213	AGCC	2	8	1887442	1887449	25 %	0 %	25 %	50 %	499144145
32605	NC_021213	TTCC	2	8	1887728	1887735	0 %	50 %	0 %	50 %	499144145
32606	NC_021213	AT	3	6	1887764	1887769	50 %	50 %	0 %	0 %	499144145
32607	NC_021213	ACG	2	6	1887805	1887810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499144145
32608	NC_021213	CGC	2	6	1887832	1887837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499144145
32609	NC_021213	GCT	2	6	1887839	1887844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499144145
32610	NC_021213	CCG	2	6	1887849	1887854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499144145
32611	NC_021213	ACC	2	6	1887931	1887936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499144146
32612	NC_021213	T	6	6	1887970	1887975	0 %	100 %	0 %	0 %	499144146
32613	NC_021213	AGG	2	6	1888016	1888021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499144146
32614	NC_021213	TGG	2	6	1888034	1888039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499144146
32615	NC_021213	CAC	2	6	1888131	1888136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499144146
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32617	NC_021213	CAC	2	6	1888212	1888217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499144146
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32622	NC_021213	GCT	2	6	1888388	1888393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499144146
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32624	NC_021213	TCTAAA	2	12	1888473	1888484	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	499144146
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32721	NC_021213	AAG	2	6	1893042	1893047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499144150
32722	NC_021213	CAC	2	6	1893068	1893073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499144150
32723	NC_021213	TTGT	2	8	1893095	1893102	0 %	75 %	25 %	0 %	499144150
32724	NC_021213	TCGG	2	8	1893150	1893157	0 %	25 %	50 %	25 %	499144150
32725	NC_021213	ATAC	2	8	1893167	1893174	50 %	25 %	0 %	25 %	499144150
32726	NC_021213	GTTGCT	2	12	1893218	1893229	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	499144150
32727	NC_021213	ATA	2	6	1893275	1893280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499144150
32728	NC_021213	AGC	2	6	1893297	1893302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499144150
32729	NC_021213	TCA	2	6	1893384	1893389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499144150
32730	NC_021213	GTA	3	9	1893641	1893649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499144150
32731	NC_021213	ACC	2	6	1893741	1893746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499144150
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32733	NC_021213	AG	3	6	1893805	1893810	50 %	0 %	50 %	0 %	499144150
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32850	NC_021213	TTTAA	2	10	1899972	1899981	40 %	60 %	0 %	0 %	499144152
32851	NC_021213	TAA	2	6	1900090	1900095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499144152
32852	NC_021213	TAATA	2	10	1900115	1900124	60 %	40 %	0 %	0 %	499144152
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