MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288 plasmid pSTU288-1

Total Repeats: 2592

< Previous123456Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021155	T	6	6	143389	143394	0 %	100 %	0 %	0 %	482907325
2502	NC_021155	GA	3	6	143418	143423	50 %	0 %	50 %	0 %	482907325
2503	NC_021155	TCTT	2	8	143466	143473	0 %	75 %	0 %	25 %	482907325
2504	NC_021155	TCAC	2	8	143483	143490	25 %	25 %	0 %	50 %	482907325
2505	NC_021155	A	6	6	143733	143738	100 %	0 %	0 %	0 %	482907326
2506	NC_021155	GAT	2	6	143748	143753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482907326
2507	NC_021155	GCT	2	6	143772	143777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907326
2508	NC_021155	TGA	2	6	143843	143848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482907326
2509	NC_021155	ATT	2	6	143850	143855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482907326
2510	NC_021155	GA	3	6	143929	143934	50 %	0 %	50 %	0 %	482907326
2511	NC_021155	ATT	2	6	143949	143954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482907326
2512	NC_021155	TTC	2	6	143987	143992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482907326
2513	NC_021155	AAC	2	6	144048	144053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482907326
2514	NC_021155	GGC	2	6	144156	144161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907327
2515	NC_021155	AAT	2	6	144185	144190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482907327
2516	NC_021155	CAA	2	6	144205	144210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482907327
2517	NC_021155	TGC	2	6	144337	144342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907327
2518	NC_021155	CAG	2	6	144371	144376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907327
2519	NC_021155	CAG	2	6	144455	144460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907327
2520	NC_021155	AAT	2	6	144467	144472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482907327
2521	NC_021155	ATT	2	6	144497	144502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482907327
2522	NC_021155	ATCA	2	8	144536	144543	50 %	25 %	0 %	25 %	482907327
2523	NC_021155	TCA	2	6	144634	144639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907327
2524	NC_021155	GCTG	2	8	144640	144647	0 %	25 %	50 %	25 %	482907327
2525	NC_021155	TCA	2	6	144654	144659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907327
2526	NC_021155	TCA	2	6	144700	144705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907327
2527	NC_021155	CTT	2	6	144754	144759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482907327
2528	NC_021155	GC	3	6	144848	144853	0 %	0 %	50 %	50 %	482907327
2529	NC_021155	GAT	2	6	144911	144916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482907327
2530	NC_021155	CAG	2	6	144970	144975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907327
2531	NC_021155	TCA	2	6	144991	144996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907327
2532	NC_021155	GAA	2	6	145372	145377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482907328
2533	NC_021155	ACG	2	6	145380	145385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907328
2534	NC_021155	CAA	2	6	145389	145394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482907328
2535	NC_021155	TGG	2	6	145402	145407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482907328
2536	NC_021155	CAC	2	6	145417	145422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482907328
2537	NC_021155	A	7	7	145468	145474	100 %	0 %	0 %	0 %	482907328
2538	NC_021155	TTC	2	6	145482	145487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482907328
2539	NC_021155	TGG	2	6	145518	145523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482907328
2540	NC_021155	ATAAA	2	10	145532	145541	80 %	20 %	0 %	0 %	482907328
2541	NC_021155	ACA	2	6	145780	145785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482907329
2542	NC_021155	CCG	2	6	145786	145791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482907329
2543	NC_021155	CAC	2	6	145798	145803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482907329
2544	NC_021155	TGT	3	9	145873	145881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482907329
2545	NC_021155	CAG	2	6	145934	145939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907329
2546	NC_021155	GCC	2	6	146046	146051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482907329
2547	NC_021155	CTG	2	6	146062	146067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907329
2548	NC_021155	GTG	2	6	146127	146132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482907329
2549	NC_021155	TGCA	2	8	146150	146157	25 %	25 %	25 %	25 %	482907329
2550	NC_021155	ACC	2	6	146234	146239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482907329
2551	NC_021155	TGGA	2	8	146288	146295	25 %	25 %	50 %	0 %	482907329
2552	NC_021155	TCCGG	2	10	146302	146311	0 %	20 %	40 %	40 %	482907329
2553	NC_021155	CCG	2	6	146329	146334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482907329
2554	NC_021155	TCA	2	6	146361	146366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907329
2555	NC_021155	ATC	2	6	146435	146440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907329
2556	NC_021155	CAG	2	6	146498	146503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907329
2557	NC_021155	GAC	2	6	146560	146565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907329
2558	NC_021155	ACA	2	6	146619	146624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482907329
2559	NC_021155	GCT	2	6	146750	146755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907329
2560	NC_021155	ACATC	2	10	146778	146787	40 %	20 %	0 %	40 %	482907329
2561	NC_021155	CAC	3	9	146803	146811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482907329
2562	NC_021155	CCGG	2	8	146833	146840	0 %	0 %	50 %	50 %	482907329
2563	NC_021155	TTC	2	6	146951	146956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482907329
2564	NC_021155	GCC	2	6	147096	147101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482907329
2565	NC_021155	GGCG	2	8	147178	147185	0 %	0 %	75 %	25 %	482907329
2566	NC_021155	CGTTC	2	10	147250	147259	0 %	40 %	20 %	40 %	482907330
2567	NC_021155	AAG	2	6	147288	147293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482907330
2568	NC_021155	CCAG	2	8	147542	147549	25 %	0 %	25 %	50 %	482907330
2569	NC_021155	GA	3	6	147567	147572	50 %	0 %	50 %	0 %	482907330
2570	NC_021155	ATC	2	6	147574	147579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907330
2571	NC_021155	GCT	2	6	147584	147589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907331
2572	NC_021155	TAA	2	6	147617	147622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482907331
2573	NC_021155	CCGG	2	8	147657	147664	0 %	0 %	50 %	50 %	482907331
2574	NC_021155	TAT	2	6	147739	147744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482907331
2575	NC_021155	T	6	6	147786	147791	0 %	100 %	0 %	0 %	482907331
2576	NC_021155	GCA	2	6	147799	147804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907331
2577	NC_021155	CA	3	6	147881	147886	50 %	0 %	0 %	50 %	482907331
2578	NC_021155	GCC	2	6	147946	147951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482907331
2579	NC_021155	T	7	7	147959	147965	0 %	100 %	0 %	0 %	482907331
2580	NC_021155	AGGC	2	8	148035	148042	25 %	0 %	50 %	25 %	482907331
2581	NC_021155	TAC	2	6	148114	148119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907331
2582	NC_021155	TTC	2	6	148175	148180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482907331
2583	NC_021155	ATG	2	6	148245	148250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482907331
2584	NC_021155	ATT	2	6	148254	148259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482907331
2585	NC_021155	GGA	2	6	148414	148419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482907332
2586	NC_021155	CTG	2	6	148446	148451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907332
2587	NC_021155	ATC	2	6	148482	148487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907332
2588	NC_021155	TG	3	6	148526	148531	0 %	50 %	50 %	0 %	482907332
2589	NC_021155	TCA	2	6	148570	148575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907333
2590	NC_021155	T	6	6	148584	148589	0 %	100 %	0 %	0 %	482907333
2591	NC_021155	TTC	2	6	148593	148598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482907333
2592	NC_021155	CCT	2	6	148616	148621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482907333

< Previous123456Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.