MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 89429

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021151	CAA	2	6	208007	208012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902727
4002	NC_021151	GCGG	2	8	208164	208171	0 %	0 %	75 %	25 %	482902728
4003	NC_021151	CTG	2	6	208202	208207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902728
4004	NC_021151	CAT	2	6	208301	208306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902728
4005	NC_021151	GC	3	6	208356	208361	0 %	0 %	50 %	50 %	482902728
4006	NC_021151	CTG	2	6	208369	208374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902728
4007	NC_021151	AG	3	6	208450	208455	50 %	0 %	50 %	0 %	482902728
4008	NC_021151	TTC	2	6	208461	208466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902728
4009	NC_021151	GCG	2	6	208567	208572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902728
4010	NC_021151	GGC	2	6	208587	208592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902728
4011	NC_021151	AGTG	2	8	208602	208609	25 %	25 %	50 %	0 %	482902728
4012	NC_021151	AAG	2	6	209062	209067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902729
4013	NC_021151	ATG	2	6	209137	209142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902729
4014	NC_021151	TG	3	6	209141	209146	0 %	50 %	50 %	0 %	482902729
4015	NC_021151	CGGCG	2	10	209202	209211	0 %	0 %	60 %	40 %	482902729
4016	NC_021151	TGA	2	6	209231	209236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902729
4017	NC_021151	GGA	2	6	209289	209294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482902729
4018	NC_021151	GC	3	6	209357	209362	0 %	0 %	50 %	50 %	482902729
4019	NC_021151	CAG	3	9	209386	209394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902729
4020	NC_021151	TGC	2	6	209414	209419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902729
4021	NC_021151	GTT	2	6	209513	209518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902730
4022	NC_021151	ACG	2	6	209582	209587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902730
4023	NC_021151	GCC	2	6	209594	209599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902730
4024	NC_021151	ATT	2	6	209685	209690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902730
4025	NC_021151	TGG	2	6	209880	209885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902730
4026	NC_021151	ATT	2	6	209903	209908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902730
4027	NC_021151	GGCT	2	8	209964	209971	0 %	25 %	50 %	25 %	482902730
4028	NC_021151	ATC	2	6	210024	210029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902730
4029	NC_021151	TGA	2	6	210040	210045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902730
4030	NC_021151	CCA	2	6	210072	210077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902730
4031	NC_021151	TTCGG	2	10	210082	210091	0 %	40 %	40 %	20 %	482902730
4032	NC_021151	GGA	2	6	210157	210162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482902730
4033	NC_021151	GC	4	8	210191	210198	0 %	0 %	50 %	50 %	482902730
4034	NC_021151	TGA	2	6	210214	210219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902730
4035	NC_021151	TAT	2	6	210289	210294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902730
4036	NC_021151	T	6	6	210409	210414	0 %	100 %	0 %	0 %	482902730
4037	NC_021151	CGC	2	6	210434	210439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902730
4038	NC_021151	TA	3	6	210447	210452	50 %	50 %	0 %	0 %	482902730
4039	NC_021151	ATA	2	6	210465	210470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902730
4040	NC_021151	CGG	2	6	210494	210499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902730
4041	NC_021151	TCTT	2	8	210532	210539	0 %	75 %	0 %	25 %	482902730
4042	NC_021151	AGC	2	6	210574	210579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902730
4043	NC_021151	TGC	2	6	210648	210653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902730
4044	NC_021151	CTT	2	6	210826	210831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902731
4045	NC_021151	GCC	2	6	210891	210896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902731
4046	NC_021151	GAT	2	6	210911	210916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902731
4047	NC_021151	CTTGC	2	10	211091	211100	0 %	40 %	20 %	40 %	482902731
4048	NC_021151	GGC	2	6	211266	211271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902732
4049	NC_021151	CAG	2	6	211311	211316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902732
4050	NC_021151	GTC	2	6	211341	211346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902732
4051	NC_021151	TTCA	2	8	211362	211369	25 %	50 %	0 %	25 %	482902732
4052	NC_021151	GGCAAT	2	12	211380	211391	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	482902732
4053	NC_021151	TCA	2	6	211442	211447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902732
4054	NC_021151	GCT	2	6	211475	211480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902732
4055	NC_021151	TGAGC	2	10	211503	211512	20 %	20 %	40 %	20 %	482902732
4056	NC_021151	AAT	2	6	211533	211538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902732
4057	NC_021151	CGA	2	6	211547	211552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902732
4058	NC_021151	CCA	2	6	211577	211582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902732
4059	NC_021151	CGC	2	6	211679	211684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902732
4060	NC_021151	AG	3	6	211722	211727	50 %	0 %	50 %	0 %	482902732
4061	NC_021151	ACGT	2	8	211741	211748	25 %	25 %	25 %	25 %	482902732
4062	NC_021151	CAC	2	6	211914	211919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902732
4063	NC_021151	CGT	2	6	211961	211966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902732
4064	NC_021151	TGG	2	6	211979	211984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902732
4065	NC_021151	GAC	2	6	212018	212023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902732
4066	NC_021151	GCA	2	6	212036	212041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902732
4067	NC_021151	CAA	2	6	212066	212071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902732
4068	NC_021151	TTC	2	6	212207	212212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902733
4069	NC_021151	CTG	2	6	212249	212254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902733
4070	NC_021151	CGG	2	6	212257	212262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902733
4071	NC_021151	CCG	2	6	212316	212321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902733
4072	NC_021151	GCCGAT	2	12	212378	212389	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	482902733
4073	NC_021151	GCAC	2	8	212437	212444	25 %	0 %	25 %	50 %	482902733
4074	NC_021151	CCAGCA	2	12	212446	212457	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	482902733
4075	NC_021151	CAG	2	6	212495	212500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902733
4076	NC_021151	GCC	2	6	212537	212542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902733
4077	NC_021151	CCAG	2	8	212626	212633	25 %	0 %	25 %	50 %	482902733
4078	NC_021151	GCC	2	6	212636	212641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902733
4079	NC_021151	CGCA	2	8	212666	212673	25 %	0 %	25 %	50 %	482902733
4080	NC_021151	GC	3	6	212755	212760	0 %	0 %	50 %	50 %	482902733
4081	NC_021151	CG	3	6	212771	212776	0 %	0 %	50 %	50 %	482902733
4082	NC_021151	CAGG	2	8	212806	212813	25 %	0 %	50 %	25 %	482902733
4083	NC_021151	AG	3	6	212844	212849	50 %	0 %	50 %	0 %	482902733
4084	NC_021151	TCG	2	6	212877	212882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902733
4085	NC_021151	T	6	6	212933	212938	0 %	100 %	0 %	0 %	482902733
4086	NC_021151	CTTG	2	8	212941	212948	0 %	50 %	25 %	25 %	482902733
4087	NC_021151	GCA	2	6	212956	212961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902733
4088	NC_021151	TGG	3	9	212968	212976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902733
4089	NC_021151	GCA	2	6	213123	213128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902734
4090	NC_021151	AGATC	2	10	213172	213181	40 %	20 %	20 %	20 %	482902734
4091	NC_021151	CGGT	2	8	213252	213259	0 %	25 %	50 %	25 %	482902734
4092	NC_021151	TTC	2	6	213377	213382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902734
4093	NC_021151	GCG	3	9	213448	213456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902734
4094	NC_021151	GAA	2	6	213468	213473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902734
4095	NC_021151	CGA	2	6	213478	213483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902734
4096	NC_021151	GGC	2	6	213518	213523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902734
4097	NC_021151	CGCGG	2	10	213594	213603	0 %	0 %	60 %	40 %	482902735
4098	NC_021151	CG	3	6	213604	213609	0 %	0 %	50 %	50 %	482902735
4099	NC_021151	ACG	2	6	213625	213630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902735
4100	NC_021151	GCG	2	6	213631	213636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902735
4101	NC_021151	TCG	2	6	213647	213652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902735
4102	NC_021151	CGG	2	6	213682	213687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902735
4103	NC_021151	CAC	2	6	213710	213715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902735
4104	NC_021151	TAT	2	6	213738	213743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902735
4105	NC_021151	GC	3	6	213755	213760	0 %	0 %	50 %	50 %	482902735
4106	NC_021151	CGCGG	2	10	213778	213787	0 %	0 %	60 %	40 %	482902735
4107	NC_021151	CAT	2	6	213924	213929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902735
4108	NC_021151	CGT	2	6	213948	213953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902735
4109	NC_021151	T	6	6	213981	213986	0 %	100 %	0 %	0 %	482902735
4110	NC_021151	CAG	2	6	213997	214002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902735
4111	NC_021151	GGC	2	6	214018	214023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902735
4112	NC_021151	TTC	2	6	214076	214081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902735
4113	NC_021151	ATG	2	6	214094	214099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902735
4114	NC_021151	AAC	2	6	214151	214156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902735
4115	NC_021151	GGT	2	6	214167	214172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902735
4116	NC_021151	GTT	2	6	214182	214187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902735
4117	NC_021151	GC	3	6	214243	214248	0 %	0 %	50 %	50 %	482902735
4118	NC_021151	GGA	2	6	214250	214255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482902735
4119	NC_021151	GC	3	6	214343	214348	0 %	0 %	50 %	50 %	482902735
4120	NC_021151	CTT	2	6	214410	214415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902735
4121	NC_021151	CCG	2	6	214430	214435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902735
4122	NC_021151	GTA	2	6	214468	214473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902735
4123	NC_021151	TCT	2	6	214508	214513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902735
4124	NC_021151	TGT	2	6	214530	214535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902735
4125	NC_021151	GCA	3	9	214539	214547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902735
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4144	NC_021151	CGG	2	6	215645	215650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902736
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4151	NC_021151	TGC	2	6	216035	216040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902736
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4153	NC_021151	GGC	2	6	216184	216189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902737
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4214	NC_021151	CTGG	2	8	219187	219194	0 %	25 %	50 %	25 %	482902740
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4230	NC_021151	TTA	2	6	219519	219524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902740
4231	NC_021151	CG	3	6	219559	219564	0 %	0 %	50 %	50 %	482902740
4232	NC_021151	CGT	2	6	219566	219571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902740
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4236	NC_021151	GTCC	2	8	219922	219929	0 %	25 %	25 %	50 %	482902740
4237	NC_021151	CGTCTG	2	12	219959	219970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902740
4238	NC_021151	GCG	2	6	219977	219982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902740
4239	NC_021151	GCT	2	6	220027	220032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902740
4240	NC_021151	TGC	2	6	220053	220058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902740
4241	NC_021151	TGC	2	6	220143	220148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902740
4242	NC_021151	CCCG	2	8	220228	220235	0 %	0 %	25 %	75 %	482902740
4243	NC_021151	GCGAA	2	10	220266	220275	40 %	0 %	40 %	20 %	482902740
4244	NC_021151	CAGCG	2	10	220329	220338	20 %	0 %	40 %	40 %	482902740
4245	NC_021151	CG	3	6	220353	220358	0 %	0 %	50 %	50 %	482902740
4246	NC_021151	GAA	2	6	220474	220479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902740
4247	NC_021151	CGT	2	6	220702	220707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902741
4248	NC_021151	GCA	2	6	220710	220715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902741
4249	NC_021151	GAC	2	6	220717	220722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902741
4250	NC_021151	ATG	3	9	220727	220735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902741
4251	NC_021151	GAA	2	6	220747	220752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902741
4252	NC_021151	GGCT	2	8	220804	220811	0 %	25 %	50 %	25 %	482902741
4253	NC_021151	A	6	6	220880	220885	100 %	0 %	0 %	0 %	482902741
4254	NC_021151	CGG	3	9	220922	220930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902741
4255	NC_021151	GAT	2	6	221073	221078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902741
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4257	NC_021151	AAG	2	6	221108	221113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902741
4258	NC_021151	GC	4	8	221121	221128	0 %	0 %	50 %	50 %	482902741
4259	NC_021151	AAC	2	6	221176	221181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902741
4260	NC_021151	CTT	2	6	221193	221198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902741
4261	NC_021151	TTC	2	6	221229	221234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902741
4262	NC_021151	AGC	2	6	221246	221251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902741
4263	NC_021151	CTG	2	6	221284	221289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902741
4264	NC_021151	ATG	2	6	221333	221338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902741
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4266	NC_021151	CAG	2	6	221422	221427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902741
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4268	NC_021151	GTC	2	6	221621	221626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902741
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4272	NC_021151	CAG	3	9	221755	221763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902741
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4284	NC_021151	GGCGG	2	10	222079	222088	0 %	0 %	80 %	20 %	482902741
4285	NC_021151	GC	3	6	222124	222129	0 %	0 %	50 %	50 %	482902741
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4332	NC_021151	CGTC	2	8	223950	223957	0 %	25 %	25 %	50 %	482902742
4333	NC_021151	ACT	2	6	224012	224017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902742
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4340	NC_021151	CTA	2	6	224269	224274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902742
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4342	NC_021151	ACA	2	6	224358	224363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902742
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4345	NC_021151	GCG	2	6	224495	224500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902742
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4349	NC_021151	AAAC	2	8	224756	224763	75 %	0 %	0 %	25 %	482902742
4350	NC_021151	GGAAT	2	10	224788	224797	40 %	20 %	40 %	0 %	482902742
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4352	NC_021151	AT	3	6	224884	224889	50 %	50 %	0 %	0 %	482902742
4353	NC_021151	ACC	2	6	224901	224906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902742
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4356	NC_021151	CCAA	2	8	225146	225153	50 %	0 %	0 %	50 %	482902742
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4359	NC_021151	GCAGC	2	10	225447	225456	20 %	0 %	40 %	40 %	482902742
4360	NC_021151	GATG	2	8	225460	225467	25 %	25 %	50 %	0 %	482902742
4361	NC_021151	GTC	2	6	225470	225475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902742
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4365	NC_021151	ACC	2	6	225710	225715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902743
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4486	NC_021151	GC	3	6	231639	231644	0 %	0 %	50 %	50 %	482902747
4487	NC_021151	GGCG	2	8	231746	231753	0 %	0 %	75 %	25 %	482902747
4488	NC_021151	GGC	2	6	231832	231837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902747
4489	NC_021151	CGA	2	6	231849	231854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902747
4490	NC_021151	AT	3	6	231893	231898	50 %	50 %	0 %	0 %	482902747
4491	NC_021151	GC	3	6	231907	231912	0 %	0 %	50 %	50 %	482902747
4492	NC_021151	GCGG	2	8	231941	231948	0 %	0 %	75 %	25 %	482902747
4493	NC_021151	GAA	2	6	232036	232041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902747
4494	NC_021151	GGC	2	6	232165	232170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902747
4495	NC_021151	CCT	2	6	232190	232195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482902747
4496	NC_021151	CGG	2	6	232224	232229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902747
4497	NC_021151	GCT	2	6	232287	232292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902747
4498	NC_021151	TGA	2	6	232407	232412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902747
4499	NC_021151	GAA	2	6	232453	232458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902747
4500	NC_021151	TGA	2	6	232734	232739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902747

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