MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 89429

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23003	NC_021151	TGT	2	6	1278038	1278043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903792
23004	NC_021151	CG	5	10	1278080	1278089	0 %	0 %	50 %	50 %	482903792
23005	NC_021151	CTG	2	6	1278124	1278129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903792
23006	NC_021151	TTG	2	6	1278130	1278135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903792
23007	NC_021151	GCC	2	6	1278151	1278156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903792
23008	NC_021151	CAAA	2	8	1278177	1278184	75 %	0 %	0 %	25 %	482903792
23009	NC_021151	GCC	2	6	1278193	1278198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903792
23010	NC_021151	GCCGC	2	10	1278214	1278223	0 %	0 %	40 %	60 %	482903792
23011	NC_021151	GTC	2	6	1278247	1278252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903792
23012	NC_021151	TTCT	2	8	1278306	1278313	0 %	75 %	0 %	25 %	482903793
23013	NC_021151	GCGACA	2	12	1278342	1278353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903793
23014	NC_021151	AGCGAT	2	12	1278383	1278394	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	482903793
23015	NC_021151	GCGTC	2	10	1278421	1278430	0 %	20 %	40 %	40 %	482903793
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23018	NC_021151	CTG	2	6	1278506	1278511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903793
23019	NC_021151	CGC	2	6	1278512	1278517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903793
23020	NC_021151	AACCTG	2	12	1278593	1278604	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	482903793
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23082	NC_021151	GCC	2	6	1281313	1281318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903798
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23088	NC_021151	GCT	2	6	1281552	1281557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903798
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23092	NC_021151	ATAA	2	8	1281886	1281893	75 %	25 %	0 %	0 %	482903798
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23101	NC_021151	TTAT	2	8	1282419	1282426	25 %	75 %	0 %	0 %	482903799
23102	NC_021151	TGA	2	6	1282457	1282462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903799
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23116	NC_021151	CGG	2	6	1282992	1282997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903800
23117	NC_021151	CCG	2	6	1283001	1283006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903800
23118	NC_021151	TCA	2	6	1283038	1283043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903800
23119	NC_021151	GGC	2	6	1283238	1283243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903801
23120	NC_021151	GACG	2	8	1283308	1283315	25 %	0 %	50 %	25 %	482903801
23121	NC_021151	A	6	6	1283702	1283707	100 %	0 %	0 %	0 %	482903802
23122	NC_021151	GCG	2	6	1283822	1283827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903802
23123	NC_021151	GCTCCA	2	12	1283868	1283879	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	482903802
23124	NC_021151	GAC	2	6	1283880	1283885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903802
23125	NC_021151	CAC	2	6	1284051	1284056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903802
23126	NC_021151	TGA	2	6	1284060	1284065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903802
23127	NC_021151	CCG	2	6	1284260	1284265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903802
23128	NC_021151	TCG	2	6	1284303	1284308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903802
23129	NC_021151	GC	4	8	1284315	1284322	0 %	0 %	50 %	50 %	482903802
23130	NC_021151	ATG	2	6	1284356	1284361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903802
23131	NC_021151	ACG	2	6	1284434	1284439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903802
23132	NC_021151	TGGC	2	8	1284480	1284487	0 %	25 %	50 %	25 %	482903802
23133	NC_021151	GTCGC	2	10	1284523	1284532	0 %	20 %	40 %	40 %	482903803
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23137	NC_021151	TCG	2	6	1284746	1284751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903803
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23139	NC_021151	TGC	2	6	1284818	1284823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903803
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23142	NC_021151	AAT	2	6	1284896	1284901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903803
23143	NC_021151	TGGC	2	8	1284927	1284934	0 %	25 %	50 %	25 %	482903803
23144	NC_021151	GC	3	6	1284980	1284985	0 %	0 %	50 %	50 %	482903803
23145	NC_021151	TA	3	6	1284992	1284997	50 %	50 %	0 %	0 %	482903803
23146	NC_021151	TGCC	2	8	1285020	1285027	0 %	25 %	25 %	50 %	482903803
23147	NC_021151	AACA	2	8	1285047	1285054	75 %	0 %	0 %	25 %	482903803
23148	NC_021151	TGC	2	6	1285142	1285147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903803
23149	NC_021151	GCA	2	6	1285187	1285192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903803
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23151	NC_021151	GC	3	6	1285291	1285296	0 %	0 %	50 %	50 %	482903803
23152	NC_021151	TGT	2	6	1285324	1285329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903803
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23155	NC_021151	ACC	2	6	1285544	1285549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903803
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23218	NC_021151	GGT	2	6	1288608	1288613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903806
23219	NC_021151	GC	3	6	1288671	1288676	0 %	0 %	50 %	50 %	482903807
23220	NC_021151	GCC	3	9	1288681	1288689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903807
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23223	NC_021151	GCCA	2	8	1288779	1288786	25 %	0 %	25 %	50 %	482903807
23224	NC_021151	T	6	6	1288839	1288844	0 %	100 %	0 %	0 %	482903807
23225	NC_021151	CCAG	2	8	1288845	1288852	25 %	0 %	25 %	50 %	482903807
23226	NC_021151	GTG	2	6	1288891	1288896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903807
23227	NC_021151	ATG	2	6	1288897	1288902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903807
23228	NC_021151	AGC	2	6	1288908	1288913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903807
23229	NC_021151	CA	3	6	1288927	1288932	50 %	0 %	0 %	50 %	482903807
23230	NC_021151	CAC	2	6	1288945	1288950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903807
23231	NC_021151	CG	3	6	1289059	1289064	0 %	0 %	50 %	50 %	482903807
23232	NC_021151	TC	4	8	1289113	1289120	0 %	50 %	0 %	50 %	482903808
23233	NC_021151	GCA	2	6	1289172	1289177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903808
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23466	NC_021151	TG	3	6	1304318	1304323	0 %	50 %	50 %	0 %	482903825
23467	NC_021151	CGC	2	6	1304358	1304363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903825
23468	NC_021151	TGAT	2	8	1304379	1304386	25 %	50 %	25 %	0 %	482903825
23469	NC_021151	TTA	2	6	1304387	1304392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903825
23470	NC_021151	TGA	2	6	1304401	1304406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903825
23471	NC_021151	TGA	2	6	1304415	1304420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903825
23472	NC_021151	TGA	2	6	1304439	1304444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903825
23473	NC_021151	GC	3	6	1304445	1304450	0 %	0 %	50 %	50 %	482903825
23474	NC_021151	ACG	2	6	1304466	1304471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903825
23475	NC_021151	GAA	2	6	1304506	1304511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482903825
23476	NC_021151	CCG	2	6	1304565	1304570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903825
23477	NC_021151	CAA	2	6	1304607	1304612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482903825
23478	NC_021151	GCCTG	2	10	1304708	1304717	0 %	20 %	40 %	40 %	482903825
23479	NC_021151	CT	3	6	1304815	1304820	0 %	50 %	0 %	50 %	482903825
23480	NC_021151	AGG	2	6	1304826	1304831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482903825
23481	NC_021151	GAT	2	6	1304833	1304838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903825
23482	NC_021151	TGA	2	6	1304883	1304888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903825
23483	NC_021151	ATA	2	6	1304907	1304912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903825
23484	NC_021151	A	6	6	1304987	1304992	100 %	0 %	0 %	0 %	482903825
23485	NC_021151	GAC	2	6	1305023	1305028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903825
23486	NC_021151	CAG	2	6	1305038	1305043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903825
23487	NC_021151	CAG	2	6	1305098	1305103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903825
23488	NC_021151	A	6	6	1305143	1305148	100 %	0 %	0 %	0 %	482903825
23489	NC_021151	AATC	2	8	1305216	1305223	50 %	25 %	0 %	25 %	482903826
23490	NC_021151	GCC	2	6	1305260	1305265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903826
23491	NC_021151	CTGC	2	8	1305283	1305290	0 %	25 %	25 %	50 %	482903826
23492	NC_021151	TCG	2	6	1305294	1305299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903826
23493	NC_021151	GAG	2	6	1305421	1305426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482903827
23494	NC_021151	GAC	4	12	1305436	1305447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903827
23495	NC_021151	CTG	2	6	1305451	1305456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903827
23496	NC_021151	GCC	2	6	1305468	1305473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903827
23497	NC_021151	CTG	2	6	1305514	1305519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903827
23498	NC_021151	ACC	2	6	1305531	1305536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903827
23499	NC_021151	ATG	3	9	1305660	1305668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903828
23500	NC_021151	ACC	2	6	1305716	1305721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903828

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