MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 89429

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20004	NC_021151	TAC	2	6	1110313	1110318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903608
20005	NC_021151	TGG	2	6	1110383	1110388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903608
20006	NC_021151	CTA	2	6	1110444	1110449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903608
20007	NC_021151	GCC	2	6	1110465	1110470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903608
20008	NC_021151	TGGA	2	8	1110565	1110572	25 %	25 %	50 %	0 %	482903608
20009	NC_021151	CAA	2	6	1110598	1110603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482903608
20010	NC_021151	CGT	2	6	1110612	1110617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903608
20011	NC_021151	CGCCC	2	10	1110668	1110677	0 %	0 %	20 %	80 %	482903608
20012	NC_021151	CTG	2	6	1110758	1110763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903608
20013	NC_021151	TGGA	2	8	1110793	1110800	25 %	25 %	50 %	0 %	482903608
20014	NC_021151	GCA	2	6	1110807	1110812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903608
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20017	NC_021151	GCG	2	6	1110904	1110909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903608
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20056	NC_021151	GAT	2	6	1112829	1112834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903611
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20117	NC_021151	TGGC	2	8	1115753	1115760	0 %	25 %	50 %	25 %	482903613
20118	NC_021151	CG	3	6	1115767	1115772	0 %	0 %	50 %	50 %	482903613
20119	NC_021151	CATC	2	8	1115783	1115790	25 %	25 %	0 %	50 %	482903613
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20349	NC_021151	ATCA	2	8	1129598	1129605	50 %	25 %	0 %	25 %	482903629
20350	NC_021151	GATC	2	8	1129735	1129742	25 %	25 %	25 %	25 %	482903629
20351	NC_021151	CA	3	6	1129855	1129860	50 %	0 %	0 %	50 %	482903629
20352	NC_021151	TCG	2	6	1130021	1130026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903630
20353	NC_021151	GTCA	2	8	1130132	1130139	25 %	25 %	25 %	25 %	482903630
20354	NC_021151	TCTT	2	8	1130148	1130155	0 %	75 %	0 %	25 %	482903630
20355	NC_021151	CGC	2	6	1130179	1130184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903630
20356	NC_021151	TAC	2	6	1130185	1130190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903630
20357	NC_021151	CCG	2	6	1130206	1130211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903630
20358	NC_021151	TGC	2	6	1130232	1130237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903630
20359	NC_021151	CAC	2	6	1130240	1130245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903630
20360	NC_021151	TCTT	2	8	1130295	1130302	0 %	75 %	0 %	25 %	482903630
20361	NC_021151	CAGC	2	8	1130360	1130367	25 %	0 %	25 %	50 %	482903630
20362	NC_021151	GTCATC	2	12	1130474	1130485	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	482903630
20363	NC_021151	CAG	2	6	1130600	1130605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903630
20364	NC_021151	ACG	2	6	1130640	1130645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903630
20365	NC_021151	CGC	2	6	1130662	1130667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903630
20366	NC_021151	GAA	2	6	1130685	1130690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482903630
20367	NC_021151	TAT	2	6	1130713	1130718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903630
20368	NC_021151	CAG	2	6	1130819	1130824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903630
20369	NC_021151	CCCA	2	8	1130831	1130838	25 %	0 %	0 %	75 %	482903630
20370	NC_021151	GCA	2	6	1130923	1130928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903630
20371	NC_021151	CGT	2	6	1131008	1131013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903630
20372	NC_021151	CCG	2	6	1131015	1131020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903630
20373	NC_021151	GC	3	6	1131094	1131099	0 %	0 %	50 %	50 %	482903630
20374	NC_021151	AAC	2	6	1131170	1131175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482903630
20375	NC_021151	ACT	2	6	1131246	1131251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903630
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20377	NC_021151	GCC	2	6	1131291	1131296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903630
20378	NC_021151	CG	3	6	1131328	1131333	0 %	0 %	50 %	50 %	482903630
20379	NC_021151	CAC	2	6	1131356	1131361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903630
20380	NC_021151	CAT	2	6	1131419	1131424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903630
20381	NC_021151	T	6	6	1131443	1131448	0 %	100 %	0 %	0 %	482903630
20382	NC_021151	TTG	2	6	1131461	1131466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903630
20383	NC_021151	TTC	2	6	1131494	1131499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482903630
20384	NC_021151	CGC	2	6	1131563	1131568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903630
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20386	NC_021151	CAG	2	6	1131628	1131633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903630
20387	NC_021151	CTT	2	6	1131653	1131658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482903630
20388	NC_021151	GCCATA	2	12	1131923	1131934	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	482903631
20389	NC_021151	CCG	2	6	1131948	1131953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903631
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20395	NC_021151	CG	3	6	1132191	1132196	0 %	0 %	50 %	50 %	482903631
20396	NC_021151	CTG	2	6	1132241	1132246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903631
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20400	NC_021151	CTG	2	6	1132331	1132336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903631
20401	NC_021151	TTA	2	6	1132423	1132428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903631
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20404	NC_021151	TC	3	6	1132596	1132601	0 %	50 %	0 %	50 %	482903632
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20420	NC_021151	GCT	2	6	1133623	1133628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903633
20421	NC_021151	CGA	2	6	1133634	1133639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903633
20422	NC_021151	CAA	2	6	1133701	1133706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482903633
20423	NC_021151	TGG	2	6	1133721	1133726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903633
20424	NC_021151	CAT	2	6	1133752	1133757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903633
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20427	NC_021151	TGGT	2	8	1133849	1133856	0 %	50 %	50 %	0 %	482903633
20428	NC_021151	TGGGC	2	10	1133908	1133917	0 %	20 %	60 %	20 %	482903633
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20434	NC_021151	CGT	2	6	1134222	1134227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903633
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20436	NC_021151	CAG	2	6	1134250	1134255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903633
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20438	NC_021151	CTGG	2	8	1134475	1134482	0 %	25 %	50 %	25 %	482903633
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20440	NC_021151	CT	3	6	1134554	1134559	0 %	50 %	0 %	50 %	482903633
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20444	NC_021151	CAC	2	6	1134637	1134642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903633
20445	NC_021151	TCC	2	6	1134722	1134727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482903633
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20450	NC_021151	T	6	6	1134988	1134993	0 %	100 %	0 %	0 %	482903633
20451	NC_021151	GC	3	6	1134998	1135003	0 %	0 %	50 %	50 %	482903633
20452	NC_021151	CAA	2	6	1135053	1135058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482903633
20453	NC_021151	CG	3	6	1135119	1135124	0 %	0 %	50 %	50 %	482903633
20454	NC_021151	CTG	2	6	1135161	1135166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903633
20455	NC_021151	CGTC	2	8	1135173	1135180	0 %	25 %	25 %	50 %	482903633
20456	NC_021151	GTG	2	6	1135355	1135360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903634
20457	NC_021151	AAT	2	6	1135367	1135372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903634
20458	NC_021151	GCC	2	6	1135532	1135537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903634
20459	NC_021151	GTC	2	6	1135562	1135567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903634
20460	NC_021151	TGA	2	6	1135608	1135613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903634
20461	NC_021151	CGG	2	6	1135647	1135652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903634
20462	NC_021151	CGCC	2	8	1135725	1135732	0 %	0 %	25 %	75 %	482903635
20463	NC_021151	TGT	2	6	1135805	1135810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903635
20464	NC_021151	ATG	2	6	1135923	1135928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903636
20465	NC_021151	CGC	2	6	1135973	1135978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903636
20466	NC_021151	TGC	3	9	1136020	1136028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903636
20467	NC_021151	CAC	2	6	1136087	1136092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903636
20468	NC_021151	CG	4	8	1136101	1136108	0 %	0 %	50 %	50 %	482903636
20469	NC_021151	GC	3	6	1136130	1136135	0 %	0 %	50 %	50 %	482903636
20470	NC_021151	CGA	2	6	1136153	1136158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903636
20471	NC_021151	CCTGAC	2	12	1136211	1136222	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	482903636
20472	NC_021151	GCG	2	6	1136236	1136241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903636
20473	NC_021151	GCG	2	6	1136270	1136275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903636
20474	NC_021151	CG	4	8	1136300	1136307	0 %	0 %	50 %	50 %	482903636
20475	NC_021151	GGT	2	6	1136375	1136380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903636
20476	NC_021151	CCAG	2	8	1136428	1136435	25 %	0 %	25 %	50 %	482903636
20477	NC_021151	CG	3	6	1136436	1136441	0 %	0 %	50 %	50 %	482903636
20478	NC_021151	TGA	2	6	1136597	1136602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903636
20479	NC_021151	TTC	2	6	1136656	1136661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482903636
20480	NC_021151	CAG	2	6	1136787	1136792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903636
20481	NC_021151	TGA	2	6	1136836	1136841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903636
20482	NC_021151	TCG	3	9	1136911	1136919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903636
20483	NC_021151	CTG	2	6	1136994	1136999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903636
20484	NC_021151	CG	3	6	1137000	1137005	0 %	0 %	50 %	50 %	482903636
20485	NC_021151	CGG	2	6	1137014	1137019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903636
20486	NC_021151	GC	3	6	1137031	1137036	0 %	0 %	50 %	50 %	482903636
20487	NC_021151	CGA	2	6	1137062	1137067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903636
20488	NC_021151	CGG	3	9	1137194	1137202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903636
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20490	NC_021151	GCC	2	6	1137384	1137389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903637
20491	NC_021151	CGC	2	6	1137408	1137413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903637
20492	NC_021151	GCT	2	6	1137425	1137430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903637
20493	NC_021151	CGG	2	6	1137485	1137490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903637
20494	NC_021151	CGC	2	6	1137521	1137526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903637
20495	NC_021151	AGG	2	6	1137544	1137549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482903637
20496	NC_021151	CGC	2	6	1137562	1137567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903637
20497	NC_021151	CCG	2	6	1137594	1137599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903637
20498	NC_021151	GGT	2	6	1137632	1137637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903637
20499	NC_021151	ATT	2	6	1137642	1137647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903637
20500	NC_021151	GC	3	6	1137665	1137670	0 %	0 %	50 %	50 %	482903637

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