MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 89429

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_021151	GC	3	6	1082314	1082319	0 %	0 %	50 %	50 %	482903580
19503	NC_021151	CAG	2	6	1082334	1082339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903580
19504	NC_021151	TAT	2	6	1082354	1082359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903580
19505	NC_021151	AAG	2	6	1082364	1082369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482903580
19506	NC_021151	GCT	2	6	1082579	1082584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903580
19507	NC_021151	CAT	2	6	1082736	1082741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903580
19508	NC_021151	CAGC	2	8	1082807	1082814	25 %	0 %	25 %	50 %	482903580
19509	NC_021151	GCC	2	6	1083107	1083112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903581
19510	NC_021151	ATT	2	6	1083127	1083132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903581
19511	NC_021151	TGCGC	2	10	1083154	1083163	0 %	20 %	40 %	40 %	482903581
19512	NC_021151	CGGA	2	8	1083321	1083328	25 %	0 %	50 %	25 %	482903581
19513	NC_021151	T	6	6	1083513	1083518	0 %	100 %	0 %	0 %	482903582
19514	NC_021151	ATC	2	6	1083531	1083536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903582
19515	NC_021151	CCG	2	6	1083563	1083568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903582
19516	NC_021151	TG	3	6	1083581	1083586	0 %	50 %	50 %	0 %	482903582
19517	NC_021151	TCA	2	6	1083607	1083612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903582
19518	NC_021151	CGA	2	6	1083613	1083618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903582
19519	NC_021151	CTTTAT	2	12	1083623	1083634	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	482903582
19520	NC_021151	CTT	2	6	1083659	1083664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482903582
19521	NC_021151	GAA	2	6	1083689	1083694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482903582
19522	NC_021151	AGC	2	6	1084100	1084105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903583
19523	NC_021151	AGC	2	6	1084160	1084165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903583
19524	NC_021151	CGT	2	6	1084246	1084251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903583
19525	NC_021151	TGC	2	6	1084297	1084302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903583
19526	NC_021151	CTCTA	2	10	1084325	1084334	20 %	40 %	0 %	40 %	482903583
19527	NC_021151	TTA	2	6	1084335	1084340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903583
19528	NC_021151	GTT	3	9	1084372	1084380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903583
19529	NC_021151	GGGC	2	8	1084381	1084388	0 %	0 %	75 %	25 %	482903583
19530	NC_021151	CGCAA	2	10	1084396	1084405	40 %	0 %	20 %	40 %	482903583
19531	NC_021151	ATTT	2	8	1084413	1084420	25 %	75 %	0 %	0 %	482903583
19532	NC_021151	ATT	2	6	1084460	1084465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903583
19533	NC_021151	ATT	2	6	1084519	1084524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903583
19534	NC_021151	CCG	2	6	1084539	1084544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903583
19535	NC_021151	TTG	2	6	1084562	1084567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903583
19536	NC_021151	TTAT	2	8	1084592	1084599	25 %	75 %	0 %	0 %	482903583
19537	NC_021151	ATGAAG	2	12	1084608	1084619	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	482903583
19538	NC_021151	GAT	2	6	1084622	1084627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903583
19539	NC_021151	CAC	2	6	1084637	1084642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903583
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19541	NC_021151	AATG	2	8	1084723	1084730	50 %	25 %	25 %	0 %	482903583
19542	NC_021151	TC	3	6	1084807	1084812	0 %	50 %	0 %	50 %	482903583
19543	NC_021151	GC	3	6	1084827	1084832	0 %	0 %	50 %	50 %	482903583
19544	NC_021151	AAT	2	6	1084847	1084852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903583
19545	NC_021151	TTC	2	6	1084877	1084882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482903583
19546	NC_021151	CGA	2	6	1084896	1084901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903583
19547	NC_021151	GTC	2	6	1084919	1084924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903583
19548	NC_021151	GC	3	6	1084971	1084976	0 %	0 %	50 %	50 %	482903583
19549	NC_021151	TGG	2	6	1084992	1084997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903583
19550	NC_021151	CGGCG	2	10	1085053	1085062	0 %	0 %	60 %	40 %	482903583
19551	NC_021151	GCC	2	6	1085078	1085083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903583
19552	NC_021151	TGA	2	6	1085088	1085093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903583
19553	NC_021151	TCG	2	6	1085180	1085185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903584
19554	NC_021151	ATC	2	6	1085200	1085205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903584
19555	NC_021151	GC	4	8	1085336	1085343	0 %	0 %	50 %	50 %	482903584
19556	NC_021151	ACG	2	6	1085362	1085367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903584
19557	NC_021151	GGC	2	6	1085377	1085382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903584
19558	NC_021151	TCA	2	6	1085454	1085459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903584
19559	NC_021151	CCA	3	9	1085478	1085486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903584
19560	NC_021151	CGC	2	6	1085508	1085513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903584
19561	NC_021151	CCA	2	6	1085640	1085645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903584
19562	NC_021151	GGTC	2	8	1085646	1085653	0 %	25 %	50 %	25 %	482903584
19563	NC_021151	GC	3	6	1085656	1085661	0 %	0 %	50 %	50 %	482903584
19564	NC_021151	CTGG	2	8	1085713	1085720	0 %	25 %	50 %	25 %	482903584
19565	NC_021151	CTT	2	6	1085787	1085792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482903584
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19567	NC_021151	TCAG	2	8	1086153	1086160	25 %	25 %	25 %	25 %	482903585
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19585	NC_021151	GC	3	6	1086962	1086967	0 %	0 %	50 %	50 %	482903586
19586	NC_021151	GAT	2	6	1087007	1087012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903586
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19588	NC_021151	GC	3	6	1087142	1087147	0 %	0 %	50 %	50 %	482903586
19589	NC_021151	GGC	2	6	1087148	1087153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903586
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19591	NC_021151	ACAA	2	8	1087191	1087198	75 %	0 %	0 %	25 %	482903586
19592	NC_021151	ACC	2	6	1087288	1087293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903587
19593	NC_021151	CTG	2	6	1087360	1087365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903587
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19600	NC_021151	GC	3	6	1087572	1087577	0 %	0 %	50 %	50 %	482903587
19601	NC_021151	CAA	2	6	1087583	1087588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482903587
19602	NC_021151	TCGC	2	8	1087693	1087700	0 %	25 %	25 %	50 %	482903587
19603	NC_021151	GCCAGC	2	12	1087703	1087714	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	482903587
19604	NC_021151	CCA	2	6	1087788	1087793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903587
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19616	NC_021151	CGG	2	6	1088324	1088329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903588
19617	NC_021151	GC	3	6	1088337	1088342	0 %	0 %	50 %	50 %	482903588
19618	NC_021151	TGC	2	6	1088377	1088382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903588
19619	NC_021151	CCA	2	6	1088402	1088407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903588
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19623	NC_021151	CCG	2	6	1088507	1088512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903588
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19627	NC_021151	GCTCAT	2	12	1088712	1088723	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	482903588
19628	NC_021151	GCG	2	6	1088739	1088744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903588
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19632	NC_021151	GTT	2	6	1088894	1088899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903588
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19639	NC_021151	GACT	2	8	1089410	1089417	25 %	25 %	25 %	25 %	482903589
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