MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 89429

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_021151	CGCC	2	8	1053523	1053530	0 %	0 %	25 %	75 %	482903559
19002	NC_021151	CAT	2	6	1053612	1053617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903559
19003	NC_021151	CCG	2	6	1053710	1053715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903559
19004	NC_021151	CTTA	2	8	1053813	1053820	25 %	50 %	0 %	25 %	482903559
19005	NC_021151	CAT	2	6	1053822	1053827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903559
19006	NC_021151	ATA	2	6	1053898	1053903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903560
19007	NC_021151	GC	3	6	1053961	1053966	0 %	0 %	50 %	50 %	482903560
19008	NC_021151	TAA	2	6	1054030	1054035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903560
19009	NC_021151	GCA	2	6	1054072	1054077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903560
19010	NC_021151	CG	3	6	1054134	1054139	0 %	0 %	50 %	50 %	482903560
19011	NC_021151	CG	3	6	1054180	1054185	0 %	0 %	50 %	50 %	482903560
19012	NC_021151	CCG	2	6	1054257	1054262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903560
19013	NC_021151	GCC	3	9	1054268	1054276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903560
19014	NC_021151	GCG	2	6	1054318	1054323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903560
19015	NC_021151	CCA	2	6	1054324	1054329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903560
19016	NC_021151	ACG	2	6	1054344	1054349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903560
19017	NC_021151	AAT	2	6	1054430	1054435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903560
19018	NC_021151	A	6	6	1054446	1054451	100 %	0 %	0 %	0 %	482903560
19019	NC_021151	GCG	3	9	1054452	1054460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903560
19020	NC_021151	GGC	2	6	1054487	1054492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903560
19021	NC_021151	GCT	2	6	1054555	1054560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903560
19022	NC_021151	ATG	2	6	1054584	1054589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903560
19023	NC_021151	GAT	2	6	1054600	1054605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903560
19024	NC_021151	CGG	2	6	1054634	1054639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903560
19025	NC_021151	GC	3	6	1054644	1054649	0 %	0 %	50 %	50 %	482903560
19026	NC_021151	CAT	2	6	1054682	1054687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903560
19027	NC_021151	AAAG	2	8	1054688	1054695	75 %	0 %	25 %	0 %	482903560
19028	NC_021151	TAA	2	6	1054702	1054707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903560
19029	NC_021151	GCG	2	6	1054739	1054744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903560
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19031	NC_021151	ATA	2	6	1054894	1054899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903561
19032	NC_021151	TA	3	6	1054898	1054903	50 %	50 %	0 %	0 %	482903561
19033	NC_021151	CCCA	2	8	1054951	1054958	25 %	0 %	0 %	75 %	482903561
19034	NC_021151	GC	3	6	1054971	1054976	0 %	0 %	50 %	50 %	482903561
19035	NC_021151	GTA	2	6	1054983	1054988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903561
19036	NC_021151	CTG	2	6	1055022	1055027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903561
19037	NC_021151	CGCTG	2	10	1055048	1055057	0 %	20 %	40 %	40 %	482903561
19038	NC_021151	ACA	2	6	1055144	1055149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482903561
19039	NC_021151	CAC	2	6	1055188	1055193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903561
19040	NC_021151	TGA	2	6	1055221	1055226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903561
19041	NC_021151	TTC	2	6	1055287	1055292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482903561
19042	NC_021151	T	6	6	1055319	1055324	0 %	100 %	0 %	0 %	482903561
19043	NC_021151	CAG	2	6	1055346	1055351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903561
19044	NC_021151	CCG	2	6	1055372	1055377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903561
19045	NC_021151	CAA	2	6	1055394	1055399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482903561
19046	NC_021151	CTT	2	6	1055408	1055413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482903561
19047	NC_021151	CGG	2	6	1055478	1055483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903561
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19050	NC_021151	ACGC	2	8	1055568	1055575	25 %	0 %	25 %	50 %	482903561
19051	NC_021151	ATT	2	6	1055601	1055606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903561
19052	NC_021151	TAA	2	6	1055614	1055619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903561
19053	NC_021151	TCTT	2	8	1055662	1055669	0 %	75 %	0 %	25 %	482903561
19054	NC_021151	AAT	2	6	1055680	1055685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903561
19055	NC_021151	CGC	2	6	1055720	1055725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903561
19056	NC_021151	TGAT	2	8	1055779	1055786	25 %	50 %	25 %	0 %	482903561
19057	NC_021151	CGTT	2	8	1055836	1055843	0 %	50 %	25 %	25 %	482903561
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19059	NC_021151	T	6	6	1055854	1055859	0 %	100 %	0 %	0 %	482903561
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19062	NC_021151	T	6	6	1056051	1056056	0 %	100 %	0 %	0 %	482903561
19063	NC_021151	TAAT	2	8	1056290	1056297	50 %	50 %	0 %	0 %	482903561
19064	NC_021151	GA	3	6	1056360	1056365	50 %	0 %	50 %	0 %	482903561
19065	NC_021151	TTA	2	6	1056382	1056387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903561
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19067	NC_021151	GGC	2	6	1056453	1056458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903561
19068	NC_021151	T	7	7	1056494	1056500	0 %	100 %	0 %	0 %	482903561
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19070	NC_021151	TAA	2	6	1057369	1057374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903562
19071	NC_021151	CAG	2	6	1057434	1057439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903562
19072	NC_021151	CTTG	2	8	1057606	1057613	0 %	50 %	25 %	25 %	482903562
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19074	NC_021151	CCGC	2	8	1057677	1057684	0 %	0 %	25 %	75 %	482903562
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19078	NC_021151	CGC	3	9	1058511	1058519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903563
19079	NC_021151	AT	3	6	1058625	1058630	50 %	50 %	0 %	0 %	482903563
19080	NC_021151	A	6	6	1058651	1058656	100 %	0 %	0 %	0 %	482903563
19081	NC_021151	GCG	2	6	1058660	1058665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903563
19082	NC_021151	GAC	2	6	1058677	1058682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903563
19083	NC_021151	ATT	2	6	1058719	1058724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903563
19084	NC_021151	CAT	2	6	1058802	1058807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903563
19085	NC_021151	CG	3	6	1058822	1058827	0 %	0 %	50 %	50 %	482903563
19086	NC_021151	CAAC	2	8	1058837	1058844	50 %	0 %	0 %	50 %	482903563
19087	NC_021151	GC	3	6	1058885	1058890	0 %	0 %	50 %	50 %	482903563
19088	NC_021151	GATC	2	8	1058910	1058917	25 %	25 %	25 %	25 %	482903563
19089	NC_021151	CAC	2	6	1058950	1058955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903563
19090	NC_021151	TGA	2	6	1059066	1059071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903563
19091	NC_021151	TGT	2	6	1059156	1059161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903563
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19094	NC_021151	GCCA	2	8	1059202	1059209	25 %	0 %	25 %	50 %	482903563
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19099	NC_021151	GCCA	2	8	1059296	1059303	25 %	0 %	25 %	50 %	482903563
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19102	NC_021151	CCT	2	6	1059506	1059511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482903563
19103	NC_021151	CCAG	2	8	1059534	1059541	25 %	0 %	25 %	50 %	482903563
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19105	NC_021151	CG	3	6	1059576	1059581	0 %	0 %	50 %	50 %	482903563
19106	NC_021151	GGT	2	6	1059610	1059615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903563
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19112	NC_021151	CT	3	6	1059798	1059803	0 %	50 %	0 %	50 %	482903563
19113	NC_021151	TGAC	2	8	1059857	1059864	25 %	25 %	25 %	25 %	482903563
19114	NC_021151	CAA	2	6	1059876	1059881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482903563
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19117	NC_021151	ATC	2	6	1060021	1060026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903563
19118	NC_021151	GCG	2	6	1060034	1060039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903563
19119	NC_021151	CGC	2	6	1060053	1060058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903563
19120	NC_021151	GAA	2	6	1060102	1060107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482903563
19121	NC_021151	GCGCT	2	10	1060111	1060120	0 %	20 %	40 %	40 %	482903563
19122	NC_021151	CAC	3	9	1060188	1060196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903563
19123	NC_021151	CGA	2	6	1060239	1060244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903563
19124	NC_021151	GCTG	2	8	1060266	1060273	0 %	25 %	50 %	25 %	482903563
19125	NC_021151	TG	3	6	1060340	1060345	0 %	50 %	50 %	0 %	482903563
19126	NC_021151	GGT	2	6	1060351	1060356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903563
19127	NC_021151	CTG	2	6	1060444	1060449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903563
19128	NC_021151	CTG	2	6	1060630	1060635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903563
19129	NC_021151	CGT	2	6	1060720	1060725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903563
19130	NC_021151	ACC	2	6	1060742	1060747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903563
19131	NC_021151	GC	3	6	1060757	1060762	0 %	0 %	50 %	50 %	482903563
19132	NC_021151	GCT	2	6	1060777	1060782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903563
19133	NC_021151	CTG	2	6	1060795	1060800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903563
19134	NC_021151	AGCTG	2	10	1060821	1060830	20 %	20 %	40 %	20 %	482903563
19135	NC_021151	CTG	2	6	1060975	1060980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903563
19136	NC_021151	CTA	2	6	1060986	1060991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903563
19137	NC_021151	GAA	2	6	1061025	1061030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482903563
19138	NC_021151	CGT	2	6	1061034	1061039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903563
19139	NC_021151	A	6	6	1061059	1061064	100 %	0 %	0 %	0 %	482903563
19140	NC_021151	A	6	6	1061068	1061073	100 %	0 %	0 %	0 %	482903563
19141	NC_021151	CTC	2	6	1061321	1061326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482903564
19142	NC_021151	ACC	2	6	1061385	1061390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903564
19143	NC_021151	CCA	2	6	1061479	1061484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903564
19144	NC_021151	CTG	2	6	1061609	1061614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903564
19145	NC_021151	TCG	2	6	1061634	1061639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903564
19146	NC_021151	CG	3	6	1061664	1061669	0 %	0 %	50 %	50 %	482903564
19147	NC_021151	CGA	2	6	1061726	1061731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903564
19148	NC_021151	TCG	2	6	1061772	1061777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903564
19149	NC_021151	CCG	2	6	1061782	1061787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903564
19150	NC_021151	TA	3	6	1061788	1061793	50 %	50 %	0 %	0 %	482903564
19151	NC_021151	GCA	2	6	1061836	1061841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903564
19152	NC_021151	CATT	2	8	1061860	1061867	25 %	50 %	0 %	25 %	482903564
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19156	NC_021151	CGT	2	6	1062676	1062681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903565
19157	NC_021151	GAA	3	9	1062682	1062690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482903565
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19161	NC_021151	A	6	6	1062916	1062921	100 %	0 %	0 %	0 %	482903565
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19183	NC_021151	TAG	2	6	1064426	1064431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903567
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19187	NC_021151	GCA	2	6	1064571	1064576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903567
19188	NC_021151	CGCC	2	8	1064601	1064608	0 %	0 %	25 %	75 %	482903567
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19194	NC_021151	GCG	2	6	1064771	1064776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903567
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19204	NC_021151	AG	3	6	1065646	1065651	50 %	0 %	50 %	0 %	482903568
19205	NC_021151	TGC	2	6	1065659	1065664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903568
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19210	NC_021151	TCG	2	6	1065882	1065887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903568
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19216	NC_021151	ATATCA	2	12	1066118	1066129	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	482903568
19217	NC_021151	TGCT	2	8	1066135	1066142	0 %	50 %	25 %	25 %	482903568
19218	NC_021151	TGA	2	6	1066152	1066157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903568
19219	NC_021151	TGT	2	6	1066380	1066385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903569
19220	NC_021151	TGA	2	6	1066459	1066464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903569
19221	NC_021151	TTAA	2	8	1066479	1066486	50 %	50 %	0 %	0 %	482903569
19222	NC_021151	TGA	2	6	1066523	1066528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903569
19223	NC_021151	ATC	2	6	1066530	1066535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903569
19224	NC_021151	CG	3	6	1066625	1066630	0 %	0 %	50 %	50 %	482903569
19225	NC_021151	TAT	2	6	1066701	1066706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903569
19226	NC_021151	CCCG	2	8	1066717	1066724	0 %	0 %	25 %	75 %	482903569
19227	NC_021151	A	6	6	1066764	1066769	100 %	0 %	0 %	0 %	482903569
19228	NC_021151	TGC	2	6	1066779	1066784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903569
19229	NC_021151	GCAAT	2	10	1066841	1066850	40 %	20 %	20 %	20 %	482903570
19230	NC_021151	CG	3	6	1066903	1066908	0 %	0 %	50 %	50 %	482903570
19231	NC_021151	TTG	2	6	1066962	1066967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903570
19232	NC_021151	T	6	6	1066985	1066990	0 %	100 %	0 %	0 %	482903570
19233	NC_021151	CCG	2	6	1067085	1067090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903570
19234	NC_021151	CTG	2	6	1067144	1067149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903570
19235	NC_021151	CGC	2	6	1067185	1067190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903570
19236	NC_021151	CGCT	2	8	1067216	1067223	0 %	25 %	25 %	50 %	482903570
19237	NC_021151	GC	3	6	1067378	1067383	0 %	0 %	50 %	50 %	482903570
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19239	NC_021151	GC	3	6	1067436	1067441	0 %	0 %	50 %	50 %	482903570
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19245	NC_021151	CG	3	6	1067621	1067626	0 %	0 %	50 %	50 %	482903570
19246	NC_021151	ATT	2	6	1067675	1067680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903570
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19465	NC_021151	CCA	2	6	1080210	1080215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903578
19466	NC_021151	CT	3	6	1080251	1080256	0 %	50 %	0 %	50 %	482903578
19467	NC_021151	CTGC	2	8	1080277	1080284	0 %	25 %	25 %	50 %	482903578
19468	NC_021151	AGC	2	6	1080311	1080316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903578
19469	NC_021151	C	7	7	1080494	1080500	0 %	0 %	0 %	100 %	482903578
19470	NC_021151	CGA	2	6	1080583	1080588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903578
19471	NC_021151	TGG	2	6	1080591	1080596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903578
19472	NC_021151	GCG	2	6	1080651	1080656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903578
19473	NC_021151	ATC	2	6	1080695	1080700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903578
19474	NC_021151	GCG	2	6	1080726	1080731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903578
19475	NC_021151	AAAC	2	8	1080792	1080799	75 %	0 %	0 %	25 %	482903578
19476	NC_021151	AAT	2	6	1080828	1080833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903578
19477	NC_021151	AGC	2	6	1080892	1080897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903579
19478	NC_021151	TCC	2	6	1080991	1080996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482903579
19479	NC_021151	GAAT	2	8	1081015	1081022	50 %	25 %	25 %	0 %	482903579
19480	NC_021151	GAA	2	6	1081098	1081103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482903579
19481	NC_021151	GTC	2	6	1081107	1081112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903579
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19485	NC_021151	GCC	3	9	1081191	1081199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903579
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19490	NC_021151	GCC	2	6	1081440	1081445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903579
19491	NC_021151	ATT	2	6	1081475	1081480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903579
19492	NC_021151	TCAG	2	8	1081534	1081541	25 %	25 %	25 %	25 %	482903580
19493	NC_021151	ACC	3	9	1081591	1081599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903580
19494	NC_021151	GCG	2	6	1081802	1081807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903580
19495	NC_021151	GCG	2	6	1081871	1081876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903580
19496	NC_021151	GGC	2	6	1081923	1081928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903580
19497	NC_021151	GCT	2	6	1081931	1081936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903580
19498	NC_021151	TGAC	2	8	1081987	1081994	25 %	25 %	25 %	25 %	482903580
19499	NC_021151	ATATC	2	10	1082191	1082200	40 %	40 %	0 %	20 %	482903580
19500	NC_021151	CG	3	6	1082201	1082206	0 %	0 %	50 %	50 %	482903580

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