MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 89429

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_021151	GCG	2	6	1028204	1028209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903531
18502	NC_021151	CCA	2	6	1028388	1028393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903532
18503	NC_021151	GCA	3	9	1028396	1028404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903532
18504	NC_021151	CCG	2	6	1028420	1028425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903532
18505	NC_021151	CGAT	2	8	1028440	1028447	25 %	25 %	25 %	25 %	482903532
18506	NC_021151	T	6	6	1028451	1028456	0 %	100 %	0 %	0 %	482903532
18507	NC_021151	TCA	2	6	1028533	1028538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903532
18508	NC_021151	CTG	2	6	1028559	1028564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903532
18509	NC_021151	GCC	2	6	1028678	1028683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903532
18510	NC_021151	CTT	2	6	1028684	1028689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482903532
18511	NC_021151	ACA	2	6	1028800	1028805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482903532
18512	NC_021151	T	6	6	1028843	1028848	0 %	100 %	0 %	0 %	482903532
18513	NC_021151	CAT	2	6	1028862	1028867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903532
18514	NC_021151	GCC	2	6	1028947	1028952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903532
18515	NC_021151	CCG	2	6	1029032	1029037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903532
18516	NC_021151	CG	3	6	1029104	1029109	0 %	0 %	50 %	50 %	482903532
18517	NC_021151	TTCGCT	2	12	1029139	1029150	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	482903532
18518	NC_021151	GGC	2	6	1029153	1029158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903532
18519	NC_021151	CCT	2	6	1029164	1029169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482903532
18520	NC_021151	T	8	8	1029178	1029185	0 %	100 %	0 %	0 %	482903532
18521	NC_021151	CCAT	2	8	1029217	1029224	25 %	25 %	0 %	50 %	482903532
18522	NC_021151	CGC	2	6	1029228	1029233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903532
18523	NC_021151	CTCA	2	8	1029264	1029271	25 %	25 %	0 %	50 %	482903532
18524	NC_021151	CGC	2	6	1029290	1029295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903532
18525	NC_021151	TGCGT	2	10	1029305	1029314	0 %	40 %	40 %	20 %	482903532
18526	NC_021151	CAG	2	6	1029327	1029332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903532
18527	NC_021151	CCA	2	6	1029350	1029355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903532
18528	NC_021151	ACA	2	6	1029395	1029400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482903532
18529	NC_021151	ATT	2	6	1029684	1029689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903533
18530	NC_021151	CTG	2	6	1029765	1029770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903533
18531	NC_021151	GCA	2	6	1029803	1029808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903533
18532	NC_021151	CTG	2	6	1029855	1029860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903533
18533	NC_021151	CGC	2	6	1029902	1029907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903533
18534	NC_021151	TTA	2	6	1030056	1030061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903533
18535	NC_021151	TCA	2	6	1030095	1030100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903533
18536	NC_021151	ATG	2	6	1030167	1030172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903533
18537	NC_021151	GGC	2	6	1030230	1030235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903533
18538	NC_021151	GC	3	6	1030250	1030255	0 %	0 %	50 %	50 %	482903533
18539	NC_021151	CGA	2	6	1030334	1030339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903533
18540	NC_021151	TGA	2	6	1030408	1030413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903534
18541	NC_021151	CAG	2	6	1030421	1030426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903534
18542	NC_021151	CAG	2	6	1030430	1030435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903534
18543	NC_021151	TAT	3	9	1030489	1030497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903534
18544	NC_021151	CGG	2	6	1030530	1030535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903534
18545	NC_021151	GCC	2	6	1030547	1030552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903534
18546	NC_021151	GTG	2	6	1030583	1030588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903534
18547	NC_021151	TTA	2	6	1030593	1030598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903534
18548	NC_021151	CTG	2	6	1030628	1030633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903534
18549	NC_021151	GCA	2	6	1030709	1030714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903534
18550	NC_021151	GCA	2	6	1030729	1030734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903534
18551	NC_021151	GCT	2	6	1030759	1030764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903534
18552	NC_021151	GTA	2	6	1030772	1030777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903534
18553	NC_021151	TGG	2	6	1030797	1030802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903534
18554	NC_021151	GC	3	6	1030836	1030841	0 %	0 %	50 %	50 %	482903534
18555	NC_021151	CG	3	6	1030846	1030851	0 %	0 %	50 %	50 %	482903534
18556	NC_021151	ATT	2	6	1030871	1030876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903534
18557	NC_021151	ATT	2	6	1030986	1030991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903534
18558	NC_021151	GTT	2	6	1031086	1031091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903535
18559	NC_021151	GCG	2	6	1031107	1031112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903535
18560	NC_021151	ACG	3	9	1031170	1031178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903535
18561	NC_021151	CGA	2	6	1031200	1031205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903535
18562	NC_021151	CGG	2	6	1031212	1031217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903535
18563	NC_021151	GCC	2	6	1031272	1031277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903535
18564	NC_021151	AACG	2	8	1031313	1031320	50 %	0 %	25 %	25 %	482903535
18565	NC_021151	CGC	3	9	1031424	1031432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903535
18566	NC_021151	GCC	2	6	1031453	1031458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903535
18567	NC_021151	GGT	2	6	1031593	1031598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903535
18568	NC_021151	ACA	2	6	1031601	1031606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482903535
18569	NC_021151	CG	3	6	1031651	1031656	0 %	0 %	50 %	50 %	482903535
18570	NC_021151	GCC	2	6	1031691	1031696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903535
18571	NC_021151	CCG	2	6	1031766	1031771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903535
18572	NC_021151	AAT	2	6	1031884	1031889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903535
18573	NC_021151	GC	4	8	1031921	1031928	0 %	0 %	50 %	50 %	482903535
18574	NC_021151	GCA	2	6	1032091	1032096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903536
18575	NC_021151	ACC	2	6	1032152	1032157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903536
18576	NC_021151	GAT	2	6	1032161	1032166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903536
18577	NC_021151	TCC	2	6	1032201	1032206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482903536
18578	NC_021151	GCA	2	6	1032235	1032240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903536
18579	NC_021151	ACG	2	6	1032244	1032249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903536
18580	NC_021151	TCA	2	6	1032409	1032414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903536
18581	NC_021151	GGAT	2	8	1032651	1032658	25 %	25 %	50 %	0 %	482903536
18582	NC_021151	A	7	7	1032661	1032667	100 %	0 %	0 %	0 %	482903536
18583	NC_021151	ATG	2	6	1032813	1032818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903537
18584	NC_021151	TTG	2	6	1032861	1032866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903537
18585	NC_021151	ATG	2	6	1032987	1032992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903537
18586	NC_021151	GCG	2	6	1033028	1033033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903537
18587	NC_021151	CG	3	6	1033054	1033059	0 %	0 %	50 %	50 %	482903537
18588	NC_021151	T	6	6	1033065	1033070	0 %	100 %	0 %	0 %	482903537
18589	NC_021151	CCA	2	6	1033106	1033111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903537
18590	NC_021151	CG	3	6	1033130	1033135	0 %	0 %	50 %	50 %	482903537
18591	NC_021151	CGC	2	6	1033142	1033147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903537
18592	NC_021151	CGC	2	6	1033234	1033239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903537
18593	NC_021151	TCTG	2	8	1033240	1033247	0 %	50 %	25 %	25 %	482903537
18594	NC_021151	CAATAT	2	12	1033280	1033291	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	482903537
18595	NC_021151	TCT	2	6	1033384	1033389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482903537
18596	NC_021151	GGC	2	6	1033554	1033559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903537
18597	NC_021151	GCC	2	6	1033868	1033873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903538
18598	NC_021151	GCG	2	6	1033911	1033916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903538
18599	NC_021151	GCT	3	9	1033930	1033938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903538
18600	NC_021151	GAT	2	6	1033964	1033969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903538
18601	NC_021151	CTG	3	9	1033979	1033987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903538
18602	NC_021151	GC	3	6	1033995	1034000	0 %	0 %	50 %	50 %	482903538
18603	NC_021151	CCTG	2	8	1034113	1034120	0 %	25 %	25 %	50 %	482903538
18604	NC_021151	CCCG	2	8	1034140	1034147	0 %	0 %	25 %	75 %	482903538
18605	NC_021151	ATT	2	6	1034155	1034160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903538
18606	NC_021151	CT	3	6	1034182	1034187	0 %	50 %	0 %	50 %	482903538
18607	NC_021151	GTG	2	6	1034222	1034227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903538
18608	NC_021151	CGG	2	6	1034263	1034268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903538
18609	NC_021151	ACT	2	6	1034340	1034345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903538
18610	NC_021151	TTTA	2	8	1034349	1034356	25 %	75 %	0 %	0 %	482903538
18611	NC_021151	ATC	2	6	1034379	1034384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903538
18612	NC_021151	A	7	7	1034387	1034393	100 %	0 %	0 %	0 %	482903538
18613	NC_021151	CGCC	2	8	1034452	1034459	0 %	0 %	25 %	75 %	482903538
18614	NC_021151	GCC	2	6	1034494	1034499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903538
18615	NC_021151	GGT	2	6	1034566	1034571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903538
18616	NC_021151	CG	3	6	1034594	1034599	0 %	0 %	50 %	50 %	482903538
18617	NC_021151	GGT	2	6	1034614	1034619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903538
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18734	NC_021151	ACCT	2	8	1040067	1040074	25 %	25 %	0 %	50 %	482903542
18735	NC_021151	CAT	2	6	1040127	1040132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903542
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18742	NC_021151	GAA	2	6	1041352	1041357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482903543
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18836	NC_021151	CTT	2	6	1045572	1045577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482903549
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18838	NC_021151	TTAT	2	8	1045613	1045620	25 %	75 %	0 %	0 %	482903549
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18842	NC_021151	A	6	6	1045663	1045668	100 %	0 %	0 %	0 %	482903549
18843	NC_021151	GCA	2	6	1045710	1045715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903549
18844	NC_021151	T	6	6	1045750	1045755	0 %	100 %	0 %	0 %	482903549
18845	NC_021151	TGCG	2	8	1045758	1045765	0 %	25 %	50 %	25 %	482903549
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