MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 89429

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_021151	G	6	6	712854	712859	0 %	0 %	100 %	0 %	482903226
13002	NC_021151	TCA	2	6	712886	712891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903226
13003	NC_021151	TGC	2	6	712942	712947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903226
13004	NC_021151	TA	3	6	712956	712961	50 %	50 %	0 %	0 %	482903226
13005	NC_021151	GTGG	2	8	713010	713017	0 %	25 %	75 %	0 %	482903227
13006	NC_021151	CAA	2	6	713068	713073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482903227
13007	NC_021151	ATT	2	6	713094	713099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903227
13008	NC_021151	ATCG	2	8	713189	713196	25 %	25 %	25 %	25 %	482903227
13009	NC_021151	GCC	2	6	713286	713291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903227
13010	NC_021151	ATT	2	6	713368	713373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903227
13011	NC_021151	T	6	6	713391	713396	0 %	100 %	0 %	0 %	482903227
13012	NC_021151	CTG	2	6	713420	713425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903227
13013	NC_021151	ACA	2	6	713430	713435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482903227
13014	NC_021151	CCT	2	6	713449	713454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482903227
13015	NC_021151	T	7	7	713565	713571	0 %	100 %	0 %	0 %	482903227
13016	NC_021151	TAT	2	6	713862	713867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903227
13017	NC_021151	CTT	2	6	714099	714104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482903228
13018	NC_021151	GGT	2	6	714118	714123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903228
13019	NC_021151	CAA	2	6	714155	714160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482903228
13020	NC_021151	C	6	6	714163	714168	0 %	0 %	0 %	100 %	482903228
13021	NC_021151	A	7	7	714333	714339	100 %	0 %	0 %	0 %	482903228
13022	NC_021151	GAAG	2	8	714349	714356	50 %	0 %	50 %	0 %	482903228
13023	NC_021151	ATT	2	6	714360	714365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903228
13024	NC_021151	AAAG	2	8	714405	714412	75 %	0 %	25 %	0 %	482903228
13025	NC_021151	GGATT	2	10	714480	714489	20 %	40 %	40 %	0 %	482903228
13026	NC_021151	TTAT	2	8	714492	714499	25 %	75 %	0 %	0 %	482903228
13027	NC_021151	CTG	2	6	714539	714544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903228
13028	NC_021151	GAT	3	9	714553	714561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903228
13029	NC_021151	GCT	2	6	714595	714600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903228
13030	NC_021151	ATGA	2	8	714661	714668	50 %	25 %	25 %	0 %	482903228
13031	NC_021151	TGG	2	6	714737	714742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903229
13032	NC_021151	ATT	2	6	714822	714827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903229
13033	NC_021151	CTTT	2	8	714991	714998	0 %	75 %	0 %	25 %	482903230
13034	NC_021151	TTA	2	6	715009	715014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903230
13035	NC_021151	CAG	2	6	715096	715101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903230
13036	NC_021151	ATG	2	6	715108	715113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903230
13037	NC_021151	GGTTAG	2	12	715136	715147	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	482903230
13038	NC_021151	ATT	2	6	715162	715167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903230
13039	NC_021151	GCG	2	6	715189	715194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903230
13040	NC_021151	GCTT	2	8	715304	715311	0 %	50 %	25 %	25 %	482903230
13041	NC_021151	TG	3	6	715325	715330	0 %	50 %	50 %	0 %	482903230
13042	NC_021151	GCG	2	6	715346	715351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903230
13043	NC_021151	ACC	2	6	715398	715403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903230
13044	NC_021151	TAT	2	6	715415	715420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903230
13045	NC_021151	AT	3	6	715440	715445	50 %	50 %	0 %	0 %	482903230
13046	NC_021151	TC	3	6	715487	715492	0 %	50 %	0 %	50 %	482903230
13047	NC_021151	ATA	2	6	715501	715506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903230
13048	NC_021151	TCGG	2	8	715545	715552	0 %	25 %	50 %	25 %	482903230
13049	NC_021151	CAA	2	6	715555	715560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482903230
13050	NC_021151	TCT	2	6	715574	715579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482903230
13051	NC_021151	TCA	2	6	715641	715646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903230
13052	NC_021151	AACAG	2	10	715715	715724	60 %	0 %	20 %	20 %	482903231
13053	NC_021151	AGAAA	2	10	715730	715739	80 %	0 %	20 %	0 %	482903231
13054	NC_021151	AAGG	2	8	715755	715762	50 %	0 %	50 %	0 %	482903231
13055	NC_021151	CAT	2	6	715789	715794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903231
13056	NC_021151	GAT	2	6	715844	715849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903231
13057	NC_021151	TAAA	2	8	715891	715898	75 %	25 %	0 %	0 %	482903231
13058	NC_021151	CTG	2	6	715959	715964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903231
13059	NC_021151	TTC	2	6	716008	716013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482903231
13060	NC_021151	GGT	2	6	716021	716026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903231
13061	NC_021151	GTAA	2	8	716073	716080	50 %	25 %	25 %	0 %	482903231
13062	NC_021151	GTA	2	6	716109	716114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903231
13063	NC_021151	TAT	3	9	716175	716183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903231
13064	NC_021151	TCT	2	6	716241	716246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482903231
13065	NC_021151	TAA	2	6	716248	716253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903231
13066	NC_021151	T	6	6	716278	716283	0 %	100 %	0 %	0 %	482903231
13067	NC_021151	TCG	2	6	716287	716292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903231
13068	NC_021151	ATC	2	6	716518	716523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903231
13069	NC_021151	GTT	2	6	716616	716621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903231
13070	NC_021151	ATT	2	6	716645	716650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903231
13071	NC_021151	T	6	6	716649	716654	0 %	100 %	0 %	0 %	482903231
13072	NC_021151	TGA	2	6	716722	716727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903231
13073	NC_021151	AGAT	2	8	716728	716735	50 %	25 %	25 %	0 %	482903231
13074	NC_021151	TAT	2	6	717233	717238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903232
13075	NC_021151	GC	3	6	717245	717250	0 %	0 %	50 %	50 %	482903232
13076	NC_021151	ATG	2	6	717257	717262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903232
13077	NC_021151	CAT	2	6	717298	717303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903232
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13079	NC_021151	GAT	2	6	717328	717333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903232
13080	NC_021151	CCA	3	9	717369	717377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903232
13081	NC_021151	A	6	6	717442	717447	100 %	0 %	0 %	0 %	482903232
13082	NC_021151	AGC	2	6	717530	717535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903232
13083	NC_021151	AGCAA	2	10	717581	717590	60 %	0 %	20 %	20 %	482903232
13084	NC_021151	CCG	2	6	717726	717731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903232
13085	NC_021151	CAGC	2	8	717732	717739	25 %	0 %	25 %	50 %	482903232
13086	NC_021151	TGA	2	6	717785	717790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903232
13087	NC_021151	CAG	2	6	717823	717828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903232
13088	NC_021151	CAGCGC	2	12	717862	717873	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	482903232
13089	NC_021151	GAC	2	6	717907	717912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903232
13090	NC_021151	CG	3	6	717962	717967	0 %	0 %	50 %	50 %	482903232
13091	NC_021151	CCG	2	6	718011	718016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903232
13092	NC_021151	CGC	2	6	718026	718031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903232
13093	NC_021151	CCG	2	6	718040	718045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903232
13094	NC_021151	CAG	2	6	718102	718107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903232
13095	NC_021151	GGTTT	2	10	718133	718142	0 %	60 %	40 %	0 %	482903232
13096	NC_021151	GAAA	2	8	718176	718183	75 %	0 %	25 %	0 %	482903232
13097	NC_021151	GC	3	6	718194	718199	0 %	0 %	50 %	50 %	482903232
13098	NC_021151	CAG	2	6	718204	718209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903232
13099	NC_021151	CG	3	6	718210	718215	0 %	0 %	50 %	50 %	482903232
13100	NC_021151	ATC	2	6	718298	718303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903232
13101	NC_021151	GCCA	2	8	718325	718332	25 %	0 %	25 %	50 %	482903232
13102	NC_021151	ACG	2	6	718366	718371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903232
13103	NC_021151	CAG	2	6	718411	718416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903232
13104	NC_021151	CAAA	2	8	718428	718435	75 %	0 %	0 %	25 %	482903232
13105	NC_021151	CGA	2	6	718515	718520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903232
13106	NC_021151	TAA	2	6	718573	718578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903232
13107	NC_021151	TGA	2	6	718869	718874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903233
13108	NC_021151	TGA	2	6	719012	719017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903233
13109	NC_021151	TGA	2	6	719061	719066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903233
13110	NC_021151	GC	3	6	719079	719084	0 %	0 %	50 %	50 %	482903233
13111	NC_021151	GGT	2	6	719107	719112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903233
13112	NC_021151	ATT	2	6	719131	719136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903233
13113	NC_021151	ACG	2	6	719137	719142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903233
13114	NC_021151	TGA	2	6	719213	719218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903233
13115	NC_021151	TAC	2	6	719328	719333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903233
13116	NC_021151	A	7	7	719343	719349	100 %	0 %	0 %	0 %	482903233
13117	NC_021151	GATC	2	8	719373	719380	25 %	25 %	25 %	25 %	482903233
13118	NC_021151	GAT	2	6	719503	719508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903234
13119	NC_021151	CGC	2	6	719537	719542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903234
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13121	NC_021151	CG	4	8	719575	719582	0 %	0 %	50 %	50 %	482903234
13122	NC_021151	ATA	2	6	719607	719612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903234
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13125	NC_021151	T	6	6	719923	719928	0 %	100 %	0 %	0 %	482903234
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13142	NC_021151	A	7	7	720516	720522	100 %	0 %	0 %	0 %	482903234
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13479	NC_021151	CGT	2	6	739396	739401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903257
13480	NC_021151	TCA	2	6	739439	739444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903257
13481	NC_021151	GGC	2	6	739480	739485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903257
13482	NC_021151	CTGG	2	8	739491	739498	0 %	25 %	50 %	25 %	482903257
13483	NC_021151	GAA	2	6	739503	739508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482903257
13484	NC_021151	TTC	2	6	739579	739584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482903257
13485	NC_021151	GAA	3	9	739618	739626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482903257
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13487	NC_021151	GC	3	6	739757	739762	0 %	0 %	50 %	50 %	482903257
13488	NC_021151	TTA	2	6	739987	739992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903257
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13494	NC_021151	CTGA	2	8	740268	740275	25 %	25 %	25 %	25 %	482903258
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13500	NC_021151	GTTGGC	2	12	740748	740759	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	482903258

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